FuNGI

A0A167ZRD2

Protein Details

Accession

A0A167ZRD2

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
25-56	PPLVRVRRQKADPLVRPRKRLPPKPPQIPAGP	Hydrophilic
509-531	ASGTDTSRKRAKKKSANTAQSSS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
30-51	VRRQKADPLVRPRKRLPPKPPQ
516-522	RKRAKKK

Subcellular Location(s)

nucl 22, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSNPTGGHLPASTSEQSTTQQPPPPPLVRVRRQKADPLVRPRKRLPPKPPQIPAGPGLQKPAGAASAPQPPGPSSNLSRNVVPPLPETAVNGFTGPLLSDVVTDYPVVTTKRALLEGLRHHVARFTSKKNIDPRDESQFVRPVRLQRRDPRATQEEAMPERPKPIKGQLANLTEAEREELEARKAAKEKEREESLAQIAPSVASTQKRTNLPKQRTQQVFKAEMTPEEIARARVKYEEALPWHLEDFENKSTWVGNYEAAMSETYAMFVPRRDRKMSMIPLDKWYKFTAKKNFKHMSLEEAEKQMARTTKEPTWLAHKVEKGPDQTERHSGLYTGKHDAGGNAFEADEMDFEEDRFADDEERADLFEEEDEDTKLAEERIKKDQLKANIFNLKDEEVYDEEELKEKREKEAFRHYGKQVQKALRRREKNNDYSSGSEDNPYEDSSSSESEDEQDEFRNPEERQQDTEMEEAPATSGKESARQKNAASKKEAGASANIRKRLGSPGLSDASGTDTSRKRAKKKSANTAQSSSRPMSPPPSTTQASATVSKKRARSGPGSPPGSDIEKSVPSSSDVIDSGSKKLKLNPPGQRSPATGTPLGSRAGSPAPPASRAGSAGAQAPSPNPSAPASPLLPFPTPAEVHAAIPASGISSAELLRLFRSRLGDSKQNQARFITVVKGVSVFGKDRLLRPNAVKPQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.21
2	0.21
3	0.23
4	0.27
5	0.31
6	0.32
7	0.37
8	0.39
9	0.43
10	0.5
11	0.52
12	0.51
13	0.54
14	0.58
15	0.62
16	0.7
17	0.72
18	0.73
19	0.73
20	0.78
21	0.79
22	0.79
23	0.79
24	0.79
25	0.82
26	0.8
27	0.83
28	0.81
29	0.82
30	0.82
31	0.82
32	0.82
33	0.82
34	0.85
35	0.88
36	0.87
37	0.83
38	0.77
39	0.71
40	0.63
41	0.61
42	0.56
43	0.46
44	0.45
45	0.39
46	0.34
47	0.3
48	0.28
49	0.2
50	0.15
51	0.15
52	0.14
53	0.22
54	0.23
55	0.24
56	0.23
57	0.23
58	0.26
59	0.28
60	0.29
61	0.26
62	0.34
63	0.4
64	0.42
65	0.43
66	0.42
67	0.46
68	0.43
69	0.39
70	0.32
71	0.3
72	0.29
73	0.27
74	0.27
75	0.24
76	0.23
77	0.21
78	0.19
79	0.15
80	0.13
81	0.12
82	0.1
83	0.08
84	0.07
85	0.07
86	0.07
87	0.08
88	0.09
89	0.09
90	0.09
91	0.08
92	0.08
93	0.11
94	0.12
95	0.12
96	0.13
97	0.16
98	0.18
99	0.19
100	0.19
101	0.18
102	0.24
103	0.3
104	0.35
105	0.34
106	0.32
107	0.32
108	0.34
109	0.33
110	0.35
111	0.36
112	0.35
113	0.42
114	0.45
115	0.52
116	0.59
117	0.65
118	0.63
119	0.63
120	0.62
121	0.61
122	0.61
123	0.56
124	0.52
125	0.51
126	0.44
127	0.42
128	0.42
129	0.42
130	0.48
131	0.55
132	0.59
133	0.61
134	0.71
135	0.72
136	0.72
137	0.72
138	0.67
139	0.62
140	0.55
141	0.5
142	0.47
143	0.44
144	0.46
145	0.39
146	0.34
147	0.37
148	0.38
149	0.36
150	0.33
151	0.36
152	0.4
153	0.4
154	0.47
155	0.49
156	0.5
157	0.5
158	0.46
159	0.4
160	0.31
161	0.28
162	0.22
163	0.14
164	0.11
165	0.11
166	0.13
167	0.13
168	0.16
169	0.17
170	0.19
171	0.23
172	0.27
173	0.33
174	0.39
175	0.41
176	0.45
177	0.48
178	0.47
179	0.44
180	0.43
181	0.38
182	0.33
183	0.29
184	0.22
185	0.17
186	0.14
187	0.13
188	0.11
189	0.11
190	0.11
191	0.15
192	0.18
193	0.24
194	0.31
195	0.38
196	0.47
197	0.54
198	0.59
199	0.64
200	0.68
201	0.72
202	0.73
203	0.72
204	0.68
205	0.65
206	0.62
207	0.54
208	0.51
209	0.42
210	0.34
211	0.34
212	0.28
213	0.21
214	0.19
215	0.19
216	0.16
217	0.18
218	0.18
219	0.14
220	0.15
221	0.16
222	0.15
223	0.17
224	0.19
225	0.19
226	0.22
227	0.22
228	0.22
229	0.21
230	0.2
231	0.18
232	0.15
233	0.18
234	0.16
235	0.16
236	0.15
237	0.15
238	0.15
239	0.15
240	0.16
241	0.12
242	0.1
243	0.09
244	0.1
245	0.1
246	0.1
247	0.1
248	0.07
249	0.07
250	0.06
251	0.07
252	0.06
253	0.06
254	0.06
255	0.08
256	0.16
257	0.22
258	0.27
259	0.29
260	0.31
261	0.35
262	0.43
263	0.47
264	0.48
265	0.47
266	0.45
267	0.48
268	0.52
269	0.48
270	0.42
271	0.37
272	0.36
273	0.35
274	0.42
275	0.46
276	0.51
277	0.56
278	0.63
279	0.66
280	0.61
281	0.62
282	0.54
283	0.5
284	0.42
285	0.4
286	0.32
287	0.29
288	0.27
289	0.21
290	0.21
291	0.18
292	0.17
293	0.16
294	0.16
295	0.2
296	0.21
297	0.26
298	0.27
299	0.25
300	0.3
301	0.32
302	0.32
303	0.32
304	0.32
305	0.3
306	0.33
307	0.35
308	0.31
309	0.29
310	0.32
311	0.31
312	0.31
313	0.33
314	0.31
315	0.28
316	0.26
317	0.25
318	0.22
319	0.22
320	0.22
321	0.2
322	0.18
323	0.18
324	0.18
325	0.17
326	0.15
327	0.12
328	0.1
329	0.07
330	0.07
331	0.06
332	0.06
333	0.05
334	0.04
335	0.04
336	0.05
337	0.05
338	0.05
339	0.05
340	0.05
341	0.05
342	0.06
343	0.06
344	0.06
345	0.06
346	0.06
347	0.07
348	0.08
349	0.07
350	0.07
351	0.07
352	0.06
353	0.06
354	0.07
355	0.06
356	0.07
357	0.07
358	0.06
359	0.06
360	0.06
361	0.07
362	0.06
363	0.09
364	0.12
365	0.15
366	0.21
367	0.28
368	0.29
369	0.34
370	0.38
371	0.43
372	0.47
373	0.47
374	0.46
375	0.45
376	0.44
377	0.4
378	0.36
379	0.29
380	0.22
381	0.19
382	0.15
383	0.11
384	0.12
385	0.12
386	0.11
387	0.11
388	0.15
389	0.15
390	0.15
391	0.19
392	0.17
393	0.21
394	0.27
395	0.29
396	0.31
397	0.42
398	0.47
399	0.48
400	0.54
401	0.51
402	0.53
403	0.55
404	0.56
405	0.52
406	0.52
407	0.55
408	0.57
409	0.66
410	0.68
411	0.71
412	0.7
413	0.74
414	0.76
415	0.77
416	0.74
417	0.68
418	0.62
419	0.56
420	0.54
421	0.46
422	0.37
423	0.29
424	0.24
425	0.2
426	0.18
427	0.16
428	0.13
429	0.11
430	0.11
431	0.12
432	0.13
433	0.12
434	0.11
435	0.11
436	0.11
437	0.12
438	0.12
439	0.11
440	0.11
441	0.12
442	0.12
443	0.13
444	0.17
445	0.16
446	0.21
447	0.26
448	0.26
449	0.29
450	0.31
451	0.32
452	0.28
453	0.3
454	0.24
455	0.2
456	0.18
457	0.14
458	0.11
459	0.1
460	0.09
461	0.08
462	0.09
463	0.08
464	0.16
465	0.23
466	0.3
467	0.34
468	0.37
469	0.38
470	0.46
471	0.53
472	0.52
473	0.5
474	0.46
475	0.42
476	0.44
477	0.44
478	0.35
479	0.32
480	0.33
481	0.36
482	0.38
483	0.39
484	0.35
485	0.34
486	0.35
487	0.36
488	0.34
489	0.28
490	0.25
491	0.28
492	0.3
493	0.29
494	0.27
495	0.21
496	0.21
497	0.19
498	0.17
499	0.18
500	0.18
501	0.23
502	0.31
503	0.38
504	0.42
505	0.51
506	0.62
507	0.66
508	0.73
509	0.8
510	0.83
511	0.86
512	0.84
513	0.79
514	0.74
515	0.68
516	0.63
517	0.54
518	0.48
519	0.4
520	0.36
521	0.38
522	0.35
523	0.34
524	0.34
525	0.38
526	0.35
527	0.35
528	0.35
529	0.33
530	0.33
531	0.35
532	0.34
533	0.36
534	0.4
535	0.44
536	0.44
537	0.45
538	0.47
539	0.47
540	0.5
541	0.51
542	0.56
543	0.6
544	0.6
545	0.56
546	0.52
547	0.49
548	0.46
549	0.38
550	0.29
551	0.23
552	0.23
553	0.25
554	0.23
555	0.21
556	0.2
557	0.21
558	0.2
559	0.18
560	0.15
561	0.15
562	0.19
563	0.19
564	0.21
565	0.26
566	0.28
567	0.28
568	0.35
569	0.41
570	0.46
571	0.54
572	0.6
573	0.62
574	0.68
575	0.71
576	0.66
577	0.61
578	0.59
579	0.54
580	0.49
581	0.42
582	0.35
583	0.34
584	0.33
585	0.31
586	0.25
587	0.2
588	0.17
589	0.19
590	0.18
591	0.18
592	0.21
593	0.22
594	0.23
595	0.25
596	0.25
597	0.23
598	0.24
599	0.24
600	0.2
601	0.19
602	0.21
603	0.2
604	0.18
605	0.18
606	0.18
607	0.18
608	0.19
609	0.18
610	0.15
611	0.16
612	0.18
613	0.2
614	0.23
615	0.22
616	0.21
617	0.24
618	0.26
619	0.26
620	0.25
621	0.24
622	0.25
623	0.24
624	0.23
625	0.27
626	0.24
627	0.23
628	0.24
629	0.23
630	0.18
631	0.17
632	0.16
633	0.11
634	0.1
635	0.09
636	0.07
637	0.07
638	0.08
639	0.09
640	0.1
641	0.1
642	0.13
643	0.16
644	0.17
645	0.19
646	0.23
647	0.25
648	0.31
649	0.38
650	0.44
651	0.44
652	0.54
653	0.58
654	0.58
655	0.57
656	0.51
657	0.47
658	0.4
659	0.39
660	0.33
661	0.28
662	0.25
663	0.23
664	0.22
665	0.21
666	0.21
667	0.22
668	0.19
669	0.19
670	0.25
671	0.27
672	0.31
673	0.39
674	0.41
675	0.44
676	0.48

A0A167ZRD2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer