Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179IJE0

Protein Details
Accession A0A179IJE0    Localization Confidence High Confidence Score 16.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
111-132FDGANKPTTKRNKRSGRGDGVAHydrophilic
476-499AAKALRKSPKKNLPKKATKPAKDTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
478-497KALRKSPKKNLPKKATKPAK
644-666VKAGPRRQEKPAKPAASKPAPPK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12.333, cyto 4, cyto_mito 3.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036279  5-3_exonuclease_C_sf  
IPR041177  GEN1_C  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
IPR006086  XPG-I_dom  
IPR006084  XPG/Rad2  
IPR019974  XPG_CS  
IPR006085  XPG_DNA_repair_N  
IPR037316  Yen1_H3TH  
Gene Ontology GO:0008821  F:crossover junction DNA endonuclease activity  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF18380  GEN1_C  
PF00867  XPG_I  
PF00752  XPG_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00842  XPG_2  
CDD cd09906  H3TH_YEN1  
cd09870  PIN_YEN1  
Amino Acid Sequences MGVQVNNQWLHQSNAAQAMAIYGELGSGQRVSLSKLAADNLKAEGRPLRLAVDVAIWQFQAQAARGALETTAGSCIETNQAISGGTNPAIRTLFYRLVRLLAIPVQPVFVFDGANKPTTKRNKRSGRGDGVANSQAKRLIRLFGLPVLDAPGEAEAECALLQRHGIVDAVLSEDVDTIMFGCTKTLRNWSSEGKTATAPTHVSLYDTAAVANHGLDRQGMVLVALMSGGDYLPDGIPGCGVKVACEAANAGFGTSLCRLKASDTDSIDAWRAELRHELTTNESGHFRTKHKSLHIPDDFPNMEVLRYYTHPVVSPQNNLELIRQKVQQHKNVDLDSLREFTRETFDWDYREGAIKFIRVLGQAMLVQNLSQSRNLIQDISKRRTHFSTDATPELRLSFIPQEVVPIDLSTEVAENINYGRDGLALNSDDEFAPSQGAEAKTPQSFDVTVPELAWVLEDVARHYAPESIHKFDMAEAAKALRKSPKKNLPKKATKPAKDTAMPKGAIDSFFRITKKSNPTADSVAKEKSPSPRRNVPSSSIDAIVQSQELPPLPRPPKTPPQSPSKQTGASAAGSPDKDAARLHMPPRLSQSTVYSEAIVISSSPPGQSSPPSTAPYSQAPASQPAKDAGPLCSQPATYSSPLRVKAGPRRQEKPAKPAASKPAPPKFKQTSLDVFTSRKTARPAFKVPPALPTLTQKQLLDDPFDADSSLLSMSDMVPQEPSSPGKRRSQRGQAASGDGSGSPTPSRRKKLLISCASGTLREIEVDLDEREAVIAQEEAKLAGSKIKGRVTRWSDVSIIDLTEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.29
3 0.25
4 0.23
5 0.2
6 0.16
7 0.14
8 0.11
9 0.05
10 0.05
11 0.05
12 0.06
13 0.06
14 0.06
15 0.06
16 0.09
17 0.09
18 0.13
19 0.16
20 0.16
21 0.18
22 0.2
23 0.23
24 0.24
25 0.25
26 0.23
27 0.24
28 0.26
29 0.24
30 0.25
31 0.27
32 0.26
33 0.28
34 0.27
35 0.25
36 0.23
37 0.23
38 0.21
39 0.19
40 0.18
41 0.16
42 0.16
43 0.14
44 0.13
45 0.13
46 0.14
47 0.14
48 0.12
49 0.15
50 0.14
51 0.15
52 0.15
53 0.16
54 0.14
55 0.12
56 0.11
57 0.08
58 0.09
59 0.09
60 0.09
61 0.08
62 0.1
63 0.12
64 0.12
65 0.12
66 0.11
67 0.11
68 0.11
69 0.11
70 0.12
71 0.11
72 0.13
73 0.14
74 0.14
75 0.16
76 0.17
77 0.17
78 0.18
79 0.21
80 0.27
81 0.27
82 0.3
83 0.28
84 0.29
85 0.29
86 0.27
87 0.24
88 0.21
89 0.21
90 0.19
91 0.18
92 0.18
93 0.17
94 0.17
95 0.17
96 0.12
97 0.11
98 0.1
99 0.17
100 0.18
101 0.21
102 0.21
103 0.21
104 0.3
105 0.41
106 0.51
107 0.53
108 0.62
109 0.69
110 0.78
111 0.86
112 0.87
113 0.85
114 0.78
115 0.74
116 0.66
117 0.61
118 0.58
119 0.51
120 0.41
121 0.34
122 0.33
123 0.29
124 0.3
125 0.26
126 0.23
127 0.21
128 0.23
129 0.24
130 0.24
131 0.24
132 0.2
133 0.19
134 0.18
135 0.16
136 0.13
137 0.12
138 0.09
139 0.08
140 0.08
141 0.08
142 0.05
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.07
151 0.07
152 0.07
153 0.06
154 0.06
155 0.06
156 0.08
157 0.07
158 0.07
159 0.06
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.05
164 0.04
165 0.05
166 0.06
167 0.05
168 0.06
169 0.09
170 0.11
171 0.14
172 0.22
173 0.23
174 0.26
175 0.3
176 0.36
177 0.38
178 0.41
179 0.41
180 0.34
181 0.33
182 0.33
183 0.29
184 0.25
185 0.22
186 0.17
187 0.17
188 0.15
189 0.15
190 0.13
191 0.14
192 0.13
193 0.12
194 0.12
195 0.09
196 0.1
197 0.09
198 0.08
199 0.07
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.04
212 0.04
213 0.03
214 0.03
215 0.03
216 0.03
217 0.03
218 0.04
219 0.04
220 0.05
221 0.05
222 0.05
223 0.06
224 0.06
225 0.07
226 0.08
227 0.08
228 0.07
229 0.08
230 0.1
231 0.09
232 0.09
233 0.1
234 0.08
235 0.1
236 0.09
237 0.08
238 0.07
239 0.07
240 0.09
241 0.11
242 0.12
243 0.1
244 0.11
245 0.11
246 0.13
247 0.17
248 0.18
249 0.22
250 0.22
251 0.24
252 0.23
253 0.24
254 0.24
255 0.2
256 0.16
257 0.12
258 0.1
259 0.1
260 0.14
261 0.15
262 0.17
263 0.18
264 0.18
265 0.2
266 0.24
267 0.24
268 0.21
269 0.2
270 0.18
271 0.22
272 0.25
273 0.24
274 0.25
275 0.28
276 0.32
277 0.37
278 0.44
279 0.44
280 0.51
281 0.52
282 0.51
283 0.48
284 0.49
285 0.44
286 0.35
287 0.33
288 0.22
289 0.18
290 0.15
291 0.14
292 0.1
293 0.11
294 0.13
295 0.12
296 0.12
297 0.13
298 0.15
299 0.22
300 0.22
301 0.24
302 0.22
303 0.24
304 0.24
305 0.24
306 0.25
307 0.24
308 0.23
309 0.24
310 0.27
311 0.29
312 0.37
313 0.43
314 0.47
315 0.46
316 0.49
317 0.49
318 0.46
319 0.44
320 0.34
321 0.3
322 0.25
323 0.22
324 0.17
325 0.13
326 0.13
327 0.11
328 0.15
329 0.13
330 0.16
331 0.19
332 0.2
333 0.21
334 0.22
335 0.22
336 0.19
337 0.23
338 0.18
339 0.15
340 0.15
341 0.14
342 0.13
343 0.13
344 0.13
345 0.09
346 0.1
347 0.08
348 0.08
349 0.09
350 0.09
351 0.09
352 0.08
353 0.07
354 0.07
355 0.09
356 0.09
357 0.08
358 0.08
359 0.09
360 0.11
361 0.11
362 0.12
363 0.12
364 0.18
365 0.26
366 0.3
367 0.33
368 0.32
369 0.34
370 0.35
371 0.38
372 0.34
373 0.31
374 0.34
375 0.33
376 0.35
377 0.34
378 0.32
379 0.27
380 0.24
381 0.2
382 0.12
383 0.11
384 0.09
385 0.08
386 0.09
387 0.08
388 0.09
389 0.09
390 0.1
391 0.08
392 0.06
393 0.06
394 0.05
395 0.06
396 0.05
397 0.05
398 0.04
399 0.04
400 0.04
401 0.04
402 0.04
403 0.05
404 0.04
405 0.04
406 0.04
407 0.04
408 0.05
409 0.05
410 0.06
411 0.06
412 0.07
413 0.07
414 0.08
415 0.07
416 0.08
417 0.08
418 0.06
419 0.06
420 0.05
421 0.05
422 0.08
423 0.09
424 0.09
425 0.1
426 0.12
427 0.13
428 0.13
429 0.13
430 0.11
431 0.11
432 0.11
433 0.13
434 0.13
435 0.13
436 0.12
437 0.12
438 0.11
439 0.1
440 0.09
441 0.06
442 0.04
443 0.05
444 0.05
445 0.06
446 0.08
447 0.08
448 0.08
449 0.08
450 0.11
451 0.1
452 0.18
453 0.21
454 0.22
455 0.22
456 0.22
457 0.22
458 0.19
459 0.25
460 0.18
461 0.15
462 0.11
463 0.13
464 0.15
465 0.15
466 0.17
467 0.19
468 0.25
469 0.31
470 0.4
471 0.49
472 0.58
473 0.68
474 0.76
475 0.79
476 0.83
477 0.85
478 0.87
479 0.87
480 0.82
481 0.78
482 0.73
483 0.68
484 0.63
485 0.58
486 0.53
487 0.5
488 0.43
489 0.37
490 0.34
491 0.29
492 0.25
493 0.24
494 0.2
495 0.15
496 0.18
497 0.19
498 0.18
499 0.19
500 0.26
501 0.33
502 0.37
503 0.4
504 0.38
505 0.42
506 0.46
507 0.47
508 0.42
509 0.37
510 0.32
511 0.27
512 0.26
513 0.26
514 0.31
515 0.37
516 0.41
517 0.45
518 0.53
519 0.57
520 0.63
521 0.64
522 0.59
523 0.54
524 0.53
525 0.47
526 0.38
527 0.33
528 0.26
529 0.23
530 0.18
531 0.13
532 0.09
533 0.07
534 0.08
535 0.09
536 0.1
537 0.12
538 0.21
539 0.24
540 0.27
541 0.31
542 0.37
543 0.46
544 0.51
545 0.57
546 0.53
547 0.6
548 0.65
549 0.65
550 0.64
551 0.58
552 0.53
553 0.45
554 0.44
555 0.36
556 0.29
557 0.26
558 0.21
559 0.19
560 0.18
561 0.18
562 0.17
563 0.14
564 0.14
565 0.14
566 0.15
567 0.17
568 0.21
569 0.23
570 0.24
571 0.24
572 0.25
573 0.33
574 0.33
575 0.3
576 0.26
577 0.29
578 0.3
579 0.33
580 0.32
581 0.25
582 0.21
583 0.2
584 0.19
585 0.15
586 0.09
587 0.06
588 0.07
589 0.07
590 0.07
591 0.08
592 0.09
593 0.1
594 0.13
595 0.16
596 0.2
597 0.24
598 0.27
599 0.28
600 0.29
601 0.31
602 0.31
603 0.3
604 0.26
605 0.25
606 0.24
607 0.29
608 0.3
609 0.28
610 0.26
611 0.24
612 0.24
613 0.24
614 0.24
615 0.2
616 0.23
617 0.22
618 0.23
619 0.23
620 0.22
621 0.19
622 0.21
623 0.23
624 0.2
625 0.22
626 0.26
627 0.3
628 0.32
629 0.34
630 0.34
631 0.37
632 0.45
633 0.53
634 0.56
635 0.59
636 0.62
637 0.68
638 0.75
639 0.74
640 0.72
641 0.72
642 0.7
643 0.66
644 0.68
645 0.69
646 0.66
647 0.67
648 0.67
649 0.67
650 0.67
651 0.66
652 0.69
653 0.66
654 0.66
655 0.63
656 0.6
657 0.59
658 0.55
659 0.58
660 0.51
661 0.46
662 0.39
663 0.42
664 0.37
665 0.33
666 0.34
667 0.37
668 0.42
669 0.48
670 0.54
671 0.54
672 0.61
673 0.65
674 0.6
675 0.58
676 0.53
677 0.48
678 0.43
679 0.42
680 0.41
681 0.38
682 0.41
683 0.35
684 0.34
685 0.37
686 0.37
687 0.35
688 0.3
689 0.27
690 0.25
691 0.25
692 0.22
693 0.16
694 0.14
695 0.1
696 0.09
697 0.07
698 0.06
699 0.06
700 0.06
701 0.11
702 0.12
703 0.12
704 0.13
705 0.13
706 0.15
707 0.17
708 0.21
709 0.24
710 0.32
711 0.37
712 0.46
713 0.54
714 0.61
715 0.68
716 0.75
717 0.77
718 0.76
719 0.77
720 0.71
721 0.67
722 0.59
723 0.5
724 0.4
725 0.3
726 0.26
727 0.19
728 0.17
729 0.14
730 0.19
731 0.29
732 0.37
733 0.44
734 0.46
735 0.53
736 0.61
737 0.69
738 0.74
739 0.72
740 0.7
741 0.65
742 0.67
743 0.61
744 0.53
745 0.43
746 0.35
747 0.27
748 0.21
749 0.19
750 0.13
751 0.13
752 0.15
753 0.15
754 0.13
755 0.12
756 0.12
757 0.12
758 0.11
759 0.09
760 0.08
761 0.08
762 0.08
763 0.1
764 0.1
765 0.1
766 0.11
767 0.12
768 0.11
769 0.16
770 0.19
771 0.23
772 0.29
773 0.37
774 0.41
775 0.43
776 0.53
777 0.55
778 0.6
779 0.58
780 0.55
781 0.48
782 0.44
783 0.44
784 0.35