FuNGI

A0A1Y2X0S0

Protein Details

Accession

A0A1Y2X0S0

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
8-34	VPGYRLGAHHRLNKRKKTDDNQENEEE	Hydrophilic
84-103	LFPHKPLRPEGKGRRRRDTT	Basic
378-405	TDDDNSRGEKKRRKKGKGKGKSSEDELR	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
88-100	KPLRPEGKGRRRR
384-398	RGEKKRRKKGKGKGK

Subcellular Location(s)

cyto 9.5, cyto_mito 9.5, mito 8.5, nucl 8

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007224 TIF_Rrn11
Gene Ontology	GO:0001164 F:RNA polymerase I core promoter sequence-specific DNA binding GO:0001181 F:RNA polymerase I general transcription initiation factor activity
Pfam	View protein in Pfam PF04090 RNA_pol_I_TF

Amino Acid Sequences

MGPFALPVPGYRLGAHHRLNKRKKTDDNQENEEEVWIESEWNTPSSRLPSDSINPLSHTPDTLRQFAVAGLSPADEIPSKANPLFPHKPLRPEGKGRRRRDTTGKDDESAAENVDAGNATSKQHAERLKHLSTLTAILHRCLAEGDIQRAKRAFGLLVQTKDVDIRQAGLWALGSEILMRDGENERESEREREREQEREQERDRGLLFRRWGAAANIEKVKSYFEMLIQQHPHDPHRPHLTSALDFWPALFGIEVYNVDAEMRAATFHLLAQQQEIREAEEEEDGGGGGDGYGLDADMAYSDETFESRRESVEDARREEMYTARDEIRLRALAAAESIAKQMDQVMENAPYGAHRGLLRLRAHLALFVGDLCLPARLTDDDNSRGEKKRRKKGKGKGKSSEDELRMRAETTEEHAALARRRDEHDRARTLFRKVLDGGVEGEAEGEGGADSWVRKFVDESEDDEIDERGDDEW

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.35
2	0.42
3	0.46
4	0.53
5	0.63
6	0.72
7	0.78
8	0.82
9	0.83
10	0.86
11	0.87
12	0.88
13	0.88
14	0.86
15	0.83
16	0.78
17	0.7
18	0.6
19	0.51
20	0.4
21	0.3
22	0.23
23	0.16
24	0.12
25	0.1
26	0.13
27	0.14
28	0.15
29	0.15
30	0.15
31	0.19
32	0.23
33	0.26
34	0.25
35	0.25
36	0.29
37	0.33
38	0.4
39	0.41
40	0.37
41	0.37
42	0.36
43	0.38
44	0.34
45	0.31
46	0.26
47	0.3
48	0.33
49	0.33
50	0.31
51	0.27
52	0.27
53	0.26
54	0.25
55	0.17
56	0.13
57	0.11
58	0.1
59	0.1
60	0.1
61	0.11
62	0.09
63	0.09
64	0.11
65	0.13
66	0.16
67	0.16
68	0.2
69	0.22
70	0.3
71	0.36
72	0.37
73	0.46
74	0.46
75	0.53
76	0.56
77	0.62
78	0.6
79	0.65
80	0.71
81	0.72
82	0.78
83	0.79
84	0.82
85	0.79
86	0.79
87	0.79
88	0.78
89	0.76
90	0.76
91	0.72
92	0.63
93	0.58
94	0.53
95	0.45
96	0.36
97	0.28
98	0.17
99	0.13
100	0.12
101	0.11
102	0.09
103	0.06
104	0.08
105	0.08
106	0.08
107	0.1
108	0.12
109	0.13
110	0.19
111	0.24
112	0.25
113	0.32
114	0.39
115	0.38
116	0.4
117	0.39
118	0.34
119	0.3
120	0.3
121	0.23
122	0.21
123	0.2
124	0.18
125	0.19
126	0.18
127	0.17
128	0.14
129	0.13
130	0.14
131	0.16
132	0.21
133	0.25
134	0.25
135	0.28
136	0.28
137	0.27
138	0.23
139	0.21
140	0.16
141	0.13
142	0.21
143	0.23
144	0.24
145	0.25
146	0.24
147	0.23
148	0.23
149	0.21
150	0.14
151	0.1
152	0.1
153	0.09
154	0.1
155	0.1
156	0.09
157	0.09
158	0.07
159	0.07
160	0.05
161	0.05
162	0.04
163	0.04
164	0.05
165	0.05
166	0.04
167	0.06
168	0.08
169	0.1
170	0.1
171	0.11
172	0.11
173	0.14
174	0.16
175	0.2
176	0.22
177	0.25
178	0.26
179	0.32
180	0.35
181	0.39
182	0.4
183	0.44
184	0.43
185	0.46
186	0.47
187	0.46
188	0.43
189	0.39
190	0.36
191	0.31
192	0.31
193	0.29
194	0.28
195	0.23
196	0.24
197	0.22
198	0.22
199	0.18
200	0.2
201	0.18
202	0.2
203	0.21
204	0.2
205	0.19
206	0.18
207	0.19
208	0.14
209	0.13
210	0.1
211	0.08
212	0.15
213	0.16
214	0.21
215	0.21
216	0.22
217	0.23
218	0.24
219	0.26
220	0.26
221	0.26
222	0.27
223	0.34
224	0.34
225	0.32
226	0.34
227	0.34
228	0.28
229	0.28
230	0.25
231	0.17
232	0.16
233	0.15
234	0.11
235	0.09
236	0.08
237	0.06
238	0.04
239	0.04
240	0.04
241	0.05
242	0.04
243	0.04
244	0.04
245	0.04
246	0.04
247	0.04
248	0.03
249	0.03
250	0.03
251	0.03
252	0.04
253	0.04
254	0.04
255	0.08
256	0.08
257	0.09
258	0.1
259	0.12
260	0.12
261	0.14
262	0.14
263	0.12
264	0.11
265	0.12
266	0.11
267	0.09
268	0.09
269	0.07
270	0.07
271	0.06
272	0.05
273	0.04
274	0.03
275	0.02
276	0.02
277	0.02
278	0.02
279	0.02
280	0.02
281	0.02
282	0.02
283	0.02
284	0.02
285	0.03
286	0.03
287	0.03
288	0.04
289	0.04
290	0.05
291	0.06
292	0.07
293	0.09
294	0.09
295	0.1
296	0.11
297	0.14
298	0.21
299	0.29
300	0.33
301	0.33
302	0.35
303	0.35
304	0.34
305	0.33
306	0.28
307	0.22
308	0.19
309	0.19
310	0.18
311	0.2
312	0.2
313	0.21
314	0.22
315	0.21
316	0.19
317	0.17
318	0.16
319	0.14
320	0.13
321	0.12
322	0.09
323	0.08
324	0.09
325	0.07
326	0.07
327	0.06
328	0.08
329	0.09
330	0.09
331	0.1
332	0.12
333	0.13
334	0.13
335	0.13
336	0.11
337	0.09
338	0.11
339	0.1
340	0.1
341	0.09
342	0.12
343	0.15
344	0.23
345	0.24
346	0.24
347	0.26
348	0.26
349	0.25
350	0.23
351	0.21
352	0.14
353	0.13
354	0.11
355	0.09
356	0.07
357	0.07
358	0.07
359	0.07
360	0.07
361	0.07
362	0.09
363	0.1
364	0.13
365	0.17
366	0.22
367	0.25
368	0.27
369	0.32
370	0.34
371	0.41
372	0.47
373	0.52
374	0.58
375	0.64
376	0.73
377	0.79
378	0.85
379	0.88
380	0.91
381	0.92
382	0.92
383	0.92
384	0.89
385	0.84
386	0.8
387	0.78
388	0.72
389	0.66
390	0.57
391	0.5
392	0.43
393	0.38
394	0.31
395	0.24
396	0.2
397	0.2
398	0.25
399	0.21
400	0.21
401	0.23
402	0.26
403	0.29
404	0.33
405	0.32
406	0.29
407	0.33
408	0.41
409	0.47
410	0.53
411	0.58
412	0.61
413	0.61
414	0.68
415	0.68
416	0.66
417	0.63
418	0.54
419	0.5
420	0.43
421	0.43
422	0.35
423	0.31
424	0.28
425	0.24
426	0.22
427	0.17
428	0.16
429	0.11
430	0.09
431	0.07
432	0.05
433	0.04
434	0.04
435	0.04
436	0.05
437	0.06
438	0.07
439	0.12
440	0.12
441	0.13
442	0.14
443	0.18
444	0.25
445	0.26
446	0.3
447	0.32
448	0.32
449	0.32
450	0.31
451	0.27
452	0.2
453	0.18

A0A1Y2X0S0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer