Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q9HED8

Protein Details
Accession Q9HED8    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
99-123TGVWVINKQTRRKRPPTNPARPEDGHydrophilic
331-360TKSPKTPGGGGPPKPKRRKSKNVITTPGAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
332-351KSPKTPGGGGPPKPKRRKSK
Subcellular Location(s) cyto 12, nucl 8, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007018  Mediator_Med6  
IPR038566  Mediator_Med6_sf  
Gene Ontology GO:0070847  C:core mediator complex  
GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003713  F:transcription coactivator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG ncr:NCU03809  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04934  Med6  
Amino Acid Sequences MAFDPAANAGPPLDEIQWHTPPQFEAGIHSNSILYYFAQSPFYDKTSNNEVVFQQGLNNQAMSQYLATRELFESRLKEMSGLEFIVAQEPAETGPGMGTGVWVINKQTRRKRPPTNPARPEDGPPDEIIVHSVYFVVGENIYMAPTLADVLSSRIGAIATAITKTIPLVDEVSDWAPAVGRRYITPAQPSAGAGAASGTTNYTASRTATPLPDGLPSTATTNKPGAKAGGGTTTNDPLLDSLLMEEALLTHERYGTEYMDENPITGKPGDFHLTSTGRKTQTKSALTLKEAAAALPALNTKGLGAAGSNPLAKGAAAAAAANANAVTGKETKSPKTPGGGGPPKPKRRKSKNVITTPGAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.17
3 0.23
4 0.27
5 0.29
6 0.28
7 0.28
8 0.28
9 0.3
10 0.28
11 0.21
12 0.22
13 0.25
14 0.27
15 0.25
16 0.24
17 0.21
18 0.18
19 0.19
20 0.15
21 0.1
22 0.11
23 0.13
24 0.14
25 0.16
26 0.17
27 0.2
28 0.22
29 0.25
30 0.25
31 0.23
32 0.28
33 0.33
34 0.39
35 0.35
36 0.35
37 0.32
38 0.32
39 0.33
40 0.27
41 0.22
42 0.18
43 0.21
44 0.19
45 0.18
46 0.15
47 0.14
48 0.15
49 0.13
50 0.12
51 0.1
52 0.11
53 0.13
54 0.14
55 0.15
56 0.16
57 0.17
58 0.18
59 0.2
60 0.21
61 0.21
62 0.22
63 0.2
64 0.2
65 0.19
66 0.19
67 0.17
68 0.15
69 0.12
70 0.11
71 0.11
72 0.12
73 0.11
74 0.08
75 0.07
76 0.07
77 0.07
78 0.07
79 0.06
80 0.05
81 0.05
82 0.05
83 0.05
84 0.05
85 0.04
86 0.04
87 0.05
88 0.05
89 0.06
90 0.08
91 0.13
92 0.2
93 0.28
94 0.38
95 0.48
96 0.57
97 0.67
98 0.76
99 0.81
100 0.86
101 0.88
102 0.9
103 0.87
104 0.82
105 0.79
106 0.7
107 0.63
108 0.58
109 0.5
110 0.4
111 0.32
112 0.29
113 0.22
114 0.2
115 0.18
116 0.12
117 0.09
118 0.07
119 0.07
120 0.05
121 0.05
122 0.06
123 0.05
124 0.04
125 0.04
126 0.05
127 0.05
128 0.05
129 0.05
130 0.04
131 0.04
132 0.04
133 0.04
134 0.03
135 0.03
136 0.03
137 0.05
138 0.06
139 0.06
140 0.06
141 0.05
142 0.06
143 0.05
144 0.05
145 0.04
146 0.04
147 0.05
148 0.05
149 0.04
150 0.04
151 0.05
152 0.05
153 0.04
154 0.05
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.08
159 0.08
160 0.08
161 0.07
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.08
166 0.08
167 0.08
168 0.08
169 0.14
170 0.16
171 0.17
172 0.19
173 0.18
174 0.18
175 0.18
176 0.17
177 0.13
178 0.11
179 0.09
180 0.06
181 0.06
182 0.05
183 0.05
184 0.04
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.05
189 0.05
190 0.06
191 0.07
192 0.09
193 0.1
194 0.12
195 0.13
196 0.14
197 0.14
198 0.14
199 0.14
200 0.14
201 0.12
202 0.11
203 0.11
204 0.13
205 0.16
206 0.16
207 0.17
208 0.2
209 0.22
210 0.21
211 0.22
212 0.2
213 0.16
214 0.17
215 0.15
216 0.17
217 0.15
218 0.16
219 0.17
220 0.17
221 0.16
222 0.15
223 0.14
224 0.09
225 0.09
226 0.08
227 0.06
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.04
234 0.05
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.07
239 0.08
240 0.1
241 0.11
242 0.1
243 0.11
244 0.12
245 0.14
246 0.17
247 0.17
248 0.15
249 0.15
250 0.14
251 0.15
252 0.14
253 0.13
254 0.09
255 0.13
256 0.16
257 0.15
258 0.16
259 0.2
260 0.24
261 0.25
262 0.28
263 0.32
264 0.33
265 0.36
266 0.39
267 0.41
268 0.46
269 0.48
270 0.49
271 0.51
272 0.51
273 0.49
274 0.5
275 0.41
276 0.37
277 0.33
278 0.28
279 0.2
280 0.16
281 0.14
282 0.11
283 0.12
284 0.08
285 0.08
286 0.08
287 0.07
288 0.07
289 0.07
290 0.06
291 0.06
292 0.08
293 0.1
294 0.12
295 0.13
296 0.12
297 0.12
298 0.12
299 0.12
300 0.1
301 0.07
302 0.07
303 0.06
304 0.07
305 0.07
306 0.07
307 0.07
308 0.07
309 0.06
310 0.05
311 0.05
312 0.05
313 0.08
314 0.09
315 0.12
316 0.19
317 0.23
318 0.28
319 0.35
320 0.4
321 0.42
322 0.45
323 0.48
324 0.47
325 0.53
326 0.58
327 0.59
328 0.64
329 0.71
330 0.76
331 0.82
332 0.85
333 0.86
334 0.88
335 0.91
336 0.91
337 0.92
338 0.92
339 0.92
340 0.9