Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A261Y4R6

Protein Details
Accession A0A261Y4R6    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
706-730MYSSCVHTQVKKRRRRTNREELAILHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
717-720KRRR
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR017970  Homeobox_CS  
IPR001356  Homeobox_dom  
IPR045146  SF3A1  
IPR022030  SF3A1_dom  
IPR035563  SF3As1_ubi  
IPR000061  Surp  
IPR035967  SWAP/Surp_sf  
IPR000626  Ubiquitin-like_dom  
IPR029071  Ubiquitin-like_domsf  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF00046  Homeodomain  
PF12230  PRP21_like_P  
PF01805  Surp  
PF00240  ubiquitin  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00027  HOMEOBOX_1  
PS50071  HOMEOBOX_2  
PS50128  SURP  
PS50053  UBIQUITIN_2  
CDD cd00086  homeodomain  
cd01800  Ubl_SF3a120  
Amino Acid Sequences MPPVATSTMNGIPAPFGNGTMRDVAMNGVEHDASKPSTGIIYPPPDIRAIVDKTADFVARHGTQAEDRIREQGRHNPKFAFMNPLDPYHAYYRNMIQDIKEGKSTKKAVTKEIKMEDAQPAQKPIPKEPPPFQFIAEMPAISLQDLQIVKLTAQFVARNGRQFMTELAQREARNYQFDFLRPTHSLHAFFNKLVKQYTYVLMAPKELTEALKRNSEDKYHILDKVKERAEFVAWQEAEKQKQEDEAEKEREAYASIDWHDFIVVDTVEFTEADESTELPPPMSLIELQNMSLEQKRMSGMPDQLPAEAGEEDNEMDIEEVDMDEDEEETVEQVPTAEPEIKVPEVSSTMKIRNSYVPRVMAEKKKQEAMQICPRCGQAIPASELAEHVRIELLDPKWKEQRLAAEAKNKDSNLLQEGQDVAKILKNFSSYRSDIFRETDTDVAKKLEEDAKKAQERSKAVWDGHTASINLTQQRALHKGAEEVHAAQAYPAESQIGPQTPQMQAVQSAYPAYPQPPGYYGAPPPAPYGMPPAANYIPPPPPLNNTYTPPTGSPAPPKMARPADEAAFGASSAKKAKPEGDYIDEQTFLSNHQDPVNVSIATIPFADKPEWKLDGRTFIVENLPPTTLVSALKNKIAQQIGMPVGRQTLTVQAKGTVMKNGESLAYYNIGPGDIITLKLSVPERRPFGELNRQSVSDYNWVNSASGMYSSCVHTQVKKRRRRTNREELAILEKAFAEDHMPSYEKRAALAEQLDMTPRNVQIWFQNRRQMIRKMIQQRAETQSNAQRNSTEFVRYQGASAGHINITHPADPQTRVTGAKQINATLQISRQMSAPTSQGEKSIQANFNDQNTLRDQAELIEALDNSRKHLKQNDRARTHFFIYETLDNQNQDSTNHSPQEGEVHQHDTQHASKADAEPQLIHDTKASNKLGRSFSSPNILTRDVEGPTKRYSLLRFRQSKSFNDGHPDGRGNSSASNLGAYPAHLEALLAPDCPNHARHLTAEDALREKVLLMKQRKQKLQAIDDLRATYRLKSSKSSSSRSSSMPSQFVLTTSDRGDAIVAPRINGQVDTAMSFSAESTRSIDTLPETIYDNDDNGEDNDTEHEVTTCSEESDTSSQTSKEPYTPEKSANLEKPQNTFLQLLSNAASQCT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.16
3 0.15
4 0.16
5 0.18
6 0.2
7 0.2
8 0.2
9 0.16
10 0.16
11 0.16
12 0.15
13 0.14
14 0.13
15 0.13
16 0.13
17 0.13
18 0.14
19 0.16
20 0.15
21 0.15
22 0.14
23 0.12
24 0.14
25 0.14
26 0.17
27 0.21
28 0.25
29 0.27
30 0.29
31 0.3
32 0.29
33 0.29
34 0.28
35 0.29
36 0.27
37 0.28
38 0.29
39 0.27
40 0.28
41 0.3
42 0.3
43 0.22
44 0.19
45 0.23
46 0.21
47 0.23
48 0.21
49 0.22
50 0.22
51 0.29
52 0.35
53 0.32
54 0.32
55 0.38
56 0.41
57 0.42
58 0.45
59 0.47
60 0.52
61 0.55
62 0.58
63 0.52
64 0.53
65 0.55
66 0.52
67 0.52
68 0.41
69 0.43
70 0.41
71 0.41
72 0.4
73 0.35
74 0.37
75 0.34
76 0.38
77 0.31
78 0.32
79 0.36
80 0.39
81 0.41
82 0.38
83 0.33
84 0.36
85 0.39
86 0.38
87 0.39
88 0.35
89 0.35
90 0.43
91 0.46
92 0.45
93 0.48
94 0.49
95 0.52
96 0.6
97 0.64
98 0.64
99 0.65
100 0.62
101 0.55
102 0.55
103 0.52
104 0.49
105 0.46
106 0.4
107 0.4
108 0.39
109 0.41
110 0.41
111 0.42
112 0.45
113 0.49
114 0.54
115 0.57
116 0.61
117 0.63
118 0.61
119 0.55
120 0.48
121 0.4
122 0.37
123 0.31
124 0.23
125 0.18
126 0.18
127 0.17
128 0.13
129 0.13
130 0.08
131 0.13
132 0.13
133 0.13
134 0.13
135 0.14
136 0.14
137 0.16
138 0.17
139 0.13
140 0.16
141 0.16
142 0.17
143 0.26
144 0.29
145 0.31
146 0.32
147 0.31
148 0.3
149 0.3
150 0.3
151 0.26
152 0.27
153 0.25
154 0.26
155 0.3
156 0.29
157 0.31
158 0.34
159 0.32
160 0.33
161 0.32
162 0.32
163 0.3
164 0.32
165 0.35
166 0.3
167 0.34
168 0.3
169 0.32
170 0.35
171 0.35
172 0.36
173 0.33
174 0.39
175 0.35
176 0.35
177 0.38
178 0.35
179 0.34
180 0.34
181 0.32
182 0.28
183 0.28
184 0.29
185 0.27
186 0.25
187 0.26
188 0.24
189 0.24
190 0.22
191 0.19
192 0.18
193 0.15
194 0.15
195 0.17
196 0.23
197 0.24
198 0.3
199 0.31
200 0.33
201 0.36
202 0.37
203 0.36
204 0.34
205 0.38
206 0.36
207 0.4
208 0.42
209 0.45
210 0.47
211 0.51
212 0.51
213 0.45
214 0.43
215 0.4
216 0.38
217 0.34
218 0.31
219 0.32
220 0.27
221 0.27
222 0.31
223 0.34
224 0.34
225 0.34
226 0.33
227 0.25
228 0.29
229 0.32
230 0.32
231 0.35
232 0.39
233 0.41
234 0.4
235 0.4
236 0.36
237 0.34
238 0.28
239 0.22
240 0.15
241 0.13
242 0.15
243 0.14
244 0.14
245 0.14
246 0.13
247 0.12
248 0.11
249 0.1
250 0.08
251 0.07
252 0.07
253 0.07
254 0.08
255 0.07
256 0.07
257 0.06
258 0.06
259 0.07
260 0.07
261 0.08
262 0.09
263 0.14
264 0.14
265 0.13
266 0.12
267 0.12
268 0.12
269 0.12
270 0.11
271 0.08
272 0.11
273 0.11
274 0.12
275 0.12
276 0.12
277 0.13
278 0.15
279 0.15
280 0.12
281 0.13
282 0.13
283 0.14
284 0.16
285 0.18
286 0.2
287 0.22
288 0.26
289 0.26
290 0.25
291 0.24
292 0.23
293 0.2
294 0.15
295 0.12
296 0.08
297 0.08
298 0.08
299 0.08
300 0.07
301 0.05
302 0.05
303 0.05
304 0.04
305 0.04
306 0.04
307 0.04
308 0.04
309 0.04
310 0.04
311 0.04
312 0.04
313 0.04
314 0.04
315 0.04
316 0.05
317 0.05
318 0.05
319 0.05
320 0.05
321 0.06
322 0.08
323 0.1
324 0.09
325 0.11
326 0.14
327 0.14
328 0.14
329 0.13
330 0.12
331 0.13
332 0.15
333 0.17
334 0.18
335 0.21
336 0.24
337 0.24
338 0.26
339 0.31
340 0.34
341 0.36
342 0.37
343 0.36
344 0.34
345 0.39
346 0.43
347 0.44
348 0.46
349 0.48
350 0.47
351 0.49
352 0.49
353 0.5
354 0.49
355 0.48
356 0.51
357 0.48
358 0.46
359 0.44
360 0.43
361 0.38
362 0.32
363 0.27
364 0.21
365 0.2
366 0.22
367 0.21
368 0.21
369 0.19
370 0.2
371 0.19
372 0.16
373 0.12
374 0.09
375 0.08
376 0.07
377 0.09
378 0.14
379 0.14
380 0.19
381 0.2
382 0.24
383 0.3
384 0.31
385 0.31
386 0.28
387 0.33
388 0.32
389 0.38
390 0.39
391 0.41
392 0.42
393 0.45
394 0.47
395 0.39
396 0.35
397 0.29
398 0.27
399 0.22
400 0.22
401 0.18
402 0.16
403 0.17
404 0.16
405 0.15
406 0.13
407 0.1
408 0.1
409 0.1
410 0.1
411 0.11
412 0.13
413 0.14
414 0.17
415 0.22
416 0.21
417 0.23
418 0.26
419 0.26
420 0.25
421 0.27
422 0.25
423 0.21
424 0.22
425 0.22
426 0.2
427 0.19
428 0.18
429 0.17
430 0.15
431 0.13
432 0.14
433 0.17
434 0.17
435 0.21
436 0.25
437 0.32
438 0.36
439 0.38
440 0.39
441 0.39
442 0.41
443 0.4
444 0.42
445 0.39
446 0.36
447 0.36
448 0.35
449 0.32
450 0.3
451 0.28
452 0.2
453 0.16
454 0.19
455 0.18
456 0.17
457 0.14
458 0.14
459 0.14
460 0.17
461 0.19
462 0.18
463 0.17
464 0.16
465 0.18
466 0.19
467 0.19
468 0.17
469 0.15
470 0.15
471 0.13
472 0.13
473 0.1
474 0.09
475 0.08
476 0.07
477 0.06
478 0.06
479 0.06
480 0.06
481 0.09
482 0.09
483 0.1
484 0.1
485 0.13
486 0.12
487 0.14
488 0.14
489 0.12
490 0.12
491 0.12
492 0.12
493 0.09
494 0.1
495 0.08
496 0.09
497 0.09
498 0.09
499 0.1
500 0.1
501 0.1
502 0.11
503 0.14
504 0.15
505 0.16
506 0.16
507 0.17
508 0.17
509 0.17
510 0.16
511 0.15
512 0.13
513 0.11
514 0.15
515 0.13
516 0.13
517 0.13
518 0.16
519 0.16
520 0.16
521 0.16
522 0.15
523 0.15
524 0.16
525 0.17
526 0.15
527 0.17
528 0.19
529 0.23
530 0.22
531 0.23
532 0.25
533 0.25
534 0.25
535 0.22
536 0.22
537 0.19
538 0.19
539 0.21
540 0.2
541 0.23
542 0.23
543 0.24
544 0.28
545 0.29
546 0.29
547 0.28
548 0.27
549 0.24
550 0.23
551 0.22
552 0.16
553 0.13
554 0.11
555 0.08
556 0.06
557 0.07
558 0.09
559 0.09
560 0.1
561 0.11
562 0.15
563 0.16
564 0.19
565 0.21
566 0.23
567 0.24
568 0.25
569 0.25
570 0.22
571 0.2
572 0.17
573 0.13
574 0.1
575 0.11
576 0.1
577 0.11
578 0.11
579 0.12
580 0.12
581 0.15
582 0.17
583 0.13
584 0.12
585 0.12
586 0.11
587 0.11
588 0.11
589 0.08
590 0.07
591 0.08
592 0.1
593 0.1
594 0.12
595 0.14
596 0.17
597 0.17
598 0.19
599 0.19
600 0.23
601 0.23
602 0.22
603 0.19
604 0.17
605 0.19
606 0.17
607 0.16
608 0.12
609 0.11
610 0.1
611 0.1
612 0.09
613 0.08
614 0.08
615 0.1
616 0.13
617 0.14
618 0.16
619 0.17
620 0.18
621 0.22
622 0.22
623 0.19
624 0.15
625 0.18
626 0.19
627 0.18
628 0.17
629 0.12
630 0.13
631 0.12
632 0.12
633 0.08
634 0.14
635 0.16
636 0.17
637 0.17
638 0.17
639 0.18
640 0.2
641 0.2
642 0.15
643 0.14
644 0.13
645 0.13
646 0.13
647 0.12
648 0.1
649 0.1
650 0.08
651 0.09
652 0.08
653 0.08
654 0.07
655 0.07
656 0.06
657 0.06
658 0.06
659 0.05
660 0.06
661 0.06
662 0.06
663 0.06
664 0.09
665 0.11
666 0.13
667 0.18
668 0.22
669 0.24
670 0.25
671 0.28
672 0.27
673 0.31
674 0.37
675 0.36
676 0.37
677 0.36
678 0.35
679 0.33
680 0.33
681 0.3
682 0.24
683 0.22
684 0.17
685 0.17
686 0.16
687 0.16
688 0.15
689 0.12
690 0.07
691 0.07
692 0.07
693 0.07
694 0.08
695 0.09
696 0.1
697 0.13
698 0.13
699 0.18
700 0.27
701 0.37
702 0.46
703 0.54
704 0.63
705 0.71
706 0.81
707 0.86
708 0.87
709 0.87
710 0.87
711 0.82
712 0.74
713 0.66
714 0.6
715 0.51
716 0.41
717 0.3
718 0.2
719 0.16
720 0.14
721 0.12
722 0.08
723 0.06
724 0.08
725 0.09
726 0.1
727 0.1
728 0.15
729 0.18
730 0.17
731 0.17
732 0.17
733 0.16
734 0.18
735 0.19
736 0.15
737 0.13
738 0.13
739 0.14
740 0.13
741 0.13
742 0.12
743 0.11
744 0.12
745 0.11
746 0.12
747 0.18
748 0.26
749 0.32
750 0.34
751 0.4
752 0.4
753 0.45
754 0.51
755 0.5
756 0.49
757 0.49
758 0.53
759 0.56
760 0.61
761 0.62
762 0.58
763 0.58
764 0.57
765 0.53
766 0.46
767 0.41
768 0.42
769 0.42
770 0.41
771 0.36
772 0.3
773 0.29
774 0.31
775 0.28
776 0.24
777 0.18
778 0.19
779 0.22
780 0.21
781 0.2
782 0.2
783 0.19
784 0.17
785 0.18
786 0.17
787 0.13
788 0.13
789 0.13
790 0.13
791 0.15
792 0.13
793 0.13
794 0.16
795 0.18
796 0.2
797 0.21
798 0.2
799 0.2
800 0.21
801 0.21
802 0.26
803 0.25
804 0.27
805 0.26
806 0.24
807 0.24
808 0.25
809 0.25
810 0.18
811 0.17
812 0.19
813 0.19
814 0.18
815 0.18
816 0.17
817 0.17
818 0.17
819 0.18
820 0.14
821 0.17
822 0.16
823 0.17
824 0.18
825 0.19
826 0.21
827 0.26
828 0.28
829 0.26
830 0.31
831 0.31
832 0.32
833 0.34
834 0.3
835 0.26
836 0.24
837 0.26
838 0.21
839 0.19
840 0.18
841 0.15
842 0.16
843 0.13
844 0.11
845 0.1
846 0.09
847 0.1
848 0.15
849 0.14
850 0.16
851 0.23
852 0.24
853 0.27
854 0.36
855 0.45
856 0.5
857 0.61
858 0.69
859 0.68
860 0.71
861 0.73
862 0.69
863 0.62
864 0.55
865 0.45
866 0.37
867 0.34
868 0.33
869 0.28
870 0.27
871 0.26
872 0.24
873 0.23
874 0.23
875 0.19
876 0.16
877 0.2
878 0.22
879 0.26
880 0.27
881 0.27
882 0.25
883 0.24
884 0.3
885 0.26
886 0.24
887 0.21
888 0.25
889 0.26
890 0.27
891 0.27
892 0.26
893 0.26
894 0.28
895 0.26
896 0.22
897 0.24
898 0.25
899 0.29
900 0.27
901 0.26
902 0.21
903 0.23
904 0.28
905 0.26
906 0.24
907 0.2
908 0.2
909 0.23
910 0.31
911 0.31
912 0.28
913 0.3
914 0.36
915 0.38
916 0.38
917 0.41
918 0.38
919 0.37
920 0.42
921 0.41
922 0.37
923 0.39
924 0.38
925 0.32
926 0.31
927 0.31
928 0.24
929 0.29
930 0.28
931 0.26
932 0.27
933 0.28
934 0.27
935 0.28
936 0.32
937 0.37
938 0.44
939 0.51
940 0.56
941 0.58
942 0.66
943 0.67
944 0.66
945 0.63
946 0.59
947 0.51
948 0.51
949 0.5
950 0.44
951 0.44
952 0.42
953 0.35
954 0.33
955 0.32
956 0.25
957 0.23
958 0.22
959 0.19
960 0.16
961 0.16
962 0.13
963 0.13
964 0.12
965 0.11
966 0.11
967 0.1
968 0.1
969 0.09
970 0.09
971 0.08
972 0.12
973 0.12
974 0.11
975 0.1
976 0.1
977 0.13
978 0.15
979 0.16
980 0.16
981 0.17
982 0.18
983 0.2
984 0.23
985 0.24
986 0.25
987 0.27
988 0.25
989 0.26
990 0.25
991 0.23
992 0.19
993 0.17
994 0.19
995 0.22
996 0.28
997 0.33
998 0.41
999 0.5
1000 0.59
1001 0.66
1002 0.67
1003 0.69
1004 0.69
1005 0.69
1006 0.69
1007 0.67
1008 0.62
1009 0.58
1010 0.54
1011 0.47
1012 0.42
1013 0.36
1014 0.3
1015 0.31
1016 0.32
1017 0.32
1018 0.36
1019 0.41
1020 0.47
1021 0.53
1022 0.57
1023 0.56
1024 0.57
1025 0.58
1026 0.54
1027 0.54
1028 0.51
1029 0.5
1030 0.46
1031 0.4
1032 0.36
1033 0.33
1034 0.31
1035 0.31
1036 0.25
1037 0.22
1038 0.21
1039 0.22
1040 0.19
1041 0.19
1042 0.19
1043 0.16
1044 0.17
1045 0.22
1046 0.21
1047 0.2
1048 0.22
1049 0.23
1050 0.23
1051 0.21
1052 0.19
1053 0.14
1054 0.15
1055 0.15
1056 0.13
1057 0.12
1058 0.11
1059 0.11
1060 0.1
1061 0.11
1062 0.11
1063 0.11
1064 0.14
1065 0.15
1066 0.15
1067 0.16
1068 0.17
1069 0.16
1070 0.17
1071 0.17
1072 0.16
1073 0.17
1074 0.18
1075 0.21
1076 0.2
1077 0.19
1078 0.17
1079 0.16
1080 0.17
1081 0.15
1082 0.17
1083 0.13
1084 0.13
1085 0.15
1086 0.16
1087 0.16
1088 0.15
1089 0.14
1090 0.12
1091 0.13
1092 0.16
1093 0.14
1094 0.13
1095 0.13
1096 0.13
1097 0.18
1098 0.21
1099 0.22
1100 0.21
1101 0.23
1102 0.23
1103 0.24
1104 0.29
1105 0.27
1106 0.27
1107 0.32
1108 0.36
1109 0.42
1110 0.45
1111 0.47
1112 0.48
1113 0.51
1114 0.55
1115 0.57
1116 0.59
1117 0.6
1118 0.6
1119 0.6
1120 0.59
1121 0.55
1122 0.49
1123 0.43
1124 0.34
1125 0.32
1126 0.29
1127 0.26
1128 0.25
1129 0.25