FuNGI

A0A179I476

Protein Details

Accession

A0A179I476

Localization Confidence

High

Confidence Score

25.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-38	MSAPPPKNTNGPPKRKPNPLRPMRPKPRPNPLVTAKRP	Hydrophilic
181-206	APVAKEVVPKKPKKQKEERAVFNRGP	Hydrophilic
482-501	TTPQGKHKHGDKKSKSLKRA	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
10-48	NGPPKRKPNPLRPMRPKPRPNPLVTAKRPGQKPSPKPDA
186-208	EVVPKKPKKQKEERAVFNRGPRT
472-478	KPKAAGA
481-544	STTPQGKHKHGDKKSKSLKRAGSPALSESSGNESSRKKMKKTAATAPGSRSGTPIPGAARKKKL

Subcellular Location(s)

nucl 22, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSAPPPKNTNGPPKRKPNPLRPMRPKPRPNPLVTAKRPGQKPSPKPDAPGPSRLNAPNGSRQSLEELRRQYGGWSEPPPPYQYSDIPIMTTKKALLDGIRHHLMKLSSTKADGKPIDPTDQEEFARPVTLHRRDARLPPPGRVVKEEAPQRAPVDEQEREKLAQIKAEKEAQRAINQAKIAPVAKEVVPKKPKKQKEERAVFNRGPRTAAAKKESDLRYEEALPWHLEDVDGKNVWVGSYVAALSESSVAFMIDGAVFRMVPLEKWYRFTAKPHFQAFTLDQAEEYMNRKVDVGRWVMKDEEKKSGQEDLQATRRMLYGAGMIKTESDTFKAASRAEKMEHDEIDMSGDEFQDDDEAPMFERNDDEDTKDTKDRIRREQLGANLFGDGDEGQVDQELQQQLREELDRQKFGKTTRKALIKRDREDIYESDDSEDNPWSSSSDDDSSDEENEDKKDDEKEDGENKDDKDDKGKPKAAGAQGSTTPQGKHKHGDKKSKSLKRAGSPALSESSGNESSRKKMKKTAATAPGSRSGTPIPGAARKKKLGAGSTSDGEATAGEMSDGAGPRKKIKLVGSAKGTPSASRAGSPAPAGESTLLWTTRSFVKLKLTAGASPPPSSAGIEPWEILEKIPDGGISIVELIKPFQSRVGIKPGQMAKADWIKLVTRLCEYGPDKLLRKRK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.83
2	0.87
3	0.89
4	0.88
5	0.89
6	0.89
7	0.91
8	0.91
9	0.93
10	0.93
11	0.95
12	0.94
13	0.93
14	0.93
15	0.9
16	0.85
17	0.83
18	0.83
19	0.83
20	0.78
21	0.78
22	0.74
23	0.73
24	0.72
25	0.69
26	0.69
27	0.69
28	0.73
29	0.73
30	0.76
31	0.7
32	0.71
33	0.73
34	0.73
35	0.68
36	0.68
37	0.62
38	0.55
39	0.59
40	0.56
41	0.52
42	0.47
43	0.47
44	0.46
45	0.47
46	0.47
47	0.41
48	0.4
49	0.43
50	0.45
51	0.45
52	0.42
53	0.42
54	0.42
55	0.42
56	0.41
57	0.35
58	0.33
59	0.33
60	0.32
61	0.31
62	0.33
63	0.35
64	0.38
65	0.4
66	0.36
67	0.35
68	0.34
69	0.32
70	0.32
71	0.33
72	0.31
73	0.29
74	0.31
75	0.31
76	0.28
77	0.27
78	0.23
79	0.19
80	0.2
81	0.2
82	0.2
83	0.23
84	0.27
85	0.33
86	0.37
87	0.36
88	0.35
89	0.37
90	0.34
91	0.33
92	0.32
93	0.3
94	0.26
95	0.29
96	0.36
97	0.34
98	0.41
99	0.38
100	0.35
101	0.38
102	0.39
103	0.41
104	0.35
105	0.37
106	0.34
107	0.35
108	0.34
109	0.29
110	0.27
111	0.23
112	0.25
113	0.2
114	0.22
115	0.28
116	0.33
117	0.38
118	0.41
119	0.47
120	0.48
121	0.56
122	0.58
123	0.58
124	0.54
125	0.51
126	0.56
127	0.55
128	0.54
129	0.5
130	0.49
131	0.44
132	0.49
133	0.52
134	0.47
135	0.44
136	0.45
137	0.42
138	0.36
139	0.32
140	0.3
141	0.3
142	0.3
143	0.3
144	0.31
145	0.32
146	0.32
147	0.34
148	0.35
149	0.29
150	0.3
151	0.3
152	0.3
153	0.31
154	0.38
155	0.38
156	0.34
157	0.39
158	0.36
159	0.36
160	0.39
161	0.37
162	0.33
163	0.31
164	0.3
165	0.25
166	0.25
167	0.23
168	0.18
169	0.17
170	0.15
171	0.16
172	0.23
173	0.24
174	0.3
175	0.39
176	0.44
177	0.53
178	0.61
179	0.68
180	0.71
181	0.8
182	0.81
183	0.83
184	0.86
185	0.87
186	0.84
187	0.83
188	0.76
189	0.72
190	0.67
191	0.56
192	0.48
193	0.39
194	0.39
195	0.36
196	0.39
197	0.36
198	0.33
199	0.33
200	0.4
201	0.41
202	0.37
203	0.35
204	0.31
205	0.29
206	0.29
207	0.29
208	0.23
209	0.23
210	0.2
211	0.18
212	0.16
213	0.13
214	0.11
215	0.12
216	0.12
217	0.14
218	0.13
219	0.13
220	0.12
221	0.12
222	0.12
223	0.11
224	0.09
225	0.05
226	0.06
227	0.06
228	0.05
229	0.06
230	0.06
231	0.05
232	0.06
233	0.05
234	0.05
235	0.05
236	0.05
237	0.05
238	0.05
239	0.05
240	0.04
241	0.04
242	0.04
243	0.04
244	0.04
245	0.04
246	0.06
247	0.06
248	0.06
249	0.1
250	0.16
251	0.17
252	0.2
253	0.23
254	0.26
255	0.27
256	0.32
257	0.38
258	0.4
259	0.46
260	0.46
261	0.44
262	0.4
263	0.42
264	0.38
265	0.35
266	0.28
267	0.21
268	0.18
269	0.18
270	0.18
271	0.15
272	0.17
273	0.13
274	0.12
275	0.12
276	0.12
277	0.12
278	0.15
279	0.18
280	0.2
281	0.23
282	0.23
283	0.24
284	0.25
285	0.28
286	0.31
287	0.29
288	0.31
289	0.28
290	0.27
291	0.28
292	0.3
293	0.27
294	0.26
295	0.26
296	0.24
297	0.28
298	0.29
299	0.28
300	0.25
301	0.25
302	0.2
303	0.17
304	0.13
305	0.11
306	0.11
307	0.12
308	0.11
309	0.11
310	0.11
311	0.11
312	0.12
313	0.09
314	0.07
315	0.08
316	0.08
317	0.1
318	0.12
319	0.12
320	0.14
321	0.16
322	0.16
323	0.17
324	0.18
325	0.2
326	0.21
327	0.2
328	0.18
329	0.16
330	0.14
331	0.14
332	0.12
333	0.08
334	0.06
335	0.06
336	0.05
337	0.05
338	0.05
339	0.04
340	0.04
341	0.04
342	0.04
343	0.05
344	0.05
345	0.07
346	0.07
347	0.06
348	0.07
349	0.08
350	0.1
351	0.11
352	0.12
353	0.13
354	0.15
355	0.18
356	0.2
357	0.2
358	0.21
359	0.28
360	0.31
361	0.37
362	0.43
363	0.45
364	0.47
365	0.5
366	0.51
367	0.48
368	0.43
369	0.35
370	0.27
371	0.22
372	0.18
373	0.14
374	0.09
375	0.05
376	0.04
377	0.04
378	0.04
379	0.04
380	0.04
381	0.04
382	0.08
383	0.1
384	0.1
385	0.1
386	0.11
387	0.12
388	0.13
389	0.14
390	0.12
391	0.19
392	0.23
393	0.26
394	0.27
395	0.29
396	0.3
397	0.34
398	0.41
399	0.37
400	0.4
401	0.43
402	0.51
403	0.53
404	0.61
405	0.66
406	0.65
407	0.65
408	0.64
409	0.59
410	0.52
411	0.52
412	0.43
413	0.39
414	0.31
415	0.28
416	0.24
417	0.23
418	0.21
419	0.18
420	0.19
421	0.12
422	0.11
423	0.11
424	0.09
425	0.09
426	0.1
427	0.11
428	0.11
429	0.12
430	0.13
431	0.14
432	0.15
433	0.15
434	0.15
435	0.13
436	0.13
437	0.13
438	0.13
439	0.12
440	0.12
441	0.15
442	0.16
443	0.18
444	0.18
445	0.23
446	0.27
447	0.28
448	0.3
449	0.31
450	0.3
451	0.33
452	0.34
453	0.29
454	0.31
455	0.37
456	0.41
457	0.46
458	0.51
459	0.46
460	0.47
461	0.53
462	0.5
463	0.46
464	0.4
465	0.35
466	0.31
467	0.32
468	0.3
469	0.25
470	0.22
471	0.24
472	0.28
473	0.28
474	0.34
475	0.41
476	0.49
477	0.56
478	0.67
479	0.67
480	0.72
481	0.8
482	0.81
483	0.78
484	0.77
485	0.75
486	0.71
487	0.72
488	0.66
489	0.6
490	0.52
491	0.48
492	0.42
493	0.35
494	0.29
495	0.22
496	0.23
497	0.21
498	0.2
499	0.22
500	0.21
501	0.26
502	0.36
503	0.4
504	0.38
505	0.44
506	0.52
507	0.58
508	0.63
509	0.67
510	0.68
511	0.68
512	0.68
513	0.63
514	0.61
515	0.54
516	0.47
517	0.39
518	0.31
519	0.27
520	0.24
521	0.23
522	0.19
523	0.25
524	0.32
525	0.38
526	0.43
527	0.44
528	0.46
529	0.48
530	0.5
531	0.47
532	0.44
533	0.43
534	0.41
535	0.39
536	0.37
537	0.32
538	0.27
539	0.22
540	0.17
541	0.11
542	0.07
543	0.05
544	0.05
545	0.05
546	0.05
547	0.08
548	0.09
549	0.11
550	0.15
551	0.16
552	0.21
553	0.25
554	0.27
555	0.3
556	0.33
557	0.41
558	0.44
559	0.5
560	0.53
561	0.54
562	0.53
563	0.53
564	0.49
565	0.39
566	0.34
567	0.31
568	0.25
569	0.21
570	0.21
571	0.18
572	0.19
573	0.19
574	0.18
575	0.16
576	0.15
577	0.15
578	0.14
579	0.13
580	0.13
581	0.16
582	0.16
583	0.14
584	0.14
585	0.16
586	0.2
587	0.23
588	0.22
589	0.22
590	0.3
591	0.33
592	0.34
593	0.37
594	0.35
595	0.34
596	0.36
597	0.4
598	0.34
599	0.31
600	0.3
601	0.27
602	0.25
603	0.24
604	0.21
605	0.18
606	0.19
607	0.18
608	0.18
609	0.18
610	0.2
611	0.19
612	0.18
613	0.17
614	0.14
615	0.14
616	0.14
617	0.12
618	0.1
619	0.1
620	0.1
621	0.08
622	0.09
623	0.09
624	0.09
625	0.1
626	0.1
627	0.13
628	0.14
629	0.14
630	0.16
631	0.22
632	0.25
633	0.29
634	0.38
635	0.38
636	0.38
637	0.46
638	0.47
639	0.45
640	0.44
641	0.4
642	0.38
643	0.42
644	0.42
645	0.35
646	0.33
647	0.3
648	0.34
649	0.36
650	0.32
651	0.27
652	0.28
653	0.27
654	0.34
655	0.35
656	0.37
657	0.4
658	0.43
659	0.47

A0A179I476

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer