FuNGI

A0A167VJM0

Protein Details

Accession

A0A167VJM0

Localization Confidence

High

Confidence Score

24.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
135-160	LQYAPFSKIPKRSRKDKRQGMIDQDS	Hydrophilic
196-215	IQYMKDKKAKQTRSKDSTGR	Hydrophilic
390-414	TEPAPKPPRAPRNRREKARERAKAK	Basic
640-663	PTGPRGGRSRHHRGPRGGNRSGNK	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
145-149	KRSRK
202-324	KKAKQTRSKDSTGRPLKAPMRESKETRADRNKKVTTRAEREKEKREKIAGPSIQLPEKPKDKPAKEPVKSVKTGRAPGTPELSAAKDKGVKELKQKDRAPPTAPAADRKKDKGKTIIKPQILR
337-359	RPARTPKDSREPRDGKAKDVKGK
393-414	APKPPRAPRNRREKARERAKAK
633-663	GGNGKAPPTGPRGGRSRHHRGPRGGNRSGNK

Subcellular Location(s)

nucl 19, mito 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom IPR039722 Upf3 IPR005120 UPF3_dom
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1 PF03467 Smg4_UPF3
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12455 RRM_like_Smg4_UPF3

Amino Acid Sequences

MSSRSSRTPGVLSVPSDATQRGTEKSSTGQSSAAKAPTPALKVVVRRLPPGLTQTEFESVLGDEWKVGGPWVDWYSFKPGKATKGIAKPSKPGRAYFHLTDQSQVTVLHEKIKLSQFHDAANTHRDPVLTGPPYLQYAPFSKIPKRSRKDKRQGMIDQDSDFIAFLESLTNPIQKASPDAWMEEPKEEIPVVTPLIQYMKDKKAKQTRSKDSTGRPLKAPMRESKETRADRNKKVTTRAEREKEKREKIAGPSIQLPEKPKDKPAKEPVKSVKTGRAPGTPELSAAKDKGVKELKQKDRAPPTAPAADRKKDKGKTIIKPQILRREPTVEQSADAARPARTPKDSREPRDGKAKDVKGKAEEKTTVEKEAETATSATLTSTPITNVAPPTEPAPKPPRAPRNRREKARERAKAKSEESNNNAPNPPTGPKASMPSESGTPAAQETSTKSIAAGTSRPTTASSKQAQSTQTPAPAQPATQAFLKHANPSQGVTEENLLTGFSVFGQVLKTEIDKKKGFGYVYFAEPEALKKAIQASPVQIADSKVVVLERKTGPQIAMSRGGRGGGGAVRSGAGTPPAQPPAQPQSLQTQTVQNQSQPPAPATVSATQGSSQAQNNQASKQPPTAPAAERAAAGGNGKAPPTGPRGGRSRHHRGPRGGNRSGNKASGSASGNAPASAPAAAPSGSSAQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.32
2	0.3
3	0.29
4	0.27
5	0.23
6	0.23
7	0.24
8	0.23
9	0.25
10	0.25
11	0.25
12	0.29
13	0.34
14	0.33
15	0.31
16	0.33
17	0.31
18	0.35
19	0.38
20	0.35
21	0.29
22	0.27
23	0.3
24	0.31
25	0.32
26	0.28
27	0.27
28	0.3
29	0.33
30	0.4
31	0.44
32	0.42
33	0.42
34	0.43
35	0.41
36	0.4
37	0.41
38	0.38
39	0.33
40	0.31
41	0.32
42	0.32
43	0.3
44	0.26
45	0.22
46	0.17
47	0.16
48	0.16
49	0.12
50	0.09
51	0.09
52	0.1
53	0.09
54	0.09
55	0.09
56	0.08
57	0.13
58	0.16
59	0.17
60	0.17
61	0.19
62	0.29
63	0.31
64	0.31
65	0.32
66	0.34
67	0.39
68	0.44
69	0.47
70	0.46
71	0.52
72	0.61
73	0.62
74	0.62
75	0.63
76	0.66
77	0.7
78	0.64
79	0.6
80	0.58
81	0.57
82	0.61
83	0.56
84	0.56
85	0.53
86	0.51
87	0.48
88	0.42
89	0.35
90	0.29
91	0.26
92	0.2
93	0.2
94	0.2
95	0.23
96	0.24
97	0.24
98	0.28
99	0.35
100	0.36
101	0.34
102	0.41
103	0.36
104	0.36
105	0.4
106	0.35
107	0.33
108	0.35
109	0.33
110	0.27
111	0.27
112	0.25
113	0.22
114	0.24
115	0.29
116	0.24
117	0.23
118	0.23
119	0.23
120	0.25
121	0.25
122	0.22
123	0.16
124	0.17
125	0.21
126	0.25
127	0.28
128	0.32
129	0.41
130	0.5
131	0.58
132	0.62
133	0.69
134	0.75
135	0.82
136	0.87
137	0.88
138	0.86
139	0.85
140	0.85
141	0.83
142	0.79
143	0.71
144	0.6
145	0.51
146	0.43
147	0.33
148	0.26
149	0.17
150	0.1
151	0.06
152	0.05
153	0.06
154	0.06
155	0.08
156	0.1
157	0.11
158	0.11
159	0.12
160	0.13
161	0.11
162	0.16
163	0.14
164	0.18
165	0.18
166	0.2
167	0.23
168	0.26
169	0.27
170	0.24
171	0.25
172	0.19
173	0.2
174	0.18
175	0.14
176	0.11
177	0.11
178	0.12
179	0.11
180	0.11
181	0.11
182	0.13
183	0.14
184	0.15
185	0.2
186	0.28
187	0.34
188	0.36
189	0.45
190	0.53
191	0.62
192	0.7
193	0.74
194	0.76
195	0.76
196	0.8
197	0.78
198	0.74
199	0.75
200	0.72
201	0.65
202	0.56
203	0.57
204	0.55
205	0.54
206	0.53
207	0.5
208	0.5
209	0.52
210	0.54
211	0.54
212	0.58
213	0.56
214	0.59
215	0.62
216	0.63
217	0.65
218	0.71
219	0.71
220	0.65
221	0.69
222	0.7
223	0.69
224	0.7
225	0.72
226	0.7
227	0.72
228	0.76
229	0.78
230	0.78
231	0.74
232	0.7
233	0.65
234	0.62
235	0.58
236	0.6
237	0.52
238	0.44
239	0.43
240	0.4
241	0.37
242	0.34
243	0.33
244	0.29
245	0.32
246	0.31
247	0.34
248	0.41
249	0.42
250	0.49
251	0.56
252	0.62
253	0.59
254	0.66
255	0.67
256	0.64
257	0.65
258	0.57
259	0.55
260	0.49
261	0.52
262	0.45
263	0.41
264	0.37
265	0.36
266	0.38
267	0.3
268	0.25
269	0.22
270	0.21
271	0.18
272	0.15
273	0.15
274	0.15
275	0.16
276	0.22
277	0.26
278	0.28
279	0.36
280	0.46
281	0.52
282	0.57
283	0.6
284	0.61
285	0.64
286	0.65
287	0.59
288	0.52
289	0.48
290	0.45
291	0.42
292	0.42
293	0.39
294	0.41
295	0.41
296	0.43
297	0.47
298	0.44
299	0.48
300	0.5
301	0.53
302	0.55
303	0.62
304	0.66
305	0.62
306	0.63
307	0.65
308	0.65
309	0.59
310	0.53
311	0.45
312	0.42
313	0.38
314	0.37
315	0.35
316	0.25
317	0.23
318	0.22
319	0.21
320	0.16
321	0.16
322	0.13
323	0.09
324	0.11
325	0.13
326	0.14
327	0.17
328	0.2
329	0.24
330	0.34
331	0.41
332	0.44
333	0.52
334	0.53
335	0.52
336	0.59
337	0.55
338	0.5
339	0.51
340	0.51
341	0.47
342	0.47
343	0.47
344	0.41
345	0.45
346	0.41
347	0.36
348	0.34
349	0.29
350	0.33
351	0.31
352	0.28
353	0.24
354	0.22
355	0.19
356	0.18
357	0.16
358	0.1
359	0.09
360	0.07
361	0.07
362	0.07
363	0.06
364	0.06
365	0.06
366	0.06
367	0.06
368	0.06
369	0.07
370	0.07
371	0.08
372	0.08
373	0.09
374	0.09
375	0.09
376	0.12
377	0.18
378	0.17
379	0.22
380	0.28
381	0.31
382	0.35
383	0.43
384	0.51
385	0.55
386	0.65
387	0.68
388	0.73
389	0.79
390	0.82
391	0.84
392	0.83
393	0.83
394	0.84
395	0.84
396	0.78
397	0.77
398	0.75
399	0.72
400	0.65
401	0.63
402	0.58
403	0.57
404	0.57
405	0.58
406	0.52
407	0.48
408	0.46
409	0.39
410	0.33
411	0.28
412	0.25
413	0.19
414	0.19
415	0.19
416	0.19
417	0.23
418	0.24
419	0.24
420	0.23
421	0.22
422	0.22
423	0.2
424	0.19
425	0.14
426	0.12
427	0.1
428	0.09
429	0.08
430	0.07
431	0.09
432	0.13
433	0.13
434	0.13
435	0.12
436	0.13
437	0.14
438	0.15
439	0.14
440	0.13
441	0.15
442	0.15
443	0.16
444	0.17
445	0.2
446	0.21
447	0.27
448	0.28
449	0.3
450	0.32
451	0.36
452	0.36
453	0.34
454	0.36
455	0.31
456	0.31
457	0.28
458	0.26
459	0.26
460	0.24
461	0.22
462	0.22
463	0.2
464	0.18
465	0.19
466	0.19
467	0.17
468	0.22
469	0.24
470	0.23
471	0.25
472	0.26
473	0.25
474	0.25
475	0.25
476	0.2
477	0.2
478	0.17
479	0.17
480	0.13
481	0.12
482	0.11
483	0.09
484	0.08
485	0.07
486	0.06
487	0.04
488	0.05
489	0.05
490	0.06
491	0.06
492	0.06
493	0.07
494	0.08
495	0.1
496	0.18
497	0.22
498	0.28
499	0.29
500	0.3
501	0.34
502	0.37
503	0.36
504	0.29
505	0.31
506	0.27
507	0.28
508	0.28
509	0.24
510	0.2
511	0.2
512	0.2
513	0.16
514	0.15
515	0.12
516	0.12
517	0.16
518	0.18
519	0.2
520	0.2
521	0.2
522	0.24
523	0.25
524	0.24
525	0.21
526	0.2
527	0.19
528	0.17
529	0.14
530	0.1
531	0.11
532	0.12
533	0.12
534	0.17
535	0.18
536	0.21
537	0.23
538	0.24
539	0.23
540	0.27
541	0.3
542	0.27
543	0.34
544	0.31
545	0.31
546	0.3
547	0.3
548	0.24
549	0.2
550	0.18
551	0.11
552	0.12
553	0.1
554	0.1
555	0.1
556	0.1
557	0.1
558	0.09
559	0.09
560	0.09
561	0.11
562	0.15
563	0.19
564	0.19
565	0.19
566	0.25
567	0.3
568	0.35
569	0.33
570	0.3
571	0.36
572	0.4
573	0.41
574	0.37
575	0.37
576	0.36
577	0.42
578	0.42
579	0.37
580	0.38
581	0.39
582	0.42
583	0.36
584	0.34
585	0.3
586	0.28
587	0.27
588	0.25
589	0.25
590	0.24
591	0.22
592	0.22
593	0.19
594	0.2
595	0.2
596	0.2
597	0.2
598	0.23
599	0.28
600	0.33
601	0.35
602	0.36
603	0.4
604	0.4
605	0.41
606	0.41
607	0.4
608	0.38
609	0.4
610	0.43
611	0.4
612	0.42
613	0.43
614	0.37
615	0.33
616	0.3
617	0.27
618	0.22
619	0.2
620	0.15
621	0.14
622	0.15
623	0.15
624	0.15
625	0.14
626	0.17
627	0.22
628	0.27
629	0.27
630	0.32
631	0.39
632	0.46
633	0.54
634	0.6
635	0.65
636	0.68
637	0.75
638	0.78
639	0.79
640	0.83
641	0.85
642	0.85
643	0.82
644	0.81
645	0.75
646	0.75
647	0.7
648	0.62
649	0.53
650	0.45
651	0.4
652	0.37
653	0.35
654	0.29
655	0.27
656	0.27
657	0.26
658	0.25
659	0.23
660	0.18
661	0.15
662	0.13
663	0.12
664	0.09
665	0.1
666	0.1
667	0.1

A0A167VJM0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer