Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q7SHZ0

Protein Details
Accession Q7SHZ0    Localization Confidence High Confidence Score 15.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
229-282EGEIRSRTRSRSRTPRSRSRSTSYSRSRSPVTRRRSRTRSRSRTPEDRNGRERMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
145-151RKLRRKG
235-273RTRSRSRTPRSRSRSTSYSRSRSPVTRRRSRTRSRSRTP
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 15, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005037  PRP38  
Gene Ontology GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG ncr:NCU00662  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03371  PRP38  
Amino Acid Sequences MSKSEFHRADERRFLDERGSSGPLAPNGLNPATIMEKAVRERIIDSYFYKEQCFGVNEADIVDRVVEHVDFIGGVYGTVQKPSPFLCLAFKLLQLAPSDDILNEYLQFGGEKFKYLRALALFYIRLTRKDQDVYKTLEPFLEDRRKLRRKGRNGTSLTYMDVFVDDLLTKDRVCATSLWKMRKRDILEDLDILEPRVSPLGNIEDLLEEEDEAMRKAEEEQNNNGSESEGEIRSRTRSRSRTPRSRSRSTSYSRSRSPVTRRRSRTRSRSRTPEDRNGRERMDIDGPE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.48
3 0.44
4 0.39
5 0.34
6 0.34
7 0.28
8 0.29
9 0.31
10 0.25
11 0.26
12 0.23
13 0.2
14 0.22
15 0.22
16 0.19
17 0.16
18 0.17
19 0.16
20 0.16
21 0.16
22 0.14
23 0.17
24 0.19
25 0.24
26 0.22
27 0.21
28 0.23
29 0.26
30 0.26
31 0.26
32 0.25
33 0.28
34 0.31
35 0.31
36 0.31
37 0.27
38 0.25
39 0.26
40 0.27
41 0.21
42 0.19
43 0.19
44 0.18
45 0.17
46 0.17
47 0.13
48 0.11
49 0.09
50 0.06
51 0.06
52 0.07
53 0.06
54 0.05
55 0.05
56 0.05
57 0.05
58 0.05
59 0.06
60 0.04
61 0.04
62 0.05
63 0.08
64 0.08
65 0.1
66 0.11
67 0.1
68 0.11
69 0.12
70 0.15
71 0.13
72 0.14
73 0.16
74 0.17
75 0.21
76 0.21
77 0.2
78 0.19
79 0.18
80 0.2
81 0.18
82 0.17
83 0.14
84 0.14
85 0.14
86 0.11
87 0.12
88 0.1
89 0.1
90 0.08
91 0.07
92 0.06
93 0.06
94 0.06
95 0.06
96 0.09
97 0.09
98 0.11
99 0.12
100 0.14
101 0.16
102 0.16
103 0.19
104 0.15
105 0.17
106 0.15
107 0.17
108 0.15
109 0.13
110 0.18
111 0.17
112 0.18
113 0.19
114 0.2
115 0.2
116 0.24
117 0.27
118 0.26
119 0.29
120 0.32
121 0.32
122 0.31
123 0.29
124 0.25
125 0.23
126 0.2
127 0.23
128 0.26
129 0.24
130 0.27
131 0.37
132 0.43
133 0.48
134 0.57
135 0.59
136 0.61
137 0.7
138 0.75
139 0.75
140 0.71
141 0.68
142 0.62
143 0.53
144 0.44
145 0.35
146 0.26
147 0.16
148 0.13
149 0.11
150 0.06
151 0.06
152 0.05
153 0.04
154 0.06
155 0.07
156 0.06
157 0.07
158 0.08
159 0.09
160 0.1
161 0.11
162 0.14
163 0.22
164 0.27
165 0.36
166 0.41
167 0.43
168 0.46
169 0.52
170 0.51
171 0.48
172 0.49
173 0.45
174 0.41
175 0.38
176 0.36
177 0.3
178 0.27
179 0.22
180 0.16
181 0.1
182 0.09
183 0.09
184 0.07
185 0.06
186 0.08
187 0.1
188 0.1
189 0.11
190 0.11
191 0.1
192 0.1
193 0.12
194 0.09
195 0.06
196 0.06
197 0.07
198 0.07
199 0.07
200 0.07
201 0.06
202 0.06
203 0.1
204 0.17
205 0.22
206 0.26
207 0.31
208 0.35
209 0.36
210 0.36
211 0.33
212 0.26
213 0.21
214 0.19
215 0.17
216 0.14
217 0.14
218 0.14
219 0.16
220 0.21
221 0.25
222 0.29
223 0.35
224 0.42
225 0.51
226 0.61
227 0.71
228 0.76
229 0.81
230 0.86
231 0.84
232 0.87
233 0.84
234 0.8
235 0.78
236 0.75
237 0.76
238 0.75
239 0.75
240 0.7
241 0.68
242 0.66
243 0.65
244 0.69
245 0.67
246 0.68
247 0.7
248 0.74
249 0.8
250 0.85
251 0.87
252 0.88
253 0.9
254 0.91
255 0.91
256 0.92
257 0.91
258 0.91
259 0.9
260 0.89
261 0.88
262 0.87
263 0.83
264 0.79
265 0.72
266 0.66
267 0.58
268 0.53