Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179IB47

Protein Details
Accession A0A179IB47    Localization Confidence High Confidence Score 22.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
129-152DDEDDKKKPQAKKQKTKTAAKEDSBasic
223-245EEQAKSKAKAKKTKAKKDSSDSSHydrophilic
258-283PMPTTTTTTKRKRNEPFSRIKKDIKVHydrophilic
307-329ITKGKGFTKAKNKMKKGSFRGGMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
135-143KKPQAKKQK
227-239KSKAKAKKTKAKK
315-322KAKNKMKK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 14, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MSAPPSWLFSNNNTTIPATANPTATPDHRSTETMGKKTSTAVAAPAAPALLMDMVESDDESSDSSDSSDSSDDEDVDDSSSSSSSDEEVVVVEVKPAVTKSLKRKAPESDSDDSDDSSDSGSASSDSSDDEDDKKKPQAKKQKTKTAAKEDSSDDEMDVDSSDSDSDSDSSDSDSESDSDSDSDSDSSDSEVEKAAAVALPDSDSSDSESDSDSDSDSSSSEEEQAKSKAKAKKTKAKKDSSDSSVTLDRASPVPLPPMPTTTTTTKRKRNEPFSRIKKDIKVDPKFASNEWVPMDYSQRAHEDLIITKGKGFTKAKNKMKKGSFRGGMIDITEKKAVYFED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.31
3 0.31
4 0.28
5 0.25
6 0.24
7 0.24
8 0.22
9 0.24
10 0.26
11 0.25
12 0.29
13 0.25
14 0.28
15 0.29
16 0.3
17 0.32
18 0.38
19 0.44
20 0.43
21 0.44
22 0.4
23 0.38
24 0.39
25 0.38
26 0.3
27 0.23
28 0.2
29 0.2
30 0.19
31 0.18
32 0.16
33 0.13
34 0.1
35 0.09
36 0.07
37 0.05
38 0.04
39 0.04
40 0.04
41 0.05
42 0.05
43 0.06
44 0.05
45 0.05
46 0.06
47 0.06
48 0.07
49 0.07
50 0.07
51 0.07
52 0.07
53 0.07
54 0.09
55 0.09
56 0.08
57 0.11
58 0.11
59 0.11
60 0.11
61 0.12
62 0.11
63 0.11
64 0.1
65 0.08
66 0.08
67 0.08
68 0.07
69 0.07
70 0.07
71 0.07
72 0.07
73 0.07
74 0.07
75 0.07
76 0.07
77 0.08
78 0.08
79 0.07
80 0.07
81 0.06
82 0.07
83 0.07
84 0.09
85 0.12
86 0.18
87 0.28
88 0.37
89 0.42
90 0.43
91 0.48
92 0.52
93 0.56
94 0.58
95 0.55
96 0.5
97 0.48
98 0.49
99 0.45
100 0.37
101 0.3
102 0.23
103 0.16
104 0.12
105 0.09
106 0.06
107 0.06
108 0.06
109 0.05
110 0.05
111 0.05
112 0.05
113 0.05
114 0.06
115 0.07
116 0.08
117 0.11
118 0.14
119 0.15
120 0.18
121 0.24
122 0.29
123 0.34
124 0.43
125 0.51
126 0.59
127 0.68
128 0.75
129 0.8
130 0.83
131 0.86
132 0.85
133 0.85
134 0.8
135 0.71
136 0.64
137 0.55
138 0.5
139 0.42
140 0.34
141 0.23
142 0.17
143 0.15
144 0.11
145 0.1
146 0.07
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.04
152 0.04
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.06
158 0.06
159 0.06
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.07
164 0.07
165 0.06
166 0.07
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.06
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.06
179 0.06
180 0.06
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.04
186 0.04
187 0.05
188 0.05
189 0.06
190 0.06
191 0.06
192 0.08
193 0.08
194 0.08
195 0.08
196 0.09
197 0.08
198 0.09
199 0.09
200 0.08
201 0.08
202 0.08
203 0.08
204 0.07
205 0.08
206 0.07
207 0.07
208 0.1
209 0.12
210 0.13
211 0.15
212 0.19
213 0.22
214 0.24
215 0.31
216 0.33
217 0.4
218 0.49
219 0.55
220 0.62
221 0.69
222 0.78
223 0.8
224 0.84
225 0.83
226 0.82
227 0.8
228 0.75
229 0.7
230 0.59
231 0.53
232 0.47
233 0.39
234 0.32
235 0.25
236 0.2
237 0.16
238 0.17
239 0.14
240 0.12
241 0.16
242 0.17
243 0.2
244 0.2
245 0.22
246 0.22
247 0.24
248 0.27
249 0.3
250 0.37
251 0.43
252 0.51
253 0.57
254 0.62
255 0.69
256 0.75
257 0.8
258 0.82
259 0.82
260 0.84
261 0.85
262 0.87
263 0.84
264 0.81
265 0.76
266 0.72
267 0.72
268 0.72
269 0.68
270 0.65
271 0.61
272 0.61
273 0.57
274 0.51
275 0.48
276 0.38
277 0.36
278 0.31
279 0.3
280 0.24
281 0.23
282 0.27
283 0.24
284 0.24
285 0.23
286 0.23
287 0.24
288 0.23
289 0.24
290 0.22
291 0.22
292 0.27
293 0.27
294 0.24
295 0.25
296 0.28
297 0.28
298 0.33
299 0.34
300 0.37
301 0.45
302 0.56
303 0.64
304 0.7
305 0.76
306 0.78
307 0.84
308 0.85
309 0.83
310 0.83
311 0.78
312 0.7
313 0.67
314 0.6
315 0.52
316 0.43
317 0.42
318 0.34
319 0.32
320 0.32
321 0.27
322 0.24