Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179I3K4

Protein Details
Accession A0A179I3K4    Localization Confidence Low Confidence Score 9.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
149-172DEARAAEKRRDKTRGRKLARLGFEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
154-166AEKRRDKTRGRKL
Subcellular Location(s) cyto 12, cysk 5, pero 4, nucl 3, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034104  Lsm1  
IPR010920  LSM_dom_sf  
IPR044642  PTHR15588  
IPR001163  Sm_dom_euk/arc  
Gene Ontology GO:0000932  C:P-body  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0000339  F:RNA cap binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0000956  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF01423  LSM  
CDD cd01728  LSm1  
Amino Acid Sequences MFTTAAQLLDLTDSMSFSSSDAERWTRARRRIADRTALVLEKLMVVLRDGRKLVGVLRSWDQFANIVLQSTTERIFAPQATAKTPSSESEAPAAAAAAPRGLYADIFHGIFLVRGENVLLLGEIDLDKDDLPPAGFELGAADVVGRLADEARAAEKRRDKTRGRKLARLGFEGDGAGEIVLL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.08
3 0.08
4 0.07
5 0.1
6 0.1
7 0.11
8 0.15
9 0.17
10 0.19
11 0.24
12 0.33
13 0.39
14 0.46
15 0.54
16 0.58
17 0.65
18 0.72
19 0.74
20 0.73
21 0.66
22 0.63
23 0.58
24 0.5
25 0.4
26 0.31
27 0.24
28 0.15
29 0.14
30 0.1
31 0.07
32 0.07
33 0.13
34 0.14
35 0.17
36 0.17
37 0.17
38 0.17
39 0.17
40 0.19
41 0.18
42 0.18
43 0.18
44 0.2
45 0.21
46 0.22
47 0.21
48 0.19
49 0.15
50 0.13
51 0.13
52 0.1
53 0.1
54 0.09
55 0.09
56 0.09
57 0.1
58 0.1
59 0.08
60 0.08
61 0.08
62 0.09
63 0.09
64 0.11
65 0.12
66 0.13
67 0.14
68 0.17
69 0.16
70 0.17
71 0.18
72 0.16
73 0.18
74 0.18
75 0.17
76 0.16
77 0.15
78 0.14
79 0.13
80 0.12
81 0.06
82 0.06
83 0.05
84 0.04
85 0.04
86 0.03
87 0.04
88 0.04
89 0.04
90 0.04
91 0.06
92 0.07
93 0.07
94 0.07
95 0.06
96 0.06
97 0.07
98 0.06
99 0.05
100 0.04
101 0.04
102 0.05
103 0.04
104 0.04
105 0.04
106 0.04
107 0.03
108 0.03
109 0.04
110 0.03
111 0.04
112 0.04
113 0.04
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.06
118 0.06
119 0.06
120 0.07
121 0.07
122 0.06
123 0.06
124 0.06
125 0.06
126 0.06
127 0.06
128 0.05
129 0.04
130 0.04
131 0.04
132 0.03
133 0.03
134 0.03
135 0.04
136 0.04
137 0.05
138 0.09
139 0.14
140 0.17
141 0.24
142 0.32
143 0.39
144 0.48
145 0.56
146 0.62
147 0.68
148 0.77
149 0.8
150 0.8
151 0.81
152 0.82
153 0.82
154 0.78
155 0.71
156 0.63
157 0.53
158 0.47
159 0.38
160 0.29
161 0.2
162 0.15