FuNGI

A0A168DL38

Protein Details

Accession

A0A168DL38

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
355-379	TEQPSVPSRKKGKKKAQTAPDPRSL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
110-179	PRAVARRSKEERAKIEAQEAEENKKRAAEVAAIRRANSSGDRGRGRGRGRGRGGDGRAGPGRGGFMNRKI
363-369	RKKGKKK

Subcellular Location(s)

nucl 16, cyto_nucl 11, mito 7, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MSARGGRRGGFRALASGNNSQPSTDATGEESSTGSPAPGPSNPPSTTASSTGMATTAAIRTGTGAPPTRGGAARAPVGRLQSLKKRGPTGVPVPLNPDGAAPKPTLKYQPRAVARRSKEERAKIEAQEAEENKKRAAEVAAIRRANSSGDRGRGRGRGRGRGGDGRAGPGRGGFMNRKIKMEYGGAGRRSNTQSGANSPASSDDDDFGGRFSIEQINLDTDDEEGEEAEGKVKGKQPERASTSGRGMRPERLERHEHVERQVGVNTEAAASKAAQKKKEAEKNAIGAATTEAADDDDDSLFFRSEDDEDYESDQAEITEVRKIKGVEGADEEGPRIKQEADLDTTMVDDIPLAGTEQPSVPSRKKGKKKAQTAPDPRSLLQTEEERQEYDRYEEEVRDLKRSLGTLTTDDALEEDKPEGAELTEEDKKRALERQEAEAIKTERQQRLFLVQFPPMTPNLVDPVKRAANESSSASIDVDSVQGTQTPDGVKQENGGRSSPFVASPTAPSTSSPMINAMANRLPPGQAGKLQIHASGKATISWGGIRFELNKGSDVSFLQDAIVMEEQKSMPGSATPSIVGGNVSRDGPPEKSIWAMSQVSGKFVVTPDWDSML

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.36
2	0.35
3	0.36
4	0.35
5	0.36
6	0.36
7	0.3
8	0.29
9	0.28
10	0.29
11	0.24
12	0.21
13	0.2
14	0.22
15	0.22
16	0.22
17	0.19
18	0.14
19	0.14
20	0.13
21	0.1
22	0.09
23	0.11
24	0.14
25	0.16
26	0.21
27	0.25
28	0.32
29	0.32
30	0.34
31	0.36
32	0.37
33	0.38
34	0.36
35	0.34
36	0.29
37	0.28
38	0.25
39	0.22
40	0.17
41	0.14
42	0.12
43	0.1
44	0.1
45	0.09
46	0.09
47	0.11
48	0.14
49	0.15
50	0.19
51	0.22
52	0.23
53	0.25
54	0.26
55	0.27
56	0.26
57	0.26
58	0.25
59	0.25
60	0.29
61	0.28
62	0.29
63	0.28
64	0.29
65	0.3
66	0.29
67	0.32
68	0.36
69	0.44
70	0.48
71	0.51
72	0.53
73	0.54
74	0.55
75	0.56
76	0.54
77	0.54
78	0.51
79	0.46
80	0.48
81	0.46
82	0.42
83	0.34
84	0.29
85	0.23
86	0.21
87	0.23
88	0.18
89	0.21
90	0.22
91	0.25
92	0.33
93	0.37
94	0.42
95	0.47
96	0.54
97	0.59
98	0.64
99	0.67
100	0.67
101	0.66
102	0.7
103	0.7
104	0.7
105	0.69
106	0.71
107	0.7
108	0.67
109	0.68
110	0.59
111	0.59
112	0.52
113	0.46
114	0.45
115	0.41
116	0.41
117	0.41
118	0.41
119	0.35
120	0.33
121	0.3
122	0.25
123	0.25
124	0.24
125	0.26
126	0.34
127	0.41
128	0.41
129	0.41
130	0.4
131	0.39
132	0.34
133	0.28
134	0.26
135	0.23
136	0.29
137	0.31
138	0.33
139	0.37
140	0.42
141	0.43
142	0.44
143	0.45
144	0.48
145	0.5
146	0.53
147	0.53
148	0.54
149	0.53
150	0.51
151	0.45
152	0.4
153	0.38
154	0.33
155	0.27
156	0.21
157	0.2
158	0.15
159	0.18
160	0.17
161	0.24
162	0.33
163	0.35
164	0.37
165	0.36
166	0.36
167	0.35
168	0.33
169	0.28
170	0.26
171	0.3
172	0.31
173	0.31
174	0.31
175	0.33
176	0.34
177	0.33
178	0.28
179	0.25
180	0.24
181	0.27
182	0.32
183	0.27
184	0.24
185	0.23
186	0.22
187	0.2
188	0.2
189	0.17
190	0.11
191	0.11
192	0.11
193	0.11
194	0.1
195	0.08
196	0.07
197	0.06
198	0.07
199	0.1
200	0.1
201	0.1
202	0.11
203	0.12
204	0.13
205	0.13
206	0.11
207	0.08
208	0.08
209	0.07
210	0.06
211	0.05
212	0.04
213	0.05
214	0.05
215	0.06
216	0.07
217	0.08
218	0.11
219	0.15
220	0.21
221	0.25
222	0.32
223	0.35
224	0.42
225	0.47
226	0.49
227	0.47
228	0.45
229	0.47
230	0.46
231	0.42
232	0.39
233	0.36
234	0.36
235	0.39
236	0.42
237	0.41
238	0.4
239	0.44
240	0.41
241	0.47
242	0.47
243	0.44
244	0.39
245	0.39
246	0.35
247	0.31
248	0.31
249	0.24
250	0.19
251	0.18
252	0.15
253	0.11
254	0.1
255	0.09
256	0.07
257	0.07
258	0.12
259	0.18
260	0.21
261	0.23
262	0.25
263	0.32
264	0.41
265	0.49
266	0.47
267	0.47
268	0.47
269	0.47
270	0.46
271	0.38
272	0.29
273	0.21
274	0.18
275	0.12
276	0.08
277	0.06
278	0.05
279	0.05
280	0.05
281	0.04
282	0.05
283	0.04
284	0.04
285	0.05
286	0.05
287	0.05
288	0.05
289	0.05
290	0.05
291	0.06
292	0.07
293	0.09
294	0.1
295	0.1
296	0.12
297	0.12
298	0.11
299	0.1
300	0.09
301	0.06
302	0.06
303	0.06
304	0.05
305	0.09
306	0.09
307	0.1
308	0.12
309	0.13
310	0.13
311	0.16
312	0.16
313	0.14
314	0.15
315	0.17
316	0.15
317	0.15
318	0.15
319	0.12
320	0.12
321	0.11
322	0.09
323	0.07
324	0.08
325	0.1
326	0.12
327	0.14
328	0.14
329	0.14
330	0.13
331	0.13
332	0.12
333	0.09
334	0.07
335	0.03
336	0.03
337	0.03
338	0.03
339	0.03
340	0.04
341	0.04
342	0.05
343	0.05
344	0.07
345	0.1
346	0.14
347	0.15
348	0.23
349	0.32
350	0.42
351	0.51
352	0.6
353	0.69
354	0.74
355	0.83
356	0.84
357	0.85
358	0.86
359	0.86
360	0.81
361	0.78
362	0.71
363	0.61
364	0.56
365	0.47
366	0.37
367	0.3
368	0.28
369	0.23
370	0.24
371	0.24
372	0.21
373	0.22
374	0.22
375	0.2
376	0.18
377	0.17
378	0.17
379	0.17
380	0.17
381	0.18
382	0.22
383	0.22
384	0.23
385	0.23
386	0.21
387	0.2
388	0.21
389	0.19
390	0.16
391	0.16
392	0.15
393	0.15
394	0.15
395	0.13
396	0.13
397	0.12
398	0.1
399	0.09
400	0.08
401	0.07
402	0.07
403	0.07
404	0.07
405	0.07
406	0.06
407	0.06
408	0.06
409	0.11
410	0.16
411	0.17
412	0.18
413	0.2
414	0.2
415	0.22
416	0.27
417	0.26
418	0.29
419	0.32
420	0.36
421	0.42
422	0.42
423	0.41
424	0.42
425	0.39
426	0.33
427	0.35
428	0.37
429	0.35
430	0.36
431	0.37
432	0.32
433	0.38
434	0.38
435	0.38
436	0.33
437	0.32
438	0.31
439	0.3
440	0.3
441	0.23
442	0.22
443	0.18
444	0.16
445	0.17
446	0.19
447	0.19
448	0.18
449	0.24
450	0.25
451	0.25
452	0.27
453	0.24
454	0.24
455	0.25
456	0.26
457	0.22
458	0.2
459	0.21
460	0.18
461	0.16
462	0.13
463	0.11
464	0.1
465	0.08
466	0.07
467	0.06
468	0.09
469	0.09
470	0.09
471	0.11
472	0.12
473	0.13
474	0.17
475	0.18
476	0.16
477	0.19
478	0.25
479	0.28
480	0.29
481	0.29
482	0.26
483	0.26
484	0.28
485	0.26
486	0.2
487	0.17
488	0.17
489	0.16
490	0.19
491	0.2
492	0.19
493	0.19
494	0.18
495	0.22
496	0.23
497	0.22
498	0.2
499	0.18
500	0.18
501	0.2
502	0.19
503	0.19
504	0.19
505	0.19
506	0.2
507	0.19
508	0.18
509	0.17
510	0.21
511	0.2
512	0.21
513	0.25
514	0.25
515	0.29
516	0.29
517	0.32
518	0.3
519	0.28
520	0.27
521	0.25
522	0.24
523	0.2
524	0.2
525	0.18
526	0.17
527	0.18
528	0.18
529	0.17
530	0.17
531	0.18
532	0.19
533	0.21
534	0.24
535	0.22
536	0.22
537	0.22
538	0.23
539	0.23
540	0.21
541	0.22
542	0.18
543	0.17
544	0.15
545	0.15
546	0.14
547	0.15
548	0.18
549	0.15
550	0.14
551	0.17
552	0.17
553	0.16
554	0.17
555	0.14
556	0.12
557	0.13
558	0.16
559	0.15
560	0.17
561	0.15
562	0.15
563	0.15
564	0.15
565	0.14
566	0.12
567	0.13
568	0.14
569	0.15
570	0.14
571	0.17
572	0.2
573	0.22
574	0.23
575	0.22
576	0.22
577	0.23
578	0.25
579	0.24
580	0.26
581	0.25
582	0.24
583	0.3
584	0.28
585	0.28
586	0.27
587	0.25
588	0.2
589	0.2
590	0.23
591	0.19
592	0.21

A0A168DL38

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer