Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179IHP3

Protein Details
Accession A0A179IHP3    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
550-575AESAEKVTTKRRRCRLPKSYEAGKAPHydrophilic
578-608ERWLPLRDRSSYRPKNKKGKKKAAESTQGGVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
544-600MKKRAAAESAEKVTTKRRRCRLPKSYEAGKAPDPERWLPLRDRSSYRPKNKKGKKKA
628-644SGGSGGGAAKKKKKGKK
Subcellular Location(s) cyto 11.5cyto_nucl 11.5, nucl 10.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013699  Signal_recog_part_SRP72_RNA-bd  
IPR026270  SRP72  
IPR031545  SRP_TPR-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005783  C:endoplasmic reticulum  
GO:0005786  C:signal recognition particle, endoplasmic reticulum targeting  
GO:0008312  F:7S RNA binding  
GO:0006614  P:SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF08492  SRP72  
PF17004  SRP_TPR_like  
Amino Acid Sequences MPQDPAAALSSLLRGASIVDHDEVLMAASLAIPADKNDILARHTKLVALLKLDRFDDALRFLAESGSALESKCVIEKAYALYKSGELEGATSTLKKAGLRERSLQHIAAQVAYRAERFGEAGQIYEELLDGNAGEEENDLKINLKAVHAQAEWSGLSAPSEPLRSMPDSFELCYNIACANIARGELGEASKLLQRAAMLCKASDYLGEEDKEAELRPIWLQQAYVYARNGKVEEALELYSSIGSLSDDEEDFIIVARQNRLSIEAKPTNPYLLHRQMVVGGIKAEKAKLFSYQSSRERQNSCLLDLDVHKVSGVQEKTQTFLQQSEQPSNSASVNAMAVVNAAAVADGLDDRAAVRKLQALAIKRPLDVGLLLTIVQLQLRLSRKGAALSLLQAFFTRLEKEGTDAARDVRFSPGLVALAVSLMRAQGHENSAKAEFVTAAKHWTKRPTASSGSLLRESGIELMRSSNPEDLKLAGSAFEKLFAEHKGSHIASAGLVASLAAVDTDKTSQHMSELPPVESLVKGINVKSLLRAGVVAAPSRPNMKKRAAAESAEKVTTKRRRCRLPKSYEAGKAPDPERWLPLRDRSSYRPKNKKGKKKAAESTQGGVVKEEETLGLVGGGGVKVEKSGGSGGGAAKKKKKGKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.08
3 0.09
4 0.11
5 0.12
6 0.12
7 0.12
8 0.12
9 0.13
10 0.12
11 0.11
12 0.09
13 0.06
14 0.05
15 0.05
16 0.05
17 0.05
18 0.05
19 0.05
20 0.06
21 0.1
22 0.1
23 0.12
24 0.14
25 0.16
26 0.19
27 0.25
28 0.28
29 0.28
30 0.28
31 0.28
32 0.3
33 0.34
34 0.34
35 0.33
36 0.36
37 0.35
38 0.37
39 0.37
40 0.33
41 0.29
42 0.27
43 0.24
44 0.21
45 0.19
46 0.17
47 0.17
48 0.17
49 0.15
50 0.13
51 0.11
52 0.11
53 0.11
54 0.11
55 0.11
56 0.11
57 0.12
58 0.12
59 0.14
60 0.13
61 0.11
62 0.11
63 0.13
64 0.18
65 0.24
66 0.24
67 0.24
68 0.25
69 0.25
70 0.25
71 0.24
72 0.2
73 0.12
74 0.13
75 0.12
76 0.12
77 0.12
78 0.11
79 0.1
80 0.11
81 0.13
82 0.14
83 0.18
84 0.26
85 0.34
86 0.39
87 0.46
88 0.47
89 0.53
90 0.55
91 0.5
92 0.43
93 0.39
94 0.35
95 0.3
96 0.27
97 0.21
98 0.2
99 0.2
100 0.18
101 0.13
102 0.13
103 0.11
104 0.12
105 0.12
106 0.15
107 0.14
108 0.14
109 0.14
110 0.14
111 0.13
112 0.12
113 0.11
114 0.06
115 0.05
116 0.05
117 0.04
118 0.04
119 0.04
120 0.04
121 0.04
122 0.05
123 0.06
124 0.06
125 0.07
126 0.07
127 0.08
128 0.08
129 0.11
130 0.12
131 0.13
132 0.16
133 0.17
134 0.21
135 0.2
136 0.21
137 0.18
138 0.19
139 0.17
140 0.14
141 0.13
142 0.08
143 0.09
144 0.09
145 0.1
146 0.1
147 0.11
148 0.11
149 0.12
150 0.15
151 0.17
152 0.17
153 0.18
154 0.2
155 0.21
156 0.21
157 0.22
158 0.2
159 0.18
160 0.17
161 0.16
162 0.12
163 0.1
164 0.1
165 0.08
166 0.08
167 0.08
168 0.08
169 0.07
170 0.07
171 0.07
172 0.08
173 0.08
174 0.07
175 0.06
176 0.08
177 0.1
178 0.1
179 0.09
180 0.09
181 0.09
182 0.12
183 0.15
184 0.18
185 0.16
186 0.16
187 0.17
188 0.17
189 0.16
190 0.14
191 0.13
192 0.12
193 0.14
194 0.15
195 0.15
196 0.15
197 0.15
198 0.15
199 0.12
200 0.1
201 0.08
202 0.09
203 0.09
204 0.11
205 0.12
206 0.11
207 0.11
208 0.11
209 0.17
210 0.18
211 0.2
212 0.19
213 0.21
214 0.21
215 0.22
216 0.22
217 0.16
218 0.16
219 0.13
220 0.13
221 0.11
222 0.11
223 0.09
224 0.09
225 0.09
226 0.07
227 0.06
228 0.05
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.05
233 0.06
234 0.06
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.06
239 0.05
240 0.06
241 0.06
242 0.08
243 0.09
244 0.1
245 0.11
246 0.11
247 0.15
248 0.16
249 0.16
250 0.23
251 0.26
252 0.27
253 0.29
254 0.29
255 0.27
256 0.26
257 0.26
258 0.26
259 0.26
260 0.26
261 0.24
262 0.23
263 0.22
264 0.24
265 0.22
266 0.14
267 0.1
268 0.09
269 0.1
270 0.11
271 0.1
272 0.08
273 0.1
274 0.1
275 0.13
276 0.15
277 0.17
278 0.22
279 0.28
280 0.33
281 0.37
282 0.4
283 0.43
284 0.42
285 0.42
286 0.44
287 0.38
288 0.34
289 0.3
290 0.26
291 0.22
292 0.21
293 0.22
294 0.14
295 0.13
296 0.12
297 0.1
298 0.11
299 0.15
300 0.15
301 0.13
302 0.17
303 0.17
304 0.19
305 0.19
306 0.19
307 0.14
308 0.15
309 0.16
310 0.17
311 0.19
312 0.21
313 0.21
314 0.2
315 0.2
316 0.2
317 0.18
318 0.13
319 0.11
320 0.08
321 0.07
322 0.07
323 0.06
324 0.05
325 0.04
326 0.04
327 0.04
328 0.03
329 0.03
330 0.02
331 0.02
332 0.02
333 0.02
334 0.02
335 0.02
336 0.02
337 0.02
338 0.03
339 0.05
340 0.06
341 0.06
342 0.07
343 0.1
344 0.1
345 0.14
346 0.17
347 0.18
348 0.22
349 0.29
350 0.29
351 0.26
352 0.26
353 0.23
354 0.2
355 0.17
356 0.14
357 0.07
358 0.06
359 0.06
360 0.05
361 0.05
362 0.05
363 0.05
364 0.04
365 0.04
366 0.09
367 0.12
368 0.13
369 0.14
370 0.16
371 0.17
372 0.18
373 0.18
374 0.15
375 0.13
376 0.13
377 0.15
378 0.13
379 0.12
380 0.11
381 0.11
382 0.1
383 0.11
384 0.1
385 0.09
386 0.1
387 0.1
388 0.12
389 0.15
390 0.15
391 0.15
392 0.15
393 0.16
394 0.16
395 0.16
396 0.15
397 0.14
398 0.14
399 0.12
400 0.12
401 0.11
402 0.1
403 0.1
404 0.09
405 0.06
406 0.06
407 0.06
408 0.05
409 0.04
410 0.04
411 0.04
412 0.04
413 0.06
414 0.08
415 0.11
416 0.13
417 0.13
418 0.15
419 0.16
420 0.15
421 0.14
422 0.12
423 0.1
424 0.09
425 0.11
426 0.09
427 0.15
428 0.18
429 0.22
430 0.25
431 0.3
432 0.34
433 0.37
434 0.4
435 0.41
436 0.42
437 0.42
438 0.44
439 0.43
440 0.42
441 0.39
442 0.34
443 0.28
444 0.24
445 0.21
446 0.18
447 0.14
448 0.11
449 0.1
450 0.13
451 0.14
452 0.15
453 0.16
454 0.18
455 0.17
456 0.17
457 0.18
458 0.17
459 0.17
460 0.16
461 0.14
462 0.11
463 0.12
464 0.13
465 0.12
466 0.13
467 0.11
468 0.12
469 0.14
470 0.13
471 0.17
472 0.15
473 0.16
474 0.21
475 0.21
476 0.2
477 0.19
478 0.18
479 0.14
480 0.14
481 0.13
482 0.06
483 0.06
484 0.05
485 0.04
486 0.04
487 0.03
488 0.03
489 0.03
490 0.03
491 0.04
492 0.06
493 0.06
494 0.08
495 0.1
496 0.1
497 0.11
498 0.15
499 0.16
500 0.23
501 0.26
502 0.25
503 0.24
504 0.25
505 0.24
506 0.2
507 0.19
508 0.12
509 0.13
510 0.13
511 0.13
512 0.16
513 0.17
514 0.18
515 0.19
516 0.19
517 0.16
518 0.15
519 0.15
520 0.12
521 0.14
522 0.15
523 0.14
524 0.14
525 0.15
526 0.16
527 0.24
528 0.28
529 0.29
530 0.34
531 0.4
532 0.45
533 0.47
534 0.55
535 0.52
536 0.51
537 0.53
538 0.54
539 0.51
540 0.46
541 0.43
542 0.35
543 0.41
544 0.46
545 0.49
546 0.52
547 0.57
548 0.66
549 0.76
550 0.86
551 0.87
552 0.88
553 0.88
554 0.86
555 0.86
556 0.82
557 0.76
558 0.7
559 0.63
560 0.61
561 0.52
562 0.48
563 0.45
564 0.39
565 0.41
566 0.39
567 0.4
568 0.39
569 0.47
570 0.49
571 0.5
572 0.54
573 0.57
574 0.64
575 0.7
576 0.75
577 0.77
578 0.81
579 0.86
580 0.9
581 0.93
582 0.93
583 0.94
584 0.93
585 0.92
586 0.92
587 0.91
588 0.91
589 0.84
590 0.76
591 0.72
592 0.65
593 0.55
594 0.46
595 0.36
596 0.27
597 0.22
598 0.19
599 0.12
600 0.1
601 0.09
602 0.08
603 0.07
604 0.06
605 0.06
606 0.07
607 0.06
608 0.05
609 0.06
610 0.05
611 0.06
612 0.07
613 0.06
614 0.07
615 0.09
616 0.09
617 0.1
618 0.13
619 0.16
620 0.24
621 0.3
622 0.36
623 0.42
624 0.51