FuNGI

A0A1Y2XC89

Protein Details

Accession

A0A1Y2XC89

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
136-157	GGDGKRGRKGKKSRATEKESGQ	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
139-150	GKRGRKGKKSRA

Subcellular Location(s)

nucl 23.5, cyto_nucl 13

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045180 La_dom_prot IPR006630 La_HTH IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf IPR036390 WH_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
Pfam	View protein in Pfam PF05383 La
PROSITE	View protein in PROSITE PS50961 HTH_LA
CDD	cd07323 LAM

Amino Acid Sequences

MSNSASFSYAQAAKGQSATVPPATASQSSSQSQAPSTTSTQSRDAVPTPSTRAPSVAISTTSNELDGSQNTGNSSVKAESVSLNSVDSDITSTSDKATELSGLQNQDAEKALGEVVPQSIERRGRGQTLTSQTTDGGDGKRGRKGKKSRATEKESGQEQDQEKKENLPPKPELSEAPVPAVNVWTQRQEARAAKIKTTPSTTTQPRSSSSATASQVDGPSNPTTQDQKQKASPSEGTEIGGTNSRPSSGGPKSKKDFDQFRSNGQGPRRAAPRGATSNGEERASFEALSPAATNTSSWPTPETAANGLKAQAQGGKSEKEQKDDSGPSKPRSKKEWQPIEFVPSVSFNTPIPSRGGSRGGRGGLRGGRDSTARGNHASSVSLDRTQYNGAATGSATSAPAASKRASVDVSTGRDSRKPLAQAASGKASGEAQSAGSKADTSKQNQPDSAPNGTSNQNAPARVTSSNQRADDTLRSSQPARDGARDSNFQGQNSTGRSERVRGGGRGRGGHSTVNGAGHSQSQFGQGANGYNYPSNGNPRQNGHQYANGYAQMPYGGAYPAQTAGGQHRSRPSSGSNRAQHARHPSSRASPYPAMNMAYEAPVYPHGNGVYGGYTDPAHLLSGVLSQVEYYFSIDNLCKDTYLRRCMDSQGFVPLNVIASFKRMQEIADYQVIRIACDHSPHIEIVITDDGHDKVRRRENWEQWVLDIGTRFKHAQNDGPKSYRPINSQMLYYPQVLPYGGEAPPIFSPTNADAHFAPYLYGNGVTSPTSNGINGHTRPLDSQLSAAVPEFSPTGNATMGTMSQQGEAPSTSFDNGLASDNTDAKSTTLPTGEQIGSPLNGSHDHGSQEQVSLGDNPTTNGVSASSETEAY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.24
2	0.23
3	0.19
4	0.19
5	0.22
6	0.19
7	0.18
8	0.17
9	0.19
10	0.22
11	0.21
12	0.21
13	0.22
14	0.25
15	0.26
16	0.28
17	0.28
18	0.26
19	0.27
20	0.26
21	0.24
22	0.24
23	0.26
24	0.29
25	0.31
26	0.33
27	0.35
28	0.35
29	0.36
30	0.36
31	0.35
32	0.33
33	0.32
34	0.32
35	0.35
36	0.38
37	0.38
38	0.35
39	0.34
40	0.32
41	0.32
42	0.32
43	0.27
44	0.24
45	0.23
46	0.25
47	0.26
48	0.25
49	0.22
50	0.18
51	0.16
52	0.17
53	0.16
54	0.19
55	0.17
56	0.17
57	0.18
58	0.2
59	0.2
60	0.18
61	0.2
62	0.16
63	0.15
64	0.15
65	0.16
66	0.15
67	0.17
68	0.19
69	0.16
70	0.16
71	0.15
72	0.15
73	0.14
74	0.12
75	0.11
76	0.09
77	0.1
78	0.11
79	0.12
80	0.12
81	0.13
82	0.13
83	0.12
84	0.12
85	0.12
86	0.12
87	0.15
88	0.19
89	0.19
90	0.19
91	0.21
92	0.2
93	0.2
94	0.2
95	0.17
96	0.13
97	0.12
98	0.12
99	0.1
100	0.1
101	0.09
102	0.08
103	0.09
104	0.1
105	0.11
106	0.16
107	0.2
108	0.22
109	0.25
110	0.27
111	0.31
112	0.32
113	0.34
114	0.36
115	0.41
116	0.43
117	0.4
118	0.38
119	0.33
120	0.32
121	0.31
122	0.26
123	0.19
124	0.21
125	0.26
126	0.29
127	0.36
128	0.41
129	0.44
130	0.51
131	0.61
132	0.65
133	0.69
134	0.76
135	0.8
136	0.83
137	0.87
138	0.84
139	0.79
140	0.76
141	0.7
142	0.63
143	0.54
144	0.51
145	0.45
146	0.47
147	0.44
148	0.41
149	0.37
150	0.4
151	0.44
152	0.45
153	0.46
154	0.44
155	0.46
156	0.46
157	0.48
158	0.44
159	0.4
160	0.39
161	0.41
162	0.34
163	0.33
164	0.29
165	0.26
166	0.25
167	0.24
168	0.18
169	0.16
170	0.17
171	0.17
172	0.18
173	0.19
174	0.21
175	0.27
176	0.29
177	0.32
178	0.4
179	0.39
180	0.4
181	0.44
182	0.46
183	0.43
184	0.45
185	0.41
186	0.37
187	0.44
188	0.48
189	0.49
190	0.49
191	0.48
192	0.45
193	0.47
194	0.44
195	0.38
196	0.35
197	0.34
198	0.32
199	0.3
200	0.29
201	0.26
202	0.25
203	0.24
204	0.21
205	0.18
206	0.18
207	0.17
208	0.17
209	0.17
210	0.21
211	0.26
212	0.35
213	0.36
214	0.39
215	0.44
216	0.49
217	0.5
218	0.51
219	0.47
220	0.42
221	0.41
222	0.37
223	0.33
224	0.27
225	0.24
226	0.19
227	0.19
228	0.14
229	0.13
230	0.12
231	0.12
232	0.12
233	0.12
234	0.18
235	0.23
236	0.33
237	0.36
238	0.44
239	0.49
240	0.55
241	0.59
242	0.6
243	0.62
244	0.58
245	0.63
246	0.57
247	0.57
248	0.58
249	0.56
250	0.53
251	0.48
252	0.49
253	0.4
254	0.44
255	0.43
256	0.37
257	0.36
258	0.34
259	0.37
260	0.35
261	0.35
262	0.31
263	0.3
264	0.34
265	0.34
266	0.31
267	0.24
268	0.21
269	0.22
270	0.2
271	0.18
272	0.13
273	0.13
274	0.12
275	0.13
276	0.11
277	0.08
278	0.08
279	0.08
280	0.08
281	0.08
282	0.12
283	0.11
284	0.12
285	0.13
286	0.13
287	0.15
288	0.16
289	0.16
290	0.16
291	0.18
292	0.18
293	0.17
294	0.16
295	0.17
296	0.16
297	0.14
298	0.13
299	0.12
300	0.14
301	0.16
302	0.18
303	0.18
304	0.28
305	0.29
306	0.3
307	0.31
308	0.3
309	0.33
310	0.37
311	0.37
312	0.37
313	0.41
314	0.41
315	0.49
316	0.53
317	0.52
318	0.54
319	0.6
320	0.6
321	0.65
322	0.71
323	0.64
324	0.64
325	0.6
326	0.59
327	0.52
328	0.43
329	0.33
330	0.23
331	0.22
332	0.16
333	0.16
334	0.1
335	0.12
336	0.12
337	0.12
338	0.13
339	0.13
340	0.14
341	0.16
342	0.22
343	0.2
344	0.22
345	0.24
346	0.24
347	0.23
348	0.22
349	0.23
350	0.19
351	0.2
352	0.18
353	0.16
354	0.16
355	0.16
356	0.17
357	0.17
358	0.18
359	0.18
360	0.18
361	0.17
362	0.18
363	0.18
364	0.17
365	0.14
366	0.14
367	0.14
368	0.14
369	0.15
370	0.13
371	0.14
372	0.14
373	0.14
374	0.11
375	0.1
376	0.09
377	0.08
378	0.08
379	0.07
380	0.07
381	0.06
382	0.06
383	0.05
384	0.05
385	0.05
386	0.06
387	0.07
388	0.07
389	0.09
390	0.09
391	0.11
392	0.11
393	0.11
394	0.13
395	0.15
396	0.17
397	0.18
398	0.19
399	0.19
400	0.21
401	0.22
402	0.22
403	0.22
404	0.21
405	0.2
406	0.21
407	0.24
408	0.24
409	0.24
410	0.24
411	0.21
412	0.19
413	0.17
414	0.15
415	0.12
416	0.1
417	0.08
418	0.06
419	0.07
420	0.07
421	0.07
422	0.06
423	0.06
424	0.06
425	0.11
426	0.14
427	0.17
428	0.25
429	0.31
430	0.32
431	0.33
432	0.34
433	0.35
434	0.35
435	0.33
436	0.26
437	0.21
438	0.22
439	0.23
440	0.22
441	0.17
442	0.18
443	0.18
444	0.17
445	0.17
446	0.15
447	0.16
448	0.16
449	0.17
450	0.18
451	0.22
452	0.27
453	0.27
454	0.27
455	0.25
456	0.27
457	0.28
458	0.27
459	0.23
460	0.19
461	0.2
462	0.2
463	0.21
464	0.22
465	0.24
466	0.22
467	0.22
468	0.24
469	0.25
470	0.28
471	0.28
472	0.27
473	0.3
474	0.3
475	0.27
476	0.25
477	0.23
478	0.22
479	0.22
480	0.22
481	0.15
482	0.15
483	0.16
484	0.18
485	0.19
486	0.22
487	0.23
488	0.23
489	0.26
490	0.28
491	0.29
492	0.29
493	0.29
494	0.25
495	0.24
496	0.22
497	0.19
498	0.17
499	0.16
500	0.14
501	0.12
502	0.11
503	0.1
504	0.11
505	0.11
506	0.1
507	0.09
508	0.1
509	0.11
510	0.1
511	0.11
512	0.09
513	0.11
514	0.11
515	0.11
516	0.1
517	0.1
518	0.11
519	0.11
520	0.12
521	0.17
522	0.22
523	0.25
524	0.27
525	0.3
526	0.36
527	0.4
528	0.43
529	0.39
530	0.37
531	0.34
532	0.34
533	0.33
534	0.28
535	0.23
536	0.19
537	0.16
538	0.12
539	0.1
540	0.09
541	0.07
542	0.06
543	0.05
544	0.06
545	0.06
546	0.06
547	0.07
548	0.06
549	0.06
550	0.1
551	0.19
552	0.19
553	0.21
554	0.26
555	0.28
556	0.29
557	0.31
558	0.32
559	0.33
560	0.41
561	0.48
562	0.47
563	0.51
564	0.55
565	0.54
566	0.53
567	0.53
568	0.53
569	0.48
570	0.47
571	0.44
572	0.46
573	0.51
574	0.48
575	0.44
576	0.41
577	0.38
578	0.37
579	0.35
580	0.3
581	0.24
582	0.23
583	0.17
584	0.14
585	0.13
586	0.1
587	0.09
588	0.1
589	0.11
590	0.1
591	0.11
592	0.11
593	0.11
594	0.12
595	0.11
596	0.09
597	0.09
598	0.08
599	0.08
600	0.08
601	0.07
602	0.07
603	0.07
604	0.06
605	0.06
606	0.06
607	0.05
608	0.06
609	0.06
610	0.06
611	0.05
612	0.05
613	0.05
614	0.06
615	0.06
616	0.07
617	0.07
618	0.07
619	0.1
620	0.11
621	0.12
622	0.14
623	0.14
624	0.12
625	0.13
626	0.21
627	0.26
628	0.33
629	0.34
630	0.33
631	0.34
632	0.39
633	0.42
634	0.38
635	0.32
636	0.32
637	0.31
638	0.28
639	0.27
640	0.22
641	0.19
642	0.17
643	0.17
644	0.08
645	0.11
646	0.13
647	0.13
648	0.14
649	0.13
650	0.13
651	0.16
652	0.19
653	0.2
654	0.24
655	0.24
656	0.22
657	0.25
658	0.25
659	0.2
660	0.19
661	0.17
662	0.12
663	0.15
664	0.16
665	0.16
666	0.18
667	0.17
668	0.17
669	0.15
670	0.13
671	0.14
672	0.16
673	0.13
674	0.12
675	0.14
676	0.15
677	0.18
678	0.22
679	0.22
680	0.27
681	0.37
682	0.42
683	0.49
684	0.58
685	0.63
686	0.7
687	0.73
688	0.66
689	0.57
690	0.56
691	0.48
692	0.39
693	0.33
694	0.24
695	0.19
696	0.21
697	0.22
698	0.2
699	0.26
700	0.27
701	0.33
702	0.41
703	0.48
704	0.51
705	0.53
706	0.53
707	0.51
708	0.56
709	0.53
710	0.48
711	0.46
712	0.48
713	0.46
714	0.46
715	0.42
716	0.41
717	0.38
718	0.36
719	0.3
720	0.23
721	0.22
722	0.2
723	0.19
724	0.16
725	0.16
726	0.14
727	0.15
728	0.14
729	0.16
730	0.16
731	0.19
732	0.17
733	0.14
734	0.18
735	0.17
736	0.23
737	0.21
738	0.23
739	0.2
740	0.23
741	0.24
742	0.2
743	0.18
744	0.13
745	0.13
746	0.12
747	0.13
748	0.09
749	0.09
750	0.11
751	0.11
752	0.1
753	0.12
754	0.12
755	0.13
756	0.13
757	0.14
758	0.16
759	0.23
760	0.23
761	0.27
762	0.27
763	0.27
764	0.28
765	0.32
766	0.31
767	0.24
768	0.24
769	0.2
770	0.2
771	0.19
772	0.19
773	0.15
774	0.12
775	0.12
776	0.12
777	0.1
778	0.11
779	0.11
780	0.13
781	0.11
782	0.12
783	0.11
784	0.11
785	0.12
786	0.12
787	0.13
788	0.12
789	0.13
790	0.14
791	0.14
792	0.15
793	0.15
794	0.14
795	0.14
796	0.15
797	0.15
798	0.13
799	0.13
800	0.13
801	0.13
802	0.15
803	0.13
804	0.13
805	0.15
806	0.17
807	0.18
808	0.17
809	0.17
810	0.15
811	0.17
812	0.18
813	0.18
814	0.18
815	0.18
816	0.18
817	0.24
818	0.23
819	0.21
820	0.21
821	0.2
822	0.19
823	0.19
824	0.18
825	0.15
826	0.15
827	0.18
828	0.19
829	0.19
830	0.22
831	0.22
832	0.25
833	0.24
834	0.23
835	0.21
836	0.18
837	0.18
838	0.17
839	0.18
840	0.18
841	0.17
842	0.17
843	0.19
844	0.19
845	0.17
846	0.15
847	0.14
848	0.13
849	0.14
850	0.16

A0A1Y2XC89

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer