Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2WVA8

Protein Details
Accession A0A1Y2WVA8    Localization Confidence High Confidence Score 15.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-25MKPRRYHGLKRPRLRQTWNKYNLFNHydrophilic
187-211ATGMPKPDPNKQKKKKSSGQKAEGEHydrophilic
371-390WDPTKPYKTPWRPRPYMAPFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
196-203NKQKKKKS
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 10.333, cyto_mito 7.833, mito 7.5, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR022801  Ribosomal_S4/S9  
IPR002942  S4_RNA-bd  
IPR036986  S4_RNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0015935  C:small ribosomal subunit  
GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF01479  S4  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50889  S4  
CDD cd00165  S4  
Amino Acid Sequences MKPRRYHGLKRPRLRQTWNKYNLFNIWRSRDPKLGKGDMETFFQQKWKAKGMLRDYHGEHVVERKWVRMFSRRLLSVAEMDPKYMAAFDGSELAAGRGSGKEERPDWGAKVVPKRVQTPYMQMTFAPMERRLDIAVFRAMFASSARQARQFCVHGAVKVNGKVMPYPAYRLNPGDMFQVDPERVLYATGMPKPDPNKQKKKKSSGQKAEGESEEATEEGAEAEAAAEGEAAETKEAEAPEQDPETTDAPEPVKQDMKPTRKQILAIVEQAKAVLNEQTDLGVRQKQQLRKFVKEIRPLVSRTGRADASPQEIAEELSNMVADLRLSGSSAEDAPATTEQSRDTFGDLTRDEFRILKKRVAEYIREEEENPWDPTKPYKTPWRPRPYMAPFAFIPKYLEVNHNICAAVYLRHPVARVGSAEVPTPFPESVSQLAFNWYLRRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.88
2 0.88
3 0.87
4 0.88
5 0.88
6 0.84
7 0.76
8 0.72
9 0.7
10 0.65
11 0.61
12 0.59
13 0.56
14 0.58
15 0.6
16 0.6
17 0.6
18 0.59
19 0.6
20 0.6
21 0.59
22 0.53
23 0.53
24 0.55
25 0.48
26 0.48
27 0.43
28 0.37
29 0.32
30 0.34
31 0.35
32 0.35
33 0.38
34 0.41
35 0.45
36 0.47
37 0.55
38 0.6
39 0.62
40 0.59
41 0.61
42 0.56
43 0.55
44 0.53
45 0.44
46 0.36
47 0.33
48 0.32
49 0.33
50 0.31
51 0.3
52 0.3
53 0.33
54 0.37
55 0.4
56 0.44
57 0.45
58 0.53
59 0.5
60 0.48
61 0.46
62 0.43
63 0.38
64 0.36
65 0.35
66 0.27
67 0.26
68 0.25
69 0.23
70 0.21
71 0.16
72 0.13
73 0.06
74 0.07
75 0.06
76 0.08
77 0.08
78 0.08
79 0.08
80 0.08
81 0.08
82 0.07
83 0.08
84 0.06
85 0.09
86 0.12
87 0.15
88 0.19
89 0.2
90 0.22
91 0.26
92 0.27
93 0.26
94 0.26
95 0.27
96 0.28
97 0.35
98 0.4
99 0.41
100 0.42
101 0.45
102 0.46
103 0.47
104 0.44
105 0.44
106 0.44
107 0.41
108 0.38
109 0.32
110 0.32
111 0.29
112 0.28
113 0.24
114 0.19
115 0.19
116 0.19
117 0.2
118 0.17
119 0.17
120 0.15
121 0.14
122 0.16
123 0.14
124 0.14
125 0.13
126 0.13
127 0.12
128 0.12
129 0.12
130 0.13
131 0.16
132 0.17
133 0.21
134 0.22
135 0.24
136 0.29
137 0.27
138 0.24
139 0.28
140 0.28
141 0.25
142 0.27
143 0.27
144 0.26
145 0.26
146 0.26
147 0.2
148 0.2
149 0.18
150 0.17
151 0.19
152 0.16
153 0.18
154 0.21
155 0.22
156 0.23
157 0.24
158 0.24
159 0.2
160 0.2
161 0.2
162 0.16
163 0.14
164 0.13
165 0.14
166 0.12
167 0.11
168 0.1
169 0.09
170 0.08
171 0.08
172 0.07
173 0.08
174 0.11
175 0.13
176 0.14
177 0.14
178 0.17
179 0.2
180 0.28
181 0.35
182 0.42
183 0.52
184 0.61
185 0.71
186 0.78
187 0.84
188 0.84
189 0.85
190 0.86
191 0.85
192 0.84
193 0.79
194 0.73
195 0.66
196 0.58
197 0.49
198 0.37
199 0.27
200 0.19
201 0.12
202 0.09
203 0.06
204 0.05
205 0.03
206 0.03
207 0.03
208 0.02
209 0.02
210 0.02
211 0.03
212 0.02
213 0.02
214 0.02
215 0.02
216 0.03
217 0.03
218 0.03
219 0.03
220 0.03
221 0.05
222 0.06
223 0.06
224 0.06
225 0.07
226 0.09
227 0.09
228 0.09
229 0.08
230 0.1
231 0.11
232 0.11
233 0.11
234 0.11
235 0.12
236 0.14
237 0.15
238 0.15
239 0.17
240 0.16
241 0.25
242 0.32
243 0.38
244 0.43
245 0.48
246 0.51
247 0.49
248 0.5
249 0.45
250 0.43
251 0.38
252 0.37
253 0.34
254 0.29
255 0.27
256 0.26
257 0.22
258 0.16
259 0.13
260 0.09
261 0.07
262 0.07
263 0.07
264 0.08
265 0.08
266 0.09
267 0.11
268 0.13
269 0.14
270 0.21
271 0.27
272 0.33
273 0.39
274 0.48
275 0.52
276 0.54
277 0.6
278 0.63
279 0.65
280 0.67
281 0.65
282 0.61
283 0.58
284 0.54
285 0.53
286 0.49
287 0.44
288 0.37
289 0.37
290 0.32
291 0.28
292 0.3
293 0.26
294 0.25
295 0.23
296 0.2
297 0.16
298 0.16
299 0.17
300 0.13
301 0.12
302 0.07
303 0.06
304 0.06
305 0.06
306 0.05
307 0.05
308 0.04
309 0.04
310 0.05
311 0.05
312 0.05
313 0.06
314 0.06
315 0.07
316 0.08
317 0.08
318 0.07
319 0.07
320 0.09
321 0.1
322 0.11
323 0.11
324 0.11
325 0.12
326 0.13
327 0.16
328 0.14
329 0.15
330 0.15
331 0.16
332 0.2
333 0.2
334 0.22
335 0.23
336 0.23
337 0.23
338 0.23
339 0.28
340 0.33
341 0.36
342 0.37
343 0.39
344 0.42
345 0.49
346 0.51
347 0.5
348 0.47
349 0.52
350 0.51
351 0.47
352 0.45
353 0.39
354 0.4
355 0.39
356 0.35
357 0.29
358 0.26
359 0.26
360 0.32
361 0.38
362 0.37
363 0.39
364 0.47
365 0.56
366 0.66
367 0.76
368 0.79
369 0.76
370 0.77
371 0.81
372 0.78
373 0.77
374 0.68
375 0.61
376 0.51
377 0.53
378 0.49
379 0.39
380 0.35
381 0.26
382 0.28
383 0.26
384 0.3
385 0.29
386 0.3
387 0.31
388 0.3
389 0.28
390 0.24
391 0.24
392 0.2
393 0.16
394 0.15
395 0.18
396 0.18
397 0.2
398 0.2
399 0.21
400 0.23
401 0.24
402 0.23
403 0.24
404 0.26
405 0.25
406 0.28
407 0.27
408 0.26
409 0.24
410 0.26
411 0.21
412 0.19
413 0.2
414 0.2
415 0.23
416 0.24
417 0.24
418 0.21
419 0.25
420 0.26
421 0.26