Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179ICH0

Protein Details
Accession A0A179ICH0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
762-781NTSPASNKRRRPSAVKIEDDHydrophilic
794-815GTGNRNKPATPRMPKRVKANPSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029005  LIM-bd/SEUSS  
Pfam View protein in Pfam  
PF01803  LIM_bind  
Amino Acid Sequences MMATSMGPNFQGHPAGMGHPGVSGHPMGPGMNANGGQPGTPGGGMPHQFAGNPMAGGNPGGMNPAMMAAMQQHGGNPNMVAFQHLNPAQQQALQQQQLQNQFSNQPMAQQMRHQQLLAQQQRQALMAQQAMAQNGGMAPNNLGANGMAANGMAANGMPIGMQLTQQQVAQLRQGGQIGPMQHNQQALMARQMAMQQQHAAAQSQLQQGGHNAQQMQMNAQVLQHLQQQQAQQHQGGPNAQVQMAGQQGQQQGQQGQQNQQGQQPGQQGQQPQGQGQPGQQQAQAHAQAQAQAQAQQQAQAQQQAAQQQVQQQAAGQAQQRQQTPAQGSQAGTPAPTGQHTPQQTPAPGPNAAQTPHPPQHQNPGQPPQQGQQQQQQQPGHQPQQQPGHQPQQQPQPQQHPMMAQHMSAVAVQQMAMNNSLLQQQRREHIKAQCLMRLSQLSEQLSGYPGARSRDDLSYWNELVGRFFSRAANFRHTLHASAEGEDTGPRQYDITFPAIARYFHTHFGSGVKSMQLVLGQGTIDRPVGTDSCLVENPKASLIYWFETGSHLVSSGSLRVLFDGEQKMELFEFLATSHEEFIARKQVINAAKPAHNWMKEWHKVNSTDTKQSPEMSKKGKGKQLKSPQREPPEVLNDLPDSAVNRQGVTEAVYQFLEINEVMGQMNPLFNFTHNNPGLGPYSALDQYVSSMNAPQGQMNGQGPQGVPRTPSFSQFPMGASPAAANMNLPGSPHVGSPAPGQIQAPGMQLQQSQQGTSSSGPSANTSPASNKRRRPSAVKIEDDGSGAGTPGSQVNGTGNRNKPATPRMPKRVKANPS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.19
3 0.2
4 0.18
5 0.16
6 0.14
7 0.15
8 0.13
9 0.14
10 0.13
11 0.11
12 0.12
13 0.12
14 0.12
15 0.13
16 0.14
17 0.14
18 0.16
19 0.16
20 0.15
21 0.17
22 0.17
23 0.15
24 0.13
25 0.13
26 0.11
27 0.11
28 0.11
29 0.1
30 0.15
31 0.17
32 0.19
33 0.19
34 0.19
35 0.19
36 0.2
37 0.21
38 0.17
39 0.16
40 0.14
41 0.12
42 0.12
43 0.12
44 0.11
45 0.09
46 0.07
47 0.09
48 0.09
49 0.08
50 0.08
51 0.08
52 0.07
53 0.06
54 0.06
55 0.06
56 0.08
57 0.09
58 0.09
59 0.1
60 0.13
61 0.15
62 0.15
63 0.14
64 0.13
65 0.14
66 0.14
67 0.16
68 0.15
69 0.15
70 0.22
71 0.23
72 0.24
73 0.23
74 0.27
75 0.24
76 0.24
77 0.25
78 0.24
79 0.31
80 0.32
81 0.34
82 0.36
83 0.41
84 0.46
85 0.46
86 0.42
87 0.37
88 0.37
89 0.35
90 0.36
91 0.3
92 0.26
93 0.29
94 0.32
95 0.31
96 0.34
97 0.4
98 0.41
99 0.43
100 0.39
101 0.35
102 0.37
103 0.47
104 0.49
105 0.45
106 0.41
107 0.42
108 0.43
109 0.42
110 0.36
111 0.28
112 0.24
113 0.21
114 0.18
115 0.19
116 0.2
117 0.19
118 0.19
119 0.15
120 0.11
121 0.1
122 0.11
123 0.09
124 0.08
125 0.08
126 0.1
127 0.1
128 0.1
129 0.1
130 0.08
131 0.08
132 0.08
133 0.08
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.04
138 0.04
139 0.03
140 0.03
141 0.03
142 0.03
143 0.03
144 0.03
145 0.03
146 0.04
147 0.05
148 0.06
149 0.08
150 0.1
151 0.11
152 0.12
153 0.14
154 0.16
155 0.17
156 0.19
157 0.2
158 0.19
159 0.2
160 0.21
161 0.19
162 0.17
163 0.19
164 0.19
165 0.2
166 0.21
167 0.21
168 0.23
169 0.23
170 0.22
171 0.22
172 0.22
173 0.19
174 0.2
175 0.19
176 0.17
177 0.17
178 0.2
179 0.2
180 0.19
181 0.19
182 0.16
183 0.16
184 0.18
185 0.18
186 0.16
187 0.13
188 0.13
189 0.17
190 0.18
191 0.2
192 0.18
193 0.17
194 0.18
195 0.22
196 0.22
197 0.19
198 0.17
199 0.17
200 0.2
201 0.2
202 0.2
203 0.18
204 0.17
205 0.15
206 0.15
207 0.14
208 0.11
209 0.13
210 0.16
211 0.17
212 0.17
213 0.2
214 0.24
215 0.27
216 0.33
217 0.33
218 0.29
219 0.3
220 0.31
221 0.31
222 0.29
223 0.27
224 0.24
225 0.22
226 0.21
227 0.17
228 0.15
229 0.14
230 0.14
231 0.13
232 0.1
233 0.14
234 0.15
235 0.16
236 0.17
237 0.17
238 0.17
239 0.2
240 0.24
241 0.23
242 0.26
243 0.31
244 0.34
245 0.34
246 0.35
247 0.35
248 0.31
249 0.33
250 0.33
251 0.29
252 0.27
253 0.28
254 0.27
255 0.27
256 0.31
257 0.27
258 0.23
259 0.23
260 0.22
261 0.21
262 0.22
263 0.25
264 0.23
265 0.24
266 0.25
267 0.23
268 0.23
269 0.27
270 0.27
271 0.2
272 0.2
273 0.19
274 0.2
275 0.2
276 0.21
277 0.17
278 0.18
279 0.18
280 0.19
281 0.19
282 0.18
283 0.19
284 0.2
285 0.21
286 0.21
287 0.2
288 0.19
289 0.21
290 0.22
291 0.22
292 0.19
293 0.19
294 0.21
295 0.25
296 0.22
297 0.2
298 0.17
299 0.18
300 0.18
301 0.19
302 0.16
303 0.17
304 0.21
305 0.25
306 0.25
307 0.26
308 0.26
309 0.28
310 0.29
311 0.27
312 0.26
313 0.24
314 0.23
315 0.22
316 0.22
317 0.18
318 0.14
319 0.12
320 0.1
321 0.08
322 0.09
323 0.1
324 0.1
325 0.16
326 0.18
327 0.19
328 0.23
329 0.25
330 0.25
331 0.24
332 0.26
333 0.23
334 0.22
335 0.2
336 0.19
337 0.18
338 0.18
339 0.18
340 0.18
341 0.22
342 0.25
343 0.28
344 0.28
345 0.27
346 0.36
347 0.4
348 0.42
349 0.41
350 0.44
351 0.45
352 0.45
353 0.45
354 0.38
355 0.4
356 0.39
357 0.37
358 0.38
359 0.42
360 0.44
361 0.5
362 0.49
363 0.43
364 0.45
365 0.48
366 0.46
367 0.42
368 0.4
369 0.38
370 0.45
371 0.46
372 0.43
373 0.42
374 0.45
375 0.44
376 0.45
377 0.44
378 0.46
379 0.49
380 0.48
381 0.47
382 0.47
383 0.46
384 0.45
385 0.41
386 0.33
387 0.3
388 0.3
389 0.27
390 0.19
391 0.15
392 0.14
393 0.13
394 0.1
395 0.09
396 0.05
397 0.04
398 0.04
399 0.05
400 0.05
401 0.06
402 0.06
403 0.06
404 0.06
405 0.07
406 0.11
407 0.12
408 0.13
409 0.16
410 0.17
411 0.23
412 0.28
413 0.3
414 0.32
415 0.35
416 0.4
417 0.42
418 0.42
419 0.39
420 0.35
421 0.33
422 0.29
423 0.25
424 0.2
425 0.18
426 0.2
427 0.18
428 0.18
429 0.17
430 0.15
431 0.15
432 0.14
433 0.11
434 0.08
435 0.1
436 0.11
437 0.12
438 0.13
439 0.15
440 0.16
441 0.17
442 0.19
443 0.21
444 0.23
445 0.23
446 0.21
447 0.2
448 0.18
449 0.17
450 0.16
451 0.13
452 0.1
453 0.11
454 0.12
455 0.13
456 0.18
457 0.21
458 0.25
459 0.25
460 0.26
461 0.3
462 0.29
463 0.28
464 0.25
465 0.26
466 0.21
467 0.21
468 0.2
469 0.15
470 0.14
471 0.13
472 0.12
473 0.08
474 0.07
475 0.06
476 0.06
477 0.07
478 0.08
479 0.11
480 0.13
481 0.13
482 0.13
483 0.15
484 0.16
485 0.16
486 0.17
487 0.19
488 0.19
489 0.21
490 0.22
491 0.2
492 0.19
493 0.21
494 0.2
495 0.16
496 0.15
497 0.11
498 0.11
499 0.1
500 0.1
501 0.08
502 0.07
503 0.06
504 0.06
505 0.06
506 0.06
507 0.06
508 0.06
509 0.06
510 0.06
511 0.06
512 0.07
513 0.07
514 0.08
515 0.1
516 0.1
517 0.12
518 0.14
519 0.15
520 0.14
521 0.15
522 0.14
523 0.14
524 0.13
525 0.11
526 0.12
527 0.13
528 0.14
529 0.15
530 0.14
531 0.13
532 0.14
533 0.14
534 0.13
535 0.1
536 0.08
537 0.07
538 0.08
539 0.08
540 0.08
541 0.08
542 0.08
543 0.07
544 0.08
545 0.09
546 0.08
547 0.12
548 0.14
549 0.13
550 0.14
551 0.14
552 0.14
553 0.13
554 0.13
555 0.09
556 0.07
557 0.06
558 0.05
559 0.07
560 0.07
561 0.08
562 0.08
563 0.08
564 0.09
565 0.09
566 0.11
567 0.18
568 0.18
569 0.18
570 0.18
571 0.24
572 0.27
573 0.29
574 0.31
575 0.28
576 0.29
577 0.29
578 0.36
579 0.36
580 0.33
581 0.32
582 0.34
583 0.39
584 0.44
585 0.47
586 0.45
587 0.43
588 0.44
589 0.48
590 0.52
591 0.48
592 0.49
593 0.47
594 0.47
595 0.44
596 0.44
597 0.46
598 0.42
599 0.45
600 0.42
601 0.49
602 0.52
603 0.57
604 0.63
605 0.65
606 0.64
607 0.67
608 0.73
609 0.76
610 0.76
611 0.77
612 0.78
613 0.78
614 0.77
615 0.69
616 0.65
617 0.61
618 0.55
619 0.47
620 0.4
621 0.32
622 0.28
623 0.25
624 0.19
625 0.14
626 0.13
627 0.17
628 0.15
629 0.15
630 0.14
631 0.15
632 0.14
633 0.15
634 0.18
635 0.14
636 0.15
637 0.14
638 0.15
639 0.14
640 0.14
641 0.12
642 0.08
643 0.08
644 0.07
645 0.08
646 0.08
647 0.07
648 0.08
649 0.07
650 0.09
651 0.08
652 0.09
653 0.09
654 0.1
655 0.15
656 0.16
657 0.26
658 0.25
659 0.26
660 0.24
661 0.26
662 0.28
663 0.23
664 0.22
665 0.12
666 0.15
667 0.15
668 0.15
669 0.12
670 0.1
671 0.11
672 0.12
673 0.13
674 0.1
675 0.11
676 0.12
677 0.16
678 0.16
679 0.15
680 0.15
681 0.16
682 0.19
683 0.19
684 0.19
685 0.16
686 0.18
687 0.17
688 0.21
689 0.22
690 0.2
691 0.21
692 0.21
693 0.28
694 0.26
695 0.31
696 0.3
697 0.29
698 0.3
699 0.29
700 0.28
701 0.24
702 0.25
703 0.2
704 0.17
705 0.15
706 0.14
707 0.14
708 0.12
709 0.1
710 0.09
711 0.1
712 0.1
713 0.1
714 0.1
715 0.11
716 0.12
717 0.12
718 0.14
719 0.14
720 0.15
721 0.17
722 0.21
723 0.2
724 0.21
725 0.21
726 0.2
727 0.21
728 0.22
729 0.22
730 0.17
731 0.17
732 0.18
733 0.18
734 0.18
735 0.23
736 0.22
737 0.21
738 0.2
739 0.21
740 0.21
741 0.21
742 0.23
743 0.17
744 0.18
745 0.18
746 0.2
747 0.21
748 0.22
749 0.22
750 0.21
751 0.27
752 0.36
753 0.44
754 0.5
755 0.57
756 0.63
757 0.71
758 0.76
759 0.77
760 0.77
761 0.79
762 0.8
763 0.77
764 0.71
765 0.64
766 0.58
767 0.5
768 0.4
769 0.3
770 0.2
771 0.14
772 0.11
773 0.09
774 0.08
775 0.08
776 0.1
777 0.08
778 0.09
779 0.14
780 0.21
781 0.26
782 0.34
783 0.38
784 0.42
785 0.44
786 0.46
787 0.48
788 0.51
789 0.56
790 0.59
791 0.64
792 0.69
793 0.77
794 0.81
795 0.85