Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V5IM33

Protein Details
Accession V5IM33    Localization Confidence Low Confidence Score 9.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
20-39DDNSLRPRNRRVASNRNNATHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 12, cyto 5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045030  LYSM1-4  
IPR018392  LysM_dom  
IPR036779  LysM_dom_sf  
KEGG ncr:NCU16785  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51782  LYSM  
CDD cd00118  LysM  
Amino Acid Sequences MSLSQRPPSNALLSASAEVDDNSLRPRNRRVASNRNNATSSSLYSSPSRTSDRGASPIPAARIGDVTGRNDSRLEVAAGSARTSSPRGGRGLLDGSWASTWASVQEFTTSLLTGGESYHTGSERLATQTAGKQKSSSSWGPEPPNESRPRLEDVGSGSLTEREGRLRALRTASVLESHEGVNGGLDVSRRFKKRNSDEDLREPSQSQEAAEHLVYIHHVQPTDTYAGIVLRYKCREDAFRKANGLWSRDNIQIRKWLAIPVDACEIKGRPCGGPSFSGTQVDYLARTPEGTDPFGRDNSNNREFFGPSTNDRGGDDKLPTNDDERPWTHVRWVSLDSFPHPVEVARVERKVLGYFPPRRRKSMNTTSTMTSPRTSMDVPGTTLSGETGPMSPGSISSRRTSLIGSRPSLVGDDARPAWMRRPGGVGSLRNVRAPGPEKDYFNTWTNKHLPGLNIDSLPSMAVMGAETARLGFHGAEEHPTIVESPFEDGGDASRLNGQGSTGLDKAAAAVENWLRGAFVKRPLGTPSLGVPKRSPLGAEEGDLIELTDTNSDDDRGGPVNPTSNNLQDTGLSNFEVGTSGRSATMGGSGMMRGRFPSGNLAGRDKKAD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.25
3 0.21
4 0.18
5 0.15
6 0.14
7 0.12
8 0.11
9 0.15
10 0.22
11 0.25
12 0.3
13 0.39
14 0.47
15 0.51
16 0.6
17 0.65
18 0.69
19 0.76
20 0.81
21 0.8
22 0.75
23 0.72
24 0.62
25 0.58
26 0.49
27 0.42
28 0.35
29 0.3
30 0.27
31 0.28
32 0.31
33 0.29
34 0.31
35 0.33
36 0.3
37 0.33
38 0.37
39 0.39
40 0.42
41 0.4
42 0.38
43 0.36
44 0.38
45 0.35
46 0.31
47 0.27
48 0.22
49 0.21
50 0.2
51 0.22
52 0.21
53 0.22
54 0.27
55 0.27
56 0.27
57 0.27
58 0.26
59 0.23
60 0.22
61 0.2
62 0.13
63 0.13
64 0.16
65 0.16
66 0.16
67 0.14
68 0.13
69 0.14
70 0.16
71 0.19
72 0.19
73 0.23
74 0.25
75 0.26
76 0.27
77 0.28
78 0.29
79 0.25
80 0.24
81 0.2
82 0.18
83 0.16
84 0.16
85 0.12
86 0.1
87 0.1
88 0.08
89 0.1
90 0.09
91 0.1
92 0.11
93 0.11
94 0.12
95 0.13
96 0.12
97 0.1
98 0.1
99 0.1
100 0.08
101 0.08
102 0.08
103 0.07
104 0.08
105 0.1
106 0.1
107 0.11
108 0.1
109 0.12
110 0.13
111 0.15
112 0.15
113 0.14
114 0.16
115 0.21
116 0.29
117 0.31
118 0.29
119 0.27
120 0.27
121 0.31
122 0.35
123 0.33
124 0.32
125 0.34
126 0.4
127 0.44
128 0.46
129 0.48
130 0.46
131 0.51
132 0.49
133 0.46
134 0.43
135 0.41
136 0.44
137 0.4
138 0.36
139 0.29
140 0.28
141 0.29
142 0.26
143 0.23
144 0.18
145 0.17
146 0.17
147 0.15
148 0.12
149 0.1
150 0.11
151 0.13
152 0.17
153 0.19
154 0.22
155 0.23
156 0.23
157 0.23
158 0.24
159 0.22
160 0.2
161 0.19
162 0.16
163 0.15
164 0.14
165 0.13
166 0.11
167 0.1
168 0.08
169 0.07
170 0.06
171 0.06
172 0.07
173 0.07
174 0.12
175 0.19
176 0.22
177 0.25
178 0.3
179 0.4
180 0.49
181 0.57
182 0.61
183 0.64
184 0.67
185 0.73
186 0.76
187 0.67
188 0.58
189 0.49
190 0.41
191 0.35
192 0.29
193 0.2
194 0.14
195 0.13
196 0.14
197 0.13
198 0.11
199 0.08
200 0.08
201 0.09
202 0.09
203 0.11
204 0.1
205 0.1
206 0.1
207 0.11
208 0.13
209 0.14
210 0.12
211 0.1
212 0.09
213 0.09
214 0.1
215 0.13
216 0.13
217 0.16
218 0.18
219 0.19
220 0.21
221 0.23
222 0.3
223 0.31
224 0.39
225 0.4
226 0.42
227 0.43
228 0.41
229 0.46
230 0.42
231 0.4
232 0.32
233 0.29
234 0.28
235 0.31
236 0.36
237 0.3
238 0.28
239 0.31
240 0.3
241 0.3
242 0.27
243 0.24
244 0.2
245 0.22
246 0.2
247 0.15
248 0.19
249 0.17
250 0.16
251 0.15
252 0.15
253 0.13
254 0.15
255 0.15
256 0.11
257 0.13
258 0.14
259 0.15
260 0.16
261 0.17
262 0.18
263 0.17
264 0.18
265 0.17
266 0.16
267 0.15
268 0.13
269 0.11
270 0.08
271 0.08
272 0.07
273 0.07
274 0.08
275 0.1
276 0.12
277 0.13
278 0.13
279 0.14
280 0.16
281 0.18
282 0.17
283 0.15
284 0.2
285 0.26
286 0.33
287 0.31
288 0.3
289 0.3
290 0.29
291 0.29
292 0.27
293 0.22
294 0.17
295 0.21
296 0.21
297 0.2
298 0.2
299 0.21
300 0.18
301 0.18
302 0.18
303 0.15
304 0.15
305 0.16
306 0.16
307 0.17
308 0.18
309 0.17
310 0.19
311 0.18
312 0.23
313 0.24
314 0.24
315 0.25
316 0.25
317 0.25
318 0.24
319 0.25
320 0.22
321 0.21
322 0.22
323 0.19
324 0.2
325 0.19
326 0.17
327 0.15
328 0.12
329 0.11
330 0.13
331 0.16
332 0.16
333 0.16
334 0.17
335 0.18
336 0.18
337 0.18
338 0.17
339 0.18
340 0.23
341 0.32
342 0.41
343 0.51
344 0.53
345 0.57
346 0.6
347 0.61
348 0.62
349 0.63
350 0.61
351 0.56
352 0.56
353 0.53
354 0.52
355 0.49
356 0.4
357 0.3
358 0.23
359 0.19
360 0.18
361 0.17
362 0.15
363 0.16
364 0.15
365 0.15
366 0.15
367 0.15
368 0.12
369 0.12
370 0.1
371 0.07
372 0.06
373 0.06
374 0.06
375 0.06
376 0.06
377 0.06
378 0.06
379 0.07
380 0.11
381 0.13
382 0.15
383 0.16
384 0.18
385 0.18
386 0.19
387 0.19
388 0.21
389 0.26
390 0.29
391 0.29
392 0.29
393 0.29
394 0.28
395 0.27
396 0.22
397 0.16
398 0.11
399 0.13
400 0.12
401 0.14
402 0.15
403 0.15
404 0.18
405 0.22
406 0.22
407 0.2
408 0.24
409 0.22
410 0.27
411 0.32
412 0.29
413 0.27
414 0.34
415 0.34
416 0.31
417 0.31
418 0.26
419 0.27
420 0.29
421 0.29
422 0.29
423 0.32
424 0.33
425 0.35
426 0.37
427 0.35
428 0.36
429 0.37
430 0.31
431 0.35
432 0.36
433 0.37
434 0.35
435 0.34
436 0.3
437 0.3
438 0.34
439 0.29
440 0.25
441 0.23
442 0.22
443 0.19
444 0.18
445 0.12
446 0.07
447 0.05
448 0.04
449 0.04
450 0.04
451 0.04
452 0.04
453 0.04
454 0.04
455 0.04
456 0.04
457 0.05
458 0.05
459 0.05
460 0.08
461 0.09
462 0.12
463 0.13
464 0.13
465 0.12
466 0.13
467 0.13
468 0.1
469 0.11
470 0.08
471 0.1
472 0.1
473 0.1
474 0.1
475 0.09
476 0.1
477 0.12
478 0.11
479 0.09
480 0.12
481 0.12
482 0.13
483 0.13
484 0.11
485 0.12
486 0.13
487 0.16
488 0.14
489 0.13
490 0.13
491 0.12
492 0.13
493 0.12
494 0.1
495 0.07
496 0.1
497 0.11
498 0.12
499 0.13
500 0.12
501 0.11
502 0.12
503 0.16
504 0.17
505 0.23
506 0.3
507 0.3
508 0.33
509 0.36
510 0.38
511 0.34
512 0.31
513 0.3
514 0.33
515 0.35
516 0.35
517 0.33
518 0.36
519 0.37
520 0.36
521 0.31
522 0.22
523 0.28
524 0.26
525 0.26
526 0.23
527 0.21
528 0.21
529 0.19
530 0.17
531 0.1
532 0.09
533 0.08
534 0.07
535 0.07
536 0.09
537 0.1
538 0.11
539 0.11
540 0.11
541 0.13
542 0.14
543 0.14
544 0.15
545 0.16
546 0.21
547 0.21
548 0.24
549 0.26
550 0.28
551 0.29
552 0.28
553 0.27
554 0.23
555 0.25
556 0.25
557 0.23
558 0.18
559 0.17
560 0.15
561 0.15
562 0.14
563 0.12
564 0.11
565 0.1
566 0.11
567 0.11
568 0.11
569 0.11
570 0.11
571 0.12
572 0.1
573 0.1
574 0.1
575 0.11
576 0.14
577 0.15
578 0.15
579 0.14
580 0.18
581 0.18
582 0.19
583 0.26
584 0.29
585 0.35
586 0.38
587 0.45
588 0.48