Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q7SG96

Protein Details
Accession Q7SG96    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
197-217TREKKREEKERHKSSWRHRHEBasic
259-288RTRSRDDRPRSRDRHPDRKRPRSEKEETSPBasic
312-339RQSRRDFARDKDRHRRDQERYRDRGRDLBasic
361-395LTDDRERRRHRDLGHRSERKSGRSRSRSPWPTSRGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
197-241TREKKREEKERHKSSWRHRHEHGDKDRDRERGGRHQHRSHRSPRR
257-295DDRTRSRDDRPRSRDRHPDRKRPRSEKEETSPAKQQRRR
365-391RERRRHRDLGHRSERKSGRSRSRSPWP
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR045844  RRM_Ist3-like  
Gene Ontology GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0005686  C:U2 snRNP  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG ncr:NCU02467  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12411  RRM_ist3_like  
Amino Acid Sequences MNQIRAIQALNKREIEAGIPPEASWHVDYRDTAFVYFGGLPYDLSEGDVITIFSQFGEPVFLKLVRDKETGKSKGFGWLKYEDQRSTDLAVDNLGGAEIGGRLIRVDHARYKIRDDEDPEEGRIGWEDMVRKERRERGLASEVDDTGDEEEDDTKPRRPLLKEEKELQLLLENHDDDDPMKEFLIEEKKKEVEEALTREKKREEKERHKSSWRHRHEHGDKDRDRERGGRHQHRSHRSPRRVEDVDSDIRGRDRNHDDRTRSRDDRPRSRDRHPDRKRPRSEKEETSPAKQQRRRRDDADDVEMQDANYDDRQSRRDFARDKDRHRRDQERYRDRGRDLDKERGTDRDRHNSERHDRERDLTDDRERRRHRDLGHRSERKSGRSRSRSPWPTSRG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.32
3 0.31
4 0.28
5 0.24
6 0.23
7 0.21
8 0.22
9 0.23
10 0.23
11 0.2
12 0.19
13 0.18
14 0.21
15 0.22
16 0.24
17 0.28
18 0.26
19 0.24
20 0.22
21 0.19
22 0.2
23 0.19
24 0.15
25 0.12
26 0.11
27 0.11
28 0.11
29 0.13
30 0.1
31 0.1
32 0.1
33 0.08
34 0.08
35 0.09
36 0.08
37 0.07
38 0.07
39 0.06
40 0.07
41 0.07
42 0.06
43 0.06
44 0.1
45 0.1
46 0.11
47 0.14
48 0.15
49 0.16
50 0.21
51 0.25
52 0.26
53 0.29
54 0.3
55 0.35
56 0.44
57 0.48
58 0.46
59 0.43
60 0.39
61 0.45
62 0.47
63 0.41
64 0.36
65 0.35
66 0.38
67 0.43
68 0.48
69 0.4
70 0.38
71 0.38
72 0.35
73 0.33
74 0.3
75 0.24
76 0.19
77 0.17
78 0.15
79 0.13
80 0.11
81 0.08
82 0.05
83 0.04
84 0.04
85 0.03
86 0.04
87 0.04
88 0.04
89 0.04
90 0.04
91 0.08
92 0.1
93 0.14
94 0.19
95 0.25
96 0.32
97 0.34
98 0.38
99 0.42
100 0.42
101 0.43
102 0.43
103 0.41
104 0.41
105 0.41
106 0.37
107 0.31
108 0.28
109 0.24
110 0.19
111 0.16
112 0.1
113 0.1
114 0.12
115 0.14
116 0.23
117 0.25
118 0.27
119 0.33
120 0.39
121 0.42
122 0.44
123 0.43
124 0.42
125 0.47
126 0.45
127 0.42
128 0.36
129 0.31
130 0.27
131 0.25
132 0.18
133 0.11
134 0.1
135 0.07
136 0.05
137 0.07
138 0.07
139 0.1
140 0.12
141 0.15
142 0.16
143 0.2
144 0.25
145 0.26
146 0.36
147 0.44
148 0.52
149 0.53
150 0.56
151 0.56
152 0.52
153 0.5
154 0.4
155 0.34
156 0.25
157 0.22
158 0.2
159 0.16
160 0.15
161 0.15
162 0.15
163 0.1
164 0.11
165 0.1
166 0.08
167 0.08
168 0.07
169 0.07
170 0.11
171 0.21
172 0.2
173 0.2
174 0.23
175 0.24
176 0.24
177 0.24
178 0.21
179 0.14
180 0.18
181 0.21
182 0.28
183 0.33
184 0.34
185 0.36
186 0.39
187 0.41
188 0.42
189 0.47
190 0.49
191 0.53
192 0.64
193 0.71
194 0.74
195 0.77
196 0.8
197 0.8
198 0.8
199 0.78
200 0.73
201 0.67
202 0.72
203 0.7
204 0.72
205 0.7
206 0.7
207 0.64
208 0.64
209 0.66
210 0.57
211 0.52
212 0.47
213 0.43
214 0.42
215 0.5
216 0.54
217 0.58
218 0.64
219 0.71
220 0.74
221 0.77
222 0.78
223 0.78
224 0.77
225 0.77
226 0.73
227 0.72
228 0.66
229 0.6
230 0.54
231 0.5
232 0.44
233 0.38
234 0.34
235 0.25
236 0.24
237 0.25
238 0.21
239 0.23
240 0.28
241 0.34
242 0.42
243 0.48
244 0.53
245 0.59
246 0.65
247 0.66
248 0.62
249 0.63
250 0.64
251 0.66
252 0.71
253 0.71
254 0.74
255 0.71
256 0.75
257 0.78
258 0.79
259 0.8
260 0.8
261 0.82
262 0.83
263 0.88
264 0.91
265 0.89
266 0.89
267 0.87
268 0.85
269 0.83
270 0.79
271 0.78
272 0.71
273 0.67
274 0.66
275 0.65
276 0.67
277 0.65
278 0.67
279 0.67
280 0.73
281 0.75
282 0.71
283 0.71
284 0.71
285 0.7
286 0.68
287 0.6
288 0.52
289 0.47
290 0.42
291 0.33
292 0.24
293 0.18
294 0.14
295 0.11
296 0.11
297 0.13
298 0.16
299 0.2
300 0.22
301 0.27
302 0.3
303 0.37
304 0.41
305 0.47
306 0.55
307 0.6
308 0.67
309 0.73
310 0.78
311 0.79
312 0.83
313 0.85
314 0.84
315 0.86
316 0.87
317 0.86
318 0.85
319 0.84
320 0.82
321 0.75
322 0.74
323 0.69
324 0.68
325 0.63
326 0.65
327 0.6
328 0.58
329 0.57
330 0.56
331 0.54
332 0.53
333 0.55
334 0.55
335 0.58
336 0.61
337 0.65
338 0.67
339 0.73
340 0.74
341 0.75
342 0.72
343 0.68
344 0.66
345 0.65
346 0.6
347 0.56
348 0.51
349 0.54
350 0.55
351 0.59
352 0.65
353 0.66
354 0.68
355 0.7
356 0.71
357 0.69
358 0.71
359 0.75
360 0.76
361 0.81
362 0.82
363 0.78
364 0.8
365 0.78
366 0.76
367 0.75
368 0.74
369 0.74
370 0.75
371 0.8
372 0.79
373 0.84
374 0.84
375 0.83