Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A168DLE2

Protein Details
Accession A0A168DLE2    Localization Confidence High Confidence Score 27
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
259-278KPTKKAKSPAKKEVKKEAKKBasic
350-378SSDSEAEKKKKTKKDTKKPKSSEKEATESHydrophilic
458-486LSVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGPIDISHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
20-20K
22-35SADKVKKTKAAAGK
175-185KAVAKKSTKRK
259-282KPTKKAKSPAKKEVKKEAKKEVKK
357-370KKKKTKKDTKKPKS
464-477KGFTKEKNKKKRGS
Subcellular Location(s) nucl 25
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006594  LisH  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50896  LISH  
Amino Acid Sequences MAPRKSADNKSSAVKKASTKTSADKVKKTKAAAGKKTADIPPALLGAIGSFLSENGYEKASKAFVDEAKADVNVKAPSLLELFQNFKEEPKPEETKKDESSDSSSDSDSSDSSSSSSDSDSDSDSDSDSDESMKDASSDSSDSDSSDDESSSSSDSSDSDSDSDSDNESEKEDKKAVAKKSTKRKASSSSSSSSESSDSSDSDSDSDSDSSSSSSDDEPAPKRTKVTKTEVKAVKEASPEPSSSSSSDSSDSSESEDEKPTKKAKSPAKKEVKKEAKKEVKKEESSDSESDSDSDSSSSSSSSSDSDSSSDSSDSDSDSEDEKKPAAKKDSSDSSSSSSSDSDSSSDSDSSDSEAEKKKKTKKDTKKPKSSEKEATESTSTSATTSTSTSTSATPSISTPASPSSADSAKQPTSATKRKHTGAKPTPLALLSEKFNPEEHKSNEYIPYAYAERAYKDLSVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGPIDISGGKSFKFDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.54
3 0.57
4 0.62
5 0.58
6 0.55
7 0.57
8 0.61
9 0.67
10 0.67
11 0.69
12 0.69
13 0.74
14 0.75
15 0.71
16 0.7
17 0.7
18 0.72
19 0.72
20 0.72
21 0.68
22 0.65
23 0.68
24 0.63
25 0.56
26 0.46
27 0.39
28 0.32
29 0.26
30 0.23
31 0.16
32 0.13
33 0.09
34 0.09
35 0.07
36 0.06
37 0.05
38 0.05
39 0.06
40 0.07
41 0.09
42 0.09
43 0.12
44 0.12
45 0.13
46 0.15
47 0.15
48 0.15
49 0.15
50 0.19
51 0.19
52 0.23
53 0.23
54 0.22
55 0.22
56 0.23
57 0.22
58 0.18
59 0.19
60 0.16
61 0.15
62 0.14
63 0.13
64 0.14
65 0.15
66 0.15
67 0.14
68 0.16
69 0.19
70 0.19
71 0.23
72 0.21
73 0.22
74 0.26
75 0.26
76 0.27
77 0.32
78 0.39
79 0.39
80 0.48
81 0.51
82 0.53
83 0.55
84 0.55
85 0.49
86 0.45
87 0.47
88 0.4
89 0.38
90 0.32
91 0.28
92 0.24
93 0.23
94 0.2
95 0.15
96 0.14
97 0.11
98 0.1
99 0.1
100 0.11
101 0.11
102 0.1
103 0.11
104 0.09
105 0.1
106 0.11
107 0.12
108 0.12
109 0.13
110 0.13
111 0.13
112 0.12
113 0.12
114 0.11
115 0.1
116 0.09
117 0.08
118 0.08
119 0.08
120 0.08
121 0.07
122 0.07
123 0.08
124 0.09
125 0.09
126 0.1
127 0.11
128 0.12
129 0.12
130 0.12
131 0.12
132 0.12
133 0.12
134 0.11
135 0.09
136 0.1
137 0.1
138 0.1
139 0.09
140 0.08
141 0.07
142 0.08
143 0.1
144 0.1
145 0.1
146 0.1
147 0.11
148 0.11
149 0.12
150 0.13
151 0.11
152 0.11
153 0.12
154 0.11
155 0.12
156 0.15
157 0.15
158 0.17
159 0.17
160 0.18
161 0.24
162 0.3
163 0.34
164 0.4
165 0.47
166 0.53
167 0.63
168 0.7
169 0.72
170 0.69
171 0.69
172 0.68
173 0.67
174 0.67
175 0.61
176 0.55
177 0.5
178 0.48
179 0.43
180 0.36
181 0.29
182 0.21
183 0.18
184 0.15
185 0.13
186 0.12
187 0.11
188 0.11
189 0.1
190 0.11
191 0.09
192 0.1
193 0.1
194 0.08
195 0.08
196 0.08
197 0.08
198 0.07
199 0.07
200 0.07
201 0.07
202 0.08
203 0.09
204 0.14
205 0.16
206 0.22
207 0.25
208 0.24
209 0.27
210 0.32
211 0.38
212 0.4
213 0.46
214 0.48
215 0.48
216 0.57
217 0.59
218 0.54
219 0.49
220 0.45
221 0.39
222 0.33
223 0.31
224 0.26
225 0.22
226 0.2
227 0.2
228 0.2
229 0.19
230 0.17
231 0.19
232 0.16
233 0.15
234 0.16
235 0.14
236 0.14
237 0.13
238 0.13
239 0.11
240 0.11
241 0.12
242 0.12
243 0.16
244 0.16
245 0.17
246 0.21
247 0.23
248 0.25
249 0.28
250 0.35
251 0.41
252 0.5
253 0.57
254 0.64
255 0.71
256 0.75
257 0.76
258 0.79
259 0.8
260 0.77
261 0.74
262 0.74
263 0.74
264 0.74
265 0.76
266 0.75
267 0.73
268 0.67
269 0.65
270 0.59
271 0.54
272 0.52
273 0.45
274 0.37
275 0.29
276 0.27
277 0.24
278 0.2
279 0.15
280 0.1
281 0.1
282 0.08
283 0.07
284 0.07
285 0.07
286 0.06
287 0.06
288 0.07
289 0.07
290 0.09
291 0.09
292 0.1
293 0.1
294 0.11
295 0.12
296 0.12
297 0.11
298 0.1
299 0.1
300 0.1
301 0.09
302 0.09
303 0.09
304 0.09
305 0.11
306 0.14
307 0.14
308 0.15
309 0.15
310 0.19
311 0.22
312 0.28
313 0.32
314 0.32
315 0.33
316 0.39
317 0.47
318 0.45
319 0.43
320 0.39
321 0.36
322 0.34
323 0.32
324 0.26
325 0.18
326 0.16
327 0.15
328 0.14
329 0.11
330 0.11
331 0.11
332 0.12
333 0.12
334 0.11
335 0.11
336 0.11
337 0.12
338 0.11
339 0.11
340 0.14
341 0.23
342 0.27
343 0.33
344 0.41
345 0.49
346 0.57
347 0.67
348 0.73
349 0.76
350 0.83
351 0.88
352 0.91
353 0.93
354 0.92
355 0.93
356 0.91
357 0.88
358 0.87
359 0.81
360 0.77
361 0.67
362 0.63
363 0.54
364 0.45
365 0.37
366 0.28
367 0.22
368 0.16
369 0.14
370 0.1
371 0.1
372 0.1
373 0.1
374 0.1
375 0.11
376 0.12
377 0.12
378 0.14
379 0.14
380 0.14
381 0.13
382 0.13
383 0.15
384 0.14
385 0.14
386 0.14
387 0.15
388 0.16
389 0.15
390 0.16
391 0.17
392 0.19
393 0.19
394 0.2
395 0.24
396 0.24
397 0.25
398 0.24
399 0.28
400 0.35
401 0.44
402 0.47
403 0.51
404 0.56
405 0.61
406 0.7
407 0.68
408 0.7
409 0.71
410 0.75
411 0.7
412 0.65
413 0.61
414 0.52
415 0.48
416 0.4
417 0.33
418 0.26
419 0.27
420 0.27
421 0.25
422 0.27
423 0.3
424 0.32
425 0.38
426 0.39
427 0.4
428 0.4
429 0.43
430 0.46
431 0.42
432 0.37
433 0.29
434 0.29
435 0.26
436 0.24
437 0.25
438 0.21
439 0.21
440 0.23
441 0.24
442 0.21
443 0.22
444 0.25
445 0.26
446 0.32
447 0.33
448 0.34
449 0.38
450 0.39
451 0.44
452 0.48
453 0.52
454 0.56
455 0.64
456 0.71
457 0.77
458 0.85
459 0.87
460 0.9
461 0.91
462 0.9
463 0.9
464 0.89
465 0.89
466 0.88
467 0.83
468 0.72
469 0.62
470 0.57
471 0.48
472 0.43
473 0.35
474 0.26
475 0.23