Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q7SHC0

Protein Details
Accession Q7SHC0    Localization Confidence Low Confidence Score 9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
202-226IIKACDACRKRKVRCDPSHKKRAASHydrophilic
229-248SPAATESKPTKKQRKETAEAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto_nucl 8.5, cyto 8, nucl 7, mito 3, extr 3, plas 2, pero 2, E.R. 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036864  Zn2-C6_fun-type_DNA-bd_sf  
IPR001138  Zn2Cys6_DnaBD  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
KEGG ncr:NCU01886  -  
CDD cd00067  GAL4  
Amino Acid Sequences MAGISPTNSANAFMEGFSVCQANLGEALTWLPAMGTPELDDMINAFIPGPASIKDKRAHISMDFLSYSQRTGFNFKFYPVPSTSFTPASIASSASSSQFVDSGYASSFNVSPVISDSSAWTQSPASFTSPAAFDDATRIAKARSSTSTTKKSTSPSSRHQVVDFANHPGMRIMTKDGRDVTNSASRGCKTKEQRDHAHLMRIIKACDACRKRKVRCDPSHKKRAASHTSPAATESKPTKKQRKETAEAPPPAPVVVETTPELLDVNHLENFDAATFVMPSVEGIETVDDNFWNRYFNFDQDVFPDFTPGTFDQFTPSQELFYQSTSSSSAASPSQVFTPETPVHSRPSPAIANEPVVATAAPALPYLNPGVPHGTEFVDFNLYSPPADFSLDEELLGLGQQQSHAPFDFGYADQQYFGDASVVAHRAESRSSPSSPSVSGVIPSHQRLPLEVYGGLPGSEDLPTLSNVSPAVQAPGQLAVQQQQEQQRYRQLASGNESRVIPQSSVQQSVTIGSGMLHSPASPASNVASSSLTALNVRHAPHNIDRSVMNVGRTDLHRRSPIALQFVNAGESVNAGAATQHASSVEQQSRAATVETSARLKSPVKYNSSVHQGQKQGFAGLPVNLSTTSRDVSSGICHSSASNSTRLGTTTTATTTTASSQSSTTTTILPGRRESGDGEGFAKIGAKLSSYTTSASSSSQSSSFPLVVLGLVSCLVVAALRTCCSHINDNWGGHFDPLNTLFIASLSLFSLWLQSSFRWSVDPDTHTTSHASVQGLFGSSVSRQAKALVASNSPFVRMVSRSRSIMI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.13
3 0.13
4 0.12
5 0.12
6 0.09
7 0.11
8 0.11
9 0.1
10 0.11
11 0.11
12 0.1
13 0.1
14 0.11
15 0.09
16 0.08
17 0.07
18 0.06
19 0.07
20 0.09
21 0.1
22 0.1
23 0.11
24 0.12
25 0.13
26 0.13
27 0.11
28 0.09
29 0.11
30 0.1
31 0.09
32 0.08
33 0.08
34 0.09
35 0.09
36 0.1
37 0.1
38 0.16
39 0.19
40 0.25
41 0.28
42 0.32
43 0.36
44 0.37
45 0.39
46 0.36
47 0.39
48 0.35
49 0.36
50 0.32
51 0.28
52 0.29
53 0.25
54 0.25
55 0.2
56 0.21
57 0.19
58 0.27
59 0.28
60 0.31
61 0.32
62 0.33
63 0.37
64 0.36
65 0.39
66 0.34
67 0.36
68 0.33
69 0.36
70 0.38
71 0.33
72 0.32
73 0.28
74 0.26
75 0.24
76 0.21
77 0.17
78 0.14
79 0.14
80 0.14
81 0.14
82 0.14
83 0.12
84 0.12
85 0.12
86 0.11
87 0.11
88 0.11
89 0.11
90 0.1
91 0.11
92 0.11
93 0.12
94 0.12
95 0.11
96 0.12
97 0.1
98 0.09
99 0.11
100 0.15
101 0.14
102 0.14
103 0.16
104 0.19
105 0.21
106 0.2
107 0.19
108 0.16
109 0.17
110 0.19
111 0.18
112 0.18
113 0.17
114 0.18
115 0.19
116 0.18
117 0.18
118 0.18
119 0.16
120 0.13
121 0.15
122 0.18
123 0.17
124 0.17
125 0.17
126 0.15
127 0.18
128 0.2
129 0.2
130 0.22
131 0.27
132 0.34
133 0.42
134 0.5
135 0.51
136 0.52
137 0.52
138 0.52
139 0.56
140 0.57
141 0.56
142 0.56
143 0.62
144 0.65
145 0.63
146 0.59
147 0.54
148 0.46
149 0.46
150 0.39
151 0.35
152 0.32
153 0.3
154 0.3
155 0.25
156 0.24
157 0.17
158 0.17
159 0.18
160 0.21
161 0.22
162 0.26
163 0.27
164 0.28
165 0.29
166 0.29
167 0.28
168 0.29
169 0.29
170 0.27
171 0.28
172 0.28
173 0.31
174 0.33
175 0.37
176 0.4
177 0.49
178 0.58
179 0.62
180 0.69
181 0.7
182 0.75
183 0.69
184 0.68
185 0.6
186 0.53
187 0.51
188 0.45
189 0.39
190 0.33
191 0.33
192 0.28
193 0.35
194 0.4
195 0.41
196 0.48
197 0.57
198 0.61
199 0.69
200 0.77
201 0.78
202 0.82
203 0.85
204 0.87
205 0.89
206 0.92
207 0.86
208 0.8
209 0.75
210 0.74
211 0.72
212 0.66
213 0.61
214 0.58
215 0.56
216 0.5
217 0.46
218 0.39
219 0.3
220 0.3
221 0.31
222 0.32
223 0.4
224 0.49
225 0.57
226 0.63
227 0.72
228 0.78
229 0.81
230 0.78
231 0.76
232 0.77
233 0.77
234 0.71
235 0.62
236 0.53
237 0.44
238 0.38
239 0.3
240 0.2
241 0.14
242 0.12
243 0.13
244 0.12
245 0.13
246 0.12
247 0.12
248 0.12
249 0.08
250 0.09
251 0.08
252 0.1
253 0.1
254 0.1
255 0.1
256 0.1
257 0.1
258 0.09
259 0.08
260 0.06
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.04
265 0.04
266 0.04
267 0.05
268 0.05
269 0.05
270 0.05
271 0.06
272 0.06
273 0.06
274 0.07
275 0.05
276 0.07
277 0.08
278 0.08
279 0.09
280 0.09
281 0.14
282 0.15
283 0.17
284 0.2
285 0.2
286 0.2
287 0.21
288 0.24
289 0.21
290 0.19
291 0.19
292 0.14
293 0.13
294 0.16
295 0.14
296 0.14
297 0.13
298 0.13
299 0.15
300 0.16
301 0.17
302 0.18
303 0.18
304 0.15
305 0.15
306 0.18
307 0.16
308 0.16
309 0.16
310 0.12
311 0.13
312 0.13
313 0.13
314 0.11
315 0.1
316 0.1
317 0.09
318 0.1
319 0.1
320 0.09
321 0.1
322 0.1
323 0.11
324 0.1
325 0.16
326 0.16
327 0.18
328 0.21
329 0.21
330 0.23
331 0.23
332 0.24
333 0.19
334 0.22
335 0.21
336 0.18
337 0.2
338 0.18
339 0.18
340 0.18
341 0.17
342 0.12
343 0.11
344 0.1
345 0.06
346 0.06
347 0.05
348 0.05
349 0.05
350 0.05
351 0.05
352 0.06
353 0.07
354 0.07
355 0.07
356 0.07
357 0.09
358 0.09
359 0.1
360 0.1
361 0.1
362 0.09
363 0.09
364 0.09
365 0.09
366 0.09
367 0.09
368 0.09
369 0.09
370 0.08
371 0.08
372 0.09
373 0.07
374 0.08
375 0.08
376 0.08
377 0.12
378 0.12
379 0.11
380 0.1
381 0.09
382 0.08
383 0.08
384 0.07
385 0.03
386 0.03
387 0.04
388 0.04
389 0.05
390 0.06
391 0.07
392 0.07
393 0.06
394 0.07
395 0.08
396 0.08
397 0.09
398 0.09
399 0.09
400 0.09
401 0.09
402 0.08
403 0.07
404 0.07
405 0.05
406 0.04
407 0.04
408 0.06
409 0.07
410 0.07
411 0.07
412 0.07
413 0.08
414 0.09
415 0.09
416 0.12
417 0.14
418 0.15
419 0.17
420 0.18
421 0.19
422 0.19
423 0.19
424 0.16
425 0.13
426 0.14
427 0.12
428 0.13
429 0.14
430 0.14
431 0.16
432 0.16
433 0.15
434 0.15
435 0.18
436 0.17
437 0.16
438 0.15
439 0.13
440 0.12
441 0.12
442 0.12
443 0.07
444 0.06
445 0.05
446 0.05
447 0.05
448 0.04
449 0.05
450 0.06
451 0.08
452 0.08
453 0.08
454 0.08
455 0.09
456 0.09
457 0.09
458 0.1
459 0.08
460 0.08
461 0.08
462 0.09
463 0.08
464 0.08
465 0.09
466 0.1
467 0.12
468 0.13
469 0.16
470 0.21
471 0.27
472 0.28
473 0.3
474 0.33
475 0.34
476 0.33
477 0.33
478 0.29
479 0.27
480 0.31
481 0.34
482 0.29
483 0.28
484 0.28
485 0.25
486 0.25
487 0.23
488 0.18
489 0.13
490 0.2
491 0.2
492 0.23
493 0.22
494 0.2
495 0.19
496 0.19
497 0.18
498 0.11
499 0.08
500 0.06
501 0.07
502 0.06
503 0.07
504 0.06
505 0.05
506 0.06
507 0.06
508 0.07
509 0.06
510 0.07
511 0.07
512 0.08
513 0.08
514 0.09
515 0.09
516 0.08
517 0.1
518 0.1
519 0.09
520 0.09
521 0.1
522 0.11
523 0.14
524 0.15
525 0.16
526 0.17
527 0.21
528 0.25
529 0.31
530 0.28
531 0.26
532 0.25
533 0.25
534 0.29
535 0.26
536 0.21
537 0.16
538 0.17
539 0.18
540 0.2
541 0.26
542 0.23
543 0.27
544 0.29
545 0.29
546 0.31
547 0.34
548 0.36
549 0.35
550 0.32
551 0.28
552 0.27
553 0.26
554 0.24
555 0.18
556 0.15
557 0.08
558 0.08
559 0.07
560 0.05
561 0.05
562 0.04
563 0.04
564 0.04
565 0.06
566 0.06
567 0.06
568 0.06
569 0.07
570 0.09
571 0.16
572 0.19
573 0.18
574 0.19
575 0.19
576 0.2
577 0.19
578 0.18
579 0.11
580 0.1
581 0.13
582 0.15
583 0.16
584 0.16
585 0.16
586 0.18
587 0.21
588 0.24
589 0.29
590 0.34
591 0.38
592 0.42
593 0.44
594 0.46
595 0.52
596 0.53
597 0.48
598 0.47
599 0.46
600 0.43
601 0.46
602 0.41
603 0.35
604 0.29
605 0.27
606 0.22
607 0.18
608 0.17
609 0.12
610 0.13
611 0.12
612 0.12
613 0.12
614 0.12
615 0.12
616 0.12
617 0.12
618 0.12
619 0.12
620 0.15
621 0.16
622 0.16
623 0.15
624 0.15
625 0.15
626 0.17
627 0.21
628 0.2
629 0.2
630 0.2
631 0.21
632 0.21
633 0.22
634 0.21
635 0.17
636 0.15
637 0.14
638 0.15
639 0.15
640 0.15
641 0.15
642 0.14
643 0.15
644 0.16
645 0.14
646 0.14
647 0.13
648 0.14
649 0.15
650 0.17
651 0.15
652 0.14
653 0.16
654 0.21
655 0.25
656 0.26
657 0.27
658 0.28
659 0.28
660 0.29
661 0.29
662 0.29
663 0.27
664 0.25
665 0.24
666 0.21
667 0.19
668 0.18
669 0.18
670 0.11
671 0.11
672 0.1
673 0.09
674 0.1
675 0.14
676 0.16
677 0.16
678 0.17
679 0.16
680 0.18
681 0.18
682 0.18
683 0.17
684 0.16
685 0.17
686 0.17
687 0.16
688 0.17
689 0.18
690 0.17
691 0.15
692 0.14
693 0.12
694 0.11
695 0.1
696 0.08
697 0.06
698 0.06
699 0.05
700 0.05
701 0.04
702 0.04
703 0.04
704 0.04
705 0.07
706 0.09
707 0.1
708 0.12
709 0.14
710 0.17
711 0.22
712 0.27
713 0.27
714 0.34
715 0.38
716 0.39
717 0.39
718 0.39
719 0.35
720 0.31
721 0.3
722 0.21
723 0.21
724 0.21
725 0.21
726 0.17
727 0.17
728 0.15
729 0.14
730 0.15
731 0.1
732 0.09
733 0.08
734 0.08
735 0.08
736 0.08
737 0.11
738 0.1
739 0.11
740 0.12
741 0.12
742 0.18
743 0.2
744 0.21
745 0.2
746 0.21
747 0.26
748 0.31
749 0.34
750 0.33
751 0.37
752 0.38
753 0.37
754 0.38
755 0.33
756 0.3
757 0.3
758 0.26
759 0.2
760 0.21
761 0.21
762 0.2
763 0.19
764 0.15
765 0.13
766 0.12
767 0.2
768 0.21
769 0.2
770 0.19
771 0.21
772 0.24
773 0.25
774 0.31
775 0.26
776 0.28
777 0.29
778 0.34
779 0.33
780 0.31
781 0.29
782 0.23
783 0.24
784 0.23
785 0.29
786 0.32
787 0.37