Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q7SCU8

Protein Details
Accession Q7SCU8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
494-533DEFFHGRNHQHRQHQRHHPDPGRHRHRRHRHEDRFFDHIPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
514-523PGRHRHRRHR
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12, cyto 5.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031127  E3_UB_ligase_RBR  
IPR002867  IBR_dom  
IPR044066  TRIAD_supradom  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0000151  C:ubiquitin ligase complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0031624  F:ubiquitin conjugating enzyme binding  
GO:0061630  F:ubiquitin protein ligase activity  
GO:0032436  P:positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process  
GO:0000209  P:protein polyubiquitination  
GO:0006511  P:ubiquitin-dependent protein catabolic process  
KEGG ncr:NCU09232  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01485  IBR  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51873  TRIAD  
Amino Acid Sequences MYRRHTDNGEGSSRRENPPRRPTRITVVIRDEPVDGPPPHIEREERRHPWPPLRFPPPMVRWDLPSRPRPPVPPPRREGLWARAQELLGHNRHFLDRIDREVALDRLEARQAERRAQRAQQNRQEEEARRDRHEQERRQEVEAERRQEEHLEQVARRDERNRQHGGNVPAARANPVEARPTPVNRLPGPQVPAPVPAAPVATATTVNAATAPVPEPSVDGDDLVPCAVCAEEFPRSQVLTTSCAPEPHHYCGQCLQSFFRNAMDRNVWRNADTFPPTCCGNRFYIHANELGNENPSREVRARNERFRRLLGVEMIRQYIARTEQVRMEREHTGTRCSNVDCGWLIPERFTGVEGRRETEAVCHHCRQVTCIICEGRAHRARYQERCPGHRRRTEEQQQLEEQADRQFRQLRRDEAWRTCPTCDMTVERDGGCNLIKCIKCKTYFCYHCLLIHPNGHGDGPLCACPIFDLHEPERRIRERRAAGIPDHVAEGEEDEFFHGRNHQHRQHQRHHPDPGRHRHRRHRHEDRFFDHIPEDDDFFHGGDHRDILDDAPEELLNRPIEVDSDDDIDPEDLRFILDTLARGRMPR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.57
3 0.59
4 0.61
5 0.7
6 0.77
7 0.77
8 0.79
9 0.78
10 0.78
11 0.8
12 0.76
13 0.73
14 0.71
15 0.68
16 0.62
17 0.58
18 0.5
19 0.4
20 0.36
21 0.35
22 0.27
23 0.25
24 0.29
25 0.3
26 0.31
27 0.33
28 0.36
29 0.38
30 0.46
31 0.54
32 0.54
33 0.58
34 0.65
35 0.69
36 0.73
37 0.74
38 0.75
39 0.74
40 0.76
41 0.73
42 0.69
43 0.72
44 0.68
45 0.63
46 0.61
47 0.52
48 0.51
49 0.55
50 0.59
51 0.57
52 0.61
53 0.6
54 0.61
55 0.64
56 0.64
57 0.66
58 0.68
59 0.7
60 0.71
61 0.7
62 0.69
63 0.66
64 0.66
65 0.63
66 0.59
67 0.58
68 0.51
69 0.48
70 0.45
71 0.42
72 0.4
73 0.39
74 0.38
75 0.34
76 0.33
77 0.32
78 0.3
79 0.31
80 0.3
81 0.26
82 0.28
83 0.26
84 0.3
85 0.32
86 0.31
87 0.31
88 0.33
89 0.32
90 0.24
91 0.22
92 0.18
93 0.16
94 0.19
95 0.18
96 0.17
97 0.24
98 0.26
99 0.33
100 0.38
101 0.41
102 0.45
103 0.51
104 0.57
105 0.59
106 0.67
107 0.67
108 0.71
109 0.68
110 0.67
111 0.67
112 0.63
113 0.62
114 0.61
115 0.56
116 0.52
117 0.55
118 0.56
119 0.59
120 0.64
121 0.64
122 0.63
123 0.69
124 0.68
125 0.65
126 0.65
127 0.58
128 0.59
129 0.57
130 0.53
131 0.45
132 0.43
133 0.42
134 0.38
135 0.35
136 0.3
137 0.29
138 0.28
139 0.26
140 0.29
141 0.35
142 0.34
143 0.36
144 0.35
145 0.38
146 0.43
147 0.5
148 0.51
149 0.45
150 0.48
151 0.53
152 0.53
153 0.52
154 0.45
155 0.38
156 0.35
157 0.33
158 0.3
159 0.23
160 0.21
161 0.16
162 0.16
163 0.2
164 0.18
165 0.23
166 0.26
167 0.28
168 0.32
169 0.32
170 0.36
171 0.32
172 0.36
173 0.34
174 0.35
175 0.36
176 0.32
177 0.3
178 0.26
179 0.27
180 0.25
181 0.21
182 0.18
183 0.14
184 0.13
185 0.1
186 0.1
187 0.09
188 0.08
189 0.07
190 0.07
191 0.08
192 0.07
193 0.07
194 0.06
195 0.06
196 0.05
197 0.06
198 0.07
199 0.06
200 0.07
201 0.07
202 0.07
203 0.08
204 0.1
205 0.09
206 0.08
207 0.08
208 0.08
209 0.08
210 0.08
211 0.07
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.03
216 0.04
217 0.06
218 0.1
219 0.1
220 0.12
221 0.13
222 0.13
223 0.13
224 0.16
225 0.15
226 0.15
227 0.16
228 0.18
229 0.17
230 0.19
231 0.21
232 0.23
233 0.25
234 0.27
235 0.31
236 0.28
237 0.28
238 0.31
239 0.34
240 0.31
241 0.28
242 0.25
243 0.24
244 0.25
245 0.24
246 0.23
247 0.22
248 0.21
249 0.23
250 0.26
251 0.24
252 0.27
253 0.31
254 0.28
255 0.25
256 0.25
257 0.23
258 0.23
259 0.24
260 0.21
261 0.18
262 0.19
263 0.2
264 0.19
265 0.19
266 0.18
267 0.16
268 0.17
269 0.18
270 0.2
271 0.21
272 0.22
273 0.22
274 0.2
275 0.17
276 0.17
277 0.15
278 0.13
279 0.11
280 0.1
281 0.1
282 0.1
283 0.12
284 0.13
285 0.16
286 0.2
287 0.31
288 0.37
289 0.45
290 0.53
291 0.56
292 0.57
293 0.54
294 0.52
295 0.42
296 0.38
297 0.32
298 0.27
299 0.23
300 0.22
301 0.21
302 0.18
303 0.16
304 0.14
305 0.12
306 0.11
307 0.12
308 0.12
309 0.13
310 0.18
311 0.22
312 0.25
313 0.25
314 0.26
315 0.26
316 0.26
317 0.3
318 0.26
319 0.27
320 0.26
321 0.26
322 0.25
323 0.23
324 0.22
325 0.17
326 0.18
327 0.13
328 0.13
329 0.13
330 0.13
331 0.12
332 0.11
333 0.11
334 0.1
335 0.1
336 0.1
337 0.13
338 0.13
339 0.2
340 0.2
341 0.22
342 0.21
343 0.22
344 0.21
345 0.2
346 0.24
347 0.24
348 0.28
349 0.28
350 0.29
351 0.31
352 0.31
353 0.31
354 0.32
355 0.3
356 0.26
357 0.3
358 0.29
359 0.27
360 0.29
361 0.28
362 0.3
363 0.32
364 0.33
365 0.31
366 0.4
367 0.47
368 0.52
369 0.56
370 0.56
371 0.55
372 0.59
373 0.65
374 0.66
375 0.68
376 0.67
377 0.68
378 0.65
379 0.71
380 0.73
381 0.74
382 0.68
383 0.64
384 0.59
385 0.54
386 0.49
387 0.39
388 0.3
389 0.27
390 0.26
391 0.21
392 0.24
393 0.29
394 0.31
395 0.38
396 0.43
397 0.42
398 0.43
399 0.51
400 0.54
401 0.53
402 0.59
403 0.57
404 0.54
405 0.49
406 0.48
407 0.43
408 0.37
409 0.33
410 0.29
411 0.26
412 0.27
413 0.28
414 0.25
415 0.23
416 0.21
417 0.2
418 0.18
419 0.15
420 0.13
421 0.19
422 0.2
423 0.22
424 0.28
425 0.33
426 0.36
427 0.39
428 0.43
429 0.47
430 0.5
431 0.51
432 0.51
433 0.46
434 0.43
435 0.44
436 0.44
437 0.37
438 0.36
439 0.34
440 0.29
441 0.28
442 0.26
443 0.22
444 0.18
445 0.15
446 0.13
447 0.13
448 0.12
449 0.11
450 0.11
451 0.11
452 0.11
453 0.13
454 0.14
455 0.2
456 0.22
457 0.3
458 0.33
459 0.36
460 0.44
461 0.46
462 0.49
463 0.48
464 0.55
465 0.53
466 0.58
467 0.61
468 0.58
469 0.53
470 0.54
471 0.5
472 0.41
473 0.36
474 0.29
475 0.21
476 0.17
477 0.17
478 0.11
479 0.09
480 0.08
481 0.1
482 0.1
483 0.1
484 0.11
485 0.14
486 0.18
487 0.26
488 0.36
489 0.42
490 0.52
491 0.62
492 0.71
493 0.76
494 0.82
495 0.84
496 0.83
497 0.86
498 0.84
499 0.85
500 0.86
501 0.87
502 0.87
503 0.87
504 0.88
505 0.89
506 0.91
507 0.92
508 0.92
509 0.93
510 0.93
511 0.93
512 0.93
513 0.87
514 0.83
515 0.74
516 0.66
517 0.56
518 0.47
519 0.39
520 0.32
521 0.28
522 0.22
523 0.22
524 0.19
525 0.17
526 0.16
527 0.15
528 0.15
529 0.15
530 0.15
531 0.14
532 0.15
533 0.15
534 0.15
535 0.16
536 0.15
537 0.14
538 0.14
539 0.14
540 0.13
541 0.14
542 0.19
543 0.16
544 0.15
545 0.16
546 0.14
547 0.15
548 0.15
549 0.17
550 0.14
551 0.17
552 0.17
553 0.16
554 0.17
555 0.17
556 0.16
557 0.13
558 0.12
559 0.09
560 0.09
561 0.1
562 0.09
563 0.1
564 0.12
565 0.14
566 0.16
567 0.21