Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q7RY25

Protein Details
Accession Q7RY25    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
407-428MRSPNRPRGRSRSRSPRRWDVRBasic
670-695GPPPAGNRWRHGREKHRNNSGDDRRGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
410-435PNRPRGRSRSRSPRRWDVRGSPRARG
677-685RWRHGREKH
Subcellular Location(s) cyto_nucl 10.833, nucl 10.5, cyto 10, cyto_mito 8.333, mito 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006569  CID_dom  
IPR008942  ENTH_VHS  
IPR034894  Nrd1/Seb1_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0000974  C:Prp19 complex  
GO:0071006  C:U2-type catalytic step 1 spliceosome  
GO:0071007  C:U2-type catalytic step 2 spliceosome  
GO:0036002  F:pre-mRNA binding  
GO:0017070  F:U6 snRNA binding  
KEGG ncr:NCU01695  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04818  CID  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51391  CID  
PS50102  RRM  
CDD cd16984  CID_Nrd1_like  
cd12331  RRM_NRD1_SEB1_like  
Amino Acid Sequences MLSSQAAVAELEKGLGDMQNLKPPGVSGSKINSLTMLCLNNVQYESQLVQKLYTHYKKTPNTHKLGVLYVVDSVTRKWLEKAKALEQPVTLGAQDGTYAAGVHRVTELMPMFMNAIISSAPEDQKEKIKKLVDIWEKGQTFPPDMVNTFKEKLNAHQQHNVSTTPPGSPPPNPLASLQATSRPLPTPTTTAVMPSNILETLANLARLNANAAQSNSSAAAPAPAPAATAAVAPSPVQMGVPQIPPVTSSTPHPMFATSGQPSNGALPAGFLPGVGHPGMPYLSASQPAGQSVNMPPTMPFGFPAPAAQLAQPVQVPGAAPSANTATTVQLFAALAAQGIPLDKIASVMQLMGQPSGTAPAAPPQSVAQPLYAGYPPPPPAGGVSAAPAWEAVRHDESRDRNGYHDGMRSPNRPRGRSRSRSPRRWDVRGSPRARGNDRFDYGRSTPPRGHPDDRGRDRDMRIPEYRQRSPPNRRHESPGQEPPSEKWVKHDPTLPNGHIKVYSRTLFVGGVTCSEAELRSIFGRYGEVQTCIVNKEKRHAFVKMYYRQDAENAKKAMEENRGSDVQLRTRWGVGFGPRDCSDYQTGISVIPIHKLTEADRKWMLTAPYGGSGGQPITTGLVVEEPDIEIGAGVSSKAISRRMQTDKGGNHGPKSSRRDEEPQHPTGNAGGPPPAGNRWRHGREKHRNNSGDDRRGDRNDKNAANDDPIVMGLPGNITVGPNGINFPPNYAFTSNSTSNN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.09
3 0.1
4 0.15
5 0.17
6 0.25
7 0.26
8 0.26
9 0.25
10 0.25
11 0.28
12 0.26
13 0.25
14 0.23
15 0.28
16 0.35
17 0.35
18 0.35
19 0.32
20 0.28
21 0.29
22 0.29
23 0.25
24 0.18
25 0.21
26 0.22
27 0.23
28 0.23
29 0.21
30 0.17
31 0.18
32 0.19
33 0.2
34 0.23
35 0.21
36 0.21
37 0.24
38 0.28
39 0.36
40 0.43
41 0.44
42 0.47
43 0.57
44 0.64
45 0.71
46 0.77
47 0.76
48 0.75
49 0.74
50 0.72
51 0.64
52 0.59
53 0.52
54 0.42
55 0.32
56 0.26
57 0.22
58 0.18
59 0.16
60 0.14
61 0.17
62 0.17
63 0.18
64 0.22
65 0.29
66 0.34
67 0.4
68 0.46
69 0.47
70 0.52
71 0.54
72 0.53
73 0.45
74 0.42
75 0.36
76 0.3
77 0.23
78 0.16
79 0.14
80 0.1
81 0.1
82 0.08
83 0.07
84 0.06
85 0.06
86 0.05
87 0.09
88 0.09
89 0.1
90 0.1
91 0.1
92 0.1
93 0.15
94 0.15
95 0.12
96 0.12
97 0.12
98 0.12
99 0.12
100 0.13
101 0.08
102 0.08
103 0.06
104 0.07
105 0.09
106 0.11
107 0.12
108 0.13
109 0.16
110 0.18
111 0.27
112 0.33
113 0.35
114 0.38
115 0.41
116 0.43
117 0.46
118 0.54
119 0.53
120 0.51
121 0.51
122 0.53
123 0.5
124 0.48
125 0.48
126 0.4
127 0.34
128 0.31
129 0.31
130 0.25
131 0.25
132 0.28
133 0.25
134 0.28
135 0.28
136 0.28
137 0.28
138 0.26
139 0.31
140 0.38
141 0.44
142 0.43
143 0.49
144 0.49
145 0.5
146 0.51
147 0.46
148 0.36
149 0.31
150 0.27
151 0.21
152 0.21
153 0.2
154 0.21
155 0.22
156 0.26
157 0.29
158 0.3
159 0.29
160 0.29
161 0.3
162 0.29
163 0.29
164 0.24
165 0.24
166 0.25
167 0.24
168 0.26
169 0.23
170 0.22
171 0.23
172 0.24
173 0.22
174 0.22
175 0.23
176 0.21
177 0.22
178 0.21
179 0.19
180 0.17
181 0.14
182 0.13
183 0.1
184 0.11
185 0.08
186 0.07
187 0.1
188 0.1
189 0.11
190 0.09
191 0.1
192 0.1
193 0.11
194 0.13
195 0.11
196 0.12
197 0.13
198 0.14
199 0.15
200 0.14
201 0.15
202 0.14
203 0.11
204 0.1
205 0.08
206 0.09
207 0.07
208 0.08
209 0.08
210 0.07
211 0.07
212 0.07
213 0.07
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.05
218 0.06
219 0.05
220 0.06
221 0.06
222 0.05
223 0.05
224 0.05
225 0.07
226 0.1
227 0.11
228 0.12
229 0.12
230 0.12
231 0.12
232 0.15
233 0.14
234 0.13
235 0.15
236 0.21
237 0.22
238 0.23
239 0.23
240 0.21
241 0.2
242 0.21
243 0.24
244 0.18
245 0.18
246 0.18
247 0.18
248 0.17
249 0.17
250 0.16
251 0.1
252 0.08
253 0.07
254 0.07
255 0.08
256 0.07
257 0.06
258 0.06
259 0.06
260 0.08
261 0.07
262 0.06
263 0.05
264 0.06
265 0.07
266 0.06
267 0.07
268 0.07
269 0.08
270 0.09
271 0.09
272 0.1
273 0.1
274 0.11
275 0.11
276 0.09
277 0.1
278 0.1
279 0.14
280 0.12
281 0.12
282 0.12
283 0.14
284 0.15
285 0.13
286 0.13
287 0.1
288 0.11
289 0.11
290 0.11
291 0.09
292 0.09
293 0.1
294 0.09
295 0.1
296 0.09
297 0.1
298 0.1
299 0.09
300 0.08
301 0.07
302 0.07
303 0.06
304 0.07
305 0.06
306 0.06
307 0.07
308 0.08
309 0.08
310 0.08
311 0.08
312 0.07
313 0.08
314 0.08
315 0.07
316 0.06
317 0.06
318 0.06
319 0.06
320 0.05
321 0.04
322 0.04
323 0.04
324 0.03
325 0.03
326 0.03
327 0.03
328 0.03
329 0.03
330 0.04
331 0.04
332 0.05
333 0.05
334 0.04
335 0.05
336 0.07
337 0.07
338 0.06
339 0.06
340 0.06
341 0.06
342 0.07
343 0.06
344 0.05
345 0.04
346 0.09
347 0.1
348 0.09
349 0.1
350 0.09
351 0.11
352 0.12
353 0.13
354 0.09
355 0.08
356 0.08
357 0.09
358 0.09
359 0.08
360 0.08
361 0.1
362 0.11
363 0.11
364 0.11
365 0.1
366 0.1
367 0.11
368 0.11
369 0.08
370 0.08
371 0.08
372 0.08
373 0.07
374 0.07
375 0.05
376 0.06
377 0.06
378 0.07
379 0.11
380 0.11
381 0.12
382 0.18
383 0.2
384 0.25
385 0.28
386 0.26
387 0.24
388 0.27
389 0.28
390 0.24
391 0.25
392 0.21
393 0.23
394 0.27
395 0.3
396 0.31
397 0.37
398 0.41
399 0.41
400 0.46
401 0.51
402 0.57
403 0.61
404 0.66
405 0.7
406 0.75
407 0.81
408 0.82
409 0.82
410 0.79
411 0.76
412 0.73
413 0.71
414 0.71
415 0.71
416 0.67
417 0.61
418 0.59
419 0.59
420 0.58
421 0.55
422 0.51
423 0.47
424 0.47
425 0.44
426 0.39
427 0.39
428 0.37
429 0.38
430 0.35
431 0.32
432 0.34
433 0.38
434 0.45
435 0.45
436 0.46
437 0.47
438 0.54
439 0.6
440 0.63
441 0.62
442 0.59
443 0.58
444 0.56
445 0.54
446 0.49
447 0.45
448 0.42
449 0.42
450 0.45
451 0.48
452 0.51
453 0.51
454 0.55
455 0.59
456 0.66
457 0.69
458 0.72
459 0.73
460 0.71
461 0.72
462 0.72
463 0.69
464 0.66
465 0.68
466 0.62
467 0.55
468 0.54
469 0.47
470 0.48
471 0.43
472 0.35
473 0.31
474 0.35
475 0.37
476 0.38
477 0.44
478 0.38
479 0.42
480 0.49
481 0.45
482 0.42
483 0.39
484 0.38
485 0.33
486 0.32
487 0.29
488 0.28
489 0.28
490 0.23
491 0.22
492 0.22
493 0.2
494 0.18
495 0.16
496 0.11
497 0.1
498 0.1
499 0.09
500 0.08
501 0.09
502 0.08
503 0.07
504 0.07
505 0.08
506 0.08
507 0.09
508 0.09
509 0.09
510 0.11
511 0.11
512 0.16
513 0.15
514 0.16
515 0.16
516 0.17
517 0.18
518 0.18
519 0.23
520 0.23
521 0.23
522 0.3
523 0.34
524 0.38
525 0.41
526 0.43
527 0.41
528 0.44
529 0.53
530 0.53
531 0.54
532 0.51
533 0.49
534 0.45
535 0.46
536 0.46
537 0.43
538 0.43
539 0.38
540 0.35
541 0.35
542 0.36
543 0.37
544 0.36
545 0.33
546 0.27
547 0.31
548 0.32
549 0.31
550 0.35
551 0.32
552 0.3
553 0.3
554 0.3
555 0.27
556 0.28
557 0.28
558 0.24
559 0.25
560 0.25
561 0.3
562 0.28
563 0.32
564 0.31
565 0.34
566 0.32
567 0.33
568 0.3
569 0.24
570 0.24
571 0.19
572 0.19
573 0.16
574 0.16
575 0.16
576 0.14
577 0.15
578 0.15
579 0.14
580 0.14
581 0.15
582 0.18
583 0.25
584 0.26
585 0.28
586 0.29
587 0.29
588 0.3
589 0.33
590 0.3
591 0.23
592 0.25
593 0.21
594 0.21
595 0.21
596 0.2
597 0.16
598 0.16
599 0.13
600 0.11
601 0.09
602 0.07
603 0.08
604 0.08
605 0.07
606 0.06
607 0.07
608 0.07
609 0.08
610 0.08
611 0.07
612 0.07
613 0.07
614 0.06
615 0.05
616 0.05
617 0.05
618 0.04
619 0.04
620 0.04
621 0.04
622 0.06
623 0.09
624 0.14
625 0.16
626 0.21
627 0.29
628 0.36
629 0.41
630 0.45
631 0.51
632 0.5
633 0.53
634 0.58
635 0.53
636 0.49
637 0.5
638 0.5
639 0.51
640 0.56
641 0.57
642 0.53
643 0.56
644 0.62
645 0.63
646 0.68
647 0.66
648 0.64
649 0.6
650 0.55
651 0.49
652 0.43
653 0.4
654 0.31
655 0.24
656 0.2
657 0.18
658 0.2
659 0.21
660 0.25
661 0.26
662 0.28
663 0.33
664 0.42
665 0.49
666 0.57
667 0.64
668 0.69
669 0.75
670 0.83
671 0.86
672 0.87
673 0.84
674 0.82
675 0.84
676 0.82
677 0.8
678 0.74
679 0.69
680 0.66
681 0.68
682 0.68
683 0.62
684 0.61
685 0.61
686 0.6
687 0.6
688 0.58
689 0.53
690 0.51
691 0.46
692 0.39
693 0.3
694 0.26
695 0.21
696 0.15
697 0.12
698 0.08
699 0.08
700 0.07
701 0.08
702 0.08
703 0.07
704 0.08
705 0.08
706 0.09
707 0.09
708 0.11
709 0.12
710 0.17
711 0.16
712 0.21
713 0.23
714 0.24
715 0.28
716 0.27
717 0.28
718 0.28
719 0.36