Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q7SHE8

Protein Details
Accession Q7SHE8    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
33-52ETAGTNKTNNKKRKEPDTLGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
79-96KGIPKLRKTASKLKLKGK
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 11.5, cyto 9.5, mito 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012923  Csm3  
IPR040038  TIPIN/Csm3/Swi3  
Gene Ontology GO:0031298  C:replication fork protection complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0000076  P:DNA replication checkpoint signaling  
GO:0051321  P:meiotic cell cycle  
GO:0043111  P:replication fork arrest  
GO:0031297  P:replication fork processing  
KEGG ncr:NCU01858  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07962  Swi3  
Amino Acid Sequences MPAQDNDNNTSAFVNEFLAGWDDDDPFRSPSPETAGTNKTNNKKRKEPDTLGIDKEIDVTKKARVPRVKLDDARLLSDKGIPKLRKTASKLKLKGKGHEFSDAARLLSFYQEWLDDLFPKATFVDALAMCEKAGHKTTLRNARLKWIAEGKPRSTTAEEEEDRDREGQPSASAEPTRMAPIFEKATGAKSKTPTLDNNLFGDDDIYNATPRRNQPTAAPGDIPDDDELDALMAEAESGAAPGASKATNNGAASDSIFGGGAINRRPRPSEVPDDDDLDALMAEAESYRPSTTNHGSIFGNGSASGGGKDKPAMAAPPQEDDDDLDALMAEAEMHASLATKTTGKESTSRERTSEQDGGKDAQNYDEDDLDAWMAEAEAYTKTTSIQVAQPKDTDDDWEAEAAMAEMHGF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.1
3 0.1
4 0.1
5 0.12
6 0.12
7 0.12
8 0.13
9 0.13
10 0.14
11 0.16
12 0.18
13 0.18
14 0.19
15 0.2
16 0.19
17 0.21
18 0.27
19 0.3
20 0.31
21 0.34
22 0.4
23 0.42
24 0.49
25 0.54
26 0.57
27 0.61
28 0.67
29 0.69
30 0.73
31 0.77
32 0.8
33 0.82
34 0.79
35 0.79
36 0.79
37 0.76
38 0.69
39 0.63
40 0.53
41 0.42
42 0.38
43 0.32
44 0.24
45 0.21
46 0.2
47 0.23
48 0.27
49 0.33
50 0.39
51 0.43
52 0.49
53 0.57
54 0.64
55 0.68
56 0.68
57 0.68
58 0.67
59 0.6
60 0.58
61 0.5
62 0.42
63 0.33
64 0.34
65 0.33
66 0.3
67 0.37
68 0.35
69 0.36
70 0.44
71 0.48
72 0.51
73 0.54
74 0.6
75 0.6
76 0.68
77 0.73
78 0.73
79 0.77
80 0.73
81 0.74
82 0.72
83 0.69
84 0.6
85 0.58
86 0.5
87 0.42
88 0.44
89 0.37
90 0.29
91 0.23
92 0.21
93 0.15
94 0.16
95 0.15
96 0.09
97 0.09
98 0.09
99 0.09
100 0.1
101 0.1
102 0.1
103 0.12
104 0.12
105 0.11
106 0.12
107 0.11
108 0.1
109 0.09
110 0.08
111 0.11
112 0.1
113 0.12
114 0.12
115 0.12
116 0.12
117 0.13
118 0.13
119 0.11
120 0.14
121 0.14
122 0.15
123 0.2
124 0.28
125 0.37
126 0.42
127 0.45
128 0.43
129 0.49
130 0.52
131 0.48
132 0.44
133 0.42
134 0.42
135 0.45
136 0.49
137 0.43
138 0.43
139 0.42
140 0.41
141 0.35
142 0.31
143 0.27
144 0.3
145 0.28
146 0.27
147 0.28
148 0.26
149 0.26
150 0.25
151 0.21
152 0.15
153 0.15
154 0.13
155 0.11
156 0.12
157 0.12
158 0.14
159 0.13
160 0.12
161 0.12
162 0.12
163 0.14
164 0.12
165 0.11
166 0.1
167 0.13
168 0.14
169 0.13
170 0.13
171 0.12
172 0.15
173 0.17
174 0.18
175 0.19
176 0.19
177 0.22
178 0.23
179 0.26
180 0.24
181 0.29
182 0.31
183 0.3
184 0.28
185 0.26
186 0.24
187 0.21
188 0.2
189 0.13
190 0.08
191 0.07
192 0.07
193 0.07
194 0.07
195 0.08
196 0.11
197 0.14
198 0.2
199 0.21
200 0.21
201 0.23
202 0.29
203 0.32
204 0.3
205 0.27
206 0.21
207 0.22
208 0.22
209 0.2
210 0.13
211 0.1
212 0.09
213 0.08
214 0.07
215 0.05
216 0.05
217 0.04
218 0.03
219 0.02
220 0.02
221 0.02
222 0.02
223 0.02
224 0.02
225 0.02
226 0.02
227 0.02
228 0.03
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.05
233 0.08
234 0.11
235 0.11
236 0.12
237 0.12
238 0.12
239 0.13
240 0.13
241 0.1
242 0.07
243 0.07
244 0.06
245 0.06
246 0.07
247 0.09
248 0.12
249 0.18
250 0.2
251 0.22
252 0.24
253 0.28
254 0.33
255 0.37
256 0.43
257 0.41
258 0.45
259 0.45
260 0.46
261 0.42
262 0.35
263 0.29
264 0.19
265 0.14
266 0.08
267 0.06
268 0.03
269 0.03
270 0.03
271 0.03
272 0.04
273 0.05
274 0.06
275 0.07
276 0.08
277 0.15
278 0.18
279 0.23
280 0.23
281 0.25
282 0.25
283 0.25
284 0.27
285 0.21
286 0.18
287 0.12
288 0.12
289 0.09
290 0.09
291 0.09
292 0.08
293 0.08
294 0.09
295 0.09
296 0.1
297 0.11
298 0.11
299 0.13
300 0.14
301 0.2
302 0.2
303 0.23
304 0.24
305 0.23
306 0.22
307 0.22
308 0.21
309 0.15
310 0.13
311 0.1
312 0.09
313 0.08
314 0.08
315 0.06
316 0.03
317 0.03
318 0.03
319 0.03
320 0.03
321 0.03
322 0.04
323 0.05
324 0.06
325 0.08
326 0.09
327 0.1
328 0.14
329 0.17
330 0.18
331 0.24
332 0.29
333 0.39
334 0.46
335 0.48
336 0.47
337 0.47
338 0.49
339 0.51
340 0.52
341 0.43
342 0.38
343 0.39
344 0.38
345 0.38
346 0.39
347 0.31
348 0.27
349 0.27
350 0.25
351 0.24
352 0.22
353 0.19
354 0.16
355 0.16
356 0.13
357 0.11
358 0.08
359 0.07
360 0.06
361 0.05
362 0.04
363 0.05
364 0.06
365 0.08
366 0.08
367 0.08
368 0.09
369 0.11
370 0.13
371 0.15
372 0.2
373 0.27
374 0.32
375 0.35
376 0.36
377 0.36
378 0.38
379 0.36
380 0.35
381 0.29
382 0.26
383 0.24
384 0.23
385 0.21
386 0.18
387 0.17
388 0.12
389 0.09