Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q9HEC4

Protein Details
Accession Q9HEC4    Localization Confidence High Confidence Score 24
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
100-121QASLGALKKKKKKKGGDEDGSDBasic
241-263LLSMESKKKARARKDKERELLSEHydrophilic
302-326QVDKAIERKRKKIAGKEKKALPLARBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
106-114LKKKKKKKG
141-154AKVEKHHRTNKHAP
158-180TSKKPVSRRRDFLANEPAKPKSR
246-276SKKKARARKDKERELLSEHKKKEKELIKQGK
305-327KAIERKRKKIAGKEKKALPLARR
Subcellular Location(s) nucl 19, mito 5, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009292  RRP36  
Gene Ontology GO:0030686  C:90S preribosome  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0000469  P:cleavage involved in rRNA processing  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
KEGG ncr:NCU03824  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06102  RRP36  
Amino Acid Sequences MPAVKRKAAPTLGAKLQRRVRPRFEAEPDSDVEGSSDEAPSEEEGGGFHTGSDTEEEEEDEEIEEGSEPGSDDDSDAPSEHGGAGIDASQLSFGALARAQASLGALKKKKKKKGGDEDGSDDDEEKEEPNWKTEIEKGMKAKVEKHHRTNKHAPVETTSKKPVSRRRDFLANEPAKPKSRDPRFAPPGIGGSSGKSVVDEIKARKAYSFLDDYQEDEMKQLRMAIKKTKDANEKEELQRALLSMESKKKARARKDKERELLSEHKKKEKELIKQGKTPFYLKKSEQKKQLLVEQFASMKKSQVDKAIERKRKKIAGKEKKALPLARRTAEDR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.6
3 0.65
4 0.66
5 0.68
6 0.69
7 0.69
8 0.7
9 0.73
10 0.73
11 0.73
12 0.73
13 0.68
14 0.63
15 0.56
16 0.51
17 0.43
18 0.34
19 0.26
20 0.19
21 0.17
22 0.14
23 0.12
24 0.08
25 0.08
26 0.09
27 0.1
28 0.11
29 0.09
30 0.08
31 0.08
32 0.11
33 0.11
34 0.1
35 0.09
36 0.08
37 0.08
38 0.09
39 0.11
40 0.09
41 0.1
42 0.1
43 0.11
44 0.12
45 0.12
46 0.11
47 0.1
48 0.09
49 0.07
50 0.07
51 0.07
52 0.06
53 0.06
54 0.06
55 0.05
56 0.06
57 0.07
58 0.06
59 0.07
60 0.08
61 0.1
62 0.1
63 0.1
64 0.11
65 0.09
66 0.1
67 0.09
68 0.08
69 0.06
70 0.06
71 0.05
72 0.05
73 0.05
74 0.05
75 0.05
76 0.04
77 0.04
78 0.04
79 0.04
80 0.04
81 0.05
82 0.05
83 0.06
84 0.07
85 0.07
86 0.07
87 0.07
88 0.07
89 0.09
90 0.11
91 0.18
92 0.22
93 0.3
94 0.39
95 0.48
96 0.57
97 0.64
98 0.71
99 0.75
100 0.82
101 0.85
102 0.84
103 0.8
104 0.76
105 0.68
106 0.6
107 0.48
108 0.38
109 0.27
110 0.19
111 0.15
112 0.1
113 0.09
114 0.13
115 0.14
116 0.15
117 0.16
118 0.15
119 0.17
120 0.19
121 0.26
122 0.23
123 0.27
124 0.27
125 0.3
126 0.32
127 0.32
128 0.34
129 0.35
130 0.43
131 0.46
132 0.53
133 0.59
134 0.62
135 0.69
136 0.73
137 0.74
138 0.71
139 0.66
140 0.58
141 0.53
142 0.55
143 0.5
144 0.44
145 0.39
146 0.34
147 0.34
148 0.4
149 0.44
150 0.47
151 0.51
152 0.52
153 0.52
154 0.57
155 0.56
156 0.56
157 0.57
158 0.5
159 0.44
160 0.43
161 0.42
162 0.37
163 0.38
164 0.37
165 0.36
166 0.4
167 0.46
168 0.5
169 0.57
170 0.59
171 0.58
172 0.55
173 0.46
174 0.41
175 0.33
176 0.29
177 0.18
178 0.13
179 0.13
180 0.12
181 0.11
182 0.08
183 0.08
184 0.07
185 0.1
186 0.13
187 0.14
188 0.21
189 0.22
190 0.22
191 0.22
192 0.23
193 0.22
194 0.22
195 0.24
196 0.18
197 0.21
198 0.21
199 0.22
200 0.23
201 0.22
202 0.18
203 0.15
204 0.16
205 0.13
206 0.13
207 0.14
208 0.15
209 0.19
210 0.23
211 0.3
212 0.33
213 0.39
214 0.44
215 0.49
216 0.54
217 0.54
218 0.56
219 0.53
220 0.56
221 0.52
222 0.53
223 0.46
224 0.38
225 0.34
226 0.28
227 0.22
228 0.17
229 0.17
230 0.16
231 0.22
232 0.26
233 0.27
234 0.34
235 0.4
236 0.47
237 0.55
238 0.62
239 0.65
240 0.72
241 0.81
242 0.84
243 0.86
244 0.82
245 0.75
246 0.71
247 0.71
248 0.69
249 0.68
250 0.62
251 0.63
252 0.6
253 0.58
254 0.61
255 0.59
256 0.59
257 0.61
258 0.67
259 0.65
260 0.7
261 0.74
262 0.71
263 0.66
264 0.62
265 0.59
266 0.53
267 0.55
268 0.53
269 0.57
270 0.6
271 0.65
272 0.69
273 0.69
274 0.7
275 0.67
276 0.71
277 0.69
278 0.62
279 0.56
280 0.5
281 0.46
282 0.42
283 0.4
284 0.32
285 0.27
286 0.28
287 0.31
288 0.31
289 0.35
290 0.4
291 0.45
292 0.55
293 0.63
294 0.68
295 0.71
296 0.75
297 0.76
298 0.78
299 0.79
300 0.79
301 0.79
302 0.81
303 0.85
304 0.86
305 0.85
306 0.84
307 0.83
308 0.79
309 0.75
310 0.74
311 0.72
312 0.67