Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1CI73

Protein Details
Accession A0A0D1CI73    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
18-37SDVKLERKARKEAQKALKLQHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 14.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002745  Ptrans_KptA/Tpt1  
IPR042081  RNA_2'-PTrans_C  
IPR042080  RNA_2'-PTrans_N  
Gene Ontology GO:0000215  F:tRNA 2'-phosphotransferase activity  
GO:0006388  P:tRNA splicing, via endonucleolytic cleavage and ligation  
KEGG uma:UMAG_04714  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01885  PTS_2-RNA  
Amino Acid Sequences MSTQEPATSSSSTDPAVSDVKLERKARKEAQKALKLQQAAQKKIAIKAEQPSTASSSISKSSSANASASASSSSSSSLKAPRKPPSSDEQLSRALAYILRHGAEKEALEIRADGYVLLEHVLQRPRVKSVTITLPDGKKTKPRLEDVRRIVESNEKKRFELSQQNSAEWWVRAVQGHSLKNVVELQHVALTLENLHLLKLTHDDPHNHSLTEEHHLKTNLDALQIASEHRVQVIHGTYAPAWDLILASGGLKPMTRNHIHLAKGKFGQQGVISGMRKSANRLIYIDIVKAITDGIPFYLSSNGVVLTPGDNQHHMLGVQYFTKVEDQNAQLVWSRPPSPSPSPSPSPSPTV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.17
3 0.19
4 0.17
5 0.17
6 0.2
7 0.26
8 0.34
9 0.39
10 0.44
11 0.48
12 0.58
13 0.64
14 0.69
15 0.72
16 0.74
17 0.79
18 0.8
19 0.8
20 0.78
21 0.74
22 0.65
23 0.61
24 0.58
25 0.57
26 0.52
27 0.5
28 0.48
29 0.45
30 0.49
31 0.5
32 0.46
33 0.41
34 0.44
35 0.45
36 0.43
37 0.41
38 0.38
39 0.35
40 0.33
41 0.29
42 0.23
43 0.21
44 0.21
45 0.2
46 0.2
47 0.16
48 0.18
49 0.21
50 0.21
51 0.19
52 0.17
53 0.18
54 0.17
55 0.17
56 0.15
57 0.12
58 0.11
59 0.1
60 0.11
61 0.1
62 0.11
63 0.14
64 0.21
65 0.28
66 0.35
67 0.42
68 0.5
69 0.55
70 0.58
71 0.59
72 0.58
73 0.6
74 0.58
75 0.54
76 0.49
77 0.46
78 0.43
79 0.38
80 0.31
81 0.22
82 0.2
83 0.17
84 0.16
85 0.14
86 0.14
87 0.14
88 0.14
89 0.15
90 0.14
91 0.14
92 0.13
93 0.14
94 0.14
95 0.13
96 0.13
97 0.12
98 0.11
99 0.11
100 0.08
101 0.06
102 0.05
103 0.05
104 0.05
105 0.05
106 0.06
107 0.1
108 0.13
109 0.15
110 0.18
111 0.19
112 0.22
113 0.23
114 0.23
115 0.2
116 0.22
117 0.28
118 0.27
119 0.29
120 0.3
121 0.31
122 0.33
123 0.34
124 0.32
125 0.31
126 0.35
127 0.39
128 0.39
129 0.44
130 0.51
131 0.58
132 0.66
133 0.64
134 0.65
135 0.59
136 0.55
137 0.49
138 0.47
139 0.47
140 0.47
141 0.49
142 0.43
143 0.42
144 0.43
145 0.44
146 0.41
147 0.44
148 0.39
149 0.4
150 0.39
151 0.4
152 0.38
153 0.37
154 0.33
155 0.22
156 0.18
157 0.09
158 0.09
159 0.1
160 0.1
161 0.14
162 0.18
163 0.19
164 0.19
165 0.19
166 0.18
167 0.18
168 0.19
169 0.15
170 0.1
171 0.09
172 0.09
173 0.09
174 0.09
175 0.08
176 0.07
177 0.06
178 0.06
179 0.05
180 0.06
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.06
186 0.08
187 0.09
188 0.12
189 0.14
190 0.17
191 0.21
192 0.27
193 0.27
194 0.25
195 0.23
196 0.21
197 0.21
198 0.25
199 0.24
200 0.19
201 0.21
202 0.22
203 0.23
204 0.22
205 0.24
206 0.19
207 0.16
208 0.16
209 0.12
210 0.12
211 0.12
212 0.12
213 0.09
214 0.09
215 0.08
216 0.08
217 0.08
218 0.07
219 0.11
220 0.12
221 0.11
222 0.11
223 0.12
224 0.12
225 0.12
226 0.12
227 0.09
228 0.07
229 0.06
230 0.06
231 0.04
232 0.05
233 0.04
234 0.05
235 0.05
236 0.06
237 0.06
238 0.06
239 0.07
240 0.1
241 0.17
242 0.19
243 0.22
244 0.27
245 0.32
246 0.36
247 0.42
248 0.42
249 0.4
250 0.4
251 0.42
252 0.39
253 0.34
254 0.32
255 0.25
256 0.25
257 0.22
258 0.26
259 0.22
260 0.2
261 0.22
262 0.23
263 0.23
264 0.25
265 0.29
266 0.27
267 0.28
268 0.29
269 0.3
270 0.32
271 0.33
272 0.29
273 0.24
274 0.2
275 0.18
276 0.16
277 0.13
278 0.08
279 0.08
280 0.07
281 0.07
282 0.08
283 0.08
284 0.09
285 0.1
286 0.1
287 0.1
288 0.1
289 0.1
290 0.09
291 0.09
292 0.09
293 0.09
294 0.11
295 0.13
296 0.15
297 0.16
298 0.18
299 0.18
300 0.19
301 0.17
302 0.17
303 0.16
304 0.15
305 0.15
306 0.14
307 0.14
308 0.14
309 0.19
310 0.18
311 0.18
312 0.23
313 0.24
314 0.27
315 0.27
316 0.27
317 0.27
318 0.28
319 0.29
320 0.27
321 0.28
322 0.25
323 0.29
324 0.35
325 0.39
326 0.44
327 0.48
328 0.51
329 0.55
330 0.58
331 0.61