Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1C1T1

Protein Details
Accession A0A0D1C1T1    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
64-90ASASAAPSKSRHRKNKKSITGIKDHSSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
72-80KSRHRKNKK
Subcellular Location(s) mito 12, extr 7, mito_nucl 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011047  Quinoprotein_ADH-like_supfam  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:2000234  P:positive regulation of rRNA processing  
GO:0045943  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase I  
KEGG uma:UMAG_04291  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MPRSAASTPVKKAMQAPSTPSLLAQAPLLAPAQSTTTRFAADASEVPAPSPSLNNDPSSSHAAASASAAPSKSRHRKNKKSITGIKDHSSEFSPFQTISEGRVSRLPVVFTHDADYFFVVSKTSVRIYSRTTGQVVSTLSSGPSSHLAPITAIMINPANPLQLLTASLDGRVKVWDFLDGVLLSSFDLQLPISGMTAHASNPSTVFVILKKFRHRDAETAPKNLSEILTALDSGAPFNSIIGHFNLDLNRHAHNLASMPKFSRGASLRPELVRIAKTREAVSIGVSPNGEWLVVVGNDKVQVARTNDLASGFTRFISSHPGSHHHHKESLTCMAFHPTDPTRLVTGDSNGRIRVWYCLQNSFMAPSKAEADDGMERHAPSSVFHWHAHAVSSLCFSPNGAHLLSGGEEGVLVVWHLGASGNAASKEFVPRLGAPIAALAVAGGLDGREQEYAVSLADGSITFVSSMSLKPTRTFTRIKIDASRHLPGAFIPADTPVPLSVHPASGNLVLLAGHPSSLQFYDPIKDVNTMELEVAPSNRVSRADDEQIEPTRVERVLFSPFTSSKIAEAGEWMVTFDSRNLSDVQGEVEVVSESSLKFWRWNPVNRRYTLNTRIDRPHNGKRLTSMVFSPSSALLVTIASDAKVRTWHVASRKLKSGKAESYWTCRSVFGYRDQTPTAAAFSADGSILAIGQAGRVTLWNPESNLLSMVISAPELAEGVQNLAFSGRYLALATRTTVLVWDLIMSRQVSRKNIQDGLHAKLLLAATGWNHAGEQEDRPVFTLVSSSDTDDRAEHGSVRVAQQVKTVVEPVSLVSDTEIGSTSILTGATPVSKAGSSASRAVFRTAVCFVAPIPLPARPHAVAQEFVAITEDMDLVTFCTSPSASDSATGGTTAESIRGLSNVKKTLFHDLFGPSAFYDARADAPADDDEQTLSISADVDGGAGSGVASLFSTAPHLLPPATLLFDAFLSKMLPAANTTPAVDSATALDSNSHVFVTDHKNDDAQLDTAMLQERSVQDILLADTHELVELFKTQIVVEDGVSKSPAKVNGTNTPAASTPVKKAQVNGFASTTPVSINKTTPADPADAATPLRKRKM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.46
3 0.49
4 0.46
5 0.47
6 0.45
7 0.39
8 0.33
9 0.27
10 0.24
11 0.18
12 0.15
13 0.12
14 0.14
15 0.14
16 0.11
17 0.1
18 0.1
19 0.14
20 0.15
21 0.17
22 0.19
23 0.2
24 0.21
25 0.21
26 0.21
27 0.19
28 0.19
29 0.19
30 0.19
31 0.21
32 0.2
33 0.2
34 0.21
35 0.2
36 0.18
37 0.18
38 0.19
39 0.22
40 0.25
41 0.28
42 0.28
43 0.29
44 0.32
45 0.37
46 0.34
47 0.27
48 0.25
49 0.23
50 0.21
51 0.22
52 0.21
53 0.16
54 0.17
55 0.17
56 0.17
57 0.21
58 0.31
59 0.39
60 0.46
61 0.56
62 0.66
63 0.76
64 0.86
65 0.93
66 0.93
67 0.94
68 0.93
69 0.9
70 0.89
71 0.83
72 0.78
73 0.7
74 0.61
75 0.52
76 0.46
77 0.4
78 0.32
79 0.29
80 0.26
81 0.22
82 0.21
83 0.24
84 0.21
85 0.22
86 0.28
87 0.26
88 0.25
89 0.29
90 0.3
91 0.3
92 0.32
93 0.3
94 0.22
95 0.3
96 0.31
97 0.28
98 0.29
99 0.26
100 0.25
101 0.24
102 0.25
103 0.17
104 0.16
105 0.15
106 0.12
107 0.11
108 0.12
109 0.14
110 0.15
111 0.18
112 0.2
113 0.23
114 0.28
115 0.33
116 0.36
117 0.37
118 0.37
119 0.33
120 0.31
121 0.32
122 0.28
123 0.23
124 0.19
125 0.16
126 0.14
127 0.14
128 0.13
129 0.11
130 0.13
131 0.12
132 0.14
133 0.14
134 0.14
135 0.13
136 0.14
137 0.14
138 0.13
139 0.11
140 0.11
141 0.11
142 0.11
143 0.13
144 0.12
145 0.1
146 0.1
147 0.1
148 0.09
149 0.08
150 0.09
151 0.09
152 0.12
153 0.11
154 0.13
155 0.14
156 0.14
157 0.14
158 0.15
159 0.14
160 0.13
161 0.14
162 0.14
163 0.14
164 0.14
165 0.16
166 0.14
167 0.14
168 0.12
169 0.11
170 0.09
171 0.09
172 0.09
173 0.06
174 0.07
175 0.06
176 0.06
177 0.07
178 0.07
179 0.07
180 0.07
181 0.07
182 0.07
183 0.08
184 0.08
185 0.1
186 0.11
187 0.11
188 0.12
189 0.12
190 0.12
191 0.12
192 0.13
193 0.12
194 0.19
195 0.24
196 0.29
197 0.37
198 0.41
199 0.45
200 0.53
201 0.54
202 0.53
203 0.56
204 0.62
205 0.58
206 0.59
207 0.55
208 0.46
209 0.43
210 0.37
211 0.28
212 0.18
213 0.13
214 0.1
215 0.1
216 0.09
217 0.09
218 0.09
219 0.09
220 0.08
221 0.08
222 0.07
223 0.06
224 0.06
225 0.08
226 0.07
227 0.09
228 0.1
229 0.12
230 0.11
231 0.14
232 0.16
233 0.15
234 0.18
235 0.18
236 0.18
237 0.18
238 0.17
239 0.16
240 0.15
241 0.17
242 0.21
243 0.22
244 0.23
245 0.23
246 0.26
247 0.27
248 0.26
249 0.3
250 0.26
251 0.27
252 0.31
253 0.34
254 0.35
255 0.34
256 0.36
257 0.31
258 0.32
259 0.31
260 0.28
261 0.29
262 0.29
263 0.3
264 0.3
265 0.29
266 0.27
267 0.24
268 0.23
269 0.22
270 0.19
271 0.18
272 0.17
273 0.15
274 0.14
275 0.14
276 0.12
277 0.07
278 0.06
279 0.06
280 0.07
281 0.08
282 0.07
283 0.08
284 0.08
285 0.09
286 0.09
287 0.09
288 0.13
289 0.15
290 0.16
291 0.17
292 0.17
293 0.18
294 0.19
295 0.18
296 0.14
297 0.14
298 0.13
299 0.12
300 0.12
301 0.11
302 0.11
303 0.18
304 0.19
305 0.19
306 0.21
307 0.27
308 0.31
309 0.41
310 0.47
311 0.42
312 0.45
313 0.43
314 0.44
315 0.42
316 0.44
317 0.36
318 0.29
319 0.27
320 0.27
321 0.26
322 0.23
323 0.24
324 0.19
325 0.21
326 0.21
327 0.22
328 0.19
329 0.19
330 0.2
331 0.16
332 0.18
333 0.2
334 0.21
335 0.22
336 0.21
337 0.21
338 0.2
339 0.19
340 0.2
341 0.19
342 0.23
343 0.23
344 0.26
345 0.27
346 0.28
347 0.27
348 0.26
349 0.26
350 0.2
351 0.18
352 0.16
353 0.17
354 0.16
355 0.15
356 0.13
357 0.12
358 0.14
359 0.14
360 0.15
361 0.15
362 0.14
363 0.14
364 0.16
365 0.13
366 0.1
367 0.13
368 0.16
369 0.18
370 0.18
371 0.2
372 0.19
373 0.2
374 0.2
375 0.19
376 0.14
377 0.11
378 0.13
379 0.12
380 0.11
381 0.1
382 0.1
383 0.09
384 0.1
385 0.12
386 0.1
387 0.1
388 0.09
389 0.1
390 0.1
391 0.09
392 0.07
393 0.04
394 0.04
395 0.04
396 0.04
397 0.03
398 0.02
399 0.02
400 0.02
401 0.02
402 0.02
403 0.03
404 0.02
405 0.03
406 0.04
407 0.06
408 0.06
409 0.06
410 0.07
411 0.07
412 0.1
413 0.1
414 0.1
415 0.11
416 0.11
417 0.14
418 0.14
419 0.13
420 0.1
421 0.1
422 0.1
423 0.07
424 0.07
425 0.03
426 0.03
427 0.03
428 0.02
429 0.02
430 0.02
431 0.02
432 0.02
433 0.03
434 0.03
435 0.03
436 0.04
437 0.04
438 0.05
439 0.05
440 0.05
441 0.04
442 0.04
443 0.04
444 0.04
445 0.04
446 0.04
447 0.04
448 0.04
449 0.04
450 0.05
451 0.05
452 0.05
453 0.09
454 0.12
455 0.12
456 0.14
457 0.18
458 0.22
459 0.26
460 0.29
461 0.28
462 0.35
463 0.38
464 0.39
465 0.41
466 0.41
467 0.43
468 0.44
469 0.42
470 0.33
471 0.3
472 0.28
473 0.21
474 0.21
475 0.15
476 0.1
477 0.09
478 0.09
479 0.09
480 0.09
481 0.09
482 0.06
483 0.06
484 0.06
485 0.09
486 0.09
487 0.1
488 0.1
489 0.1
490 0.1
491 0.1
492 0.1
493 0.07
494 0.06
495 0.05
496 0.05
497 0.06
498 0.05
499 0.04
500 0.04
501 0.05
502 0.05
503 0.06
504 0.06
505 0.06
506 0.07
507 0.09
508 0.09
509 0.1
510 0.1
511 0.11
512 0.11
513 0.11
514 0.11
515 0.1
516 0.09
517 0.09
518 0.08
519 0.07
520 0.07
521 0.06
522 0.06
523 0.06
524 0.07
525 0.08
526 0.09
527 0.11
528 0.14
529 0.17
530 0.18
531 0.19
532 0.21
533 0.22
534 0.22
535 0.19
536 0.16
537 0.14
538 0.13
539 0.12
540 0.09
541 0.09
542 0.13
543 0.13
544 0.13
545 0.14
546 0.15
547 0.17
548 0.18
549 0.16
550 0.12
551 0.13
552 0.13
553 0.1
554 0.1
555 0.08
556 0.07
557 0.07
558 0.07
559 0.05
560 0.05
561 0.05
562 0.05
563 0.06
564 0.06
565 0.07
566 0.08
567 0.08
568 0.09
569 0.09
570 0.09
571 0.07
572 0.07
573 0.06
574 0.05
575 0.05
576 0.04
577 0.04
578 0.04
579 0.04
580 0.05
581 0.07
582 0.07
583 0.1
584 0.11
585 0.2
586 0.25
587 0.34
588 0.41
589 0.5
590 0.56
591 0.56
592 0.59
593 0.55
594 0.57
595 0.57
596 0.57
597 0.49
598 0.48
599 0.52
600 0.51
601 0.53
602 0.53
603 0.53
604 0.52
605 0.52
606 0.47
607 0.44
608 0.45
609 0.4
610 0.34
611 0.26
612 0.21
613 0.19
614 0.19
615 0.17
616 0.13
617 0.11
618 0.09
619 0.08
620 0.06
621 0.05
622 0.05
623 0.05
624 0.05
625 0.05
626 0.06
627 0.06
628 0.06
629 0.08
630 0.09
631 0.1
632 0.12
633 0.16
634 0.21
635 0.31
636 0.35
637 0.37
638 0.45
639 0.46
640 0.47
641 0.47
642 0.48
643 0.42
644 0.41
645 0.43
646 0.37
647 0.41
648 0.41
649 0.38
650 0.33
651 0.29
652 0.28
653 0.25
654 0.25
655 0.25
656 0.3
657 0.31
658 0.33
659 0.34
660 0.32
661 0.29
662 0.27
663 0.21
664 0.13
665 0.1
666 0.07
667 0.07
668 0.07
669 0.06
670 0.05
671 0.04
672 0.04
673 0.04
674 0.03
675 0.04
676 0.03
677 0.03
678 0.03
679 0.03
680 0.03
681 0.04
682 0.05
683 0.07
684 0.09
685 0.1
686 0.11
687 0.12
688 0.13
689 0.13
690 0.14
691 0.12
692 0.09
693 0.08
694 0.08
695 0.07
696 0.06
697 0.05
698 0.04
699 0.04
700 0.04
701 0.04
702 0.04
703 0.04
704 0.05
705 0.05
706 0.05
707 0.05
708 0.06
709 0.06
710 0.05
711 0.07
712 0.06
713 0.06
714 0.06
715 0.07
716 0.09
717 0.1
718 0.1
719 0.1
720 0.1
721 0.09
722 0.09
723 0.09
724 0.07
725 0.06
726 0.07
727 0.06
728 0.07
729 0.09
730 0.09
731 0.1
732 0.14
733 0.18
734 0.21
735 0.24
736 0.3
737 0.33
738 0.38
739 0.37
740 0.41
741 0.4
742 0.4
743 0.4
744 0.34
745 0.29
746 0.26
747 0.25
748 0.16
749 0.13
750 0.09
751 0.07
752 0.09
753 0.09
754 0.07
755 0.07
756 0.07
757 0.09
758 0.1
759 0.12
760 0.16
761 0.16
762 0.17
763 0.18
764 0.19
765 0.16
766 0.15
767 0.15
768 0.09
769 0.12
770 0.13
771 0.13
772 0.14
773 0.15
774 0.16
775 0.14
776 0.16
777 0.15
778 0.15
779 0.13
780 0.12
781 0.15
782 0.16
783 0.17
784 0.2
785 0.2
786 0.19
787 0.21
788 0.24
789 0.22
790 0.21
791 0.21
792 0.16
793 0.15
794 0.14
795 0.12
796 0.12
797 0.11
798 0.1
799 0.08
800 0.09
801 0.09
802 0.09
803 0.09
804 0.07
805 0.07
806 0.07
807 0.06
808 0.06
809 0.06
810 0.05
811 0.05
812 0.05
813 0.06
814 0.06
815 0.06
816 0.07
817 0.07
818 0.07
819 0.09
820 0.12
821 0.14
822 0.18
823 0.2
824 0.23
825 0.24
826 0.25
827 0.25
828 0.22
829 0.23
830 0.2
831 0.19
832 0.15
833 0.14
834 0.13
835 0.15
836 0.16
837 0.14
838 0.14
839 0.17
840 0.19
841 0.2
842 0.25
843 0.2
844 0.22
845 0.25
846 0.25
847 0.23
848 0.22
849 0.25
850 0.2
851 0.19
852 0.19
853 0.14
854 0.12
855 0.11
856 0.11
857 0.06
858 0.06
859 0.06
860 0.05
861 0.06
862 0.06
863 0.05
864 0.06
865 0.07
866 0.07
867 0.1
868 0.12
869 0.11
870 0.12
871 0.13
872 0.13
873 0.13
874 0.12
875 0.1
876 0.08
877 0.08
878 0.07
879 0.08
880 0.07
881 0.07
882 0.07
883 0.09
884 0.11
885 0.14
886 0.21
887 0.26
888 0.27
889 0.3
890 0.31
891 0.41
892 0.39
893 0.36
894 0.33
895 0.29
896 0.3
897 0.27
898 0.26
899 0.15
900 0.15
901 0.15
902 0.12
903 0.12
904 0.11
905 0.12
906 0.12
907 0.13
908 0.11
909 0.14
910 0.14
911 0.14
912 0.14
913 0.13
914 0.12
915 0.11
916 0.11
917 0.09
918 0.09
919 0.07
920 0.07
921 0.06
922 0.06
923 0.06
924 0.06
925 0.05
926 0.05
927 0.04
928 0.04
929 0.03
930 0.03
931 0.03
932 0.03
933 0.03
934 0.04
935 0.05
936 0.05
937 0.08
938 0.08
939 0.09
940 0.09
941 0.11
942 0.1
943 0.1
944 0.12
945 0.11
946 0.12
947 0.12
948 0.11
949 0.1
950 0.11
951 0.12
952 0.1
953 0.09
954 0.08
955 0.08
956 0.1
957 0.09
958 0.09
959 0.11
960 0.13
961 0.16
962 0.16
963 0.17
964 0.17
965 0.17
966 0.18
967 0.16
968 0.14
969 0.12
970 0.13
971 0.13
972 0.12
973 0.12
974 0.11
975 0.12
976 0.13
977 0.11
978 0.09
979 0.09
980 0.14
981 0.22
982 0.28
983 0.3
984 0.3
985 0.31
986 0.31
987 0.33
988 0.3
989 0.22
990 0.17
991 0.14
992 0.13
993 0.14
994 0.17
995 0.15
996 0.12
997 0.15
998 0.16
999 0.19
1000 0.19
1001 0.17
1002 0.14
1003 0.15
1004 0.17
1005 0.14
1006 0.14
1007 0.1
1008 0.1
1009 0.11
1010 0.1
1011 0.09
1012 0.08
1013 0.08
1014 0.09
1015 0.1
1016 0.11
1017 0.11
1018 0.1
1019 0.14
1020 0.16
1021 0.16
1022 0.14
1023 0.19
1024 0.19
1025 0.2
1026 0.22
1027 0.19
1028 0.18
1029 0.21
1030 0.26
1031 0.26
1032 0.31
1033 0.36
1034 0.43
1035 0.48
1036 0.49
1037 0.45
1038 0.42
1039 0.37
1040 0.36
1041 0.35
1042 0.29
1043 0.3
1044 0.35
1045 0.4
1046 0.4
1047 0.44
1048 0.48
1049 0.52
1050 0.53
1051 0.5
1052 0.44
1053 0.38
1054 0.39
1055 0.35
1056 0.27
1057 0.2
1058 0.18
1059 0.19
1060 0.2
1061 0.21
1062 0.25
1063 0.29
1064 0.3
1065 0.32
1066 0.32
1067 0.3
1068 0.28
1069 0.29
1070 0.25
1071 0.23
1072 0.23
1073 0.26
1074 0.3