Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q7SE72

Protein Details
Accession Q7SE72    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
9-34AAKPVVKRKRSENGEPIKKRRKSEAGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
11-31KPVVKRKRSENGEPIKKRRKS
Subcellular Location(s) nucl 12, cyto_nucl 10.333, mito 8.5, cyto_mito 8.166, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR005612  CCAAT-binding_factor  
IPR027193  Noc4  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0030692  C:Noc4p-Nop14p complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0000480  P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000447  P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000472  P:endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
KEGG ncr:NCU00501  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03914  CBF  
Amino Acid Sequences MPSTVKAQAAKPVVKRKRSENGEPIKKRRKSEAGEEKEDLASQIQNLESQINESRKHYNNIATLIEYAEKQNEDPKTAIAAAEALCRVFVRLLASGSLVKKKDASEKDATVAKWLRDRLNDHHKALVAMFKSTKLATQALVLAMALLKAEAQYLEGKDEAVFPWPLFNAIISALLTSPVEEVRDEFCDKFIDEYDDIRFYTFEGIKDFLTERESVDEELQNTVFNLLLKMEDIPESSEDLEDFYIEQPAKKKHPLRSLSQHKKRAQEAWLALMHLGLSKEQRKKVLDVMASSIAPWFIKPELLMDFLTDCYNTGGSISLLALSGVFYLIQERNLDYPSFYQKLYSLLDTDILHSKYRSRFFRLLDTFLGSSHLPAVLVASFIKRLARLALNAPPSAIVVIVPWFYNLFKKHPLTTFMMHRVPRTKEEKELIEKEGVLDPFLPDEEDPMETHAIDSSLWEIVQLQSHYHPNVATIAKIISEQFTKQAYNLEDFLDHSYGSLIDAEMSKEVKKAPVIEFMIPKHIFTKADPGTEQTDSPLVSLWDFGSS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.67
2 0.7
3 0.71
4 0.74
5 0.76
6 0.78
7 0.77
8 0.79
9 0.81
10 0.86
11 0.88
12 0.88
13 0.86
14 0.81
15 0.8
16 0.79
17 0.75
18 0.76
19 0.77
20 0.75
21 0.76
22 0.73
23 0.65
24 0.56
25 0.5
26 0.39
27 0.3
28 0.22
29 0.15
30 0.15
31 0.13
32 0.14
33 0.15
34 0.15
35 0.13
36 0.16
37 0.22
38 0.24
39 0.27
40 0.29
41 0.36
42 0.4
43 0.45
44 0.46
45 0.46
46 0.45
47 0.47
48 0.45
49 0.38
50 0.34
51 0.3
52 0.27
53 0.21
54 0.18
55 0.17
56 0.16
57 0.16
58 0.22
59 0.22
60 0.24
61 0.24
62 0.23
63 0.23
64 0.23
65 0.22
66 0.15
67 0.16
68 0.13
69 0.15
70 0.15
71 0.11
72 0.11
73 0.11
74 0.12
75 0.1
76 0.1
77 0.1
78 0.11
79 0.13
80 0.13
81 0.14
82 0.18
83 0.21
84 0.26
85 0.24
86 0.23
87 0.25
88 0.27
89 0.35
90 0.36
91 0.4
92 0.41
93 0.42
94 0.45
95 0.46
96 0.44
97 0.42
98 0.4
99 0.36
100 0.34
101 0.37
102 0.37
103 0.38
104 0.43
105 0.44
106 0.52
107 0.56
108 0.53
109 0.52
110 0.48
111 0.44
112 0.39
113 0.36
114 0.25
115 0.22
116 0.2
117 0.18
118 0.19
119 0.18
120 0.19
121 0.16
122 0.17
123 0.14
124 0.15
125 0.15
126 0.14
127 0.13
128 0.11
129 0.08
130 0.07
131 0.07
132 0.05
133 0.03
134 0.03
135 0.03
136 0.04
137 0.04
138 0.05
139 0.08
140 0.08
141 0.1
142 0.1
143 0.11
144 0.11
145 0.12
146 0.11
147 0.11
148 0.11
149 0.1
150 0.11
151 0.11
152 0.11
153 0.1
154 0.1
155 0.07
156 0.07
157 0.08
158 0.07
159 0.07
160 0.06
161 0.07
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.06
168 0.07
169 0.09
170 0.12
171 0.14
172 0.14
173 0.14
174 0.15
175 0.15
176 0.15
177 0.14
178 0.15
179 0.14
180 0.15
181 0.16
182 0.16
183 0.16
184 0.15
185 0.14
186 0.1
187 0.15
188 0.15
189 0.14
190 0.14
191 0.16
192 0.15
193 0.17
194 0.17
195 0.12
196 0.13
197 0.12
198 0.11
199 0.12
200 0.13
201 0.13
202 0.14
203 0.14
204 0.13
205 0.14
206 0.13
207 0.11
208 0.1
209 0.09
210 0.08
211 0.07
212 0.06
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.07
221 0.07
222 0.08
223 0.08
224 0.08
225 0.07
226 0.07
227 0.07
228 0.06
229 0.06
230 0.05
231 0.08
232 0.08
233 0.1
234 0.14
235 0.18
236 0.21
237 0.29
238 0.35
239 0.4
240 0.49
241 0.52
242 0.54
243 0.61
244 0.69
245 0.72
246 0.75
247 0.77
248 0.72
249 0.73
250 0.69
251 0.63
252 0.55
253 0.5
254 0.42
255 0.36
256 0.32
257 0.27
258 0.23
259 0.18
260 0.15
261 0.1
262 0.09
263 0.06
264 0.09
265 0.15
266 0.2
267 0.22
268 0.26
269 0.27
270 0.29
271 0.32
272 0.35
273 0.3
274 0.26
275 0.27
276 0.24
277 0.22
278 0.2
279 0.16
280 0.1
281 0.09
282 0.08
283 0.06
284 0.05
285 0.06
286 0.06
287 0.07
288 0.08
289 0.1
290 0.1
291 0.09
292 0.09
293 0.1
294 0.1
295 0.08
296 0.07
297 0.06
298 0.06
299 0.06
300 0.05
301 0.05
302 0.05
303 0.05
304 0.05
305 0.04
306 0.04
307 0.04
308 0.04
309 0.03
310 0.04
311 0.03
312 0.03
313 0.03
314 0.06
315 0.06
316 0.08
317 0.08
318 0.09
319 0.1
320 0.12
321 0.12
322 0.1
323 0.13
324 0.17
325 0.18
326 0.17
327 0.17
328 0.16
329 0.19
330 0.2
331 0.18
332 0.13
333 0.12
334 0.15
335 0.14
336 0.15
337 0.17
338 0.17
339 0.17
340 0.16
341 0.21
342 0.25
343 0.32
344 0.34
345 0.37
346 0.41
347 0.42
348 0.52
349 0.5
350 0.48
351 0.42
352 0.4
353 0.33
354 0.28
355 0.28
356 0.18
357 0.14
358 0.11
359 0.1
360 0.07
361 0.07
362 0.07
363 0.05
364 0.06
365 0.06
366 0.06
367 0.07
368 0.07
369 0.09
370 0.08
371 0.09
372 0.12
373 0.13
374 0.14
375 0.18
376 0.23
377 0.25
378 0.24
379 0.24
380 0.2
381 0.19
382 0.17
383 0.13
384 0.07
385 0.05
386 0.06
387 0.06
388 0.06
389 0.06
390 0.07
391 0.08
392 0.13
393 0.15
394 0.18
395 0.25
396 0.28
397 0.33
398 0.35
399 0.39
400 0.39
401 0.41
402 0.44
403 0.43
404 0.47
405 0.44
406 0.45
407 0.47
408 0.46
409 0.5
410 0.5
411 0.47
412 0.47
413 0.51
414 0.53
415 0.54
416 0.54
417 0.49
418 0.44
419 0.41
420 0.35
421 0.35
422 0.29
423 0.21
424 0.18
425 0.15
426 0.14
427 0.14
428 0.13
429 0.08
430 0.1
431 0.1
432 0.11
433 0.11
434 0.12
435 0.13
436 0.12
437 0.12
438 0.11
439 0.1
440 0.09
441 0.09
442 0.08
443 0.08
444 0.08
445 0.07
446 0.08
447 0.09
448 0.13
449 0.13
450 0.14
451 0.17
452 0.22
453 0.22
454 0.23
455 0.22
456 0.19
457 0.24
458 0.22
459 0.19
460 0.16
461 0.15
462 0.14
463 0.15
464 0.15
465 0.12
466 0.14
467 0.15
468 0.17
469 0.2
470 0.2
471 0.2
472 0.25
473 0.25
474 0.26
475 0.26
476 0.23
477 0.21
478 0.22
479 0.25
480 0.2
481 0.17
482 0.14
483 0.13
484 0.12
485 0.12
486 0.11
487 0.07
488 0.08
489 0.09
490 0.1
491 0.11
492 0.13
493 0.13
494 0.14
495 0.16
496 0.19
497 0.21
498 0.25
499 0.26
500 0.34
501 0.36
502 0.4
503 0.43
504 0.41
505 0.47
506 0.43
507 0.41
508 0.34
509 0.33
510 0.3
511 0.26
512 0.35
513 0.3
514 0.34
515 0.34
516 0.36
517 0.37
518 0.38
519 0.36
520 0.28
521 0.27
522 0.22
523 0.22
524 0.2
525 0.16
526 0.14
527 0.15