Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1J9Q7H5

Protein Details
Accession A0A1J9Q7H5    Localization Confidence High Confidence Score 23.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
23-62SPEPTPQKTKSSVRKPTEKVKSKKHNAKEAKRKPVPEPNSHydrophilic
289-312GSDNEPGERRKKHKRIHSNSDDGSBasic
346-377VEKSSKKHRDATTQERKARKEETRRKKLGLSSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
32-56KSSVRKPTEKVKSKKHNAKEAKRKP
278-286GKKRRKSSI
292-303NEPGERRKKHKR
350-373SKKHRDATTQERKARKEETRRKKL
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013240  DNA-dir_RNA_pol1_su_RPA34  
Gene Ontology GO:0006360  P:transcription by RNA polymerase I  
Pfam View protein in Pfam  
PF08208  RNA_polI_A34  
Amino Acid Sequences MAPPLSKEIVTDSGSSDLESPSSPEPTPQKTKSSVRKPTEKVKSKKHNAKEAKRKPVPEPNSLSSDSEAENESVSSSEGEPSTPRMDSDVPKSIPAQEFKVPEGFKIMSTSTPWSSDVSKVFSDLRGKQIWHITAPASVPMNSIQELALDAVATGGSILTHRGVNYKLREDQIGAEKYKSLLLPDEKGNAYHRSRANVAQTFHLERIVDLANGATHSEQSVPISELTKPKHEQPRHLKMRYKPIGSTEEQPEIFGSSSDESEEPSFRMPQTIPQDREGKKRRKSSIEIGSDNEPGERRKKHKRIHSNSDDGSTEIHSRDRDVNPSLKSKTSKSSGIAHGRSEEQHVEKSSKKHRDATTQERKARKEETRRKKLGLSS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.23
3 0.19
4 0.15
5 0.14
6 0.14
7 0.15
8 0.15
9 0.18
10 0.18
11 0.23
12 0.29
13 0.36
14 0.45
15 0.46
16 0.5
17 0.54
18 0.64
19 0.68
20 0.73
21 0.75
22 0.75
23 0.81
24 0.81
25 0.84
26 0.85
27 0.85
28 0.83
29 0.83
30 0.86
31 0.87
32 0.9
33 0.89
34 0.89
35 0.89
36 0.91
37 0.91
38 0.9
39 0.91
40 0.88
41 0.83
42 0.81
43 0.81
44 0.76
45 0.74
46 0.71
47 0.64
48 0.62
49 0.6
50 0.53
51 0.43
52 0.39
53 0.3
54 0.24
55 0.21
56 0.15
57 0.14
58 0.12
59 0.11
60 0.09
61 0.09
62 0.09
63 0.08
64 0.1
65 0.1
66 0.11
67 0.11
68 0.14
69 0.16
70 0.15
71 0.15
72 0.16
73 0.2
74 0.22
75 0.28
76 0.33
77 0.31
78 0.32
79 0.33
80 0.35
81 0.35
82 0.34
83 0.32
84 0.29
85 0.3
86 0.3
87 0.35
88 0.3
89 0.26
90 0.28
91 0.25
92 0.2
93 0.21
94 0.2
95 0.15
96 0.17
97 0.2
98 0.17
99 0.18
100 0.18
101 0.18
102 0.18
103 0.21
104 0.21
105 0.21
106 0.19
107 0.2
108 0.19
109 0.21
110 0.25
111 0.24
112 0.27
113 0.26
114 0.27
115 0.28
116 0.32
117 0.3
118 0.26
119 0.25
120 0.2
121 0.19
122 0.19
123 0.18
124 0.14
125 0.12
126 0.12
127 0.12
128 0.13
129 0.11
130 0.12
131 0.09
132 0.08
133 0.08
134 0.08
135 0.06
136 0.05
137 0.04
138 0.04
139 0.03
140 0.03
141 0.03
142 0.02
143 0.02
144 0.02
145 0.03
146 0.04
147 0.05
148 0.05
149 0.08
150 0.1
151 0.15
152 0.18
153 0.21
154 0.24
155 0.24
156 0.25
157 0.24
158 0.24
159 0.26
160 0.27
161 0.24
162 0.22
163 0.21
164 0.21
165 0.21
166 0.18
167 0.12
168 0.12
169 0.13
170 0.15
171 0.15
172 0.18
173 0.17
174 0.18
175 0.2
176 0.22
177 0.21
178 0.25
179 0.25
180 0.25
181 0.27
182 0.29
183 0.33
184 0.31
185 0.31
186 0.27
187 0.28
188 0.28
189 0.26
190 0.24
191 0.17
192 0.13
193 0.14
194 0.12
195 0.1
196 0.08
197 0.07
198 0.06
199 0.07
200 0.07
201 0.05
202 0.04
203 0.05
204 0.05
205 0.06
206 0.06
207 0.07
208 0.08
209 0.09
210 0.1
211 0.12
212 0.16
213 0.18
214 0.24
215 0.24
216 0.31
217 0.4
218 0.43
219 0.5
220 0.56
221 0.64
222 0.69
223 0.73
224 0.73
225 0.69
226 0.76
227 0.73
228 0.66
229 0.56
230 0.51
231 0.5
232 0.46
233 0.45
234 0.38
235 0.35
236 0.32
237 0.31
238 0.27
239 0.22
240 0.2
241 0.15
242 0.12
243 0.09
244 0.09
245 0.1
246 0.1
247 0.1
248 0.11
249 0.12
250 0.11
251 0.12
252 0.14
253 0.12
254 0.15
255 0.14
256 0.2
257 0.29
258 0.37
259 0.38
260 0.41
261 0.5
262 0.5
263 0.61
264 0.63
265 0.64
266 0.64
267 0.7
268 0.73
269 0.73
270 0.77
271 0.76
272 0.76
273 0.74
274 0.68
275 0.61
276 0.57
277 0.5
278 0.43
279 0.35
280 0.27
281 0.22
282 0.27
283 0.32
284 0.37
285 0.47
286 0.56
287 0.64
288 0.73
289 0.81
290 0.83
291 0.87
292 0.88
293 0.86
294 0.78
295 0.73
296 0.63
297 0.52
298 0.43
299 0.34
300 0.27
301 0.19
302 0.2
303 0.17
304 0.19
305 0.26
306 0.28
307 0.31
308 0.33
309 0.38
310 0.39
311 0.46
312 0.46
313 0.45
314 0.47
315 0.45
316 0.48
317 0.47
318 0.48
319 0.44
320 0.49
321 0.51
322 0.57
323 0.56
324 0.5
325 0.48
326 0.46
327 0.44
328 0.4
329 0.37
330 0.31
331 0.33
332 0.34
333 0.36
334 0.39
335 0.47
336 0.52
337 0.57
338 0.6
339 0.63
340 0.66
341 0.72
342 0.76
343 0.79
344 0.8
345 0.79
346 0.82
347 0.81
348 0.79
349 0.74
350 0.74
351 0.73
352 0.73
353 0.74
354 0.77
355 0.8
356 0.84
357 0.82