Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179IER4

Protein Details
Accession A0A179IER4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
238-260VTGGSGKKQRERERKVKQTIDFDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
104-127APREGARGGAGARARGGRGGRRPR
245-252KQRERERK
268-305RPRGGARGGARGGRGGDRGDRGGDRGDRGDRGDRGDRG
Subcellular Location(s) cyto 11, cyto_nucl 10.5, nucl 8, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
IPR019084  Stm1-like_N  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF09598  Stm1_N  
Amino Acid Sequences MESTRDRGPSHTRQLLTCSNTTIILTTHRLSGNDEDGDAKPNAPVKTVDKATTHTTKRGVEPQAPVRAGGATGNRRGGPGGSEGAFRDRNAGASRNQARSADEAPREGARGGAGARARGGRGGRRPRDQDDRHSRQNRDTTAKQTAQGWGSNEGNAELKDEQAGDAIAEGDKNAAPDADTEPAEPEDKSVSYSDYLAQQAEKKLALGGHKVREANEGSKLDKKWAGAKALENEEEEYVTGGSGKKQRERERKVKQTIDFDPRFVESERPRGGARGGARGGRGGDRGDRGGDRGDRGDRGDRGDRGDR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.6
3 0.56
4 0.48
5 0.41
6 0.34
7 0.33
8 0.31
9 0.26
10 0.19
11 0.19
12 0.21
13 0.19
14 0.22
15 0.23
16 0.24
17 0.26
18 0.29
19 0.29
20 0.26
21 0.25
22 0.24
23 0.23
24 0.26
25 0.23
26 0.19
27 0.17
28 0.22
29 0.22
30 0.21
31 0.24
32 0.23
33 0.31
34 0.34
35 0.35
36 0.31
37 0.34
38 0.39
39 0.44
40 0.44
41 0.41
42 0.42
43 0.42
44 0.45
45 0.5
46 0.48
47 0.44
48 0.48
49 0.5
50 0.53
51 0.5
52 0.45
53 0.38
54 0.33
55 0.28
56 0.24
57 0.23
58 0.2
59 0.22
60 0.25
61 0.24
62 0.25
63 0.25
64 0.22
65 0.17
66 0.16
67 0.15
68 0.13
69 0.14
70 0.15
71 0.19
72 0.19
73 0.18
74 0.19
75 0.16
76 0.18
77 0.2
78 0.22
79 0.19
80 0.28
81 0.34
82 0.33
83 0.35
84 0.33
85 0.32
86 0.33
87 0.34
88 0.31
89 0.26
90 0.24
91 0.24
92 0.23
93 0.23
94 0.19
95 0.16
96 0.1
97 0.09
98 0.08
99 0.1
100 0.1
101 0.09
102 0.11
103 0.11
104 0.11
105 0.13
106 0.15
107 0.17
108 0.25
109 0.35
110 0.4
111 0.47
112 0.51
113 0.54
114 0.63
115 0.61
116 0.62
117 0.63
118 0.64
119 0.68
120 0.7
121 0.67
122 0.62
123 0.65
124 0.59
125 0.55
126 0.51
127 0.46
128 0.46
129 0.45
130 0.4
131 0.35
132 0.33
133 0.27
134 0.26
135 0.22
136 0.18
137 0.17
138 0.17
139 0.15
140 0.13
141 0.12
142 0.1
143 0.11
144 0.08
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.03
156 0.03
157 0.04
158 0.04
159 0.05
160 0.04
161 0.04
162 0.04
163 0.06
164 0.08
165 0.09
166 0.09
167 0.09
168 0.1
169 0.11
170 0.12
171 0.11
172 0.1
173 0.09
174 0.09
175 0.1
176 0.1
177 0.1
178 0.1
179 0.11
180 0.11
181 0.12
182 0.12
183 0.11
184 0.12
185 0.14
186 0.14
187 0.15
188 0.14
189 0.12
190 0.12
191 0.14
192 0.15
193 0.19
194 0.22
195 0.24
196 0.28
197 0.28
198 0.28
199 0.3
200 0.31
201 0.27
202 0.28
203 0.27
204 0.26
205 0.31
206 0.31
207 0.31
208 0.3
209 0.29
210 0.3
211 0.32
212 0.33
213 0.3
214 0.34
215 0.36
216 0.38
217 0.38
218 0.32
219 0.3
220 0.26
221 0.23
222 0.19
223 0.13
224 0.09
225 0.08
226 0.08
227 0.07
228 0.12
229 0.17
230 0.23
231 0.29
232 0.38
233 0.49
234 0.59
235 0.68
236 0.74
237 0.8
238 0.85
239 0.88
240 0.87
241 0.82
242 0.79
243 0.78
244 0.78
245 0.68
246 0.59
247 0.51
248 0.44
249 0.41
250 0.34
251 0.34
252 0.29
253 0.36
254 0.38
255 0.38
256 0.37
257 0.36
258 0.36
259 0.34
260 0.32
261 0.31
262 0.31
263 0.31
264 0.31
265 0.31
266 0.32
267 0.29
268 0.28
269 0.22
270 0.24
271 0.25
272 0.26
273 0.28
274 0.27
275 0.26
276 0.31
277 0.31
278 0.3
279 0.31
280 0.34
281 0.32
282 0.36
283 0.41
284 0.37
285 0.41
286 0.45
287 0.42