FuNGI

A0A0D1CIH0

Protein Details

Accession

A0A0D1CIH0

Localization Confidence

High

Confidence Score

24.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
80-99	EDEGVHRKVRRSRQRVASAS	Hydrophilic
415-436	LKDAEKKRIRERQKADRKSGKF	Basic
516-539	QDGQGRGGGRRKKKRSSDDEDAME	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
413-433	KELKDAEKKRIRERQKADRKS
521-530	RGGGRRKKKR
559-575	RARKKAAAGESKSKPRR

Subcellular Location(s)

nucl 20, cyto 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007149 Leo1
Gene Ontology	GO:0016593 C:Cdc73/Paf1 complex GO:0005634 C:nucleus GO:1990269 F:RNA polymerase II C-terminal domain phosphoserine binding GO:0016570 P:histone modification GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006368 P:transcription elongation by RNA polymerase II
KEGG	uma:UMAG_04830 -
Pfam	View protein in Pfam PF04004 Leo1

Amino Acid Sequences

MSDQETADNAVAAQDGVIAEQTSTTAEEVVATPAEDNLEDALFGDDDEEEEQVHAVQRNRPTRNDEVTERDAGDDDEDDEDEGVHRKVRRSRQRVASASASPPPVGSNGLTAPPPLDASSPMDVHDGRSDRSSRSGSPYGRQGSQDLDEDARRQLEYKEDDEDDLQPDDNIEVAHLALPQLPVRRTKEHWLARIPHFLRYVTTPFDADSWDEEQEEKMLLEEGFNSGFGNDVGAASLLRTSNTIRWRYTDQVDEDGARVPESNARIVRWSDGTMSLQVGSELFDITQQTEKGRVSTANTGTSTPQPGTSSQAAGSSSRLLSQATQSMPMGSSGSSDRPAQSLSYLVVPHEREQIMESQGPIAGTLAFTPADTQSETHRRIAKALRFQKTARVVATAAGAGALDPEVEKARIEKELKDAEKKRIRERQKADRKSGKFDDDTFDVDARRRSRYVAARKSGGGARNAGYYSDESDLGGVAEELGGRSGSKRGGAASQRYAEDDDDGFIVDDEGDDDDDQDGQGRGGGRRKKKRSSDDEDAMEVDDEPDEMELAEQKIEEAERARKKAAAGESKSKPRRPDPAFSSDEDDQDADADDDTPAAQDASQPIAKKKRIIESDEE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.06
2	0.06
3	0.06
4	0.07
5	0.07
6	0.06
7	0.06
8	0.07
9	0.07
10	0.08
11	0.08
12	0.08
13	0.07
14	0.09
15	0.09
16	0.11
17	0.1
18	0.1
19	0.1
20	0.1
21	0.11
22	0.09
23	0.09
24	0.09
25	0.08
26	0.08
27	0.08
28	0.09
29	0.08
30	0.08
31	0.08
32	0.07
33	0.08
34	0.09
35	0.08
36	0.07
37	0.07
38	0.08
39	0.08
40	0.12
41	0.16
42	0.19
43	0.25
44	0.33
45	0.43
46	0.47
47	0.52
48	0.55
49	0.59
50	0.63
51	0.63
52	0.59
53	0.58
54	0.57
55	0.55
56	0.48
57	0.41
58	0.34
59	0.28
60	0.24
61	0.17
62	0.13
63	0.12
64	0.11
65	0.11
66	0.1
67	0.1
68	0.09
69	0.11
70	0.11
71	0.14
72	0.17
73	0.24
74	0.33
75	0.44
76	0.54
77	0.59
78	0.68
79	0.74
80	0.81
81	0.79
82	0.76
83	0.71
84	0.64
85	0.6
86	0.54
87	0.45
88	0.35
89	0.3
90	0.25
91	0.21
92	0.18
93	0.15
94	0.13
95	0.13
96	0.15
97	0.15
98	0.14
99	0.13
100	0.12
101	0.13
102	0.11
103	0.1
104	0.11
105	0.14
106	0.17
107	0.17
108	0.17
109	0.19
110	0.19
111	0.2
112	0.24
113	0.22
114	0.2
115	0.24
116	0.26
117	0.25
118	0.3
119	0.31
120	0.28
121	0.33
122	0.39
123	0.37
124	0.4
125	0.46
126	0.45
127	0.44
128	0.43
129	0.36
130	0.33
131	0.32
132	0.3
133	0.24
134	0.22
135	0.21
136	0.21
137	0.21
138	0.19
139	0.17
140	0.16
141	0.15
142	0.2
143	0.23
144	0.23
145	0.26
146	0.25
147	0.26
148	0.27
149	0.27
150	0.22
151	0.19
152	0.17
153	0.13
154	0.12
155	0.11
156	0.1
157	0.08
158	0.06
159	0.05
160	0.05
161	0.06
162	0.05
163	0.06
164	0.07
165	0.08
166	0.1
167	0.14
168	0.16
169	0.21
170	0.26
171	0.31
172	0.33
173	0.4
174	0.48
175	0.51
176	0.55
177	0.56
178	0.58
179	0.57
180	0.63
181	0.56
182	0.51
183	0.46
184	0.41
185	0.35
186	0.32
187	0.31
188	0.24
189	0.24
190	0.19
191	0.17
192	0.17
193	0.17
194	0.14
195	0.14
196	0.13
197	0.12
198	0.12
199	0.12
200	0.12
201	0.12
202	0.11
203	0.08
204	0.06
205	0.07
206	0.07
207	0.07
208	0.07
209	0.07
210	0.07
211	0.07
212	0.07
213	0.05
214	0.05
215	0.05
216	0.05
217	0.04
218	0.04
219	0.04
220	0.04
221	0.04
222	0.04
223	0.05
224	0.05
225	0.05
226	0.06
227	0.08
228	0.13
229	0.2
230	0.23
231	0.23
232	0.26
233	0.3
234	0.33
235	0.34
236	0.34
237	0.29
238	0.28
239	0.28
240	0.25
241	0.22
242	0.2
243	0.17
244	0.13
245	0.11
246	0.09
247	0.11
248	0.12
249	0.15
250	0.14
251	0.14
252	0.17
253	0.17
254	0.18
255	0.16
256	0.16
257	0.13
258	0.13
259	0.14
260	0.12
261	0.12
262	0.1
263	0.09
264	0.08
265	0.07
266	0.06
267	0.06
268	0.05
269	0.04
270	0.05
271	0.05
272	0.06
273	0.08
274	0.08
275	0.08
276	0.11
277	0.11
278	0.11
279	0.12
280	0.12
281	0.13
282	0.18
283	0.19
284	0.19
285	0.2
286	0.2
287	0.2
288	0.2
289	0.19
290	0.14
291	0.13
292	0.12
293	0.12
294	0.15
295	0.14
296	0.14
297	0.12
298	0.13
299	0.13
300	0.12
301	0.13
302	0.1
303	0.09
304	0.09
305	0.09
306	0.08
307	0.08
308	0.09
309	0.12
310	0.11
311	0.12
312	0.11
313	0.11
314	0.11
315	0.11
316	0.1
317	0.06
318	0.07
319	0.07
320	0.08
321	0.09
322	0.1
323	0.1
324	0.1
325	0.11
326	0.1
327	0.09
328	0.09
329	0.08
330	0.09
331	0.09
332	0.09
333	0.12
334	0.13
335	0.14
336	0.17
337	0.16
338	0.15
339	0.16
340	0.18
341	0.17
342	0.17
343	0.15
344	0.11
345	0.12
346	0.12
347	0.1
348	0.08
349	0.05
350	0.05
351	0.05
352	0.05
353	0.05
354	0.05
355	0.06
356	0.06
357	0.07
358	0.07
359	0.08
360	0.13
361	0.21
362	0.24
363	0.27
364	0.32
365	0.31
366	0.36
367	0.42
368	0.43
369	0.45
370	0.52
371	0.53
372	0.51
373	0.52
374	0.55
375	0.53
376	0.5
377	0.4
378	0.33
379	0.28
380	0.25
381	0.25
382	0.17
383	0.11
384	0.08
385	0.07
386	0.05
387	0.04
388	0.03
389	0.03
390	0.03
391	0.04
392	0.05
393	0.06
394	0.06
395	0.07
396	0.09
397	0.15
398	0.17
399	0.17
400	0.23
401	0.31
402	0.34
403	0.42
404	0.45
405	0.49
406	0.55
407	0.59
408	0.62
409	0.64
410	0.69
411	0.7
412	0.74
413	0.75
414	0.79
415	0.83
416	0.83
417	0.84
418	0.78
419	0.76
420	0.73
421	0.68
422	0.59
423	0.52
424	0.47
425	0.39
426	0.38
427	0.31
428	0.27
429	0.22
430	0.22
431	0.26
432	0.24
433	0.25
434	0.24
435	0.24
436	0.31
437	0.4
438	0.48
439	0.52
440	0.55
441	0.54
442	0.54
443	0.55
444	0.52
445	0.46
446	0.37
447	0.3
448	0.26
449	0.25
450	0.25
451	0.22
452	0.19
453	0.16
454	0.16
455	0.15
456	0.14
457	0.11
458	0.11
459	0.11
460	0.09
461	0.08
462	0.05
463	0.04
464	0.04
465	0.04
466	0.04
467	0.04
468	0.04
469	0.05
470	0.06
471	0.08
472	0.09
473	0.1
474	0.11
475	0.12
476	0.19
477	0.25
478	0.3
479	0.33
480	0.35
481	0.35
482	0.36
483	0.36
484	0.3
485	0.26
486	0.21
487	0.16
488	0.13
489	0.12
490	0.11
491	0.09
492	0.09
493	0.06
494	0.06
495	0.05
496	0.06
497	0.06
498	0.06
499	0.07
500	0.07
501	0.07
502	0.07
503	0.09
504	0.08
505	0.07
506	0.09
507	0.12
508	0.15
509	0.23
510	0.32
511	0.41
512	0.52
513	0.61
514	0.69
515	0.77
516	0.83
517	0.85
518	0.87
519	0.86
520	0.83
521	0.77
522	0.69
523	0.59
524	0.49
525	0.4
526	0.3
527	0.2
528	0.13
529	0.09
530	0.07
531	0.07
532	0.06
533	0.05
534	0.05
535	0.08
536	0.08
537	0.09
538	0.09
539	0.09
540	0.1
541	0.11
542	0.13
543	0.15
544	0.24
545	0.31
546	0.35
547	0.37
548	0.38
549	0.39
550	0.43
551	0.48
552	0.49
553	0.47
554	0.53
555	0.6
556	0.69
557	0.76
558	0.75
559	0.74
560	0.71
561	0.75
562	0.72
563	0.74
564	0.71
565	0.71
566	0.69
567	0.64
568	0.63
569	0.55
570	0.49
571	0.41
572	0.34
573	0.25
574	0.21
575	0.19
576	0.13
577	0.11
578	0.1
579	0.08
580	0.08
581	0.08
582	0.08
583	0.07
584	0.07
585	0.06
586	0.08
587	0.11
588	0.16
589	0.19
590	0.22
591	0.3
592	0.39
593	0.44
594	0.48
595	0.53
596	0.57
597	0.61

A0A0D1CIH0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer