FuNGI

A0A261Y3B2

Protein Details

Accession

A0A261Y3B2

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
329-349	IDSIRRRMKRLHQSQCKQGLE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 15.5, cyto_nucl 12, cyto 7.5, mito 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039745 Vps54 IPR012501 Vps54_C IPR019515 VPS54_N
Gene Ontology	GO:0005829 C:cytosol GO:0000938 C:GARP complex GO:0015031 P:protein transport GO:0042147 P:retrograde transport, endosome to Golgi
Pfam	View protein in Pfam PF07928 Vps54 PF10475 Vps54_N

Amino Acid Sequences

MESGSVSPPKTSSGPTSTESLPLTTASPDAAFASASSEDIPQELPSRGHVRSPSLRHSRPTSIRASTTQRPWSKIYGSEHARRSSNFLNFSTLSEASVPWTTKDIGFNAISGVLNDPANRSSNIPRPTKNDIPPTPHVAIPRVRSSEFDAYIKHITPVFERYATNKNLRASATSLQEDGNESSLSRPLGGGSPEPQKQQVSGRNPYGVPTIPTSSLSDLSISTSHSKPDSEEDLPMIELVPSIFFEESFNLENPRTFDAVCEGADVVGDKNGTKAAETNTILQEKLSQYLDTVEVHLTREISKRSSSFFEALYNLQSLHQETVGCVAQIDSIRRRMKRLHQSQCKQGLEVVRLKRRQANVSALADAVASIKQIRSSVPMIQLMLGQRDYFGALFLIEESKVALEEGAFHSRSNGGYTTSDNADDESTKAVVSRRSPVDLSSVRVMLSFGPQLSDLQKNIAMMMEADLLTILMNDLETTVAKFAIKPAVQLLLVSSKAGLDDAVKAAPRDSQDQTNVMSDLSEKIIPLIAGLLKTQRMSVTLQLYRERLLVFVKEIARKQYPSYMDGLPDIDQTLDPNSVPPGTNLQSPIIRMFKSMSFDTFFDQVLSIYAVLLEVTREIALQHQVLVVIFEQLRKTSASEELIGQIGTDIGNNARIQKDVAQAESEDPDLPAEPSSDVAKENITAITNQFIVEAADILFTAVDATHVRCSKLIAIRTDQNAQLNHTDFYRLNHVSWTFIASGEEQCGKVCYGLRGALLNQAKAFLTNFHMEKLKQESSLIENEQWEFIEVPSDFQNIADRLIAQGTAKEFTNGTHEPANGDSRDKRDSSKFLVINGQSYWMVGCSLLLIKTLEEYVQCVSNLQSIGADVMHKLIEMLKMVNSRICQVILGAGAMRSAGLKNISAKHIALGSQSLGAIMALIPFIKRCFQQHMPEKQTVLLVDFDKVLNDFQEHQRELHAKLVSIMQDFLELNCKAFALIDWDKEPTPTKGASEYMERIVQQNVRLHKVLAKYLPSADTQAIMQEVSKVYVARLIEEIGEVKISTSDGKERLLLDMRFFGRRLAAYDGYKDIESKLESAVADLTVEQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.33
2	0.34
3	0.38
4	0.35
5	0.37
6	0.34
7	0.29
8	0.24
9	0.21
10	0.2
11	0.17
12	0.16
13	0.13
14	0.12
15	0.12
16	0.12
17	0.11
18	0.1
19	0.09
20	0.12
21	0.11
22	0.11
23	0.12
24	0.12
25	0.11
26	0.12
27	0.13
28	0.11
29	0.15
30	0.17
31	0.16
32	0.21
33	0.27
34	0.27
35	0.32
36	0.33
37	0.38
38	0.44
39	0.5
40	0.54
41	0.6
42	0.63
43	0.64
44	0.68
45	0.7
46	0.68
47	0.68
48	0.65
49	0.6
50	0.6
51	0.59
52	0.6
53	0.59
54	0.6
55	0.63
56	0.62
57	0.6
58	0.6
59	0.6
60	0.56
61	0.54
62	0.52
63	0.52
64	0.54
65	0.58
66	0.61
67	0.6
68	0.6
69	0.54
70	0.54
71	0.52
72	0.52
73	0.48
74	0.43
75	0.44
76	0.41
77	0.42
78	0.4
79	0.32
80	0.26
81	0.22
82	0.21
83	0.18
84	0.22
85	0.2
86	0.16
87	0.19
88	0.2
89	0.21
90	0.24
91	0.23
92	0.23
93	0.23
94	0.22
95	0.2
96	0.2
97	0.17
98	0.15
99	0.15
100	0.12
101	0.13
102	0.13
103	0.14
104	0.15
105	0.18
106	0.18
107	0.2
108	0.25
109	0.33
110	0.41
111	0.45
112	0.48
113	0.52
114	0.6
115	0.65
116	0.66
117	0.68
118	0.65
119	0.66
120	0.66
121	0.67
122	0.61
123	0.54
124	0.49
125	0.44
126	0.44
127	0.42
128	0.44
129	0.41
130	0.39
131	0.39
132	0.43
133	0.45
134	0.42
135	0.38
136	0.32
137	0.32
138	0.35
139	0.34
140	0.29
141	0.23
142	0.22
143	0.23
144	0.26
145	0.25
146	0.24
147	0.24
148	0.27
149	0.33
150	0.38
151	0.41
152	0.42
153	0.41
154	0.42
155	0.42
156	0.4
157	0.36
158	0.36
159	0.35
160	0.31
161	0.3
162	0.26
163	0.26
164	0.26
165	0.22
166	0.19
167	0.14
168	0.13
169	0.13
170	0.16
171	0.15
172	0.13
173	0.11
174	0.11
175	0.13
176	0.15
177	0.16
178	0.18
179	0.24
180	0.27
181	0.29
182	0.31
183	0.29
184	0.3
185	0.36
186	0.41
187	0.41
188	0.46
189	0.48
190	0.48
191	0.47
192	0.46
193	0.42
194	0.34
195	0.29
196	0.25
197	0.24
198	0.21
199	0.23
200	0.23
201	0.21
202	0.21
203	0.19
204	0.16
205	0.14
206	0.15
207	0.13
208	0.14
209	0.16
210	0.16
211	0.18
212	0.18
213	0.19
214	0.18
215	0.23
216	0.26
217	0.24
218	0.24
219	0.23
220	0.23
221	0.22
222	0.2
223	0.15
224	0.09
225	0.08
226	0.06
227	0.06
228	0.05
229	0.07
230	0.07
231	0.07
232	0.08
233	0.09
234	0.11
235	0.13
236	0.14
237	0.15
238	0.16
239	0.17
240	0.19
241	0.2
242	0.19
243	0.16
244	0.16
245	0.17
246	0.18
247	0.16
248	0.15
249	0.12
250	0.1
251	0.1
252	0.1
253	0.07
254	0.07
255	0.08
256	0.07
257	0.07
258	0.09
259	0.09
260	0.09
261	0.11
262	0.13
263	0.19
264	0.21
265	0.24
266	0.26
267	0.27
268	0.27
269	0.24
270	0.25
271	0.19
272	0.21
273	0.19
274	0.15
275	0.14
276	0.16
277	0.17
278	0.14
279	0.14
280	0.12
281	0.12
282	0.13
283	0.13
284	0.12
285	0.14
286	0.18
287	0.19
288	0.2
289	0.22
290	0.23
291	0.25
292	0.28
293	0.29
294	0.27
295	0.25
296	0.24
297	0.23
298	0.23
299	0.21
300	0.18
301	0.14
302	0.13
303	0.14
304	0.13
305	0.12
306	0.12
307	0.1
308	0.1
309	0.13
310	0.12
311	0.11
312	0.1
313	0.09
314	0.1
315	0.12
316	0.16
317	0.16
318	0.24
319	0.3
320	0.32
321	0.36
322	0.4
323	0.48
324	0.55
325	0.63
326	0.65
327	0.7
328	0.75
329	0.8
330	0.83
331	0.74
332	0.63
333	0.56
334	0.49
335	0.43
336	0.45
337	0.43
338	0.41
339	0.43
340	0.46
341	0.48
342	0.48
343	0.48
344	0.45
345	0.45
346	0.43
347	0.42
348	0.4
349	0.34
350	0.3
351	0.24
352	0.19
353	0.13
354	0.07
355	0.05
356	0.05
357	0.05
358	0.06
359	0.07
360	0.08
361	0.11
362	0.13
363	0.16
364	0.18
365	0.19
366	0.19
367	0.18
368	0.2
369	0.17
370	0.17
371	0.14
372	0.11
373	0.1
374	0.1
375	0.1
376	0.08
377	0.07
378	0.05
379	0.05
380	0.05
381	0.05
382	0.06
383	0.05
384	0.05
385	0.05
386	0.05
387	0.05
388	0.04
389	0.04
390	0.03
391	0.05
392	0.08
393	0.12
394	0.12
395	0.12
396	0.13
397	0.14
398	0.14
399	0.14
400	0.12
401	0.1
402	0.11
403	0.13
404	0.14
405	0.14
406	0.14
407	0.12
408	0.12
409	0.11
410	0.11
411	0.1
412	0.09
413	0.08
414	0.07
415	0.09
416	0.1
417	0.13
418	0.14
419	0.2
420	0.2
421	0.22
422	0.23
423	0.22
424	0.27
425	0.25
426	0.26
427	0.22
428	0.21
429	0.18
430	0.18
431	0.18
432	0.11
433	0.11
434	0.09
435	0.07
436	0.08
437	0.08
438	0.09
439	0.11
440	0.13
441	0.11
442	0.12
443	0.13
444	0.12
445	0.12
446	0.11
447	0.08
448	0.06
449	0.07
450	0.06
451	0.05
452	0.05
453	0.05
454	0.05
455	0.04
456	0.04
457	0.03
458	0.02
459	0.02
460	0.02
461	0.02
462	0.03
463	0.03
464	0.03
465	0.04
466	0.04
467	0.05
468	0.05
469	0.06
470	0.11
471	0.11
472	0.11
473	0.12
474	0.13
475	0.13
476	0.13
477	0.12
478	0.09
479	0.09
480	0.09
481	0.08
482	0.06
483	0.06
484	0.06
485	0.06
486	0.04
487	0.05
488	0.05
489	0.06
490	0.07
491	0.07
492	0.07
493	0.09
494	0.1
495	0.14
496	0.15
497	0.17
498	0.18
499	0.19
500	0.2
501	0.19
502	0.18
503	0.13
504	0.12
505	0.09
506	0.08
507	0.08
508	0.07
509	0.06
510	0.06
511	0.07
512	0.06
513	0.06
514	0.06
515	0.05
516	0.05
517	0.05
518	0.06
519	0.07
520	0.07
521	0.08
522	0.07
523	0.08
524	0.09
525	0.12
526	0.16
527	0.17
528	0.19
529	0.21
530	0.22
531	0.21
532	0.21
533	0.17
534	0.13
535	0.12
536	0.1
537	0.09
538	0.12
539	0.14
540	0.16
541	0.17
542	0.21
543	0.22
544	0.22
545	0.22
546	0.24
547	0.23
548	0.22
549	0.24
550	0.21
551	0.19
552	0.19
553	0.19
554	0.13
555	0.12
556	0.1
557	0.07
558	0.06
559	0.06
560	0.07
561	0.07
562	0.06
563	0.06
564	0.07
565	0.07
566	0.08
567	0.08
568	0.11
569	0.11
570	0.13
571	0.14
572	0.15
573	0.15
574	0.15
575	0.18
576	0.16
577	0.15
578	0.14
579	0.15
580	0.15
581	0.17
582	0.17
583	0.16
584	0.15
585	0.16
586	0.17
587	0.17
588	0.15
589	0.12
590	0.11
591	0.1
592	0.08
593	0.08
594	0.06
595	0.05
596	0.04
597	0.04
598	0.04
599	0.04
600	0.03
601	0.03
602	0.03
603	0.03
604	0.03
605	0.04
606	0.05
607	0.07
608	0.07
609	0.07
610	0.07
611	0.07
612	0.07
613	0.07
614	0.06
615	0.06
616	0.07
617	0.08
618	0.08
619	0.08
620	0.09
621	0.09
622	0.1
623	0.1
624	0.12
625	0.12
626	0.13
627	0.13
628	0.13
629	0.13
630	0.12
631	0.1
632	0.07
633	0.06
634	0.05
635	0.04
636	0.04
637	0.04
638	0.06
639	0.07
640	0.09
641	0.09
642	0.09
643	0.1
644	0.13
645	0.18
646	0.17
647	0.18
648	0.17
649	0.17
650	0.17
651	0.17
652	0.15
653	0.1
654	0.09
655	0.08
656	0.08
657	0.08
658	0.07
659	0.07
660	0.06
661	0.07
662	0.08
663	0.08
664	0.09
665	0.09
666	0.09
667	0.08
668	0.09
669	0.09
670	0.08
671	0.08
672	0.08
673	0.09
674	0.09
675	0.09
676	0.08
677	0.07
678	0.07
679	0.06
680	0.06
681	0.05
682	0.04
683	0.04
684	0.04
685	0.04
686	0.03
687	0.03
688	0.03
689	0.04
690	0.05
691	0.06
692	0.11
693	0.12
694	0.13
695	0.13
696	0.15
697	0.19
698	0.23
699	0.26
700	0.25
701	0.28
702	0.32
703	0.35
704	0.36
705	0.33
706	0.32
707	0.28
708	0.27
709	0.27
710	0.24
711	0.22
712	0.19
713	0.21
714	0.17
715	0.18
716	0.23
717	0.21
718	0.2
719	0.23
720	0.23
721	0.21
722	0.21
723	0.21
724	0.14
725	0.13
726	0.14
727	0.12
728	0.12
729	0.12
730	0.13
731	0.11
732	0.11
733	0.12
734	0.11
735	0.11
736	0.12
737	0.12
738	0.12
739	0.13
740	0.14
741	0.14
742	0.14
743	0.2
744	0.2
745	0.2
746	0.18
747	0.17
748	0.16
749	0.16
750	0.16
751	0.1
752	0.12
753	0.16
754	0.16
755	0.17
756	0.2
757	0.2
758	0.23
759	0.29
760	0.27
761	0.23
762	0.23
763	0.23
764	0.24
765	0.28
766	0.26
767	0.2
768	0.2
769	0.2
770	0.2
771	0.18
772	0.16
773	0.12
774	0.1
775	0.13
776	0.11
777	0.12
778	0.13
779	0.14
780	0.13
781	0.12
782	0.17
783	0.13
784	0.14
785	0.13
786	0.11
787	0.11
788	0.11
789	0.12
790	0.08
791	0.09
792	0.1
793	0.11
794	0.11
795	0.11
796	0.11
797	0.11
798	0.18
799	0.16
800	0.18
801	0.19
802	0.19
803	0.2
804	0.22
805	0.25
806	0.19
807	0.23
808	0.24
809	0.25
810	0.29
811	0.29
812	0.32
813	0.34
814	0.38
815	0.4
816	0.45
817	0.42
818	0.4
819	0.46
820	0.42
821	0.38
822	0.34
823	0.3
824	0.21
825	0.2
826	0.18
827	0.1
828	0.1
829	0.07
830	0.07
831	0.05
832	0.07
833	0.07
834	0.08
835	0.08
836	0.08
837	0.09
838	0.09
839	0.09
840	0.08
841	0.09
842	0.09
843	0.11
844	0.11
845	0.11
846	0.11
847	0.14
848	0.14
849	0.13
850	0.11
851	0.09
852	0.1
853	0.1
854	0.1
855	0.06
856	0.07
857	0.07
858	0.07
859	0.07
860	0.08
861	0.09
862	0.09
863	0.1
864	0.13
865	0.15
866	0.16
867	0.19
868	0.18
869	0.18
870	0.19
871	0.18
872	0.15
873	0.13
874	0.13
875	0.11
876	0.11
877	0.09
878	0.07
879	0.07
880	0.07
881	0.07
882	0.06
883	0.06
884	0.07
885	0.08
886	0.1
887	0.15
888	0.19
889	0.21
890	0.23
891	0.23
892	0.22
893	0.22
894	0.21
895	0.17
896	0.15
897	0.14
898	0.12
899	0.12
900	0.1
901	0.09
902	0.08
903	0.07
904	0.05
905	0.05
906	0.04
907	0.04
908	0.05
909	0.06
910	0.08
911	0.11
912	0.13
913	0.16
914	0.25
915	0.31
916	0.41
917	0.5
918	0.6
919	0.63
920	0.65
921	0.62
922	0.55
923	0.51
924	0.41
925	0.32
926	0.25
927	0.2
928	0.17
929	0.17
930	0.15
931	0.14
932	0.14
933	0.13
934	0.11
935	0.12
936	0.16
937	0.21
938	0.3
939	0.3
940	0.3
941	0.35
942	0.37
943	0.37
944	0.4
945	0.35
946	0.26
947	0.26
948	0.3
949	0.26
950	0.24
951	0.23
952	0.16
953	0.17
954	0.17
955	0.16
956	0.19
957	0.17
958	0.17
959	0.16
960	0.16
961	0.14
962	0.14
963	0.13
964	0.15
965	0.18
966	0.2
967	0.22
968	0.24
969	0.25
970	0.27
971	0.3
972	0.25
973	0.26
974	0.24
975	0.24
976	0.25
977	0.27
978	0.27
979	0.3
980	0.3
981	0.29
982	0.3
983	0.29
984	0.27
985	0.31
986	0.31
987	0.3
988	0.34
989	0.36
990	0.39
991	0.39
992	0.39
993	0.38
994	0.39
995	0.4
996	0.4
997	0.38
998	0.35
999	0.37
1000	0.37
1001	0.34
1002	0.33
1003	0.27
1004	0.22
1005	0.19
1006	0.18
1007	0.15
1008	0.14
1009	0.12
1010	0.13
1011	0.13
1012	0.13
1013	0.15
1014	0.13
1015	0.13
1016	0.16
1017	0.16
1018	0.15
1019	0.15
1020	0.14
1021	0.13
1022	0.14
1023	0.15
1024	0.12
1025	0.13
1026	0.11
1027	0.1
1028	0.1
1029	0.1
1030	0.11
1031	0.13
1032	0.19
1033	0.2
1034	0.22
1035	0.24
1036	0.25
1037	0.29
1038	0.35
1039	0.33
1040	0.3
1041	0.35
1042	0.36
1043	0.37
1044	0.36
1045	0.32
1046	0.29
1047	0.29
1048	0.3
1049	0.29
1050	0.32
1051	0.31
1052	0.34
1053	0.36
1054	0.34
1055	0.33
1056	0.31
1057	0.25
1058	0.24
1059	0.23
1060	0.2
1061	0.19
1062	0.19
1063	0.18
1064	0.19
1065	0.19
1066	0.14

A0A261Y3B2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer