Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179I2T1

Protein Details
Accession A0A179I2T1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
379-409LSPTGPPSPPKPVQRKKKPVNIFMKRPVKRTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
347-358RAKLPAPARKLP
368-368K
370-374APGKG
455-477PPKPVQRKKKPVNIFMKRPVKRT
Subcellular Location(s) mito 19, nucl 5, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010684  RNA_pol_II_trans_fac_SIII_A  
Gene Ontology GO:0070449  C:elongin complex  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF06881  Elongin_A  
Amino Acid Sequences MAPKSLSEMASAVATKNIKSIISVGDLHFSALQGETRDLWLRLIENDFPLEFRANAYKPKSDDKWYKVWSKYKAEHDCSLQASEEQLRAALMGLQKNKEQNTSKIVEGRFLPQDAVRAKKRNTGPKDNTSSVFSFGAGSRTKTLTGAGVMRKARREAKEVRNIQGSLSRSVAAPIRVLERQHLKAPPAAMVREARIAAQPALRTPEAEKREQQKQEMEKRRSATMAAYAQRATYITDSEDENSDEDETSPPRKAIKXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXPTAPPATAAAAAARAPPVPAASRAKLPAPARKLPSSGGSMFQRKFAPGKGLAKASPPKPLSIPNTAAGSAAAQASPTGKKRTNSEANLDAGPSTPTKRPALVSPKQSPLPTQPNSAEEIRASLSPTGPPSPPKPVQRKKKPVNIFMKRPVKRT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.16
3 0.19
4 0.19
5 0.17
6 0.17
7 0.19
8 0.17
9 0.2
10 0.22
11 0.2
12 0.22
13 0.22
14 0.22
15 0.2
16 0.17
17 0.14
18 0.13
19 0.14
20 0.12
21 0.14
22 0.13
23 0.16
24 0.2
25 0.19
26 0.19
27 0.19
28 0.19
29 0.2
30 0.23
31 0.22
32 0.2
33 0.22
34 0.21
35 0.2
36 0.2
37 0.19
38 0.15
39 0.16
40 0.21
41 0.22
42 0.29
43 0.33
44 0.36
45 0.38
46 0.46
47 0.48
48 0.51
49 0.58
50 0.56
51 0.62
52 0.62
53 0.67
54 0.67
55 0.71
56 0.7
57 0.69
58 0.71
59 0.72
60 0.75
61 0.72
62 0.68
63 0.65
64 0.61
65 0.54
66 0.48
67 0.38
68 0.29
69 0.26
70 0.24
71 0.2
72 0.16
73 0.13
74 0.12
75 0.11
76 0.11
77 0.11
78 0.12
79 0.16
80 0.2
81 0.22
82 0.25
83 0.3
84 0.31
85 0.36
86 0.36
87 0.36
88 0.39
89 0.39
90 0.39
91 0.4
92 0.39
93 0.35
94 0.32
95 0.32
96 0.27
97 0.25
98 0.24
99 0.18
100 0.24
101 0.24
102 0.3
103 0.32
104 0.37
105 0.38
106 0.45
107 0.52
108 0.57
109 0.61
110 0.66
111 0.67
112 0.69
113 0.75
114 0.7
115 0.64
116 0.58
117 0.5
118 0.42
119 0.34
120 0.25
121 0.18
122 0.16
123 0.19
124 0.16
125 0.16
126 0.16
127 0.17
128 0.17
129 0.16
130 0.16
131 0.12
132 0.13
133 0.16
134 0.15
135 0.2
136 0.23
137 0.25
138 0.26
139 0.3
140 0.35
141 0.33
142 0.38
143 0.42
144 0.48
145 0.56
146 0.58
147 0.57
148 0.55
149 0.52
150 0.46
151 0.42
152 0.34
153 0.26
154 0.23
155 0.2
156 0.15
157 0.16
158 0.17
159 0.13
160 0.12
161 0.11
162 0.13
163 0.14
164 0.14
165 0.17
166 0.21
167 0.22
168 0.26
169 0.27
170 0.25
171 0.26
172 0.26
173 0.26
174 0.22
175 0.2
176 0.18
177 0.17
178 0.17
179 0.16
180 0.16
181 0.12
182 0.11
183 0.12
184 0.11
185 0.12
186 0.11
187 0.1
188 0.14
189 0.13
190 0.13
191 0.14
192 0.21
193 0.22
194 0.25
195 0.29
196 0.31
197 0.39
198 0.41
199 0.42
200 0.41
201 0.46
202 0.54
203 0.59
204 0.58
205 0.55
206 0.54
207 0.53
208 0.46
209 0.39
210 0.29
211 0.24
212 0.25
213 0.22
214 0.21
215 0.2
216 0.19
217 0.19
218 0.18
219 0.14
220 0.09
221 0.08
222 0.07
223 0.08
224 0.09
225 0.1
226 0.11
227 0.1
228 0.1
229 0.1
230 0.09
231 0.09
232 0.09
233 0.09
234 0.11
235 0.12
236 0.13
237 0.13
238 0.16
239 0.2
240 0.23
241 0.3
242 0.37
243 0.44
244 0.49
245 0.56
246 0.53
247 0.5
248 0.47
249 0.4
250 0.31
251 0.22
252 0.16
253 0.1
254 0.09
255 0.09
256 0.08
257 0.06
258 0.06
259 0.06
260 0.07
261 0.08
262 0.13
263 0.17
264 0.18
265 0.21
266 0.23
267 0.24
268 0.29
269 0.31
270 0.34
271 0.36
272 0.41
273 0.43
274 0.44
275 0.44
276 0.4
277 0.39
278 0.36
279 0.31
280 0.29
281 0.3
282 0.35
283 0.33
284 0.35
285 0.33
286 0.3
287 0.31
288 0.28
289 0.29
290 0.29
291 0.33
292 0.34
293 0.36
294 0.34
295 0.39
296 0.44
297 0.4
298 0.42
299 0.38
300 0.37
301 0.36
302 0.42
303 0.4
304 0.4
305 0.42
306 0.35
307 0.36
308 0.35
309 0.32
310 0.25
311 0.2
312 0.14
313 0.11
314 0.09
315 0.06
316 0.07
317 0.09
318 0.14
319 0.18
320 0.24
321 0.28
322 0.32
323 0.37
324 0.46
325 0.54
326 0.54
327 0.55
328 0.53
329 0.51
330 0.48
331 0.44
332 0.34
333 0.25
334 0.22
335 0.18
336 0.17
337 0.18
338 0.22
339 0.24
340 0.26
341 0.28
342 0.36
343 0.44
344 0.48
345 0.53
346 0.55
347 0.59
348 0.61
349 0.6
350 0.55
351 0.54
352 0.56
353 0.5
354 0.5
355 0.46
356 0.44
357 0.48
358 0.45
359 0.38
360 0.28
361 0.27
362 0.23
363 0.2
364 0.2
365 0.18
366 0.18
367 0.19
368 0.22
369 0.24
370 0.25
371 0.3
372 0.32
373 0.4
374 0.46
375 0.54
376 0.61
377 0.68
378 0.76
379 0.82
380 0.89
381 0.9
382 0.92
383 0.92
384 0.91
385 0.92
386 0.91
387 0.9
388 0.89
389 0.9