Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A167VFD0

Protein Details
Accession A0A167VFD0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1177-1207ASENPNRSKSKYSRRKWQPWREVDPPSRRGEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
421-431KKKKAEGEKEK
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 11, cyto 5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR003890  MIF4G-like_typ-3  
IPR039762  Nmd2/UPF2  
IPR007193  Upf2/Nmd2_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
Pfam View protein in Pfam  
PF02854  MIF4G  
PF04050  Upf2  
Amino Acid Sequences MDRARKRELRQLNERAWAGETDVFPVQKHLDSALKKNTTFIKRLRTGITSTAAPTFIAEIQSLSLHKYLSEIISATYEGFCKLKSPGEIATSVEIASALHQRFGPDEFTRRLGWHLGRGLMMPDRALLKGLSQEVRERDERERLTRQRVLLRVVTELWLVGVLRTLDDVEKPDDGAARGVKEGTSTRGGSEQQGIRRAPQPKGDPDRETDPFPLEVLKELFGHDYDCTNSPLAVLFARTYSFDVLGIKSASEDATRKEGTASGDENAVVTTDDIPLTPEKVQQRFRTLISKYIDKIKAHTQKSQKALSAQSRRNDEAYVKSGEIFEDRQTNFEKQSKAHDKLVANTQTLCDILGIEMPELQDKEAIDASQSSGIGVVKTGEYLRGQGEGPGIWEDEDERRFYENLVDLKGKVPSILLDAGKKKKAEGEKEKEEQPRRDSGASASADSTPDTTAADDQSATIANKTVGAQVEALLLKLPELQTKDQVDDFALSFCFLNSKASRNRLLRAIQEIPKGRSDLLPLYARLVATLGQYLPDIIHGIVQHLDDEYRSLQRRKQKDFLGQVRMTNIRYLAELTKFGLVPEHVIFHCFRVSLDDFSRMNIEIIATYLENCGRYLLRNPETSYRMASFLETLGRKKAATHLPQQERMILENAMYYVDPPQRPAIQQKERTPMELYVRKLIYLDLNKRNYPRILKALRKLHWEEPEIVDILERIFSKPGKIKYGNIYLMVTLISSLNRYHQEFVIGIIDGLMENITLGLEINDFKFNQKRVAEVKYLGELYNSKLVDAGLIFDTLYHITTFGHEGGNPVPGSYCALDQPDDFFRVRLVCTLLDTCGTSFDRGASKHKLDFFLTFFQYYLLTKDPLPMDIEFMVNDTIALVRPKWKLVTDLPEAARLFREAIVANYQTEEVAQPNEPEEEVEESDSDADEDALDEEVIPDADENEEDATSSEDEDAEAINEDKEDEKLSDDDDGEIYVKRQDEEPDPQEEAEFDKEFEKMISESLDSRKFERKTIFDVPLPMKKQPGTPSGMLTREATPSLEESEARAGTPKPNTMAFSLMTKKGNRQRTRTIDLPSDSSLAQALKNQKAAEREEQQRIKNLVLNYDLSSEEPAAGEYDPWPPLPCNTNRSALPTHGYRRASACTIGTLNTPSPTVTPSPPLTRNTSTLSSSLDLFLASENPNRSKSKYSRRKWQPWREVDPPSRRGEEARI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.61
3 0.53
4 0.44
5 0.37
6 0.32
7 0.27
8 0.22
9 0.25
10 0.24
11 0.22
12 0.25
13 0.24
14 0.21
15 0.22
16 0.22
17 0.26
18 0.31
19 0.39
20 0.45
21 0.48
22 0.47
23 0.51
24 0.57
25 0.55
26 0.58
27 0.57
28 0.57
29 0.57
30 0.62
31 0.62
32 0.56
33 0.53
34 0.51
35 0.48
36 0.39
37 0.35
38 0.33
39 0.28
40 0.24
41 0.21
42 0.18
43 0.15
44 0.15
45 0.13
46 0.11
47 0.12
48 0.14
49 0.14
50 0.14
51 0.14
52 0.13
53 0.12
54 0.13
55 0.15
56 0.14
57 0.15
58 0.13
59 0.13
60 0.14
61 0.15
62 0.14
63 0.13
64 0.12
65 0.13
66 0.13
67 0.12
68 0.13
69 0.15
70 0.19
71 0.21
72 0.24
73 0.26
74 0.28
75 0.3
76 0.29
77 0.29
78 0.24
79 0.21
80 0.18
81 0.14
82 0.1
83 0.12
84 0.17
85 0.15
86 0.16
87 0.17
88 0.18
89 0.2
90 0.22
91 0.25
92 0.22
93 0.28
94 0.3
95 0.33
96 0.34
97 0.33
98 0.34
99 0.36
100 0.34
101 0.34
102 0.35
103 0.33
104 0.32
105 0.32
106 0.32
107 0.28
108 0.26
109 0.19
110 0.17
111 0.17
112 0.17
113 0.17
114 0.14
115 0.12
116 0.16
117 0.21
118 0.22
119 0.22
120 0.28
121 0.3
122 0.35
123 0.38
124 0.37
125 0.38
126 0.44
127 0.47
128 0.49
129 0.55
130 0.57
131 0.63
132 0.64
133 0.64
134 0.63
135 0.62
136 0.6
137 0.54
138 0.48
139 0.42
140 0.38
141 0.33
142 0.25
143 0.21
144 0.15
145 0.12
146 0.1
147 0.08
148 0.09
149 0.08
150 0.08
151 0.08
152 0.09
153 0.09
154 0.11
155 0.14
156 0.14
157 0.14
158 0.15
159 0.15
160 0.16
161 0.16
162 0.18
163 0.18
164 0.16
165 0.17
166 0.17
167 0.16
168 0.16
169 0.17
170 0.18
171 0.2
172 0.19
173 0.2
174 0.23
175 0.24
176 0.24
177 0.3
178 0.31
179 0.31
180 0.38
181 0.37
182 0.37
183 0.43
184 0.46
185 0.43
186 0.46
187 0.48
188 0.51
189 0.6
190 0.63
191 0.59
192 0.58
193 0.61
194 0.55
195 0.52
196 0.44
197 0.37
198 0.31
199 0.28
200 0.25
201 0.18
202 0.19
203 0.17
204 0.16
205 0.14
206 0.14
207 0.15
208 0.14
209 0.15
210 0.12
211 0.13
212 0.14
213 0.15
214 0.16
215 0.15
216 0.15
217 0.14
218 0.13
219 0.13
220 0.11
221 0.1
222 0.09
223 0.09
224 0.1
225 0.11
226 0.12
227 0.12
228 0.12
229 0.11
230 0.13
231 0.12
232 0.14
233 0.13
234 0.12
235 0.11
236 0.11
237 0.11
238 0.11
239 0.13
240 0.13
241 0.19
242 0.19
243 0.19
244 0.19
245 0.21
246 0.21
247 0.23
248 0.22
249 0.17
250 0.18
251 0.17
252 0.17
253 0.14
254 0.11
255 0.08
256 0.07
257 0.07
258 0.07
259 0.07
260 0.07
261 0.08
262 0.09
263 0.11
264 0.12
265 0.16
266 0.22
267 0.3
268 0.37
269 0.4
270 0.46
271 0.47
272 0.49
273 0.51
274 0.46
275 0.46
276 0.43
277 0.43
278 0.39
279 0.45
280 0.48
281 0.41
282 0.43
283 0.46
284 0.51
285 0.49
286 0.55
287 0.55
288 0.56
289 0.62
290 0.62
291 0.55
292 0.5
293 0.54
294 0.56
295 0.57
296 0.55
297 0.55
298 0.57
299 0.56
300 0.53
301 0.48
302 0.4
303 0.36
304 0.34
305 0.31
306 0.25
307 0.24
308 0.22
309 0.21
310 0.21
311 0.17
312 0.15
313 0.19
314 0.19
315 0.21
316 0.25
317 0.26
318 0.29
319 0.33
320 0.33
321 0.27
322 0.38
323 0.45
324 0.45
325 0.48
326 0.49
327 0.45
328 0.47
329 0.54
330 0.47
331 0.39
332 0.35
333 0.31
334 0.25
335 0.24
336 0.2
337 0.11
338 0.07
339 0.06
340 0.07
341 0.07
342 0.07
343 0.08
344 0.08
345 0.09
346 0.09
347 0.09
348 0.09
349 0.09
350 0.11
351 0.1
352 0.1
353 0.09
354 0.09
355 0.1
356 0.1
357 0.1
358 0.08
359 0.08
360 0.09
361 0.08
362 0.08
363 0.07
364 0.06
365 0.07
366 0.07
367 0.08
368 0.08
369 0.09
370 0.09
371 0.1
372 0.1
373 0.11
374 0.11
375 0.1
376 0.11
377 0.1
378 0.1
379 0.08
380 0.08
381 0.09
382 0.12
383 0.13
384 0.13
385 0.13
386 0.15
387 0.15
388 0.16
389 0.18
390 0.18
391 0.19
392 0.21
393 0.21
394 0.19
395 0.21
396 0.22
397 0.18
398 0.13
399 0.12
400 0.09
401 0.11
402 0.13
403 0.13
404 0.16
405 0.23
406 0.28
407 0.31
408 0.31
409 0.29
410 0.32
411 0.38
412 0.43
413 0.47
414 0.51
415 0.55
416 0.59
417 0.66
418 0.68
419 0.68
420 0.64
421 0.57
422 0.54
423 0.49
424 0.46
425 0.41
426 0.33
427 0.33
428 0.28
429 0.25
430 0.21
431 0.18
432 0.17
433 0.17
434 0.16
435 0.09
436 0.08
437 0.07
438 0.07
439 0.07
440 0.07
441 0.08
442 0.07
443 0.06
444 0.07
445 0.08
446 0.08
447 0.07
448 0.07
449 0.07
450 0.08
451 0.08
452 0.1
453 0.09
454 0.09
455 0.09
456 0.09
457 0.11
458 0.1
459 0.09
460 0.08
461 0.07
462 0.06
463 0.08
464 0.08
465 0.09
466 0.12
467 0.13
468 0.18
469 0.19
470 0.21
471 0.19
472 0.19
473 0.17
474 0.15
475 0.14
476 0.1
477 0.09
478 0.08
479 0.07
480 0.07
481 0.07
482 0.06
483 0.11
484 0.11
485 0.17
486 0.22
487 0.27
488 0.34
489 0.36
490 0.38
491 0.38
492 0.4
493 0.36
494 0.37
495 0.38
496 0.35
497 0.38
498 0.39
499 0.36
500 0.35
501 0.33
502 0.28
503 0.23
504 0.21
505 0.17
506 0.18
507 0.18
508 0.16
509 0.17
510 0.17
511 0.16
512 0.14
513 0.13
514 0.09
515 0.08
516 0.08
517 0.06
518 0.06
519 0.06
520 0.06
521 0.05
522 0.05
523 0.05
524 0.04
525 0.06
526 0.06
527 0.06
528 0.07
529 0.07
530 0.07
531 0.07
532 0.07
533 0.05
534 0.07
535 0.07
536 0.11
537 0.15
538 0.17
539 0.22
540 0.3
541 0.38
542 0.44
543 0.49
544 0.5
545 0.54
546 0.61
547 0.64
548 0.64
549 0.57
550 0.51
551 0.48
552 0.44
553 0.36
554 0.28
555 0.21
556 0.13
557 0.12
558 0.13
559 0.12
560 0.11
561 0.11
562 0.11
563 0.12
564 0.11
565 0.11
566 0.1
567 0.08
568 0.09
569 0.09
570 0.1
571 0.09
572 0.1
573 0.11
574 0.11
575 0.11
576 0.09
577 0.09
578 0.11
579 0.13
580 0.14
581 0.15
582 0.19
583 0.19
584 0.19
585 0.2
586 0.16
587 0.14
588 0.11
589 0.1
590 0.05
591 0.06
592 0.06
593 0.05
594 0.05
595 0.05
596 0.06
597 0.06
598 0.06
599 0.07
600 0.06
601 0.08
602 0.11
603 0.18
604 0.21
605 0.23
606 0.25
607 0.28
608 0.31
609 0.31
610 0.28
611 0.22
612 0.2
613 0.18
614 0.16
615 0.12
616 0.1
617 0.13
618 0.13
619 0.13
620 0.13
621 0.14
622 0.13
623 0.13
624 0.19
625 0.23
626 0.26
627 0.33
628 0.41
629 0.45
630 0.49
631 0.49
632 0.45
633 0.38
634 0.34
635 0.28
636 0.18
637 0.14
638 0.1
639 0.1
640 0.08
641 0.07
642 0.06
643 0.08
644 0.12
645 0.12
646 0.14
647 0.16
648 0.17
649 0.19
650 0.25
651 0.31
652 0.35
653 0.42
654 0.46
655 0.53
656 0.52
657 0.53
658 0.48
659 0.41
660 0.4
661 0.38
662 0.34
663 0.31
664 0.31
665 0.29
666 0.27
667 0.25
668 0.22
669 0.24
670 0.3
671 0.32
672 0.36
673 0.38
674 0.4
675 0.42
676 0.41
677 0.38
678 0.34
679 0.36
680 0.4
681 0.44
682 0.51
683 0.55
684 0.54
685 0.57
686 0.58
687 0.54
688 0.52
689 0.48
690 0.42
691 0.35
692 0.34
693 0.28
694 0.23
695 0.17
696 0.12
697 0.1
698 0.09
699 0.08
700 0.07
701 0.09
702 0.09
703 0.13
704 0.18
705 0.21
706 0.27
707 0.29
708 0.31
709 0.35
710 0.42
711 0.4
712 0.36
713 0.33
714 0.25
715 0.23
716 0.2
717 0.14
718 0.07
719 0.06
720 0.05
721 0.06
722 0.06
723 0.09
724 0.12
725 0.13
726 0.15
727 0.14
728 0.16
729 0.15
730 0.16
731 0.14
732 0.11
733 0.09
734 0.07
735 0.07
736 0.05
737 0.05
738 0.04
739 0.02
740 0.02
741 0.02
742 0.02
743 0.02
744 0.02
745 0.03
746 0.03
747 0.04
748 0.06
749 0.07
750 0.08
751 0.11
752 0.15
753 0.17
754 0.23
755 0.22
756 0.26
757 0.29
758 0.33
759 0.33
760 0.3
761 0.3
762 0.26
763 0.27
764 0.22
765 0.19
766 0.15
767 0.15
768 0.18
769 0.17
770 0.14
771 0.14
772 0.13
773 0.13
774 0.12
775 0.11
776 0.06
777 0.07
778 0.06
779 0.06
780 0.07
781 0.07
782 0.07
783 0.06
784 0.05
785 0.05
786 0.07
787 0.09
788 0.09
789 0.09
790 0.08
791 0.1
792 0.1
793 0.14
794 0.13
795 0.11
796 0.1
797 0.1
798 0.12
799 0.11
800 0.11
801 0.09
802 0.1
803 0.11
804 0.11
805 0.14
806 0.14
807 0.16
808 0.16
809 0.15
810 0.15
811 0.15
812 0.15
813 0.14
814 0.14
815 0.11
816 0.13
817 0.14
818 0.13
819 0.12
820 0.13
821 0.11
822 0.13
823 0.13
824 0.12
825 0.11
826 0.13
827 0.15
828 0.17
829 0.22
830 0.25
831 0.27
832 0.31
833 0.34
834 0.34
835 0.33
836 0.33
837 0.31
838 0.3
839 0.28
840 0.25
841 0.22
842 0.2
843 0.19
844 0.17
845 0.16
846 0.13
847 0.12
848 0.12
849 0.16
850 0.16
851 0.16
852 0.18
853 0.16
854 0.16
855 0.16
856 0.16
857 0.12
858 0.12
859 0.11
860 0.08
861 0.08
862 0.06
863 0.05
864 0.07
865 0.08
866 0.08
867 0.13
868 0.15
869 0.17
870 0.19
871 0.2
872 0.23
873 0.27
874 0.33
875 0.31
876 0.36
877 0.35
878 0.38
879 0.38
880 0.34
881 0.3
882 0.24
883 0.2
884 0.14
885 0.16
886 0.11
887 0.12
888 0.16
889 0.16
890 0.15
891 0.15
892 0.14
893 0.12
894 0.12
895 0.11
896 0.08
897 0.1
898 0.1
899 0.1
900 0.11
901 0.12
902 0.12
903 0.11
904 0.11
905 0.12
906 0.12
907 0.12
908 0.11
909 0.11
910 0.11
911 0.11
912 0.09
913 0.06
914 0.06
915 0.05
916 0.05
917 0.05
918 0.05
919 0.05
920 0.05
921 0.05
922 0.05
923 0.05
924 0.05
925 0.04
926 0.04
927 0.05
928 0.05
929 0.06
930 0.06
931 0.06
932 0.06
933 0.07
934 0.08
935 0.08
936 0.08
937 0.08
938 0.07
939 0.07
940 0.07
941 0.07
942 0.06
943 0.07
944 0.07
945 0.06
946 0.07
947 0.07
948 0.08
949 0.08
950 0.1
951 0.09
952 0.11
953 0.11
954 0.12
955 0.14
956 0.14
957 0.14
958 0.12
959 0.12
960 0.11
961 0.11
962 0.11
963 0.12
964 0.12
965 0.12
966 0.14
967 0.17
968 0.22
969 0.3
970 0.33
971 0.34
972 0.34
973 0.34
974 0.32
975 0.28
976 0.26
977 0.22
978 0.19
979 0.15
980 0.15
981 0.15
982 0.15
983 0.15
984 0.14
985 0.1
986 0.1
987 0.11
988 0.11
989 0.15
990 0.21
991 0.27
992 0.26
993 0.3
994 0.37
995 0.37
996 0.42
997 0.46
998 0.44
999 0.45
1000 0.51
1001 0.52
1002 0.46
1003 0.52
1004 0.51
1005 0.52
1006 0.52
1007 0.46
1008 0.43
1009 0.4
1010 0.43
1011 0.42
1012 0.42
1013 0.4
1014 0.38
1015 0.41
1016 0.42
1017 0.42
1018 0.38
1019 0.35
1020 0.31
1021 0.27
1022 0.26
1023 0.21
1024 0.17
1025 0.17
1026 0.18
1027 0.17
1028 0.15
1029 0.15
1030 0.19
1031 0.19
1032 0.18
1033 0.19
1034 0.18
1035 0.22
1036 0.26
1037 0.28
1038 0.26
1039 0.28
1040 0.3
1041 0.29
1042 0.3
1043 0.25
1044 0.27
1045 0.29
1046 0.31
1047 0.33
1048 0.33
1049 0.41
1050 0.47
1051 0.56
1052 0.59
1053 0.61
1054 0.67
1055 0.71
1056 0.76
1057 0.73
1058 0.7
1059 0.67
1060 0.61
1061 0.58
1062 0.49
1063 0.42
1064 0.34
1065 0.29
1066 0.25
1067 0.19
1068 0.17
1069 0.19
1070 0.24
1071 0.27
1072 0.31
1073 0.31
1074 0.33
1075 0.37
1076 0.42
1077 0.44
1078 0.45
1079 0.49
1080 0.55
1081 0.61
1082 0.6
1083 0.64
1084 0.61
1085 0.55
1086 0.51
1087 0.45
1088 0.4
1089 0.36
1090 0.35
1091 0.28
1092 0.27
1093 0.25
1094 0.21
1095 0.21
1096 0.17
1097 0.14
1098 0.12
1099 0.11
1100 0.11
1101 0.1
1102 0.1
1103 0.1
1104 0.13
1105 0.14
1106 0.15
1107 0.17
1108 0.17
1109 0.2
1110 0.27
1111 0.32
1112 0.34
1113 0.37
1114 0.42
1115 0.41
1116 0.46
1117 0.46
1118 0.41
1119 0.41
1120 0.42
1121 0.45
1122 0.48
1123 0.48
1124 0.44
1125 0.45
1126 0.46
1127 0.43
1128 0.39
1129 0.33
1130 0.29
1131 0.29
1132 0.28
1133 0.26
1134 0.25
1135 0.24
1136 0.22
1137 0.22
1138 0.18
1139 0.18
1140 0.2
1141 0.22
1142 0.21
1143 0.25
1144 0.29
1145 0.36
1146 0.4
1147 0.44
1148 0.48
1149 0.48
1150 0.49
1151 0.49
1152 0.47
1153 0.42
1154 0.38
1155 0.38
1156 0.32
1157 0.29
1158 0.26
1159 0.2
1160 0.16
1161 0.14
1162 0.13
1163 0.13
1164 0.14
1165 0.18
1166 0.23
1167 0.27
1168 0.32
1169 0.35
1170 0.38
1171 0.45
1172 0.53
1173 0.59
1174 0.64
1175 0.7
1176 0.76
1177 0.83
1178 0.91
1179 0.92
1180 0.93
1181 0.93
1182 0.92
1183 0.92
1184 0.88
1185 0.87
1186 0.86
1187 0.85
1188 0.8
1189 0.76
1190 0.69
1191 0.62