Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2WTN8

Protein Details
Accession A0A1Y2WTN8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
463-485AEEARLRKRLKRMEKSTDKDKEVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
469-474RKRLKR
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12.333, mito 4.5, cyto_mito 4.499
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
Amino Acid Sequences MSHPQPTMPPRQFSPQQHSPNQSYQLPPNKRARLSPGPPSNPGSPYPNYAASPRATTPAATPMTLPSPAPAPNHNINQGPATTTTTTAYNTPYQQPNGRSASVGMTLTMPTAVSTPPLASPQPQTPSATHAPYSNAKLAPVPTNTSFNSSGPPVITNMGPPTMNPAGSFSSNDATRQGPKPTSTKADVTYDVDDMLVGTGIDLEEEAEYLNNLETRGFPNYPPGGSETLYGAGPINQPAQSTNAKTQEELAAESADKVWNEAAARLARTRTQEIANYLLEPGVVHKRMQDTASKYGLSLNLDLKPEGGRYMGKMASPGGAKPEIKVMYQKAPDGTMVQTLGSFIPHDAFLVDQIALLSISTKQHLRELLSDANRMATTRQKTSHGAVPSEWLDAAAIPSADANGTQGEGPRTGVESAVSPRTNPLKRSADELSNGLPTPVSEASPSNPMVEAMMVTVKDARNAEEARLRKRLKRMEKSTDKDKEVGDSTSRAGSVAPGTPGSIAPESGELKAPTKKESKKAAKLAEASSTTVNQTLGLFAGGKKKKYSWMTNSGGPGSGASTPRPQATGAPGTPSSTATPSSKAPRGPLTKAGVTHLGQFREDSDKGKNIQLRDWVVVIEERGFDTKALQLAYDILDRSAKGTVENTS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.67
2 0.67
3 0.69
4 0.72
5 0.76
6 0.73
7 0.72
8 0.69
9 0.64
10 0.59
11 0.59
12 0.62
13 0.62
14 0.64
15 0.67
16 0.69
17 0.67
18 0.67
19 0.67
20 0.67
21 0.66
22 0.69
23 0.69
24 0.66
25 0.68
26 0.68
27 0.63
28 0.56
29 0.52
30 0.48
31 0.4
32 0.4
33 0.39
34 0.38
35 0.35
36 0.34
37 0.35
38 0.31
39 0.33
40 0.29
41 0.28
42 0.25
43 0.25
44 0.25
45 0.29
46 0.28
47 0.24
48 0.23
49 0.22
50 0.25
51 0.25
52 0.23
53 0.16
54 0.17
55 0.2
56 0.23
57 0.23
58 0.27
59 0.33
60 0.38
61 0.41
62 0.4
63 0.38
64 0.38
65 0.35
66 0.3
67 0.25
68 0.24
69 0.21
70 0.2
71 0.2
72 0.19
73 0.19
74 0.19
75 0.21
76 0.21
77 0.23
78 0.29
79 0.33
80 0.36
81 0.42
82 0.43
83 0.46
84 0.47
85 0.44
86 0.38
87 0.33
88 0.31
89 0.28
90 0.25
91 0.18
92 0.14
93 0.13
94 0.13
95 0.12
96 0.09
97 0.06
98 0.07
99 0.07
100 0.07
101 0.08
102 0.09
103 0.1
104 0.13
105 0.14
106 0.15
107 0.19
108 0.24
109 0.28
110 0.29
111 0.31
112 0.29
113 0.35
114 0.37
115 0.35
116 0.3
117 0.27
118 0.29
119 0.31
120 0.34
121 0.33
122 0.28
123 0.26
124 0.28
125 0.29
126 0.3
127 0.28
128 0.28
129 0.25
130 0.29
131 0.29
132 0.32
133 0.31
134 0.27
135 0.27
136 0.23
137 0.22
138 0.19
139 0.19
140 0.15
141 0.15
142 0.14
143 0.13
144 0.14
145 0.14
146 0.13
147 0.12
148 0.18
149 0.18
150 0.18
151 0.16
152 0.17
153 0.18
154 0.19
155 0.21
156 0.15
157 0.18
158 0.18
159 0.18
160 0.18
161 0.17
162 0.21
163 0.24
164 0.27
165 0.26
166 0.3
167 0.33
168 0.36
169 0.4
170 0.38
171 0.38
172 0.36
173 0.37
174 0.35
175 0.34
176 0.31
177 0.25
178 0.22
179 0.18
180 0.15
181 0.11
182 0.09
183 0.06
184 0.04
185 0.03
186 0.03
187 0.03
188 0.03
189 0.03
190 0.03
191 0.03
192 0.03
193 0.04
194 0.03
195 0.04
196 0.04
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.06
201 0.07
202 0.09
203 0.14
204 0.15
205 0.14
206 0.21
207 0.22
208 0.22
209 0.21
210 0.22
211 0.19
212 0.19
213 0.19
214 0.13
215 0.13
216 0.13
217 0.12
218 0.09
219 0.09
220 0.09
221 0.1
222 0.11
223 0.1
224 0.1
225 0.11
226 0.15
227 0.16
228 0.18
229 0.22
230 0.26
231 0.26
232 0.26
233 0.27
234 0.26
235 0.24
236 0.22
237 0.17
238 0.12
239 0.11
240 0.11
241 0.11
242 0.09
243 0.08
244 0.08
245 0.07
246 0.08
247 0.08
248 0.08
249 0.11
250 0.11
251 0.12
252 0.13
253 0.14
254 0.16
255 0.19
256 0.2
257 0.2
258 0.2
259 0.21
260 0.22
261 0.24
262 0.21
263 0.18
264 0.16
265 0.14
266 0.12
267 0.09
268 0.1
269 0.11
270 0.12
271 0.12
272 0.14
273 0.16
274 0.17
275 0.19
276 0.22
277 0.21
278 0.25
279 0.27
280 0.25
281 0.23
282 0.23
283 0.24
284 0.2
285 0.17
286 0.14
287 0.15
288 0.15
289 0.15
290 0.14
291 0.13
292 0.12
293 0.1
294 0.09
295 0.07
296 0.07
297 0.1
298 0.11
299 0.1
300 0.11
301 0.1
302 0.12
303 0.12
304 0.11
305 0.11
306 0.13
307 0.13
308 0.12
309 0.17
310 0.15
311 0.16
312 0.18
313 0.18
314 0.21
315 0.22
316 0.23
317 0.19
318 0.18
319 0.18
320 0.17
321 0.15
322 0.1
323 0.09
324 0.08
325 0.07
326 0.07
327 0.07
328 0.06
329 0.05
330 0.05
331 0.05
332 0.05
333 0.05
334 0.04
335 0.04
336 0.05
337 0.05
338 0.05
339 0.04
340 0.04
341 0.04
342 0.04
343 0.04
344 0.04
345 0.05
346 0.05
347 0.07
348 0.08
349 0.09
350 0.11
351 0.13
352 0.14
353 0.16
354 0.19
355 0.24
356 0.24
357 0.25
358 0.22
359 0.22
360 0.2
361 0.18
362 0.15
363 0.16
364 0.18
365 0.21
366 0.23
367 0.25
368 0.28
369 0.3
370 0.35
371 0.31
372 0.28
373 0.25
374 0.26
375 0.23
376 0.21
377 0.18
378 0.12
379 0.09
380 0.08
381 0.08
382 0.06
383 0.04
384 0.04
385 0.04
386 0.04
387 0.04
388 0.04
389 0.04
390 0.04
391 0.04
392 0.05
393 0.06
394 0.08
395 0.08
396 0.09
397 0.08
398 0.1
399 0.09
400 0.09
401 0.08
402 0.09
403 0.11
404 0.16
405 0.16
406 0.14
407 0.18
408 0.26
409 0.29
410 0.29
411 0.35
412 0.37
413 0.37
414 0.42
415 0.42
416 0.37
417 0.36
418 0.36
419 0.29
420 0.24
421 0.23
422 0.18
423 0.14
424 0.1
425 0.12
426 0.11
427 0.1
428 0.09
429 0.11
430 0.12
431 0.16
432 0.17
433 0.14
434 0.13
435 0.13
436 0.12
437 0.11
438 0.09
439 0.06
440 0.07
441 0.06
442 0.06
443 0.1
444 0.1
445 0.12
446 0.13
447 0.14
448 0.18
449 0.19
450 0.21
451 0.25
452 0.29
453 0.32
454 0.41
455 0.43
456 0.43
457 0.52
458 0.59
459 0.63
460 0.7
461 0.73
462 0.75
463 0.82
464 0.83
465 0.84
466 0.82
467 0.74
468 0.66
469 0.57
470 0.51
471 0.43
472 0.39
473 0.3
474 0.24
475 0.22
476 0.21
477 0.2
478 0.16
479 0.13
480 0.12
481 0.12
482 0.12
483 0.12
484 0.11
485 0.11
486 0.12
487 0.12
488 0.14
489 0.12
490 0.1
491 0.1
492 0.13
493 0.14
494 0.14
495 0.18
496 0.16
497 0.19
498 0.23
499 0.24
500 0.27
501 0.34
502 0.4
503 0.45
504 0.55
505 0.62
506 0.67
507 0.74
508 0.74
509 0.72
510 0.7
511 0.63
512 0.59
513 0.5
514 0.42
515 0.35
516 0.3
517 0.24
518 0.21
519 0.19
520 0.14
521 0.12
522 0.11
523 0.09
524 0.09
525 0.09
526 0.09
527 0.19
528 0.23
529 0.25
530 0.28
531 0.3
532 0.38
533 0.45
534 0.53
535 0.52
536 0.57
537 0.59
538 0.62
539 0.63
540 0.56
541 0.48
542 0.38
543 0.3
544 0.22
545 0.21
546 0.18
547 0.16
548 0.2
549 0.22
550 0.23
551 0.24
552 0.23
553 0.22
554 0.27
555 0.32
556 0.28
557 0.31
558 0.3
559 0.31
560 0.31
561 0.3
562 0.25
563 0.2
564 0.23
565 0.19
566 0.22
567 0.26
568 0.33
569 0.36
570 0.36
571 0.39
572 0.45
573 0.49
574 0.51
575 0.53
576 0.52
577 0.5
578 0.49
579 0.48
580 0.44
581 0.39
582 0.42
583 0.4
584 0.35
585 0.32
586 0.31
587 0.3
588 0.31
589 0.32
590 0.27
591 0.28
592 0.32
593 0.35
594 0.41
595 0.43
596 0.39
597 0.42
598 0.47
599 0.45
600 0.41
601 0.39
602 0.32
603 0.3
604 0.29
605 0.25
606 0.2
607 0.16
608 0.16
609 0.17
610 0.17
611 0.16
612 0.15
613 0.17
614 0.18
615 0.18
616 0.16
617 0.15
618 0.16
619 0.18
620 0.19
621 0.17
622 0.15
623 0.16
624 0.16
625 0.17
626 0.19
627 0.17
628 0.16