Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A167XJ27

Protein Details
Accession A0A167XJ27    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
197-220RAIRVKLTPKERKRAEKLIREAKDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
203-213LTPKERKRAEK
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 13, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001611  Leu-rich_rpt  
IPR032675  LRR_dom_sf  
IPR044640  RU2A  
Gene Ontology GO:0030620  F:U2 snRNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF14580  LRR_9  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51450  LRR  
Amino Acid Sequences MRLTTELIQSSLSYINPLKERELDLRGHKIPAIENLGVAGDQECIDFTDNDILSISNFPLSPRLRTLLFARNRITHIQPSLAKSIPGLTTLVLTQNNIAELADLEPLRHLSKLTHLSILENPVARKEHYRLWVIWLVPSVRFLDYQKVKDAERGRAAELFGTFEEPTDLAKKTLGVKSRVFDPSAIEATRGVGPTERAIRVKLTPKERKRAEKLIREAKDLQTIARLERELNEGRVPGGTVGYEDDDSDEDNDTKMS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.21
3 0.25
4 0.26
5 0.27
6 0.29
7 0.33
8 0.34
9 0.36
10 0.37
11 0.39
12 0.45
13 0.44
14 0.42
15 0.39
16 0.35
17 0.33
18 0.33
19 0.33
20 0.25
21 0.23
22 0.22
23 0.21
24 0.19
25 0.17
26 0.11
27 0.06
28 0.06
29 0.06
30 0.06
31 0.07
32 0.09
33 0.09
34 0.09
35 0.15
36 0.15
37 0.15
38 0.15
39 0.14
40 0.13
41 0.14
42 0.14
43 0.08
44 0.08
45 0.09
46 0.16
47 0.18
48 0.19
49 0.21
50 0.23
51 0.23
52 0.25
53 0.3
54 0.31
55 0.35
56 0.38
57 0.39
58 0.39
59 0.41
60 0.42
61 0.41
62 0.36
63 0.32
64 0.32
65 0.32
66 0.32
67 0.33
68 0.3
69 0.26
70 0.22
71 0.23
72 0.18
73 0.15
74 0.13
75 0.09
76 0.09
77 0.09
78 0.12
79 0.1
80 0.09
81 0.09
82 0.09
83 0.09
84 0.08
85 0.08
86 0.05
87 0.05
88 0.06
89 0.07
90 0.07
91 0.07
92 0.07
93 0.08
94 0.09
95 0.09
96 0.08
97 0.07
98 0.13
99 0.18
100 0.19
101 0.2
102 0.19
103 0.21
104 0.22
105 0.24
106 0.19
107 0.16
108 0.15
109 0.14
110 0.15
111 0.14
112 0.16
113 0.16
114 0.19
115 0.22
116 0.24
117 0.22
118 0.25
119 0.28
120 0.25
121 0.24
122 0.2
123 0.17
124 0.15
125 0.16
126 0.13
127 0.1
128 0.11
129 0.11
130 0.18
131 0.22
132 0.23
133 0.26
134 0.27
135 0.26
136 0.32
137 0.34
138 0.32
139 0.33
140 0.32
141 0.3
142 0.29
143 0.29
144 0.24
145 0.2
146 0.16
147 0.11
148 0.11
149 0.1
150 0.09
151 0.09
152 0.08
153 0.09
154 0.1
155 0.11
156 0.09
157 0.1
158 0.12
159 0.16
160 0.2
161 0.24
162 0.26
163 0.28
164 0.29
165 0.35
166 0.35
167 0.31
168 0.28
169 0.25
170 0.25
171 0.26
172 0.24
173 0.19
174 0.17
175 0.18
176 0.19
177 0.16
178 0.13
179 0.11
180 0.12
181 0.15
182 0.2
183 0.2
184 0.2
185 0.21
186 0.23
187 0.27
188 0.35
189 0.39
190 0.45
191 0.53
192 0.6
193 0.69
194 0.75
195 0.79
196 0.78
197 0.82
198 0.81
199 0.81
200 0.83
201 0.83
202 0.77
203 0.73
204 0.69
205 0.61
206 0.59
207 0.49
208 0.4
209 0.35
210 0.34
211 0.3
212 0.3
213 0.27
214 0.2
215 0.22
216 0.28
217 0.25
218 0.27
219 0.27
220 0.24
221 0.24
222 0.23
223 0.22
224 0.16
225 0.14
226 0.11
227 0.09
228 0.11
229 0.12
230 0.12
231 0.11
232 0.12
233 0.12
234 0.14
235 0.14
236 0.15
237 0.13