FuNGI

Q7RWR7

Protein Details

Accession

Q7RWR7

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
13-52	VAPNGPQPPKKIIRKKATADPLVARKKTLPKPPMARRPAD	Hydrophilic
74-93	IKAMEHKRKRSMNPGKWSEQ	Hydrophilic
192-216	APVMKPNEPNKPQKKDKSLKTHVFH	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
20-51	PPKKIIRKKATADPLVARKKTLPKPPMARRPA
498-511	KAPDSAKKNKLKRA

Subcellular Location(s)

nucl 19, cyto 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005674 C:transcription factor TFIIF complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0016251 F:RNA polymerase II general transcription initiation factor activity GO:0001096 F:TFIIF-class transcription factor complex binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
KEGG	ncr:NCU04363 -

Amino Acid Sequences

MSASPAGAPPTGVAPNGPQPPKKIIRKKATADPLVARKKTLPKPPMARRPADWEARSRASENAGQNRSLRQLEIKAMEHKRKRSMNPGKWSEQAQGYVEEFPLIVTKKQLMELRFHVMQLNNKHGNLDVTDQDQFPRPVTLQRRDPRLPPAHRMALKEEMEDVPMDDAEAERIRQEKEAKEAQRALDQAKIAPVMKPNEPNKPQKKDKSLKTHVFHGKHSEEHKKALDLRYQETLPWHLEDAEGKSGVWVGHYVAGLSEVNCALIQTQDQKFQMIPLTRWYAFHEKPKFNVLSLDDAENMMKQNKDVKRWVMRDRERELTQKEKADTRMFLGGRARVKTESYTSRAAPKSERRDDFELDMSGDEFQDDDETPGFEAEDEDAKEAKERIRREQAAANLFGEGDQSKVDEEERERQLEKLRLKKTGKEVVKRLVKLEHAMDYDASSDSERESDNPFADSEESEDENEEKKEGEEVKEEEKKDGVSGTISKGTATPTGKQKAPDSAKKNKLKRAGSPNLSESSEAESSRKKAKLAANKGTASVGQSRSNTPLPGRPKGATSDGEMSDGGAKSSRPQIKQVPTSRPGSPPQPGSPSGSPPPTSGGATPANDFIKPEEVMAAIDQYPNGVALAVLMKPFSHRIDATPNRSKPHLSTKSEWLGMVKRFGYLGPDKLIRRKTGPAQGGGSGAASPQS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.16
2	0.24
3	0.32
4	0.38
5	0.37
6	0.4
7	0.49
8	0.58
9	0.66
10	0.68
11	0.7
12	0.75
13	0.81
14	0.84
15	0.85
16	0.85
17	0.79
18	0.74
19	0.71
20	0.71
21	0.71
22	0.65
23	0.57
24	0.54
25	0.59
26	0.62
27	0.64
28	0.61
29	0.62
30	0.72
31	0.8
32	0.84
33	0.82
34	0.78
35	0.72
36	0.73
37	0.71
38	0.7
39	0.63
40	0.59
41	0.59
42	0.59
43	0.58
44	0.5
45	0.45
46	0.4
47	0.43
48	0.44
49	0.46
50	0.44
51	0.44
52	0.44
53	0.45
54	0.46
55	0.41
56	0.34
57	0.29
58	0.31
59	0.34
60	0.37
61	0.38
62	0.42
63	0.49
64	0.57
65	0.6
66	0.63
67	0.66
68	0.7
69	0.72
70	0.74
71	0.77
72	0.76
73	0.79
74	0.8
75	0.76
76	0.71
77	0.68
78	0.61
79	0.53
80	0.46
81	0.37
82	0.33
83	0.29
84	0.27
85	0.24
86	0.19
87	0.15
88	0.12
89	0.15
90	0.14
91	0.13
92	0.14
93	0.17
94	0.18
95	0.23
96	0.28
97	0.25
98	0.3
99	0.32
100	0.37
101	0.35
102	0.34
103	0.33
104	0.32
105	0.37
106	0.37
107	0.42
108	0.4
109	0.39
110	0.39
111	0.36
112	0.34
113	0.28
114	0.26
115	0.19
116	0.18
117	0.2
118	0.2
119	0.21
120	0.24
121	0.23
122	0.2
123	0.21
124	0.19
125	0.25
126	0.34
127	0.4
128	0.46
129	0.51
130	0.59
131	0.6
132	0.63
133	0.64
134	0.66
135	0.63
136	0.6
137	0.61
138	0.61
139	0.61
140	0.6
141	0.55
142	0.53
143	0.48
144	0.42
145	0.37
146	0.28
147	0.26
148	0.23
149	0.19
150	0.11
151	0.1
152	0.09
153	0.07
154	0.06
155	0.08
156	0.09
157	0.08
158	0.09
159	0.12
160	0.13
161	0.17
162	0.22
163	0.22
164	0.28
165	0.37
166	0.38
167	0.42
168	0.44
169	0.42
170	0.41
171	0.4
172	0.35
173	0.3
174	0.28
175	0.22
176	0.2
177	0.21
178	0.17
179	0.17
180	0.21
181	0.21
182	0.24
183	0.32
184	0.34
185	0.42
186	0.48
187	0.56
188	0.61
189	0.67
190	0.73
191	0.74
192	0.8
193	0.8
194	0.83
195	0.83
196	0.84
197	0.84
198	0.77
199	0.78
200	0.76
201	0.69
202	0.62
203	0.59
204	0.51
205	0.47
206	0.5
207	0.5
208	0.43
209	0.45
210	0.44
211	0.4
212	0.43
213	0.42
214	0.41
215	0.34
216	0.34
217	0.34
218	0.32
219	0.29
220	0.26
221	0.25
222	0.21
223	0.19
224	0.17
225	0.13
226	0.14
227	0.15
228	0.15
229	0.14
230	0.13
231	0.12
232	0.11
233	0.12
234	0.12
235	0.1
236	0.08
237	0.06
238	0.08
239	0.09
240	0.08
241	0.07
242	0.09
243	0.08
244	0.08
245	0.08
246	0.06
247	0.06
248	0.06
249	0.06
250	0.05
251	0.05
252	0.06
253	0.12
254	0.13
255	0.17
256	0.18
257	0.19
258	0.19
259	0.19
260	0.23
261	0.19
262	0.18
263	0.18
264	0.23
265	0.23
266	0.24
267	0.27
268	0.3
269	0.31
270	0.39
271	0.43
272	0.4
273	0.41
274	0.47
275	0.43
276	0.35
277	0.36
278	0.28
279	0.25
280	0.24
281	0.23
282	0.17
283	0.16
284	0.16
285	0.13
286	0.13
287	0.1
288	0.09
289	0.09
290	0.17
291	0.19
292	0.24
293	0.27
294	0.33
295	0.4
296	0.46
297	0.52
298	0.54
299	0.58
300	0.61
301	0.62
302	0.61
303	0.55
304	0.55
305	0.51
306	0.47
307	0.44
308	0.4
309	0.38
310	0.35
311	0.37
312	0.34
313	0.3
314	0.26
315	0.28
316	0.24
317	0.25
318	0.23
319	0.23
320	0.24
321	0.24
322	0.23
323	0.18
324	0.19
325	0.18
326	0.2
327	0.2
328	0.21
329	0.23
330	0.22
331	0.28
332	0.29
333	0.29
334	0.3
335	0.35
336	0.4
337	0.46
338	0.47
339	0.45
340	0.48
341	0.48
342	0.45
343	0.38
344	0.29
345	0.22
346	0.2
347	0.15
348	0.11
349	0.09
350	0.06
351	0.05
352	0.04
353	0.05
354	0.05
355	0.05
356	0.05
357	0.06
358	0.06
359	0.06
360	0.06
361	0.05
362	0.05
363	0.05
364	0.07
365	0.07
366	0.08
367	0.08
368	0.08
369	0.1
370	0.11
371	0.14
372	0.17
373	0.2
374	0.26
375	0.35
376	0.36
377	0.38
378	0.41
379	0.43
380	0.41
381	0.39
382	0.32
383	0.23
384	0.21
385	0.18
386	0.15
387	0.09
388	0.06
389	0.05
390	0.05
391	0.05
392	0.05
393	0.06
394	0.08
395	0.11
396	0.17
397	0.2
398	0.22
399	0.23
400	0.24
401	0.29
402	0.34
403	0.38
404	0.4
405	0.41
406	0.47
407	0.49
408	0.53
409	0.55
410	0.57
411	0.58
412	0.56
413	0.58
414	0.58
415	0.63
416	0.59
417	0.53
418	0.47
419	0.41
420	0.36
421	0.33
422	0.27
423	0.21
424	0.2
425	0.18
426	0.15
427	0.15
428	0.13
429	0.11
430	0.08
431	0.07
432	0.07
433	0.08
434	0.08
435	0.09
436	0.12
437	0.14
438	0.14
439	0.15
440	0.14
441	0.14
442	0.15
443	0.13
444	0.12
445	0.12
446	0.12
447	0.12
448	0.12
449	0.13
450	0.14
451	0.14
452	0.12
453	0.1
454	0.09
455	0.13
456	0.15
457	0.15
458	0.17
459	0.2
460	0.27
461	0.32
462	0.32
463	0.3
464	0.28
465	0.27
466	0.23
467	0.21
468	0.14
469	0.11
470	0.12
471	0.13
472	0.16
473	0.15
474	0.15
475	0.15
476	0.16
477	0.2
478	0.2
479	0.23
480	0.28
481	0.33
482	0.35
483	0.37
484	0.38
485	0.42
486	0.48
487	0.52
488	0.51
489	0.57
490	0.65
491	0.72
492	0.77
493	0.74
494	0.76
495	0.72
496	0.73
497	0.73
498	0.73
499	0.7
500	0.67
501	0.63
502	0.57
503	0.53
504	0.44
505	0.34
506	0.3
507	0.26
508	0.22
509	0.2
510	0.21
511	0.23
512	0.3
513	0.31
514	0.27
515	0.32
516	0.39
517	0.47
518	0.54
519	0.6
520	0.59
521	0.58
522	0.58
523	0.52
524	0.45
525	0.37
526	0.33
527	0.27
528	0.24
529	0.25
530	0.27
531	0.3
532	0.32
533	0.31
534	0.28
535	0.32
536	0.34
537	0.39
538	0.41
539	0.37
540	0.37
541	0.39
542	0.41
543	0.35
544	0.33
545	0.33
546	0.29
547	0.29
548	0.27
549	0.23
550	0.22
551	0.2
552	0.16
553	0.12
554	0.11
555	0.13
556	0.23
557	0.29
558	0.27
559	0.34
560	0.42
561	0.5
562	0.6
563	0.65
564	0.65
565	0.63
566	0.65
567	0.62
568	0.58
569	0.54
570	0.51
571	0.49
572	0.46
573	0.46
574	0.47
575	0.46
576	0.48
577	0.46
578	0.45
579	0.45
580	0.44
581	0.4
582	0.35
583	0.37
584	0.32
585	0.31
586	0.26
587	0.25
588	0.25
589	0.25
590	0.25
591	0.26
592	0.25
593	0.24
594	0.24
595	0.21
596	0.21
597	0.2
598	0.19
599	0.15
600	0.14
601	0.15
602	0.15
603	0.15
604	0.11
605	0.11
606	0.11
607	0.1
608	0.1
609	0.09
610	0.08
611	0.06
612	0.05
613	0.05
614	0.08
615	0.08
616	0.08
617	0.08
618	0.08
619	0.11
620	0.15
621	0.16
622	0.19
623	0.19
624	0.23
625	0.34
626	0.42
627	0.49
628	0.56
629	0.58
630	0.58
631	0.6
632	0.6
633	0.55
634	0.57
635	0.58
636	0.55
637	0.56
638	0.61
639	0.65
640	0.63
641	0.58
642	0.51
643	0.48
644	0.44
645	0.45
646	0.36
647	0.3
648	0.28
649	0.28
650	0.3
651	0.28
652	0.29
653	0.29
654	0.36
655	0.39
656	0.47
657	0.53
658	0.51
659	0.51
660	0.55
661	0.58
662	0.61
663	0.63
664	0.6
665	0.57
666	0.53
667	0.5
668	0.42
669	0.33
670	0.23

Q7RWR7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer