Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179IHQ3

Protein Details
Accession A0A179IHQ3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
445-469EREWEEARLRRRQKRKDGTIDTNTAHydrophilic
485-507APESEKTMTKKEQKKNQALKAAEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
454-459RRRQKR
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 10.333, mito 8.5, cyto_mito 7.499, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
Amino Acid Sequences MAQPQSQVPARAFSPPQPSPSPAGSQSAYALPPNKRVGAASQPGSPYPASPYAASPGAAGSPPLTAASPPYAQTPSAQQGGYNTPYANGGATPVYNVAEARAAAAAAAAANASISPMQQHQHIPGTMTAYTNATLTPVPHQGQQHMQQNIMGPPQRPAERPTKDYEYDVTDSLAGTGIDLRAEEQYMSELYSNAMEGTQDARTGFAVQPPTGPNSFYGAGPASQPAETIKDQSQKDYEAQAAERAWTESSMRLAASRTQEIADPFLFVAIMHRRADKIAREHHLGLNLELRNNAYAPGKMRYPEQFPTPSVNVKTQPGPDSTTVSTTGSFIPHDAYLIDQLALLSLSTKQRVRELIEDANAIALNRQKTSHGDVPEEWAPAAAPMNKEPLEFVAAPNEDGGTETGDGSLKRPAEQMNGETSAKPAKLPKISSYMTVTMREIARQEREWEEARLRRRQKRKDGTIDTNTAGSRAGSIAPGTPGSVAPESEKTMTKKEQKKNQALKAAEANSHANQNMTSSMFAGLGGKSGLFGKSKRKTYDWMNVGRGGSGASTPVKSAGDGGKALNGMMSASPGNPALTTEGRNRLGTWREDKEKGKNIQLRDWIAVLERDGREGPSLQQAYLRLDSSNPK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.4
3 0.45
4 0.45
5 0.48
6 0.46
7 0.47
8 0.46
9 0.39
10 0.41
11 0.35
12 0.32
13 0.31
14 0.29
15 0.26
16 0.25
17 0.3
18 0.28
19 0.34
20 0.37
21 0.37
22 0.35
23 0.35
24 0.36
25 0.38
26 0.42
27 0.38
28 0.38
29 0.38
30 0.38
31 0.39
32 0.34
33 0.26
34 0.24
35 0.26
36 0.24
37 0.23
38 0.24
39 0.25
40 0.26
41 0.26
42 0.2
43 0.16
44 0.16
45 0.14
46 0.13
47 0.1
48 0.08
49 0.09
50 0.09
51 0.09
52 0.08
53 0.1
54 0.14
55 0.15
56 0.16
57 0.19
58 0.2
59 0.2
60 0.21
61 0.25
62 0.25
63 0.27
64 0.26
65 0.23
66 0.25
67 0.3
68 0.31
69 0.27
70 0.22
71 0.19
72 0.2
73 0.2
74 0.17
75 0.11
76 0.1
77 0.09
78 0.09
79 0.1
80 0.1
81 0.1
82 0.1
83 0.1
84 0.09
85 0.1
86 0.1
87 0.1
88 0.09
89 0.08
90 0.07
91 0.07
92 0.06
93 0.04
94 0.04
95 0.03
96 0.03
97 0.03
98 0.03
99 0.04
100 0.04
101 0.04
102 0.06
103 0.09
104 0.1
105 0.14
106 0.16
107 0.19
108 0.24
109 0.25
110 0.25
111 0.24
112 0.26
113 0.23
114 0.22
115 0.19
116 0.15
117 0.15
118 0.14
119 0.12
120 0.1
121 0.1
122 0.1
123 0.13
124 0.17
125 0.18
126 0.22
127 0.24
128 0.26
129 0.32
130 0.38
131 0.43
132 0.39
133 0.38
134 0.35
135 0.36
136 0.35
137 0.34
138 0.3
139 0.22
140 0.24
141 0.29
142 0.31
143 0.3
144 0.32
145 0.37
146 0.39
147 0.42
148 0.46
149 0.47
150 0.46
151 0.46
152 0.43
153 0.39
154 0.35
155 0.32
156 0.26
157 0.19
158 0.18
159 0.16
160 0.14
161 0.08
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.06
168 0.06
169 0.07
170 0.07
171 0.06
172 0.07
173 0.07
174 0.08
175 0.08
176 0.07
177 0.07
178 0.07
179 0.07
180 0.06
181 0.06
182 0.05
183 0.05
184 0.07
185 0.07
186 0.08
187 0.08
188 0.08
189 0.08
190 0.11
191 0.11
192 0.13
193 0.15
194 0.14
195 0.16
196 0.17
197 0.2
198 0.18
199 0.18
200 0.16
201 0.17
202 0.18
203 0.15
204 0.15
205 0.13
206 0.13
207 0.13
208 0.13
209 0.1
210 0.09
211 0.09
212 0.09
213 0.12
214 0.12
215 0.15
216 0.18
217 0.24
218 0.25
219 0.27
220 0.28
221 0.26
222 0.27
223 0.26
224 0.23
225 0.17
226 0.18
227 0.17
228 0.15
229 0.14
230 0.13
231 0.12
232 0.11
233 0.1
234 0.1
235 0.09
236 0.1
237 0.1
238 0.09
239 0.09
240 0.1
241 0.14
242 0.16
243 0.16
244 0.15
245 0.15
246 0.17
247 0.17
248 0.18
249 0.14
250 0.11
251 0.1
252 0.09
253 0.09
254 0.07
255 0.1
256 0.11
257 0.14
258 0.14
259 0.15
260 0.15
261 0.16
262 0.2
263 0.21
264 0.24
265 0.27
266 0.3
267 0.34
268 0.35
269 0.35
270 0.36
271 0.32
272 0.26
273 0.26
274 0.23
275 0.19
276 0.18
277 0.17
278 0.13
279 0.13
280 0.13
281 0.08
282 0.09
283 0.11
284 0.12
285 0.13
286 0.13
287 0.16
288 0.17
289 0.2
290 0.21
291 0.23
292 0.23
293 0.23
294 0.27
295 0.27
296 0.27
297 0.25
298 0.26
299 0.23
300 0.23
301 0.24
302 0.21
303 0.21
304 0.19
305 0.21
306 0.19
307 0.2
308 0.19
309 0.18
310 0.17
311 0.16
312 0.14
313 0.12
314 0.12
315 0.09
316 0.09
317 0.08
318 0.08
319 0.07
320 0.07
321 0.06
322 0.06
323 0.06
324 0.07
325 0.06
326 0.05
327 0.05
328 0.05
329 0.05
330 0.04
331 0.04
332 0.06
333 0.07
334 0.1
335 0.12
336 0.13
337 0.16
338 0.18
339 0.21
340 0.22
341 0.25
342 0.25
343 0.24
344 0.23
345 0.21
346 0.19
347 0.16
348 0.12
349 0.09
350 0.1
351 0.1
352 0.1
353 0.11
354 0.12
355 0.14
356 0.21
357 0.25
358 0.24
359 0.25
360 0.25
361 0.29
362 0.29
363 0.27
364 0.21
365 0.15
366 0.13
367 0.11
368 0.13
369 0.1
370 0.09
371 0.1
372 0.14
373 0.14
374 0.14
375 0.14
376 0.13
377 0.15
378 0.14
379 0.14
380 0.15
381 0.15
382 0.15
383 0.15
384 0.14
385 0.1
386 0.1
387 0.1
388 0.06
389 0.06
390 0.06
391 0.07
392 0.08
393 0.08
394 0.08
395 0.12
396 0.11
397 0.12
398 0.14
399 0.14
400 0.18
401 0.2
402 0.2
403 0.21
404 0.24
405 0.24
406 0.22
407 0.22
408 0.21
409 0.19
410 0.19
411 0.19
412 0.22
413 0.26
414 0.28
415 0.31
416 0.34
417 0.35
418 0.36
419 0.36
420 0.34
421 0.31
422 0.3
423 0.27
424 0.24
425 0.24
426 0.22
427 0.21
428 0.2
429 0.22
430 0.22
431 0.25
432 0.24
433 0.28
434 0.29
435 0.3
436 0.33
437 0.35
438 0.4
439 0.46
440 0.53
441 0.59
442 0.67
443 0.74
444 0.78
445 0.83
446 0.86
447 0.88
448 0.87
449 0.87
450 0.83
451 0.76
452 0.66
453 0.58
454 0.47
455 0.37
456 0.28
457 0.19
458 0.13
459 0.09
460 0.09
461 0.07
462 0.07
463 0.08
464 0.09
465 0.09
466 0.09
467 0.09
468 0.09
469 0.11
470 0.11
471 0.11
472 0.12
473 0.14
474 0.16
475 0.18
476 0.23
477 0.22
478 0.28
479 0.35
480 0.43
481 0.51
482 0.58
483 0.66
484 0.72
485 0.8
486 0.84
487 0.84
488 0.83
489 0.74
490 0.69
491 0.66
492 0.59
493 0.49
494 0.42
495 0.38
496 0.31
497 0.32
498 0.28
499 0.21
500 0.18
501 0.18
502 0.17
503 0.14
504 0.13
505 0.11
506 0.11
507 0.11
508 0.11
509 0.11
510 0.09
511 0.09
512 0.08
513 0.07
514 0.07
515 0.08
516 0.1
517 0.12
518 0.15
519 0.25
520 0.33
521 0.41
522 0.46
523 0.48
524 0.52
525 0.58
526 0.65
527 0.63
528 0.62
529 0.58
530 0.57
531 0.54
532 0.48
533 0.4
534 0.3
535 0.22
536 0.15
537 0.13
538 0.11
539 0.11
540 0.12
541 0.14
542 0.14
543 0.13
544 0.16
545 0.17
546 0.18
547 0.18
548 0.19
549 0.19
550 0.19
551 0.18
552 0.15
553 0.12
554 0.09
555 0.08
556 0.1
557 0.08
558 0.08
559 0.1
560 0.1
561 0.1
562 0.1
563 0.11
564 0.14
565 0.16
566 0.2
567 0.25
568 0.32
569 0.35
570 0.35
571 0.36
572 0.38
573 0.41
574 0.45
575 0.47
576 0.47
577 0.51
578 0.58
579 0.63
580 0.65
581 0.69
582 0.68
583 0.7
584 0.68
585 0.66
586 0.66
587 0.68
588 0.63
589 0.55
590 0.5
591 0.4
592 0.37
593 0.34
594 0.27
595 0.27
596 0.23
597 0.24
598 0.24
599 0.24
600 0.24
601 0.24
602 0.25
603 0.27
604 0.29
605 0.26
606 0.28
607 0.3
608 0.33
609 0.34
610 0.33
611 0.23