Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F5HCQ1

Protein Details
Accession F5HCQ1    Localization Confidence High Confidence Score 19.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
38-58EEEAPKKPSTRKAPAPKFANAHydrophilic
443-524GDRDRNRGRDHSRDRYRDRDGDRDRHRDRDRDRDRRRDDDYRERRRSPSPRRDRDRDHGERRKRSPSRERDRYESDKRRKVDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
44-54KPSTRKAPAPK
93-100KRREAAAK
421-523RKSAPERSRGDDRPRGEDRYRGGDRDRNRGRDHSRDRYRDRDGDRDRHRDRDRDRDRRRDDDYRERRRSPSPRRDRDRDHGERRKRSPSRERDRYESDKRRKV
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR033194  MFAP1  
IPR009730  MFAP1_C  
Gene Ontology GO:0005684  C:U2-type spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG ncr:NCU03598  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06991  MFAP1  
Amino Acid Sequences MPPAKSMTANPVKAPRYRAGKPTGVDSESESDNVPEDEEEAPKKPSTRKAPAPKFANAAGPGRIISRGNDGKINLKAAGIGSNAPDNEEEEKKRREAAAKARIAAEQKAREEGFVTEEEDEEEEESGNEEEESEEEESSEEEEEAPRRLMLRPKFIRKADREAGVTASNSASTNKKSTPEEDEAAAAEARRRAADELVEEQIKKDLAARAAGKKHWDDDTDPEDDQIDDTDDIDPEAEYAAWKLRELKRVRREREAIEAKEKELAEIERRRNLTEEERRAEDEKHLQQQKEEKEGKGKMAYMQKYFHKGAFYQDESKEMGLDKRDIMGARFADDVKNRELLPKALQLRDMTKLGRKGATKYRDLKSEDTGQWGRLHDNRPGREFDRFGDERFQPDDSHRDRYRDRGGDGPKGSNAIPLGDRKSAPERSRGDDRPRGEDRYRGGDRDRNRGRDHSRDRYRDRDGDRDRHRDRDRDRDRRRDDDYRERRRSPSPRRDRDRDHGERRKRSPSRERDRYESDKRRKVDTR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.54
3 0.53
4 0.56
5 0.59
6 0.58
7 0.6
8 0.57
9 0.59
10 0.57
11 0.5
12 0.45
13 0.41
14 0.37
15 0.31
16 0.31
17 0.24
18 0.18
19 0.18
20 0.18
21 0.15
22 0.11
23 0.12
24 0.13
25 0.16
26 0.19
27 0.19
28 0.22
29 0.24
30 0.29
31 0.34
32 0.42
33 0.48
34 0.55
35 0.63
36 0.71
37 0.79
38 0.83
39 0.82
40 0.77
41 0.71
42 0.63
43 0.59
44 0.51
45 0.44
46 0.36
47 0.31
48 0.27
49 0.24
50 0.25
51 0.19
52 0.17
53 0.23
54 0.26
55 0.27
56 0.31
57 0.31
58 0.35
59 0.37
60 0.38
61 0.29
62 0.24
63 0.23
64 0.2
65 0.21
66 0.16
67 0.14
68 0.12
69 0.15
70 0.15
71 0.15
72 0.15
73 0.15
74 0.19
75 0.23
76 0.27
77 0.31
78 0.36
79 0.36
80 0.4
81 0.41
82 0.43
83 0.46
84 0.51
85 0.54
86 0.54
87 0.55
88 0.52
89 0.51
90 0.48
91 0.44
92 0.41
93 0.36
94 0.33
95 0.36
96 0.35
97 0.32
98 0.31
99 0.27
100 0.22
101 0.18
102 0.18
103 0.13
104 0.13
105 0.14
106 0.13
107 0.12
108 0.1
109 0.09
110 0.07
111 0.07
112 0.08
113 0.07
114 0.07
115 0.06
116 0.06
117 0.06
118 0.06
119 0.09
120 0.09
121 0.08
122 0.08
123 0.09
124 0.09
125 0.09
126 0.09
127 0.07
128 0.06
129 0.08
130 0.1
131 0.11
132 0.12
133 0.11
134 0.12
135 0.16
136 0.24
137 0.27
138 0.36
139 0.43
140 0.51
141 0.59
142 0.63
143 0.69
144 0.66
145 0.7
146 0.64
147 0.6
148 0.53
149 0.46
150 0.43
151 0.35
152 0.3
153 0.21
154 0.16
155 0.13
156 0.12
157 0.12
158 0.13
159 0.14
160 0.17
161 0.18
162 0.22
163 0.24
164 0.27
165 0.32
166 0.34
167 0.33
168 0.3
169 0.28
170 0.25
171 0.23
172 0.21
173 0.14
174 0.11
175 0.1
176 0.1
177 0.1
178 0.1
179 0.1
180 0.11
181 0.12
182 0.13
183 0.14
184 0.16
185 0.17
186 0.16
187 0.15
188 0.16
189 0.14
190 0.12
191 0.12
192 0.13
193 0.12
194 0.17
195 0.19
196 0.24
197 0.27
198 0.28
199 0.29
200 0.27
201 0.28
202 0.26
203 0.25
204 0.21
205 0.24
206 0.26
207 0.25
208 0.24
209 0.21
210 0.2
211 0.18
212 0.16
213 0.11
214 0.09
215 0.06
216 0.07
217 0.07
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.04
223 0.05
224 0.04
225 0.03
226 0.04
227 0.07
228 0.07
229 0.07
230 0.15
231 0.18
232 0.27
233 0.32
234 0.41
235 0.49
236 0.58
237 0.62
238 0.63
239 0.63
240 0.57
241 0.62
242 0.59
243 0.52
244 0.5
245 0.47
246 0.39
247 0.39
248 0.37
249 0.27
250 0.21
251 0.19
252 0.19
253 0.25
254 0.27
255 0.28
256 0.29
257 0.29
258 0.29
259 0.31
260 0.33
261 0.36
262 0.39
263 0.37
264 0.38
265 0.4
266 0.4
267 0.38
268 0.32
269 0.3
270 0.28
271 0.34
272 0.37
273 0.35
274 0.37
275 0.43
276 0.43
277 0.45
278 0.43
279 0.36
280 0.38
281 0.39
282 0.39
283 0.34
284 0.31
285 0.27
286 0.32
287 0.34
288 0.3
289 0.32
290 0.32
291 0.36
292 0.37
293 0.33
294 0.27
295 0.24
296 0.27
297 0.29
298 0.29
299 0.29
300 0.28
301 0.28
302 0.27
303 0.27
304 0.22
305 0.17
306 0.16
307 0.13
308 0.14
309 0.12
310 0.12
311 0.14
312 0.13
313 0.13
314 0.15
315 0.13
316 0.13
317 0.14
318 0.14
319 0.16
320 0.18
321 0.2
322 0.18
323 0.2
324 0.18
325 0.21
326 0.22
327 0.2
328 0.21
329 0.25
330 0.27
331 0.26
332 0.29
333 0.27
334 0.28
335 0.3
336 0.29
337 0.24
338 0.25
339 0.27
340 0.27
341 0.3
342 0.3
343 0.32
344 0.39
345 0.43
346 0.46
347 0.5
348 0.51
349 0.53
350 0.55
351 0.52
352 0.48
353 0.5
354 0.43
355 0.43
356 0.41
357 0.36
358 0.35
359 0.33
360 0.32
361 0.3
362 0.32
363 0.31
364 0.38
365 0.4
366 0.4
367 0.44
368 0.43
369 0.42
370 0.41
371 0.36
372 0.37
373 0.34
374 0.33
375 0.34
376 0.33
377 0.31
378 0.32
379 0.31
380 0.23
381 0.25
382 0.33
383 0.3
384 0.39
385 0.38
386 0.42
387 0.43
388 0.49
389 0.56
390 0.51
391 0.49
392 0.48
393 0.5
394 0.52
395 0.53
396 0.48
397 0.39
398 0.37
399 0.34
400 0.29
401 0.24
402 0.18
403 0.18
404 0.2
405 0.23
406 0.24
407 0.24
408 0.26
409 0.32
410 0.39
411 0.39
412 0.43
413 0.44
414 0.47
415 0.56
416 0.59
417 0.61
418 0.61
419 0.62
420 0.61
421 0.62
422 0.63
423 0.56
424 0.54
425 0.49
426 0.51
427 0.51
428 0.46
429 0.47
430 0.47
431 0.49
432 0.55
433 0.59
434 0.56
435 0.58
436 0.63
437 0.65
438 0.69
439 0.74
440 0.74
441 0.76
442 0.79
443 0.81
444 0.8
445 0.81
446 0.79
447 0.75
448 0.74
449 0.73
450 0.73
451 0.75
452 0.78
453 0.74
454 0.76
455 0.77
456 0.76
457 0.74
458 0.75
459 0.77
460 0.78
461 0.83
462 0.84
463 0.85
464 0.83
465 0.84
466 0.83
467 0.81
468 0.81
469 0.82
470 0.82
471 0.83
472 0.8
473 0.77
474 0.78
475 0.8
476 0.79
477 0.8
478 0.8
479 0.82
480 0.87
481 0.91
482 0.9
483 0.9
484 0.89
485 0.89
486 0.88
487 0.88
488 0.89
489 0.89
490 0.87
491 0.88
492 0.86
493 0.85
494 0.85
495 0.86
496 0.86
497 0.87
498 0.87
499 0.84
500 0.85
501 0.84
502 0.84
503 0.84
504 0.84
505 0.82
506 0.78