Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2XB47

Protein Details
Accession A0A1Y2XB47    Localization Confidence High Confidence Score 16.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
58-84VSRIEKAHQKPAKRRRPNKKLVANLDSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
8-22KRRSLRAKLAARTGP
27-29PRK
46-77KKDKRSIKHASFVSRIEKAHQKPAKRRRPNKK
107-128EGKVRHKSLKSRPGALKRKERI
Subcellular Location(s) nucl 13, mito 9, cyto_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028160  Slx9-like  
Gene Ontology GO:0030686  C:90S preribosome  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030688  C:preribosome, small subunit precursor  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
Pfam View protein in Pfam  
PF15341  SLX9  
Amino Acid Sequences MAPVVPSKRRSLRAKLAARTGPEPYAPRKAPRPDAASTSDTFSNTKKDKRSIKHASFVSRIEKAHQKPAKRRRPNKKLVANLDSLADALPDLLADGETEEGLRQLREGKVRHKSLKSRPGALKRKERIVKGEVERFGVSLARLSAVAEKEVVQMDVEKEGESVVAVPEGQGASTTAPPQVSTTNRWAALRGYISATMEQNPAFVEKKDGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.78
2 0.75
3 0.76
4 0.71
5 0.68
6 0.61
7 0.54
8 0.45
9 0.4
10 0.39
11 0.35
12 0.4
13 0.4
14 0.43
15 0.48
16 0.54
17 0.58
18 0.62
19 0.62
20 0.55
21 0.57
22 0.56
23 0.5
24 0.44
25 0.39
26 0.33
27 0.28
28 0.27
29 0.24
30 0.27
31 0.29
32 0.35
33 0.38
34 0.45
35 0.53
36 0.58
37 0.67
38 0.7
39 0.7
40 0.71
41 0.69
42 0.66
43 0.61
44 0.57
45 0.51
46 0.44
47 0.39
48 0.35
49 0.39
50 0.36
51 0.43
52 0.44
53 0.47
54 0.54
55 0.65
56 0.71
57 0.74
58 0.82
59 0.82
60 0.89
61 0.91
62 0.91
63 0.89
64 0.87
65 0.83
66 0.77
67 0.68
68 0.57
69 0.47
70 0.37
71 0.28
72 0.19
73 0.11
74 0.06
75 0.04
76 0.03
77 0.02
78 0.02
79 0.02
80 0.02
81 0.02
82 0.03
83 0.03
84 0.03
85 0.03
86 0.03
87 0.04
88 0.04
89 0.04
90 0.04
91 0.07
92 0.09
93 0.15
94 0.17
95 0.24
96 0.32
97 0.38
98 0.44
99 0.47
100 0.53
101 0.57
102 0.64
103 0.6
104 0.6
105 0.61
106 0.66
107 0.7
108 0.69
109 0.7
110 0.64
111 0.71
112 0.68
113 0.63
114 0.58
115 0.52
116 0.52
117 0.48
118 0.51
119 0.42
120 0.39
121 0.37
122 0.31
123 0.28
124 0.21
125 0.15
126 0.1
127 0.09
128 0.07
129 0.07
130 0.07
131 0.1
132 0.1
133 0.1
134 0.1
135 0.1
136 0.11
137 0.12
138 0.11
139 0.08
140 0.09
141 0.09
142 0.11
143 0.1
144 0.09
145 0.08
146 0.08
147 0.08
148 0.07
149 0.06
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.04
154 0.06
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.06
159 0.08
160 0.09
161 0.1
162 0.11
163 0.11
164 0.12
165 0.13
166 0.18
167 0.2
168 0.23
169 0.29
170 0.33
171 0.35
172 0.35
173 0.35
174 0.31
175 0.33
176 0.3
177 0.25
178 0.22
179 0.22
180 0.23
181 0.24
182 0.24
183 0.21
184 0.21
185 0.2
186 0.17
187 0.17
188 0.18
189 0.18
190 0.17