Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A8NY47

Protein Details
Accession A8NY47    Localization Confidence High Confidence Score 20
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
100-130IAKPAEQKDKEKKERKAKRRPGRRGGKAVPGBasic
149-176SAEGEDKPKRKKRKSPRKKKAAAPPPEGBasic
193-216ADAPKKAPRARKPKAPRTPRPAGEBasic
252-273VNSARIVRRRWGQPRKSKGYGFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
106-127QKDKEKKERKAKRRPGRRGGKA
154-172DKPKRKKRKSPRKKKAAAP
196-213PKKAPRARKPKAPRTPRP
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 12.833, cyto 10, mito_nucl 8.666
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG cci:CC1G_01254  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSDAQAAQVTENGAPAVEKTQEAPGFKVFAGNLAYTTTDEGLKAFFEPVQADILSASVILRGTRSAGYGFVALATEEAAQKAVDALNKKELDGRQVIVEIAKPAEQKDKEKKERKAKRRPGRRGGKAVPGEVTEAEANGEAPKPEAAASAEGEDKPKRKKRKSPRKKKAAAPPPEGEAGTEGTPAAADGTTDADAPKKAPRARKPKAPRTPRPAGEDPVGEPSKTMLFVANLGFAVDDEALAALFTDAGITVNSARIVRRRWGQPRKSKGYGFVDVGSEENQKKAIAALDGKDIAGRAIAVKVAVNTPEEKEEEAKPAEGTAPAATPAAAEAAAPAAAAAAPGPAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.1
3 0.11
4 0.11
5 0.11
6 0.13
7 0.2
8 0.24
9 0.26
10 0.27
11 0.27
12 0.27
13 0.27
14 0.28
15 0.2
16 0.2
17 0.21
18 0.19
19 0.17
20 0.16
21 0.17
22 0.14
23 0.16
24 0.13
25 0.11
26 0.11
27 0.11
28 0.1
29 0.1
30 0.1
31 0.1
32 0.09
33 0.1
34 0.11
35 0.12
36 0.14
37 0.13
38 0.12
39 0.11
40 0.1
41 0.09
42 0.08
43 0.07
44 0.05
45 0.06
46 0.06
47 0.06
48 0.07
49 0.09
50 0.09
51 0.1
52 0.1
53 0.1
54 0.11
55 0.11
56 0.1
57 0.09
58 0.08
59 0.07
60 0.06
61 0.06
62 0.06
63 0.06
64 0.06
65 0.07
66 0.06
67 0.06
68 0.07
69 0.08
70 0.11
71 0.13
72 0.16
73 0.23
74 0.24
75 0.24
76 0.29
77 0.28
78 0.3
79 0.29
80 0.28
81 0.2
82 0.21
83 0.21
84 0.16
85 0.16
86 0.12
87 0.1
88 0.11
89 0.11
90 0.12
91 0.2
92 0.22
93 0.3
94 0.39
95 0.49
96 0.58
97 0.67
98 0.75
99 0.78
100 0.86
101 0.88
102 0.89
103 0.9
104 0.9
105 0.91
106 0.92
107 0.92
108 0.92
109 0.9
110 0.88
111 0.81
112 0.8
113 0.71
114 0.61
115 0.51
116 0.41
117 0.34
118 0.24
119 0.21
120 0.12
121 0.1
122 0.09
123 0.07
124 0.07
125 0.06
126 0.07
127 0.05
128 0.06
129 0.06
130 0.06
131 0.06
132 0.06
133 0.07
134 0.07
135 0.08
136 0.08
137 0.1
138 0.1
139 0.12
140 0.14
141 0.18
142 0.26
143 0.34
144 0.43
145 0.5
146 0.61
147 0.7
148 0.79
149 0.86
150 0.89
151 0.92
152 0.92
153 0.92
154 0.89
155 0.89
156 0.87
157 0.84
158 0.78
159 0.68
160 0.59
161 0.52
162 0.44
163 0.33
164 0.24
165 0.17
166 0.11
167 0.09
168 0.07
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.04
173 0.03
174 0.03
175 0.03
176 0.04
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.06
181 0.07
182 0.08
183 0.11
184 0.17
185 0.21
186 0.29
187 0.39
188 0.49
189 0.54
190 0.64
191 0.71
192 0.76
193 0.82
194 0.84
195 0.84
196 0.81
197 0.85
198 0.79
199 0.76
200 0.69
201 0.62
202 0.54
203 0.45
204 0.38
205 0.36
206 0.32
207 0.24
208 0.2
209 0.17
210 0.16
211 0.15
212 0.14
213 0.08
214 0.07
215 0.09
216 0.09
217 0.09
218 0.08
219 0.08
220 0.07
221 0.06
222 0.07
223 0.05
224 0.05
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.03
231 0.02
232 0.02
233 0.02
234 0.03
235 0.03
236 0.03
237 0.04
238 0.05
239 0.06
240 0.07
241 0.08
242 0.1
243 0.14
244 0.18
245 0.23
246 0.3
247 0.39
248 0.49
249 0.59
250 0.67
251 0.73
252 0.8
253 0.83
254 0.82
255 0.75
256 0.73
257 0.69
258 0.63
259 0.55
260 0.46
261 0.38
262 0.32
263 0.31
264 0.25
265 0.23
266 0.19
267 0.17
268 0.17
269 0.16
270 0.15
271 0.15
272 0.15
273 0.14
274 0.16
275 0.17
276 0.2
277 0.21
278 0.2
279 0.19
280 0.18
281 0.14
282 0.11
283 0.1
284 0.07
285 0.07
286 0.07
287 0.07
288 0.08
289 0.09
290 0.11
291 0.12
292 0.13
293 0.15
294 0.16
295 0.19
296 0.2
297 0.21
298 0.22
299 0.23
300 0.26
301 0.26
302 0.26
303 0.22
304 0.22
305 0.21
306 0.19
307 0.18
308 0.14
309 0.13
310 0.12
311 0.12
312 0.11
313 0.1
314 0.09
315 0.08
316 0.07
317 0.06
318 0.05
319 0.06
320 0.06
321 0.06
322 0.05
323 0.05
324 0.05
325 0.05
326 0.04