Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A168DU30

Protein Details
Accession A0A168DU30    Localization Confidence High Confidence Score 20.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
7-65PKAVSATPLEKKEKKRHHKDKDGSSSKKRKHESSSAGDAEHKKKKKEKAEQKRHESFLEBasic
382-412EEVNAVKVKKEKKEKKDKKDKKEKKSKKNSQBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
17-59KKEKKRHHKDKDGSSSKKRKHESSSAGDAEHKKKKKEKAEQKR
388-411KVKKEKKEKKDKKDKKEKKSKKNS
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
Amino Acid Sequences MDSDSTPKAVSATPLEKKEKKRHHKDKDGSSSKKRKHESSSAGDAEHKKKKKEKAEQKRHESFLESEAATFSPKPKSKRSTGNATTTAPKKSGSSPYHLITSTLYLPLSPISISPSHALSSLLSEHLSPLLLTYYPPFHGVVLAYSNPSMSSTPPKSASSQSQNGGSSFKPLTLAKTAGEYGVMFILEGWVNVQSEGFLGAIVNNLFSVGIDRRRLPKDWKWVAPGDGTFSSASSVAGTEIESEYERDEEVDKDASTGPDCVGLTGNDNSVATLENAEDDSTGYFVTPSGRRVRGTIRFRVRDVDVIPGAERDKGFISIEGSMLSKDDEAKLLAEERRKAGGGKSNIDTSVGRRLGDTSVNQESAGAVPQDDAMDIDEPLHEEVNAVKVKKEKKEKKDKKDKKEKKSKKNSQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.52
3 0.58
4 0.67
5 0.74
6 0.78
7 0.8
8 0.85
9 0.89
10 0.91
11 0.94
12 0.94
13 0.94
14 0.94
15 0.93
16 0.91
17 0.91
18 0.9
19 0.87
20 0.87
21 0.83
22 0.79
23 0.78
24 0.79
25 0.77
26 0.74
27 0.75
28 0.68
29 0.62
30 0.61
31 0.59
32 0.58
33 0.59
34 0.57
35 0.56
36 0.62
37 0.7
38 0.75
39 0.79
40 0.82
41 0.83
42 0.88
43 0.91
44 0.93
45 0.92
46 0.85
47 0.75
48 0.68
49 0.59
50 0.51
51 0.45
52 0.34
53 0.26
54 0.23
55 0.21
56 0.19
57 0.17
58 0.17
59 0.22
60 0.28
61 0.33
62 0.41
63 0.48
64 0.54
65 0.64
66 0.68
67 0.69
68 0.7
69 0.73
70 0.68
71 0.64
72 0.63
73 0.56
74 0.52
75 0.42
76 0.36
77 0.3
78 0.31
79 0.38
80 0.35
81 0.38
82 0.4
83 0.41
84 0.43
85 0.41
86 0.36
87 0.27
88 0.26
89 0.2
90 0.17
91 0.15
92 0.11
93 0.11
94 0.11
95 0.11
96 0.08
97 0.07
98 0.09
99 0.1
100 0.12
101 0.13
102 0.13
103 0.13
104 0.14
105 0.14
106 0.1
107 0.12
108 0.11
109 0.11
110 0.1
111 0.09
112 0.09
113 0.09
114 0.09
115 0.06
116 0.06
117 0.06
118 0.06
119 0.06
120 0.08
121 0.09
122 0.1
123 0.11
124 0.11
125 0.1
126 0.11
127 0.11
128 0.1
129 0.1
130 0.1
131 0.1
132 0.09
133 0.09
134 0.09
135 0.09
136 0.09
137 0.08
138 0.16
139 0.18
140 0.21
141 0.24
142 0.25
143 0.27
144 0.3
145 0.35
146 0.34
147 0.36
148 0.35
149 0.35
150 0.35
151 0.33
152 0.31
153 0.24
154 0.21
155 0.16
156 0.15
157 0.14
158 0.14
159 0.16
160 0.16
161 0.17
162 0.13
163 0.15
164 0.15
165 0.12
166 0.12
167 0.1
168 0.07
169 0.06
170 0.06
171 0.04
172 0.04
173 0.05
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.04
182 0.04
183 0.05
184 0.04
185 0.03
186 0.03
187 0.03
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.03
192 0.04
193 0.03
194 0.03
195 0.05
196 0.06
197 0.1
198 0.11
199 0.13
200 0.19
201 0.22
202 0.25
203 0.3
204 0.35
205 0.43
206 0.48
207 0.49
208 0.48
209 0.47
210 0.45
211 0.4
212 0.33
213 0.26
214 0.2
215 0.18
216 0.14
217 0.12
218 0.12
219 0.1
220 0.1
221 0.06
222 0.06
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.07
232 0.07
233 0.07
234 0.07
235 0.08
236 0.08
237 0.09
238 0.1
239 0.1
240 0.11
241 0.11
242 0.11
243 0.11
244 0.11
245 0.09
246 0.1
247 0.1
248 0.1
249 0.1
250 0.09
251 0.11
252 0.12
253 0.12
254 0.1
255 0.1
256 0.09
257 0.09
258 0.09
259 0.06
260 0.06
261 0.06
262 0.06
263 0.06
264 0.06
265 0.06
266 0.06
267 0.06
268 0.05
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.05
273 0.09
274 0.11
275 0.15
276 0.21
277 0.24
278 0.25
279 0.27
280 0.35
281 0.41
282 0.46
283 0.52
284 0.55
285 0.56
286 0.56
287 0.58
288 0.52
289 0.47
290 0.41
291 0.37
292 0.28
293 0.25
294 0.24
295 0.22
296 0.21
297 0.19
298 0.17
299 0.13
300 0.13
301 0.14
302 0.14
303 0.14
304 0.15
305 0.13
306 0.13
307 0.13
308 0.12
309 0.1
310 0.1
311 0.09
312 0.08
313 0.09
314 0.09
315 0.1
316 0.1
317 0.11
318 0.11
319 0.16
320 0.19
321 0.23
322 0.26
323 0.27
324 0.29
325 0.29
326 0.29
327 0.3
328 0.35
329 0.35
330 0.37
331 0.38
332 0.38
333 0.37
334 0.38
335 0.34
336 0.27
337 0.31
338 0.27
339 0.25
340 0.23
341 0.24
342 0.24
343 0.28
344 0.27
345 0.24
346 0.27
347 0.27
348 0.27
349 0.25
350 0.23
351 0.2
352 0.2
353 0.14
354 0.09
355 0.09
356 0.1
357 0.1
358 0.1
359 0.09
360 0.08
361 0.09
362 0.09
363 0.09
364 0.09
365 0.1
366 0.11
367 0.11
368 0.09
369 0.09
370 0.1
371 0.16
372 0.21
373 0.2
374 0.22
375 0.29
376 0.37
377 0.46
378 0.57
379 0.6
380 0.67
381 0.78
382 0.85
383 0.9
384 0.94
385 0.95
386 0.95
387 0.96
388 0.96
389 0.95
390 0.96
391 0.96
392 0.95