FuNGI

A0A1J9RD94

Protein Details

Accession

A0A1J9RD94

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
226-248	FETQPKWKTCSIKCKKKLFSSII	Hydrophilic
355-378	GLGSRLINRRRRRERTPPDHSERA	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
363-369	RRRRRER

Subcellular Location(s)

nucl 18, cyto 6, mito 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR006595 CTLH_C IPR006594 LisH IPR012337 RNaseH-like_sf IPR002156 RNaseH_domain IPR036397 RNaseH_sf IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR001680 WD40_repeat IPR019775 WD40_repeat_CS IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0004523 F:RNA-DNA hybrid ribonuclease activity
Pfam	View protein in Pfam PF00075 RNase_H PF00400 WD40
PROSITE	View protein in PROSITE PS50897 CTLH PS50896 LISH PS50879 RNASE_H_1 PS00678 WD_REPEATS_1 PS50082 WD_REPEATS_2 PS50294 WD_REPEATS_REGION
CDD	cd09276 Rnase_HI_RT_non_LTR cd00200 WD40

Amino Acid Sequences

MHEKLSPWRRKLNSLVDIQISTLSKEDEAKNHLLLLKNKIDWEKSLAIYTDGSKNENSVNLGAGISYSKDNKIYMSDSWQIGAESEVFDAEIFAISRAFQLVEKQLRLQDNLREIWIFSDSQAALKRLLNHKIHNGQLYIERIVNILERINKRFSVNIHLFWVPAHMNIRGNELADLAAKRGSELNSAFQKIVSWSFIKRKIKESCLSEWSEKWNSQRKSAHYSVFETQPKWKTCSIKCKKKLFSSIIQLKHAHGYFKSYLKRFAQTFDSDRYESPSHTPASAAPGPSNLTTNLESVPTTTTTSSTPTTSTTNHSSTPSNAQITHENSPLSLQSNELPPRLPGLGLHTDRSETVGLGSRLINRRRRRERTPPDHSERAGSRSGNPGLSHLLEDQSRDRNRDDIPPSPKRRRLAGGNMRPDGGASTSNTNGFSPISNGSTSSPLRKAPVSNSVNGRSPHSSPTGQPQANGSGKSPISISPTYFGHDREEVTRILIQSLHDLGYNEAASILSRESGFELESPAVASFRSAVLNGRWADAEDILLGSYCPNRGGNGTDAGEGNTNNRGTDTVLADEQGTLVLAEGADRNEMLFCLRQQKFLELLERRDLGTALMVLRQELTPLNHDIAQLHALSSLLMCPAENLRAQAGWDGSVLQSRRRLLGELSRSISPAVMIPDHRLAVLLDYVKHNQINQCLYHNTAESPSLYSDHQCDRSQFPLRTSLELNEHTDEVWYLEFSHDGAKLATTGRENIVIIYDVATFSVIHRLTDHGGPVAYATWSPDDSKLISCSQDYKARLWDVETGRCILTIDHHHEPVTSAAWAPDGDSFVTGSLDRQSQLCHWSVAGESLYKWSGQYRVRDCSISPDGRRLIAISTEKKIYVYNFESRAEEYSMSIKLDLTCVNISRDSRYMLLNTSECEMQLLDIESREVVRQYVGQKQQGNDEYIIRNSFGGAAENFVVSGSEDSKIHIWHKENSTLVATLQGHGAGCVNAVSWNPRDPGMFASAGDDRKVRIWTRDPPTRTPVSRKARMPPSNGLARTSALRSTFNRSPNF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.66
2	0.64
3	0.58
4	0.54
5	0.47
6	0.42
7	0.33
8	0.26
9	0.22
10	0.18
11	0.16
12	0.21
13	0.24
14	0.25
15	0.31
16	0.33
17	0.32
18	0.34
19	0.37
20	0.38
21	0.4
22	0.42
23	0.43
24	0.42
25	0.46
26	0.48
27	0.46
28	0.42
29	0.44
30	0.41
31	0.36
32	0.37
33	0.33
34	0.29
35	0.28
36	0.29
37	0.29
38	0.25
39	0.26
40	0.23
41	0.24
42	0.25
43	0.25
44	0.25
45	0.19
46	0.19
47	0.17
48	0.17
49	0.15
50	0.13
51	0.11
52	0.1
53	0.13
54	0.14
55	0.16
56	0.18
57	0.19
58	0.19
59	0.23
60	0.25
61	0.23
62	0.28
63	0.31
64	0.29
65	0.3
66	0.29
67	0.25
68	0.22
69	0.21
70	0.15
71	0.1
72	0.1
73	0.09
74	0.08
75	0.08
76	0.08
77	0.07
78	0.07
79	0.06
80	0.07
81	0.07
82	0.07
83	0.08
84	0.08
85	0.09
86	0.08
87	0.13
88	0.21
89	0.27
90	0.29
91	0.32
92	0.37
93	0.39
94	0.43
95	0.42
96	0.4
97	0.4
98	0.4
99	0.38
100	0.33
101	0.3
102	0.28
103	0.26
104	0.19
105	0.14
106	0.18
107	0.16
108	0.19
109	0.23
110	0.23
111	0.23
112	0.26
113	0.33
114	0.34
115	0.43
116	0.45
117	0.46
118	0.54
119	0.58
120	0.59
121	0.56
122	0.5
123	0.43
124	0.43
125	0.41
126	0.34
127	0.28
128	0.24
129	0.2
130	0.2
131	0.2
132	0.15
133	0.15
134	0.21
135	0.25
136	0.29
137	0.33
138	0.34
139	0.34
140	0.36
141	0.35
142	0.37
143	0.37
144	0.35
145	0.36
146	0.34
147	0.32
148	0.29
149	0.3
150	0.2
151	0.19
152	0.19
153	0.17
154	0.21
155	0.22
156	0.27
157	0.24
158	0.24
159	0.22
160	0.19
161	0.17
162	0.16
163	0.16
164	0.12
165	0.12
166	0.11
167	0.12
168	0.15
169	0.15
170	0.17
171	0.18
172	0.24
173	0.28
174	0.3
175	0.3
176	0.26
177	0.26
178	0.24
179	0.24
180	0.21
181	0.18
182	0.21
183	0.29
184	0.38
185	0.46
186	0.47
187	0.54
188	0.58
189	0.64
190	0.66
191	0.63
192	0.61
193	0.58
194	0.6
195	0.54
196	0.48
197	0.48
198	0.45
199	0.43
200	0.45
201	0.49
202	0.46
203	0.51
204	0.56
205	0.54
206	0.58
207	0.6
208	0.58
209	0.51
210	0.54
211	0.49
212	0.51
213	0.49
214	0.42
215	0.45
216	0.47
217	0.46
218	0.46
219	0.47
220	0.48
221	0.52
222	0.61
223	0.64
224	0.67
225	0.74
226	0.8
227	0.83
228	0.83
229	0.84
230	0.79
231	0.76
232	0.76
233	0.75
234	0.69
235	0.66
236	0.59
237	0.5
238	0.5
239	0.44
240	0.35
241	0.27
242	0.28
243	0.27
244	0.33
245	0.39
246	0.35
247	0.41
248	0.42
249	0.47
250	0.42
251	0.41
252	0.4
253	0.38
254	0.4
255	0.39
256	0.4
257	0.36
258	0.35
259	0.37
260	0.33
261	0.29
262	0.29
263	0.27
264	0.24
265	0.23
266	0.23
267	0.18
268	0.24
269	0.25
270	0.22
271	0.18
272	0.18
273	0.2
274	0.2
275	0.21
276	0.14
277	0.15
278	0.15
279	0.16
280	0.15
281	0.14
282	0.13
283	0.12
284	0.13
285	0.11
286	0.12
287	0.11
288	0.12
289	0.12
290	0.15
291	0.16
292	0.15
293	0.14
294	0.15
295	0.17
296	0.18
297	0.22
298	0.24
299	0.25
300	0.26
301	0.27
302	0.27
303	0.26
304	0.31
305	0.3
306	0.27
307	0.25
308	0.26
309	0.29
310	0.32
311	0.33
312	0.28
313	0.24
314	0.22
315	0.22
316	0.21
317	0.18
318	0.14
319	0.12
320	0.12
321	0.19
322	0.21
323	0.21
324	0.2
325	0.18
326	0.2
327	0.19
328	0.17
329	0.11
330	0.14
331	0.22
332	0.22
333	0.24
334	0.22
335	0.22
336	0.22
337	0.23
338	0.18
339	0.1
340	0.1
341	0.14
342	0.13
343	0.14
344	0.15
345	0.19
346	0.26
347	0.33
348	0.4
349	0.44
350	0.54
351	0.64
352	0.71
353	0.74
354	0.78
355	0.82
356	0.84
357	0.85
358	0.84
359	0.82
360	0.79
361	0.71
362	0.65
363	0.55
364	0.48
365	0.42
366	0.33
367	0.27
368	0.28
369	0.29
370	0.26
371	0.24
372	0.21
373	0.2
374	0.2
375	0.19
376	0.13
377	0.14
378	0.12
379	0.14
380	0.15
381	0.21
382	0.23
383	0.24
384	0.24
385	0.26
386	0.27
387	0.34
388	0.35
389	0.35
390	0.41
391	0.49
392	0.57
393	0.62
394	0.67
395	0.61
396	0.61
397	0.59
398	0.57
399	0.58
400	0.6
401	0.6
402	0.61
403	0.59
404	0.55
405	0.49
406	0.43
407	0.32
408	0.22
409	0.15
410	0.09
411	0.11
412	0.11
413	0.12
414	0.13
415	0.12
416	0.12
417	0.11
418	0.1
419	0.09
420	0.1
421	0.11
422	0.1
423	0.11
424	0.11
425	0.15
426	0.16
427	0.17
428	0.18
429	0.17
430	0.19
431	0.2
432	0.21
433	0.19
434	0.29
435	0.28
436	0.3
437	0.33
438	0.34
439	0.37
440	0.36
441	0.36
442	0.28
443	0.28
444	0.27
445	0.26
446	0.25
447	0.21
448	0.28
449	0.33
450	0.31
451	0.3
452	0.28
453	0.31
454	0.32
455	0.32
456	0.24
457	0.2
458	0.2
459	0.2
460	0.19
461	0.14
462	0.16
463	0.16
464	0.16
465	0.14
466	0.15
467	0.16
468	0.17
469	0.16
470	0.14
471	0.14
472	0.15
473	0.14
474	0.16
475	0.14
476	0.15
477	0.15
478	0.13
479	0.12
480	0.12
481	0.1
482	0.1
483	0.1
484	0.09
485	0.08
486	0.09
487	0.08
488	0.09
489	0.09
490	0.07
491	0.06
492	0.06
493	0.05
494	0.05
495	0.05
496	0.04
497	0.04
498	0.05
499	0.05
500	0.06
501	0.06
502	0.06
503	0.07
504	0.06
505	0.06
506	0.06
507	0.06
508	0.05
509	0.05
510	0.05
511	0.04
512	0.05
513	0.05
514	0.05
515	0.06
516	0.07
517	0.12
518	0.12
519	0.12
520	0.12
521	0.12
522	0.12
523	0.11
524	0.1
525	0.05
526	0.05
527	0.04
528	0.04
529	0.04
530	0.04
531	0.04
532	0.04
533	0.05
534	0.05
535	0.06
536	0.07
537	0.09
538	0.1
539	0.12
540	0.13
541	0.13
542	0.13
543	0.13
544	0.13
545	0.11
546	0.11
547	0.11
548	0.1
549	0.09
550	0.09
551	0.09
552	0.09
553	0.11
554	0.11
555	0.09
556	0.09
557	0.09
558	0.09
559	0.09
560	0.08
561	0.06
562	0.05
563	0.03
564	0.03
565	0.03
566	0.03
567	0.03
568	0.04
569	0.04
570	0.04
571	0.04
572	0.04
573	0.04
574	0.05
575	0.05
576	0.06
577	0.07
578	0.17
579	0.17
580	0.21
581	0.22
582	0.24
583	0.25
584	0.26
585	0.33
586	0.26
587	0.28
588	0.27
589	0.27
590	0.25
591	0.24
592	0.22
593	0.14
594	0.12
595	0.1
596	0.07
597	0.08
598	0.07
599	0.07
600	0.07
601	0.07
602	0.08
603	0.08
604	0.09
605	0.1
606	0.12
607	0.13
608	0.13
609	0.13
610	0.13
611	0.12
612	0.13
613	0.1
614	0.09
615	0.08
616	0.07
617	0.06
618	0.06
619	0.05
620	0.04
621	0.04
622	0.04
623	0.04
624	0.05
625	0.07
626	0.08
627	0.08
628	0.08
629	0.09
630	0.09
631	0.1
632	0.1
633	0.08
634	0.08
635	0.07
636	0.07
637	0.11
638	0.11
639	0.13
640	0.16
641	0.17
642	0.19
643	0.19
644	0.2
645	0.18
646	0.25
647	0.28
648	0.28
649	0.3
650	0.28
651	0.28
652	0.27
653	0.24
654	0.17
655	0.13
656	0.1
657	0.1
658	0.1
659	0.12
660	0.13
661	0.14
662	0.13
663	0.12
664	0.1
665	0.1
666	0.11
667	0.1
668	0.1
669	0.12
670	0.14
671	0.15
672	0.16
673	0.17
674	0.17
675	0.21
676	0.23
677	0.22
678	0.24
679	0.23
680	0.25
681	0.25
682	0.23
683	0.19
684	0.16
685	0.16
686	0.13
687	0.13
688	0.12
689	0.12
690	0.12
691	0.13
692	0.15
693	0.19
694	0.22
695	0.22
696	0.24
697	0.26
698	0.32
699	0.38
700	0.37
701	0.34
702	0.38
703	0.38
704	0.38
705	0.37
706	0.33
707	0.3
708	0.3
709	0.32
710	0.24
711	0.23
712	0.2
713	0.19
714	0.16
715	0.12
716	0.1
717	0.07
718	0.06
719	0.06
720	0.07
721	0.07
722	0.09
723	0.08
724	0.09
725	0.09
726	0.08
727	0.09
728	0.1
729	0.11
730	0.11
731	0.12
732	0.12
733	0.13
734	0.13
735	0.12
736	0.12
737	0.11
738	0.1
739	0.09
740	0.08
741	0.07
742	0.07
743	0.07
744	0.06
745	0.06
746	0.13
747	0.12
748	0.12
749	0.13
750	0.15
751	0.16
752	0.18
753	0.18
754	0.12
755	0.12
756	0.12
757	0.11
758	0.1
759	0.08
760	0.07
761	0.08
762	0.08
763	0.09
764	0.11
765	0.12
766	0.13
767	0.14
768	0.15
769	0.17
770	0.17
771	0.17
772	0.17
773	0.2
774	0.22
775	0.28
776	0.28
777	0.28
778	0.32
779	0.32
780	0.32
781	0.3
782	0.33
783	0.3
784	0.33
785	0.32
786	0.28
787	0.26
788	0.26
789	0.25
790	0.17
791	0.18
792	0.2
793	0.25
794	0.26
795	0.27
796	0.27
797	0.27
798	0.28
799	0.25
800	0.2
801	0.13
802	0.1
803	0.1
804	0.1
805	0.1
806	0.1
807	0.09
808	0.09
809	0.09
810	0.09
811	0.09
812	0.08
813	0.09
814	0.09
815	0.08
816	0.1
817	0.11
818	0.11
819	0.11
820	0.13
821	0.15
822	0.19
823	0.19
824	0.17
825	0.16
826	0.16
827	0.16
828	0.16
829	0.15
830	0.12
831	0.11
832	0.13
833	0.14
834	0.13
835	0.13
836	0.13
837	0.19
838	0.23
839	0.32
840	0.35
841	0.41
842	0.43
843	0.44
844	0.42
845	0.43
846	0.46
847	0.44
848	0.41
849	0.42
850	0.41
851	0.4
852	0.4
853	0.32
854	0.26
855	0.25
856	0.3
857	0.27
858	0.29
859	0.31
860	0.31
861	0.3
862	0.31
863	0.27
864	0.27
865	0.28
866	0.31
867	0.32
868	0.34
869	0.35
870	0.34
871	0.35
872	0.3
873	0.25
874	0.2
875	0.19
876	0.19
877	0.18
878	0.17
879	0.15
880	0.14
881	0.15
882	0.15
883	0.15
884	0.16
885	0.17
886	0.19
887	0.22
888	0.23
889	0.25
890	0.26
891	0.25
892	0.25
893	0.25
894	0.24
895	0.23
896	0.27
897	0.24
898	0.23
899	0.23
900	0.21
901	0.19
902	0.18
903	0.15
904	0.11
905	0.11
906	0.12
907	0.11
908	0.11
909	0.11
910	0.11
911	0.12
912	0.13
913	0.12
914	0.1
915	0.11
916	0.15
917	0.18
918	0.27
919	0.33
920	0.38
921	0.42
922	0.43
923	0.5
924	0.5
925	0.5
926	0.43
927	0.4
928	0.37
929	0.36
930	0.36
931	0.27
932	0.23
933	0.2
934	0.2
935	0.16
936	0.16
937	0.12
938	0.13
939	0.13
940	0.13
941	0.13
942	0.11
943	0.11
944	0.08
945	0.1
946	0.09
947	0.1
948	0.1
949	0.13
950	0.15
951	0.18
952	0.21
953	0.26
954	0.29
955	0.35
956	0.4
957	0.44
958	0.44
959	0.43
960	0.43
961	0.36
962	0.32
963	0.31
964	0.27
965	0.21
966	0.2
967	0.19
968	0.16
969	0.15
970	0.16
971	0.09
972	0.09
973	0.08
974	0.08
975	0.08
976	0.09
977	0.14
978	0.15
979	0.2
980	0.21
981	0.22
982	0.23
983	0.23
984	0.25
985	0.25
986	0.23
987	0.19
988	0.22
989	0.25
990	0.26
991	0.26
992	0.24
993	0.21
994	0.24
995	0.3
996	0.29
997	0.32
998	0.38
999	0.46
1000	0.54
1001	0.62
1002	0.64
1003	0.65
1004	0.69
1005	0.7
1006	0.7
1007	0.69
1008	0.7
1009	0.71
1010	0.74
1011	0.73
1012	0.76
1013	0.78
1014	0.78
1015	0.76
1016	0.74
1017	0.71
1018	0.72
1019	0.67
1020	0.6
1021	0.51
1022	0.45
1023	0.42
1024	0.36
1025	0.33
1026	0.26
1027	0.3
1028	0.31
1029	0.38
1030	0.42

A0A1J9RD94

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer