Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V5IRI0

Protein Details
Accession V5IRI0    Localization Confidence High Confidence Score 21.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
123-159DEEEDGEKSKKKRRSKRKPKKKKKKKTTTGKDAQEYLBasic
223-288EEQSPQPKKSKINNAKRKRRKQRKQKAEQAAKEKAEREAWEKKKQEAKERKERKKREEEAQKAARKBasic
365-384REKEARKKEAREKQVREKDABasic
911-948TVPPPPPQQQQQQQQQQQQQQQQQKQQQQQQPERKDWQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
130-148KSKKKRRSKRKPKKKKKKK
229-409PKKSKINNAKRKRRKQRKQKAEQAAKEKAEREAWEKKKQEAKERKERKKREEEAQKAARKKEAREKETREKEAREKAAREKEEKAMREKAAREIAARKKEAREKETREKEAREKAAREKEAREKTAREKEAREKEVREKEARKKEAREKQVREKDAREKAAKEREEKVAREKEAQKARERQ
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018799  TRAF3IP1  
Gene Ontology GO:0008017  F:microtubule binding  
KEGG ncr:NCU16490  -  
Amino Acid Sequences MQTDLEALQRNYSAVLAALRKTGLDVAVQEWEKENDKGAVEQRTEDQRFTEWLERLGGSLPAMVIEGNVHVIEVDPKKAEDSLQGQVDMKNYIMVVKKEYEAATAYLRMMGVDVTAQEVKNEDEEEDGEKSKKKRRSKRKPKKKKKKKTTTGKDAQEYLDDEQTRNLEDGQDDKKDEQDDDNEKDERDDADEKDEDGQANVDEKDKDEMDSEENSDEYNTAAEEQSPQPKKSKINNAKRKRRKQRKQKAEQAAKEKAEREAWEKKKQEAKERKERKKREEEAQKAARKKEAREKETREKEAREKAAREKEEKAMREKAAREIAARKKEAREKETREKEAREKAAREKEAREKTAREKEAREKEVREKEARKKEAREKQVREKDAREKAAKEREEKVAREKEAQKARERQEQEKEAQKAREQQEQEARERKKLDEVIVVEEKVNEDDIKQEDEVKEEADNNPMSSQALMPSQQQMPGPGPGPMMLGHQIPPPPGLEPKPQQGQIPWGGHMWRQRQIPWASQMQQQTQVPWQWQMSQVEQVLRQWQMSQETQVPRQMQMPLQGQMPYQNPMPLQNPMAHQNSIPEQNSIPEQNPIPDQNPWPMQPQTPMPPQNLMPHQNPMPHQNSMPHPNPIPDQNSIPEQNPILDQNPWPMQPQTPMPPQNLMPHQNPMPHQNSMPHPNPIPDQNSIPEQNSILDQNPWPMQPQTPMPPQNLMPHQNPMPHQNSMPHPNPIPDQNSIPEQNPILDQNPGPMQPQTPMPPQNLMPHQNPMPHQNSMPHPNPIPDQNSIPEQNPILDQNPWPMQPQTPMPHHNSMPQGQMLPQEQMPAEPHVFPPPPVQDIVPNSVELTAEQLEIHARLLVRTGCFWMVRNGFFWIHSALSDDDNTANLSDHSKKLVIGRFRVLVSHLMNDLTVPPPPPQQQQQQQQQQQQQQQQQKQQQQQQPERKDWQETQWTQQAEEEERPTVRFYRPVAKEDNDKMDRT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.15
3 0.16
4 0.17
5 0.18
6 0.18
7 0.18
8 0.18
9 0.19
10 0.15
11 0.13
12 0.14
13 0.14
14 0.21
15 0.22
16 0.22
17 0.23
18 0.25
19 0.27
20 0.26
21 0.27
22 0.23
23 0.24
24 0.28
25 0.31
26 0.35
27 0.33
28 0.34
29 0.38
30 0.44
31 0.46
32 0.41
33 0.37
34 0.33
35 0.34
36 0.38
37 0.39
38 0.31
39 0.31
40 0.33
41 0.31
42 0.29
43 0.28
44 0.23
45 0.16
46 0.15
47 0.12
48 0.09
49 0.09
50 0.08
51 0.07
52 0.06
53 0.06
54 0.07
55 0.07
56 0.06
57 0.06
58 0.07
59 0.14
60 0.15
61 0.18
62 0.18
63 0.19
64 0.2
65 0.21
66 0.22
67 0.21
68 0.23
69 0.27
70 0.28
71 0.29
72 0.29
73 0.3
74 0.31
75 0.26
76 0.21
77 0.16
78 0.13
79 0.16
80 0.2
81 0.2
82 0.22
83 0.23
84 0.24
85 0.26
86 0.27
87 0.24
88 0.21
89 0.22
90 0.2
91 0.19
92 0.19
93 0.16
94 0.16
95 0.14
96 0.12
97 0.1
98 0.07
99 0.07
100 0.06
101 0.09
102 0.11
103 0.11
104 0.11
105 0.13
106 0.13
107 0.15
108 0.16
109 0.12
110 0.12
111 0.13
112 0.16
113 0.17
114 0.19
115 0.2
116 0.25
117 0.31
118 0.38
119 0.47
120 0.54
121 0.63
122 0.72
123 0.8
124 0.86
125 0.91
126 0.94
127 0.97
128 0.98
129 0.98
130 0.98
131 0.98
132 0.98
133 0.98
134 0.97
135 0.97
136 0.97
137 0.96
138 0.95
139 0.92
140 0.86
141 0.77
142 0.68
143 0.59
144 0.51
145 0.42
146 0.38
147 0.31
148 0.26
149 0.25
150 0.25
151 0.23
152 0.21
153 0.18
154 0.13
155 0.13
156 0.19
157 0.2
158 0.23
159 0.24
160 0.24
161 0.28
162 0.28
163 0.28
164 0.26
165 0.3
166 0.32
167 0.34
168 0.38
169 0.36
170 0.34
171 0.33
172 0.31
173 0.24
174 0.23
175 0.22
176 0.19
177 0.23
178 0.23
179 0.23
180 0.24
181 0.25
182 0.2
183 0.17
184 0.16
185 0.12
186 0.14
187 0.14
188 0.14
189 0.13
190 0.14
191 0.18
192 0.17
193 0.17
194 0.16
195 0.17
196 0.17
197 0.19
198 0.19
199 0.16
200 0.15
201 0.15
202 0.14
203 0.12
204 0.09
205 0.08
206 0.06
207 0.07
208 0.07
209 0.07
210 0.11
211 0.14
212 0.23
213 0.28
214 0.3
215 0.34
216 0.39
217 0.46
218 0.52
219 0.6
220 0.61
221 0.68
222 0.77
223 0.83
224 0.89
225 0.93
226 0.95
227 0.95
228 0.95
229 0.95
230 0.96
231 0.96
232 0.96
233 0.96
234 0.95
235 0.95
236 0.94
237 0.91
238 0.88
239 0.84
240 0.76
241 0.69
242 0.6
243 0.51
244 0.45
245 0.39
246 0.37
247 0.4
248 0.43
249 0.49
250 0.5
251 0.54
252 0.58
253 0.61
254 0.66
255 0.66
256 0.69
257 0.71
258 0.79
259 0.83
260 0.86
261 0.9
262 0.9
263 0.9
264 0.87
265 0.86
266 0.86
267 0.83
268 0.82
269 0.82
270 0.78
271 0.73
272 0.69
273 0.66
274 0.59
275 0.58
276 0.58
277 0.59
278 0.59
279 0.63
280 0.69
281 0.73
282 0.78
283 0.8
284 0.74
285 0.7
286 0.7
287 0.69
288 0.68
289 0.63
290 0.59
291 0.6
292 0.64
293 0.63
294 0.59
295 0.54
296 0.54
297 0.55
298 0.54
299 0.5
300 0.47
301 0.45
302 0.47
303 0.45
304 0.43
305 0.41
306 0.38
307 0.35
308 0.37
309 0.43
310 0.44
311 0.46
312 0.43
313 0.45
314 0.51
315 0.56
316 0.54
317 0.56
318 0.58
319 0.66
320 0.72
321 0.73
322 0.71
323 0.7
324 0.7
325 0.69
326 0.68
327 0.63
328 0.59
329 0.6
330 0.63
331 0.63
332 0.59
333 0.56
334 0.57
335 0.59
336 0.59
337 0.54
338 0.49
339 0.53
340 0.59
341 0.59
342 0.53
343 0.52
344 0.57
345 0.63
346 0.64
347 0.59
348 0.54
349 0.58
350 0.62
351 0.62
352 0.59
353 0.58
354 0.62
355 0.68
356 0.71
357 0.68
358 0.68
359 0.72
360 0.74
361 0.76
362 0.77
363 0.74
364 0.77
365 0.8
366 0.78
367 0.72
368 0.69
369 0.68
370 0.65
371 0.64
372 0.57
373 0.51
374 0.53
375 0.58
376 0.55
377 0.5
378 0.47
379 0.49
380 0.5
381 0.48
382 0.5
383 0.47
384 0.45
385 0.48
386 0.48
387 0.48
388 0.51
389 0.53
390 0.52
391 0.54
392 0.56
393 0.58
394 0.58
395 0.56
396 0.56
397 0.57
398 0.54
399 0.53
400 0.53
401 0.49
402 0.47
403 0.44
404 0.44
405 0.43
406 0.46
407 0.39
408 0.4
409 0.43
410 0.44
411 0.47
412 0.47
413 0.46
414 0.43
415 0.44
416 0.39
417 0.37
418 0.36
419 0.32
420 0.28
421 0.27
422 0.28
423 0.27
424 0.27
425 0.21
426 0.19
427 0.17
428 0.12
429 0.12
430 0.07
431 0.05
432 0.07
433 0.09
434 0.1
435 0.1
436 0.12
437 0.12
438 0.14
439 0.14
440 0.12
441 0.12
442 0.11
443 0.12
444 0.13
445 0.13
446 0.11
447 0.11
448 0.1
449 0.1
450 0.09
451 0.08
452 0.06
453 0.07
454 0.07
455 0.08
456 0.11
457 0.11
458 0.12
459 0.12
460 0.13
461 0.13
462 0.13
463 0.13
464 0.11
465 0.11
466 0.09
467 0.1
468 0.09
469 0.08
470 0.08
471 0.08
472 0.08
473 0.1
474 0.1
475 0.1
476 0.1
477 0.1
478 0.1
479 0.11
480 0.13
481 0.17
482 0.19
483 0.24
484 0.27
485 0.27
486 0.27
487 0.25
488 0.27
489 0.27
490 0.26
491 0.22
492 0.19
493 0.19
494 0.21
495 0.26
496 0.25
497 0.24
498 0.24
499 0.24
500 0.31
501 0.33
502 0.33
503 0.31
504 0.33
505 0.3
506 0.33
507 0.35
508 0.29
509 0.31
510 0.28
511 0.26
512 0.24
513 0.24
514 0.2
515 0.19
516 0.18
517 0.15
518 0.19
519 0.19
520 0.18
521 0.19
522 0.19
523 0.19
524 0.18
525 0.18
526 0.17
527 0.16
528 0.15
529 0.12
530 0.13
531 0.15
532 0.15
533 0.16
534 0.19
535 0.21
536 0.23
537 0.27
538 0.26
539 0.23
540 0.25
541 0.25
542 0.2
543 0.23
544 0.24
545 0.21
546 0.21
547 0.21
548 0.19
549 0.21
550 0.21
551 0.17
552 0.15
553 0.15
554 0.14
555 0.16
556 0.18
557 0.16
558 0.16
559 0.16
560 0.17
561 0.21
562 0.23
563 0.21
564 0.19
565 0.2
566 0.21
567 0.23
568 0.22
569 0.18
570 0.16
571 0.17
572 0.18
573 0.18
574 0.16
575 0.13
576 0.13
577 0.13
578 0.15
579 0.16
580 0.16
581 0.17
582 0.18
583 0.21
584 0.23
585 0.23
586 0.25
587 0.24
588 0.24
589 0.24
590 0.26
591 0.26
592 0.31
593 0.33
594 0.3
595 0.31
596 0.32
597 0.35
598 0.37
599 0.36
600 0.31
601 0.31
602 0.32
603 0.33
604 0.33
605 0.34
606 0.32
607 0.29
608 0.28
609 0.29
610 0.32
611 0.36
612 0.37
613 0.33
614 0.3
615 0.31
616 0.32
617 0.32
618 0.3
619 0.25
620 0.24
621 0.23
622 0.26
623 0.26
624 0.25
625 0.22
626 0.19
627 0.18
628 0.17
629 0.17
630 0.14
631 0.14
632 0.14
633 0.17
634 0.19
635 0.19
636 0.2
637 0.19
638 0.19
639 0.19
640 0.22
641 0.23
642 0.28
643 0.31
644 0.3
645 0.31
646 0.32
647 0.35
648 0.37
649 0.36
650 0.31
651 0.31
652 0.32
653 0.33
654 0.33
655 0.34
656 0.32
657 0.29
658 0.28
659 0.29
660 0.32
661 0.36
662 0.37
663 0.33
664 0.3
665 0.31
666 0.32
667 0.32
668 0.3
669 0.25
670 0.24
671 0.23
672 0.26
673 0.26
674 0.26
675 0.22
676 0.19
677 0.18
678 0.17
679 0.17
680 0.14
681 0.14
682 0.13
683 0.16
684 0.17
685 0.17
686 0.17
687 0.17
688 0.17
689 0.17
690 0.2
691 0.22
692 0.28
693 0.31
694 0.3
695 0.31
696 0.32
697 0.35
698 0.37
699 0.36
700 0.31
701 0.31
702 0.32
703 0.33
704 0.33
705 0.34
706 0.32
707 0.29
708 0.28
709 0.29
710 0.32
711 0.36
712 0.37
713 0.33
714 0.3
715 0.31
716 0.32
717 0.32
718 0.3
719 0.25
720 0.24
721 0.23
722 0.26
723 0.26
724 0.25
725 0.22
726 0.19
727 0.18
728 0.17
729 0.17
730 0.14
731 0.14
732 0.13
733 0.15
734 0.17
735 0.17
736 0.18
737 0.17
738 0.17
739 0.16
740 0.2
741 0.22
742 0.26
743 0.28
744 0.28
745 0.29
746 0.3
747 0.34
748 0.36
749 0.36
750 0.31
751 0.31
752 0.32
753 0.33
754 0.33
755 0.34
756 0.32
757 0.29
758 0.28
759 0.29
760 0.32
761 0.36
762 0.37
763 0.33
764 0.3
765 0.31
766 0.32
767 0.32
768 0.3
769 0.25
770 0.24
771 0.23
772 0.26
773 0.26
774 0.25
775 0.22
776 0.19
777 0.18
778 0.17
779 0.17
780 0.14
781 0.14
782 0.14
783 0.17
784 0.19
785 0.19
786 0.2
787 0.19
788 0.19
789 0.19
790 0.26
791 0.28
792 0.32
793 0.37
794 0.42
795 0.46
796 0.47
797 0.5
798 0.48
799 0.44
800 0.41
801 0.37
802 0.31
803 0.27
804 0.31
805 0.27
806 0.24
807 0.22
808 0.21
809 0.19
810 0.2
811 0.21
812 0.2
813 0.2
814 0.19
815 0.2
816 0.24
817 0.25
818 0.24
819 0.28
820 0.27
821 0.28
822 0.28
823 0.27
824 0.27
825 0.3
826 0.34
827 0.29
828 0.26
829 0.24
830 0.23
831 0.22
832 0.16
833 0.16
834 0.11
835 0.11
836 0.1
837 0.1
838 0.11
839 0.12
840 0.12
841 0.11
842 0.1
843 0.1
844 0.14
845 0.16
846 0.16
847 0.17
848 0.19
849 0.19
850 0.2
851 0.21
852 0.26
853 0.28
854 0.28
855 0.28
856 0.29
857 0.27
858 0.27
859 0.27
860 0.21
861 0.18
862 0.16
863 0.18
864 0.15
865 0.16
866 0.16
867 0.16
868 0.14
869 0.14
870 0.15
871 0.12
872 0.12
873 0.1
874 0.15
875 0.18
876 0.19
877 0.22
878 0.22
879 0.23
880 0.29
881 0.36
882 0.39
883 0.39
884 0.43
885 0.43
886 0.42
887 0.41
888 0.36
889 0.35
890 0.3
891 0.28
892 0.24
893 0.21
894 0.2
895 0.2
896 0.2
897 0.15
898 0.15
899 0.14
900 0.15
901 0.22
902 0.26
903 0.33
904 0.38
905 0.47
906 0.55
907 0.63
908 0.72
909 0.76
910 0.8
911 0.82
912 0.84
913 0.82
914 0.81
915 0.8
916 0.79
917 0.78
918 0.78
919 0.79
920 0.8
921 0.81
922 0.82
923 0.83
924 0.8
925 0.81
926 0.83
927 0.83
928 0.82
929 0.8
930 0.79
931 0.74
932 0.75
933 0.69
934 0.67
935 0.68
936 0.63
937 0.63
938 0.61
939 0.57
940 0.5
941 0.49
942 0.45
943 0.39
944 0.4
945 0.35
946 0.32
947 0.33
948 0.33
949 0.33
950 0.33
951 0.32
952 0.32
953 0.34
954 0.4
955 0.44
956 0.48
957 0.52
958 0.53
959 0.58
960 0.6
961 0.65