Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A168C649

Protein Details
Accession A0A168C649    Localization Confidence High Confidence Score 22.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
8-51NLSSNWKKLQEQLKKQPQKTSLSTPTFTASKKPASKQKKQGGSDHydrophilic
75-102ATKSKGQPVPEKGKKNNKKRKMDSETEAHydrophilic
327-352EGGRETTPEQEKRKKRLKKKKKKAKKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
39-46KPASKQKK
60-95GKTVKKRRISDISSPATKSKGQPVPEKGKKNNKKRK
337-352EKRKKRLKKKKKKAKK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, mito_nucl 11.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013520  Exonuclease_RNaseT/DNA_pol3  
IPR037431  REX4_DEDDh_dom  
IPR047021  REXO1/3/4-like  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0008408  F:3'-5' exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00929  RNase_T  
CDD cd06144  REX4_like  
Amino Acid Sequences MVAMEVKNLSSNWKKLQEQLKKQPQKTSLSTPTFTASKKPASKQKKQGGSDGAAVSGHDGKTVKKRRISDISSPATKSKGQPVPEKGKKNNKKRKMDSETEADISEKLAETKIASRKSSSASLTKVVSNQSTERSSKVNEGLSPTVKVGKYVAIDCEMVGVGPNPDRDSSLARVSVVNYDGEQVYDSYVQQREEVTDWRTHVSGISPKHMLAARPFAEVQQDVAKLLDGKVLVGHAVSNDLNVLMLGHPRRDIRDTSHHPPYKKLAGGCSPRLKMLASELLGIDIQGAAHSSVEDARATMLLYRRDKDTFEREHAKKWPVKVVQAAEGGRETTPEQEKRKKRLKKKKKKAKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.53
3 0.64
4 0.66
5 0.7
6 0.75
7 0.79
8 0.81
9 0.83
10 0.84
11 0.8
12 0.77
13 0.73
14 0.71
15 0.7
16 0.66
17 0.63
18 0.56
19 0.53
20 0.48
21 0.43
22 0.4
23 0.35
24 0.38
25 0.44
26 0.5
27 0.57
28 0.63
29 0.72
30 0.77
31 0.81
32 0.82
33 0.78
34 0.77
35 0.74
36 0.67
37 0.62
38 0.52
39 0.42
40 0.32
41 0.29
42 0.23
43 0.2
44 0.16
45 0.13
46 0.13
47 0.16
48 0.27
49 0.36
50 0.42
51 0.45
52 0.5
53 0.56
54 0.65
55 0.68
56 0.67
57 0.68
58 0.68
59 0.65
60 0.63
61 0.56
62 0.49
63 0.45
64 0.38
65 0.38
66 0.37
67 0.38
68 0.44
69 0.51
70 0.59
71 0.65
72 0.71
73 0.7
74 0.76
75 0.81
76 0.84
77 0.86
78 0.85
79 0.88
80 0.88
81 0.9
82 0.88
83 0.85
84 0.79
85 0.74
86 0.68
87 0.58
88 0.49
89 0.39
90 0.3
91 0.23
92 0.18
93 0.11
94 0.08
95 0.07
96 0.07
97 0.08
98 0.14
99 0.2
100 0.24
101 0.25
102 0.26
103 0.28
104 0.3
105 0.33
106 0.3
107 0.28
108 0.26
109 0.28
110 0.28
111 0.27
112 0.25
113 0.23
114 0.21
115 0.2
116 0.19
117 0.2
118 0.22
119 0.22
120 0.22
121 0.22
122 0.22
123 0.23
124 0.24
125 0.22
126 0.2
127 0.23
128 0.24
129 0.23
130 0.22
131 0.19
132 0.21
133 0.19
134 0.18
135 0.15
136 0.14
137 0.14
138 0.14
139 0.15
140 0.12
141 0.12
142 0.11
143 0.11
144 0.09
145 0.07
146 0.06
147 0.06
148 0.05
149 0.06
150 0.07
151 0.07
152 0.08
153 0.08
154 0.09
155 0.12
156 0.14
157 0.14
158 0.14
159 0.14
160 0.14
161 0.14
162 0.14
163 0.12
164 0.1
165 0.08
166 0.08
167 0.08
168 0.07
169 0.07
170 0.06
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.09
175 0.11
176 0.11
177 0.11
178 0.11
179 0.12
180 0.13
181 0.16
182 0.15
183 0.15
184 0.16
185 0.17
186 0.17
187 0.15
188 0.14
189 0.14
190 0.17
191 0.16
192 0.18
193 0.18
194 0.17
195 0.2
196 0.21
197 0.2
198 0.17
199 0.22
200 0.2
201 0.21
202 0.22
203 0.19
204 0.2
205 0.19
206 0.18
207 0.14
208 0.13
209 0.12
210 0.12
211 0.12
212 0.1
213 0.1
214 0.11
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.04
223 0.06
224 0.06
225 0.06
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.05
230 0.06
231 0.04
232 0.09
233 0.1
234 0.11
235 0.13
236 0.15
237 0.18
238 0.21
239 0.22
240 0.24
241 0.34
242 0.41
243 0.45
244 0.55
245 0.57
246 0.55
247 0.57
248 0.57
249 0.53
250 0.49
251 0.44
252 0.39
253 0.43
254 0.48
255 0.52
256 0.53
257 0.48
258 0.45
259 0.44
260 0.39
261 0.31
262 0.29
263 0.27
264 0.2
265 0.2
266 0.19
267 0.18
268 0.18
269 0.17
270 0.12
271 0.06
272 0.06
273 0.04
274 0.05
275 0.05
276 0.05
277 0.05
278 0.05
279 0.06
280 0.08
281 0.08
282 0.07
283 0.08
284 0.08
285 0.08
286 0.11
287 0.16
288 0.23
289 0.27
290 0.29
291 0.32
292 0.34
293 0.36
294 0.4
295 0.44
296 0.42
297 0.46
298 0.55
299 0.53
300 0.58
301 0.63
302 0.65
303 0.61
304 0.59
305 0.61
306 0.55
307 0.59
308 0.59
309 0.55
310 0.52
311 0.53
312 0.49
313 0.41
314 0.37
315 0.33
316 0.25
317 0.23
318 0.18
319 0.19
320 0.28
321 0.33
322 0.41
323 0.51
324 0.6
325 0.69
326 0.78
327 0.82
328 0.85
329 0.89
330 0.91
331 0.93
332 0.95