Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179IJB3

Protein Details
Accession A0A179IJB3    Localization Confidence Low Confidence Score 5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
670-689GSLTPWSRRHPRKALPGPVHHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 11, cyto 7.5, extr 6, cyto_nucl 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR046351  UTP4  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0030686  C:90S preribosome  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
Amino Acid Sequences MTAIDIHRCRFVPFQSSAINAVAFSHPRTRDSKHAAVARLAVGRANGDIEIWNAAAGIWHQELVIRGGKDRSIDGLVWVNEPDQDFGEGRILIGKSRLFSIGYTSTVTEWDLETGKPKRHASGQHGDIWCIAAQPALSEERGSSVADSPGSNKLVAGTIDGELVMYSVEDDDLRFQRILVKSPTKKAQMVSIIFQSRKVVIVGCSDSTIRAYDITKGHMLRRMTLGSDLVGGSKNIIVWSVKCLPNGNIVSGDSTGQVCIWDGKTYTQMQRLQSHKQDVLSLAISADGSTIMSGGMDRRTVLYKQNSGAGQRWGKVWGRRYHEHDVKAMATFEHARISVVVSGGPDSNLVVVPLKEMGRENHRMVSSLPQQPPLISASKARFMVSWWDREIHIWLLQQSASDLTKLNGDSDFDIDQNRRLLKTIVVKGDSNISSASINADGTLLVASTSTDVKAFALEHSNPTKPADVTLSSIELPERITKLGASRVQISSNGSWLCFVQDGSRVVIASITADSGSHTISASRHLRRLHRSIPKHILNGGLGSYERNVTHISFSPDSKLLAVADLAGYIDTWVLRVPGDGATDGHANGNKDDDASASDSDSSDDHVGSTATSEAGRWVRNPNAKLMPKLPAAPSVLAFSDSIPGQGDAEDYTLAAVTSSWSVVAFNVLQGSLTPWSRRHPRKALPGPVHDLLDLAKGAFWQGPRFWIYGVSFLFMLDMSQDLPTPDKEAGDQLVSGTKRKRTNATSGAGGRMEREGLKPQQIRKYAANKWEDVDVDGPSLIGENDNDSDDDVIDATDSELTQLRSATAASGPQAGGAEDESGRKKWWITYKYRPVLGVVSFSGQEGFEVAMVERPTWDIDMQDSYYTGEEWERR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.37
3 0.38
4 0.38
5 0.34
6 0.3
7 0.22
8 0.22
9 0.21
10 0.2
11 0.21
12 0.26
13 0.27
14 0.31
15 0.36
16 0.39
17 0.45
18 0.52
19 0.56
20 0.56
21 0.61
22 0.59
23 0.57
24 0.54
25 0.48
26 0.42
27 0.35
28 0.28
29 0.22
30 0.2
31 0.18
32 0.16
33 0.12
34 0.1
35 0.11
36 0.1
37 0.11
38 0.1
39 0.09
40 0.08
41 0.08
42 0.08
43 0.08
44 0.1
45 0.1
46 0.1
47 0.1
48 0.11
49 0.13
50 0.16
51 0.21
52 0.18
53 0.2
54 0.22
55 0.24
56 0.24
57 0.24
58 0.23
59 0.21
60 0.2
61 0.21
62 0.25
63 0.24
64 0.24
65 0.24
66 0.2
67 0.2
68 0.2
69 0.19
70 0.13
71 0.15
72 0.14
73 0.15
74 0.18
75 0.15
76 0.14
77 0.18
78 0.17
79 0.16
80 0.19
81 0.19
82 0.17
83 0.19
84 0.21
85 0.16
86 0.16
87 0.21
88 0.2
89 0.2
90 0.21
91 0.2
92 0.19
93 0.19
94 0.19
95 0.14
96 0.11
97 0.12
98 0.12
99 0.12
100 0.2
101 0.24
102 0.3
103 0.37
104 0.38
105 0.4
106 0.46
107 0.53
108 0.54
109 0.59
110 0.57
111 0.58
112 0.57
113 0.53
114 0.46
115 0.4
116 0.31
117 0.22
118 0.17
119 0.09
120 0.08
121 0.08
122 0.1
123 0.1
124 0.1
125 0.1
126 0.1
127 0.12
128 0.13
129 0.13
130 0.12
131 0.12
132 0.14
133 0.15
134 0.15
135 0.15
136 0.19
137 0.2
138 0.19
139 0.16
140 0.16
141 0.17
142 0.16
143 0.15
144 0.12
145 0.11
146 0.11
147 0.11
148 0.1
149 0.07
150 0.07
151 0.05
152 0.04
153 0.03
154 0.03
155 0.04
156 0.04
157 0.05
158 0.1
159 0.12
160 0.14
161 0.14
162 0.14
163 0.21
164 0.23
165 0.28
166 0.31
167 0.4
168 0.43
169 0.5
170 0.57
171 0.55
172 0.56
173 0.52
174 0.51
175 0.48
176 0.46
177 0.42
178 0.41
179 0.42
180 0.39
181 0.39
182 0.34
183 0.26
184 0.25
185 0.22
186 0.17
187 0.13
188 0.17
189 0.18
190 0.17
191 0.18
192 0.17
193 0.17
194 0.16
195 0.15
196 0.11
197 0.11
198 0.11
199 0.15
200 0.16
201 0.19
202 0.23
203 0.24
204 0.26
205 0.3
206 0.3
207 0.27
208 0.29
209 0.27
210 0.23
211 0.23
212 0.21
213 0.16
214 0.16
215 0.14
216 0.11
217 0.1
218 0.09
219 0.08
220 0.08
221 0.08
222 0.07
223 0.08
224 0.08
225 0.08
226 0.14
227 0.2
228 0.22
229 0.23
230 0.25
231 0.25
232 0.32
233 0.33
234 0.28
235 0.22
236 0.21
237 0.21
238 0.19
239 0.18
240 0.11
241 0.1
242 0.09
243 0.08
244 0.08
245 0.06
246 0.08
247 0.09
248 0.09
249 0.1
250 0.11
251 0.15
252 0.19
253 0.23
254 0.28
255 0.31
256 0.34
257 0.41
258 0.44
259 0.48
260 0.49
261 0.51
262 0.46
263 0.42
264 0.4
265 0.33
266 0.31
267 0.24
268 0.18
269 0.12
270 0.1
271 0.1
272 0.08
273 0.07
274 0.04
275 0.04
276 0.03
277 0.03
278 0.03
279 0.03
280 0.03
281 0.05
282 0.06
283 0.06
284 0.06
285 0.08
286 0.11
287 0.13
288 0.19
289 0.24
290 0.26
291 0.27
292 0.31
293 0.31
294 0.31
295 0.32
296 0.32
297 0.29
298 0.26
299 0.26
300 0.26
301 0.29
302 0.32
303 0.37
304 0.38
305 0.42
306 0.47
307 0.53
308 0.59
309 0.61
310 0.58
311 0.51
312 0.46
313 0.4
314 0.35
315 0.28
316 0.18
317 0.14
318 0.13
319 0.12
320 0.11
321 0.1
322 0.1
323 0.09
324 0.11
325 0.1
326 0.08
327 0.08
328 0.07
329 0.08
330 0.08
331 0.07
332 0.06
333 0.05
334 0.06
335 0.05
336 0.05
337 0.05
338 0.05
339 0.06
340 0.08
341 0.08
342 0.08
343 0.1
344 0.12
345 0.17
346 0.22
347 0.23
348 0.25
349 0.26
350 0.26
351 0.25
352 0.29
353 0.3
354 0.33
355 0.33
356 0.31
357 0.31
358 0.3
359 0.3
360 0.26
361 0.21
362 0.14
363 0.17
364 0.16
365 0.2
366 0.21
367 0.2
368 0.17
369 0.16
370 0.25
371 0.23
372 0.25
373 0.22
374 0.23
375 0.22
376 0.23
377 0.24
378 0.16
379 0.16
380 0.13
381 0.13
382 0.12
383 0.12
384 0.11
385 0.09
386 0.1
387 0.08
388 0.07
389 0.07
390 0.07
391 0.09
392 0.09
393 0.1
394 0.08
395 0.09
396 0.09
397 0.1
398 0.1
399 0.09
400 0.1
401 0.1
402 0.12
403 0.14
404 0.14
405 0.13
406 0.13
407 0.14
408 0.16
409 0.22
410 0.25
411 0.25
412 0.26
413 0.26
414 0.25
415 0.29
416 0.25
417 0.18
418 0.14
419 0.11
420 0.1
421 0.1
422 0.1
423 0.06
424 0.06
425 0.05
426 0.05
427 0.04
428 0.04
429 0.04
430 0.03
431 0.03
432 0.03
433 0.03
434 0.04
435 0.04
436 0.04
437 0.04
438 0.05
439 0.05
440 0.05
441 0.06
442 0.06
443 0.09
444 0.1
445 0.13
446 0.16
447 0.17
448 0.17
449 0.18
450 0.18
451 0.15
452 0.15
453 0.14
454 0.12
455 0.13
456 0.13
457 0.13
458 0.12
459 0.12
460 0.11
461 0.09
462 0.09
463 0.09
464 0.09
465 0.08
466 0.08
467 0.08
468 0.1
469 0.15
470 0.17
471 0.16
472 0.19
473 0.19
474 0.2
475 0.21
476 0.22
477 0.16
478 0.17
479 0.16
480 0.13
481 0.12
482 0.12
483 0.12
484 0.09
485 0.09
486 0.07
487 0.11
488 0.12
489 0.12
490 0.13
491 0.12
492 0.11
493 0.11
494 0.1
495 0.06
496 0.05
497 0.04
498 0.04
499 0.04
500 0.05
501 0.05
502 0.05
503 0.05
504 0.05
505 0.06
506 0.06
507 0.13
508 0.19
509 0.21
510 0.25
511 0.3
512 0.36
513 0.41
514 0.48
515 0.51
516 0.54
517 0.57
518 0.6
519 0.65
520 0.63
521 0.58
522 0.53
523 0.45
524 0.36
525 0.31
526 0.23
527 0.15
528 0.11
529 0.09
530 0.09
531 0.08
532 0.08
533 0.08
534 0.1
535 0.09
536 0.12
537 0.14
538 0.19
539 0.19
540 0.19
541 0.21
542 0.2
543 0.2
544 0.18
545 0.16
546 0.11
547 0.09
548 0.09
549 0.06
550 0.05
551 0.05
552 0.05
553 0.04
554 0.04
555 0.03
556 0.04
557 0.03
558 0.03
559 0.04
560 0.04
561 0.04
562 0.04
563 0.05
564 0.06
565 0.07
566 0.08
567 0.08
568 0.09
569 0.1
570 0.1
571 0.11
572 0.12
573 0.12
574 0.11
575 0.13
576 0.11
577 0.11
578 0.11
579 0.09
580 0.09
581 0.11
582 0.11
583 0.1
584 0.1
585 0.1
586 0.11
587 0.1
588 0.1
589 0.09
590 0.09
591 0.08
592 0.08
593 0.08
594 0.07
595 0.08
596 0.06
597 0.06
598 0.06
599 0.06
600 0.09
601 0.12
602 0.13
603 0.14
604 0.18
605 0.25
606 0.32
607 0.33
608 0.36
609 0.42
610 0.45
611 0.46
612 0.44
613 0.42
614 0.38
615 0.4
616 0.34
617 0.29
618 0.28
619 0.25
620 0.23
621 0.2
622 0.18
623 0.16
624 0.15
625 0.11
626 0.11
627 0.1
628 0.1
629 0.09
630 0.09
631 0.08
632 0.08
633 0.08
634 0.07
635 0.08
636 0.07
637 0.06
638 0.06
639 0.05
640 0.05
641 0.05
642 0.04
643 0.04
644 0.05
645 0.05
646 0.05
647 0.05
648 0.05
649 0.05
650 0.08
651 0.07
652 0.07
653 0.07
654 0.07
655 0.07
656 0.07
657 0.09
658 0.1
659 0.12
660 0.14
661 0.16
662 0.24
663 0.35
664 0.43
665 0.51
666 0.57
667 0.63
668 0.72
669 0.8
670 0.82
671 0.8
672 0.77
673 0.74
674 0.67
675 0.59
676 0.48
677 0.38
678 0.28
679 0.22
680 0.17
681 0.1
682 0.08
683 0.07
684 0.08
685 0.1
686 0.11
687 0.12
688 0.13
689 0.16
690 0.19
691 0.19
692 0.19
693 0.21
694 0.2
695 0.23
696 0.22
697 0.2
698 0.18
699 0.17
700 0.17
701 0.12
702 0.11
703 0.06
704 0.06
705 0.05
706 0.06
707 0.07
708 0.07
709 0.09
710 0.1
711 0.13
712 0.13
713 0.13
714 0.13
715 0.15
716 0.16
717 0.15
718 0.14
719 0.12
720 0.18
721 0.18
722 0.23
723 0.26
724 0.31
725 0.37
726 0.41
727 0.49
728 0.48
729 0.57
730 0.6
731 0.58
732 0.58
733 0.54
734 0.53
735 0.46
736 0.41
737 0.32
738 0.25
739 0.24
740 0.18
741 0.18
742 0.22
743 0.25
744 0.34
745 0.39
746 0.45
747 0.52
748 0.55
749 0.58
750 0.59
751 0.63
752 0.61
753 0.64
754 0.62
755 0.55
756 0.51
757 0.5
758 0.42
759 0.36
760 0.3
761 0.22
762 0.18
763 0.16
764 0.14
765 0.11
766 0.1
767 0.08
768 0.07
769 0.07
770 0.09
771 0.1
772 0.11
773 0.12
774 0.12
775 0.12
776 0.11
777 0.11
778 0.08
779 0.07
780 0.06
781 0.06
782 0.06
783 0.07
784 0.06
785 0.07
786 0.1
787 0.11
788 0.12
789 0.13
790 0.12
791 0.12
792 0.13
793 0.13
794 0.11
795 0.12
796 0.12
797 0.15
798 0.14
799 0.14
800 0.14
801 0.13
802 0.12
803 0.11
804 0.12
805 0.1
806 0.15
807 0.17
808 0.19
809 0.2
810 0.22
811 0.23
812 0.28
813 0.37
814 0.42
815 0.48
816 0.58
817 0.67
818 0.73
819 0.74
820 0.67
821 0.6
822 0.56
823 0.48
824 0.41
825 0.31
826 0.26
827 0.23
828 0.22
829 0.2
830 0.15
831 0.13
832 0.1
833 0.09
834 0.07
835 0.08
836 0.08
837 0.12
838 0.13
839 0.13
840 0.13
841 0.14
842 0.15
843 0.16
844 0.16
845 0.13
846 0.15
847 0.19
848 0.2
849 0.2
850 0.19
851 0.18
852 0.18
853 0.17
854 0.16