Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179IKB3

Protein Details
Accession A0A179IKB3    Localization Confidence High Confidence Score 20.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
104-127ARAWLMGQKKRQKKIDKARQLEEEHydrophilic
278-304DASEIKIKKPKKKKTKQTRQRQQDEDDBasic
347-370LAAQRRSALKKRKKSRPEDLAKALHydrophilic
589-613KDSGNMKKQKLLKKIEDEKRREAQSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
65-79KRRREQKAAAARRAR
283-294KIKKPKKKKTKQ
351-363RRSALKKRKKSRP
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 14.333, mito_nucl 10.166, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045347  HIND  
IPR005011  SNU66/SART1  
Gene Ontology GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF19252  HIND  
PF03343  SART-1  
Amino Acid Sequences MDAATIEETNRIRVSLGMKPLPVPGADAPSDSDSEPEEDRGSTLETREAEGGDNYKKYLDGEANKRRREQKAAAARRAREMAQRNRVLDGKGLGEADTDDPADARAWLMGQKKRQKKIDKARQLEEELAAAEAAAAAAVQYTSKDLAGIKVGHDMSSFLDSDEQILTLKDSAIDGNDEDDELENVAVREQESLKDKLDLIKKRPGYNPLDGEDAGSILAQYDEEISGKKRKLFTLDETGMNAELADILSAPAEKKKQHNVSLDDIVGDGVRPSSDYLDASEIKIKKPKKKKTKQTRQRQQDEDDLIPLEPVIEGKDEMEVDSKDNFRKKPKTVSDTFVDDDDLQASLAAQRRSALKKRKKSRPEDLAKALKEQDGEEATQAQQEGGLVIGAVSEFVSALSVPEEEVRRPKQSPSPKKDSKPEGDGEDYVMEDLDEAQVHHTEDPELQPQDQAEEEEKMVGSGMGAALSLLRERGLVEESKGDEEYAAFKRRQDFLAKKKQLEDELDEETRRQRERDRASGKLDRMSVREREDYARQQNQWRDQQQARRMAELFEANYKPSVAIKHRDEHGRDLDIKDAFKHLSHHFHGKDSGNMKKQKLLKKIEDEKRREAQSMFDASQSAGMSRATLQQLKKRKEAGVRLG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.25
3 0.33
4 0.33
5 0.33
6 0.34
7 0.36
8 0.34
9 0.3
10 0.27
11 0.21
12 0.23
13 0.22
14 0.22
15 0.23
16 0.23
17 0.25
18 0.2
19 0.19
20 0.16
21 0.18
22 0.19
23 0.18
24 0.17
25 0.16
26 0.16
27 0.17
28 0.18
29 0.17
30 0.17
31 0.2
32 0.2
33 0.22
34 0.22
35 0.22
36 0.2
37 0.2
38 0.24
39 0.24
40 0.24
41 0.22
42 0.22
43 0.22
44 0.21
45 0.24
46 0.27
47 0.31
48 0.41
49 0.51
50 0.6
51 0.64
52 0.7
53 0.74
54 0.72
55 0.72
56 0.68
57 0.68
58 0.7
59 0.76
60 0.78
61 0.77
62 0.73
63 0.69
64 0.66
65 0.58
66 0.55
67 0.55
68 0.55
69 0.58
70 0.62
71 0.57
72 0.58
73 0.58
74 0.51
75 0.44
76 0.36
77 0.27
78 0.23
79 0.22
80 0.18
81 0.15
82 0.16
83 0.13
84 0.12
85 0.11
86 0.09
87 0.08
88 0.09
89 0.09
90 0.08
91 0.07
92 0.06
93 0.07
94 0.12
95 0.19
96 0.24
97 0.33
98 0.43
99 0.52
100 0.6
101 0.69
102 0.75
103 0.78
104 0.84
105 0.86
106 0.87
107 0.85
108 0.83
109 0.8
110 0.73
111 0.64
112 0.53
113 0.43
114 0.32
115 0.25
116 0.18
117 0.12
118 0.08
119 0.05
120 0.04
121 0.03
122 0.02
123 0.02
124 0.02
125 0.02
126 0.03
127 0.03
128 0.05
129 0.06
130 0.06
131 0.07
132 0.08
133 0.09
134 0.13
135 0.14
136 0.13
137 0.18
138 0.18
139 0.17
140 0.17
141 0.16
142 0.14
143 0.15
144 0.15
145 0.1
146 0.11
147 0.1
148 0.12
149 0.11
150 0.1
151 0.08
152 0.08
153 0.09
154 0.08
155 0.08
156 0.07
157 0.07
158 0.07
159 0.07
160 0.08
161 0.07
162 0.08
163 0.08
164 0.08
165 0.08
166 0.08
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.06
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.08
176 0.08
177 0.12
178 0.16
179 0.18
180 0.19
181 0.2
182 0.2
183 0.25
184 0.33
185 0.36
186 0.36
187 0.43
188 0.46
189 0.5
190 0.54
191 0.55
192 0.53
193 0.53
194 0.51
195 0.45
196 0.44
197 0.38
198 0.34
199 0.26
200 0.21
201 0.13
202 0.09
203 0.07
204 0.04
205 0.04
206 0.03
207 0.03
208 0.04
209 0.04
210 0.05
211 0.06
212 0.09
213 0.15
214 0.18
215 0.22
216 0.24
217 0.25
218 0.31
219 0.34
220 0.37
221 0.4
222 0.41
223 0.38
224 0.36
225 0.34
226 0.29
227 0.24
228 0.18
229 0.08
230 0.06
231 0.04
232 0.04
233 0.03
234 0.03
235 0.03
236 0.04
237 0.04
238 0.07
239 0.1
240 0.14
241 0.18
242 0.28
243 0.34
244 0.41
245 0.47
246 0.49
247 0.51
248 0.5
249 0.45
250 0.36
251 0.29
252 0.22
253 0.16
254 0.11
255 0.06
256 0.04
257 0.03
258 0.04
259 0.04
260 0.05
261 0.06
262 0.06
263 0.07
264 0.11
265 0.11
266 0.12
267 0.17
268 0.17
269 0.18
270 0.24
271 0.29
272 0.35
273 0.45
274 0.55
275 0.61
276 0.71
277 0.8
278 0.85
279 0.91
280 0.92
281 0.94
282 0.94
283 0.93
284 0.91
285 0.85
286 0.77
287 0.73
288 0.66
289 0.55
290 0.45
291 0.35
292 0.26
293 0.2
294 0.16
295 0.09
296 0.05
297 0.05
298 0.04
299 0.04
300 0.04
301 0.04
302 0.05
303 0.05
304 0.06
305 0.07
306 0.07
307 0.08
308 0.1
309 0.12
310 0.15
311 0.19
312 0.22
313 0.28
314 0.35
315 0.37
316 0.45
317 0.52
318 0.55
319 0.55
320 0.56
321 0.5
322 0.48
323 0.44
324 0.35
325 0.28
326 0.21
327 0.17
328 0.13
329 0.1
330 0.06
331 0.05
332 0.05
333 0.06
334 0.11
335 0.11
336 0.1
337 0.11
338 0.16
339 0.22
340 0.3
341 0.38
342 0.44
343 0.54
344 0.64
345 0.74
346 0.79
347 0.82
348 0.84
349 0.84
350 0.83
351 0.8
352 0.78
353 0.75
354 0.65
355 0.59
356 0.5
357 0.41
358 0.33
359 0.26
360 0.2
361 0.14
362 0.14
363 0.12
364 0.12
365 0.11
366 0.11
367 0.11
368 0.08
369 0.06
370 0.06
371 0.05
372 0.04
373 0.04
374 0.03
375 0.02
376 0.03
377 0.02
378 0.02
379 0.02
380 0.02
381 0.02
382 0.02
383 0.03
384 0.03
385 0.03
386 0.04
387 0.04
388 0.04
389 0.07
390 0.08
391 0.1
392 0.17
393 0.2
394 0.23
395 0.25
396 0.28
397 0.35
398 0.45
399 0.54
400 0.56
401 0.64
402 0.68
403 0.73
404 0.78
405 0.78
406 0.72
407 0.67
408 0.61
409 0.55
410 0.49
411 0.43
412 0.36
413 0.27
414 0.22
415 0.16
416 0.13
417 0.08
418 0.05
419 0.05
420 0.04
421 0.04
422 0.04
423 0.05
424 0.07
425 0.08
426 0.08
427 0.08
428 0.09
429 0.1
430 0.12
431 0.17
432 0.17
433 0.16
434 0.17
435 0.17
436 0.17
437 0.16
438 0.16
439 0.12
440 0.12
441 0.12
442 0.12
443 0.12
444 0.1
445 0.1
446 0.08
447 0.06
448 0.05
449 0.04
450 0.03
451 0.03
452 0.03
453 0.03
454 0.04
455 0.04
456 0.04
457 0.04
458 0.04
459 0.05
460 0.07
461 0.09
462 0.1
463 0.11
464 0.14
465 0.15
466 0.17
467 0.17
468 0.15
469 0.13
470 0.12
471 0.16
472 0.18
473 0.21
474 0.2
475 0.23
476 0.28
477 0.31
478 0.33
479 0.38
480 0.43
481 0.48
482 0.59
483 0.63
484 0.61
485 0.64
486 0.65
487 0.6
488 0.55
489 0.5
490 0.42
491 0.41
492 0.41
493 0.36
494 0.33
495 0.33
496 0.34
497 0.31
498 0.3
499 0.32
500 0.39
501 0.47
502 0.56
503 0.58
504 0.58
505 0.64
506 0.69
507 0.65
508 0.6
509 0.56
510 0.48
511 0.46
512 0.46
513 0.43
514 0.41
515 0.41
516 0.39
517 0.39
518 0.43
519 0.48
520 0.52
521 0.54
522 0.53
523 0.58
524 0.64
525 0.67
526 0.7
527 0.65
528 0.64
529 0.64
530 0.69
531 0.69
532 0.7
533 0.63
534 0.58
535 0.55
536 0.48
537 0.44
538 0.39
539 0.32
540 0.3
541 0.29
542 0.25
543 0.25
544 0.24
545 0.21
546 0.2
547 0.25
548 0.24
549 0.32
550 0.36
551 0.42
552 0.48
553 0.55
554 0.56
555 0.57
556 0.56
557 0.53
558 0.51
559 0.46
560 0.46
561 0.41
562 0.38
563 0.32
564 0.3
565 0.26
566 0.24
567 0.27
568 0.27
569 0.32
570 0.36
571 0.44
572 0.43
573 0.45
574 0.5
575 0.47
576 0.49
577 0.47
578 0.52
579 0.51
580 0.57
581 0.55
582 0.56
583 0.62
584 0.64
585 0.67
586 0.68
587 0.68
588 0.72
589 0.8
590 0.83
591 0.85
592 0.84
593 0.82
594 0.81
595 0.75
596 0.68
597 0.58
598 0.54
599 0.51
600 0.5
601 0.43
602 0.36
603 0.33
604 0.29
605 0.31
606 0.26
607 0.19
608 0.13
609 0.12
610 0.12
611 0.13
612 0.19
613 0.21
614 0.27
615 0.33
616 0.4
617 0.51
618 0.56
619 0.62
620 0.62
621 0.64
622 0.67