Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1J9Q3U6

Protein Details
Accession A0A1J9Q3U6    Localization Confidence High Confidence Score 15.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
486-506AAEKRASRKRAPKVTKPKVVDHydrophilic
811-836GDVRDSRRKTIPDKKVGKKRLIGRVSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
483-503KLAAAEKRASRKRAPKVTKPK
817-830RRKTIPDKKVGKKR
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 12.833, cyto 9, cyto_mito 6.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036279  5-3_exonuclease_C_sf  
IPR041177  GEN1_C  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
IPR006086  XPG-I_dom  
IPR006084  XPG/Rad2  
IPR037316  Yen1_H3TH  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008821  F:crossover junction DNA endonuclease activity  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF18380  GEN1_C  
PF00867  XPG_I  
CDD cd09906  H3TH_YEN1  
cd09870  PIN_YEN1  
Amino Acid Sequences MEESCILTDVCSLIQSLGPGERISLAKLAVDHLQRTSRPIRVAIDISIWLFQIQAGRGGTNPELRTLFYRLVRLTGLPVHPLFVYDGPQRPMCKRGKLIGRNTGVGDLGRVIQRSKYLIDLFRFPHHTAPGEAEAECARLQTSGVVDAVMSNDVDAIMFGSKVTIMNFSKENSSGTNAATHVTLYRTEGTNDEEKPNVPLDRGGMILFALLSGGDYLPAGVPKCGPKLAGEIAQAGFGNELLQAIEGSPSEVAVKLGKWRERLQNELHENSEGYFRSKHKAVQIPDNFPDLKVLRDYTHPVVSSSEKLNEVRQSFKWDQSIDIEGLRNFVGKDFGWQRGSARRLTKILAAPLVCNRLRLCLPLLANLDSLPLYGPTTGAQFCGQRFHYSTDGLSELRLEFIPSDIVGLDLKCEPTAPGAQQESETEDIDNLEIEDDVANPNRETRRQTSYDPTQKDRVWVFEAVAEIGMPEAVNIWNTRKQEKLAAAEKRASRKRAPKVTKPKVVDPKMKFGEIMKYGTIVKSPGTAVTNSRSFSSQKAPYRNDSTITDEDAFGLLSQLSELPSSPAYSSSNGDRLGSLKSSNEVTSINTKAALAFERSSESDSYTSIEMIGKAMFDMQISDAQLSSPKNRDLSLGGSHKAAGSRTIISSNHQTRIRNKSKGISNISLPLQSLDIEEENDATKLNTFASCSRSSNSESDISTADDILSRISALRIQEHKLDKCSERSPATIEKDETSQDSPSASAAADIPPNDDCRNLLSKTANGIQATNSPIQRTDLSVIETCKGYWTYGQNTSEDEYHSPEVRSTHNTGDVRDSRRKTIPDKKVGKKRLIGRVSILDLSEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.1
3 0.11
4 0.13
5 0.14
6 0.14
7 0.14
8 0.16
9 0.16
10 0.18
11 0.17
12 0.15
13 0.15
14 0.16
15 0.18
16 0.2
17 0.23
18 0.23
19 0.25
20 0.31
21 0.3
22 0.36
23 0.4
24 0.39
25 0.39
26 0.41
27 0.4
28 0.4
29 0.42
30 0.37
31 0.33
32 0.29
33 0.27
34 0.24
35 0.21
36 0.15
37 0.12
38 0.12
39 0.13
40 0.12
41 0.16
42 0.16
43 0.16
44 0.17
45 0.21
46 0.23
47 0.27
48 0.26
49 0.26
50 0.26
51 0.27
52 0.3
53 0.31
54 0.33
55 0.29
56 0.34
57 0.31
58 0.32
59 0.32
60 0.29
61 0.28
62 0.28
63 0.27
64 0.26
65 0.26
66 0.25
67 0.23
68 0.23
69 0.23
70 0.17
71 0.21
72 0.21
73 0.27
74 0.29
75 0.33
76 0.36
77 0.36
78 0.44
79 0.46
80 0.49
81 0.49
82 0.55
83 0.61
84 0.67
85 0.73
86 0.73
87 0.7
88 0.65
89 0.6
90 0.52
91 0.43
92 0.33
93 0.25
94 0.16
95 0.15
96 0.15
97 0.15
98 0.15
99 0.15
100 0.18
101 0.2
102 0.2
103 0.23
104 0.25
105 0.3
106 0.32
107 0.36
108 0.36
109 0.4
110 0.44
111 0.4
112 0.4
113 0.37
114 0.36
115 0.32
116 0.33
117 0.3
118 0.27
119 0.26
120 0.22
121 0.2
122 0.2
123 0.18
124 0.14
125 0.1
126 0.09
127 0.09
128 0.09
129 0.1
130 0.1
131 0.1
132 0.09
133 0.09
134 0.09
135 0.1
136 0.09
137 0.07
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.05
146 0.05
147 0.05
148 0.05
149 0.06
150 0.07
151 0.13
152 0.13
153 0.16
154 0.18
155 0.19
156 0.21
157 0.21
158 0.22
159 0.18
160 0.21
161 0.19
162 0.19
163 0.2
164 0.17
165 0.17
166 0.16
167 0.14
168 0.12
169 0.12
170 0.12
171 0.12
172 0.14
173 0.14
174 0.15
175 0.16
176 0.19
177 0.23
178 0.25
179 0.25
180 0.24
181 0.23
182 0.24
183 0.26
184 0.23
185 0.18
186 0.17
187 0.16
188 0.16
189 0.16
190 0.14
191 0.1
192 0.09
193 0.09
194 0.07
195 0.05
196 0.04
197 0.03
198 0.03
199 0.03
200 0.03
201 0.03
202 0.03
203 0.04
204 0.05
205 0.07
206 0.07
207 0.07
208 0.1
209 0.12
210 0.15
211 0.16
212 0.16
213 0.15
214 0.19
215 0.21
216 0.23
217 0.21
218 0.21
219 0.2
220 0.2
221 0.19
222 0.15
223 0.12
224 0.08
225 0.07
226 0.05
227 0.05
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.06
238 0.06
239 0.06
240 0.07
241 0.07
242 0.13
243 0.19
244 0.23
245 0.27
246 0.32
247 0.41
248 0.44
249 0.49
250 0.48
251 0.52
252 0.53
253 0.52
254 0.47
255 0.39
256 0.35
257 0.3
258 0.28
259 0.19
260 0.16
261 0.18
262 0.18
263 0.22
264 0.24
265 0.27
266 0.31
267 0.38
268 0.39
269 0.45
270 0.5
271 0.5
272 0.5
273 0.51
274 0.43
275 0.35
276 0.37
277 0.27
278 0.22
279 0.18
280 0.18
281 0.16
282 0.18
283 0.22
284 0.21
285 0.23
286 0.22
287 0.21
288 0.22
289 0.23
290 0.23
291 0.2
292 0.19
293 0.18
294 0.19
295 0.22
296 0.25
297 0.24
298 0.26
299 0.25
300 0.31
301 0.32
302 0.34
303 0.34
304 0.3
305 0.29
306 0.27
307 0.29
308 0.21
309 0.2
310 0.18
311 0.14
312 0.15
313 0.13
314 0.12
315 0.09
316 0.09
317 0.09
318 0.08
319 0.13
320 0.15
321 0.19
322 0.2
323 0.2
324 0.22
325 0.27
326 0.3
327 0.3
328 0.3
329 0.29
330 0.3
331 0.31
332 0.33
333 0.28
334 0.28
335 0.25
336 0.22
337 0.2
338 0.21
339 0.25
340 0.21
341 0.2
342 0.19
343 0.18
344 0.19
345 0.19
346 0.18
347 0.17
348 0.17
349 0.19
350 0.21
351 0.19
352 0.19
353 0.17
354 0.16
355 0.12
356 0.11
357 0.07
358 0.05
359 0.05
360 0.05
361 0.05
362 0.05
363 0.07
364 0.07
365 0.08
366 0.09
367 0.1
368 0.11
369 0.14
370 0.15
371 0.16
372 0.17
373 0.2
374 0.2
375 0.19
376 0.19
377 0.16
378 0.17
379 0.14
380 0.12
381 0.1
382 0.08
383 0.08
384 0.08
385 0.07
386 0.05
387 0.06
388 0.06
389 0.05
390 0.05
391 0.04
392 0.05
393 0.05
394 0.05
395 0.05
396 0.06
397 0.06
398 0.06
399 0.06
400 0.06
401 0.07
402 0.09
403 0.08
404 0.11
405 0.11
406 0.12
407 0.12
408 0.12
409 0.13
410 0.13
411 0.12
412 0.09
413 0.08
414 0.08
415 0.08
416 0.07
417 0.05
418 0.04
419 0.03
420 0.03
421 0.03
422 0.04
423 0.05
424 0.06
425 0.07
426 0.07
427 0.1
428 0.12
429 0.15
430 0.19
431 0.22
432 0.27
433 0.3
434 0.33
435 0.37
436 0.45
437 0.51
438 0.5
439 0.5
440 0.49
441 0.46
442 0.47
443 0.41
444 0.34
445 0.28
446 0.25
447 0.21
448 0.17
449 0.17
450 0.13
451 0.12
452 0.08
453 0.05
454 0.05
455 0.04
456 0.03
457 0.02
458 0.03
459 0.03
460 0.04
461 0.05
462 0.08
463 0.13
464 0.15
465 0.17
466 0.18
467 0.19
468 0.23
469 0.26
470 0.3
471 0.33
472 0.36
473 0.36
474 0.4
475 0.42
476 0.46
477 0.48
478 0.46
479 0.46
480 0.51
481 0.58
482 0.63
483 0.68
484 0.69
485 0.76
486 0.81
487 0.82
488 0.76
489 0.76
490 0.76
491 0.75
492 0.74
493 0.66
494 0.65
495 0.59
496 0.56
497 0.47
498 0.38
499 0.37
500 0.3
501 0.29
502 0.19
503 0.18
504 0.19
505 0.18
506 0.18
507 0.11
508 0.09
509 0.09
510 0.09
511 0.1
512 0.11
513 0.11
514 0.13
515 0.17
516 0.19
517 0.18
518 0.19
519 0.19
520 0.19
521 0.21
522 0.26
523 0.29
524 0.34
525 0.41
526 0.44
527 0.48
528 0.53
529 0.51
530 0.47
531 0.41
532 0.41
533 0.34
534 0.34
535 0.29
536 0.22
537 0.21
538 0.18
539 0.16
540 0.09
541 0.08
542 0.05
543 0.04
544 0.04
545 0.04
546 0.05
547 0.05
548 0.05
549 0.06
550 0.07
551 0.08
552 0.08
553 0.09
554 0.11
555 0.12
556 0.14
557 0.15
558 0.18
559 0.18
560 0.18
561 0.17
562 0.16
563 0.17
564 0.16
565 0.15
566 0.11
567 0.13
568 0.14
569 0.14
570 0.14
571 0.12
572 0.13
573 0.17
574 0.18
575 0.17
576 0.15
577 0.15
578 0.14
579 0.15
580 0.14
581 0.12
582 0.11
583 0.12
584 0.14
585 0.15
586 0.17
587 0.16
588 0.16
589 0.14
590 0.14
591 0.15
592 0.13
593 0.12
594 0.11
595 0.11
596 0.09
597 0.09
598 0.09
599 0.07
600 0.07
601 0.07
602 0.06
603 0.05
604 0.06
605 0.06
606 0.09
607 0.09
608 0.09
609 0.09
610 0.09
611 0.12
612 0.14
613 0.17
614 0.19
615 0.22
616 0.23
617 0.23
618 0.25
619 0.23
620 0.25
621 0.29
622 0.28
623 0.27
624 0.26
625 0.26
626 0.25
627 0.24
628 0.21
629 0.15
630 0.13
631 0.14
632 0.15
633 0.18
634 0.18
635 0.2
636 0.29
637 0.32
638 0.36
639 0.38
640 0.42
641 0.46
642 0.57
643 0.62
644 0.59
645 0.58
646 0.59
647 0.63
648 0.67
649 0.66
650 0.59
651 0.52
652 0.51
653 0.49
654 0.42
655 0.34
656 0.26
657 0.19
658 0.16
659 0.14
660 0.12
661 0.11
662 0.11
663 0.11
664 0.11
665 0.11
666 0.11
667 0.1
668 0.08
669 0.08
670 0.08
671 0.09
672 0.09
673 0.11
674 0.14
675 0.19
676 0.22
677 0.23
678 0.24
679 0.27
680 0.3
681 0.3
682 0.3
683 0.29
684 0.26
685 0.25
686 0.25
687 0.23
688 0.2
689 0.18
690 0.14
691 0.12
692 0.11
693 0.1
694 0.09
695 0.07
696 0.07
697 0.08
698 0.1
699 0.11
700 0.18
701 0.21
702 0.24
703 0.31
704 0.38
705 0.41
706 0.43
707 0.48
708 0.45
709 0.48
710 0.49
711 0.48
712 0.44
713 0.42
714 0.43
715 0.45
716 0.47
717 0.47
718 0.45
719 0.4
720 0.39
721 0.38
722 0.37
723 0.31
724 0.25
725 0.21
726 0.19
727 0.17
728 0.16
729 0.15
730 0.11
731 0.09
732 0.09
733 0.11
734 0.12
735 0.12
736 0.14
737 0.15
738 0.19
739 0.19
740 0.19
741 0.17
742 0.2
743 0.25
744 0.24
745 0.27
746 0.27
747 0.28
748 0.33
749 0.37
750 0.36
751 0.32
752 0.32
753 0.29
754 0.29
755 0.31
756 0.31
757 0.28
758 0.25
759 0.25
760 0.28
761 0.27
762 0.27
763 0.25
764 0.22
765 0.25
766 0.27
767 0.27
768 0.27
769 0.26
770 0.22
771 0.23
772 0.22
773 0.19
774 0.21
775 0.25
776 0.3
777 0.37
778 0.39
779 0.36
780 0.38
781 0.4
782 0.36
783 0.33
784 0.28
785 0.26
786 0.28
787 0.3
788 0.28
789 0.27
790 0.28
791 0.29
792 0.34
793 0.32
794 0.32
795 0.39
796 0.39
797 0.39
798 0.46
799 0.49
800 0.51
801 0.56
802 0.56
803 0.54
804 0.6
805 0.64
806 0.65
807 0.68
808 0.71
809 0.72
810 0.79
811 0.83
812 0.86
813 0.89
814 0.88
815 0.85
816 0.84
817 0.84
818 0.79
819 0.72
820 0.67
821 0.64
822 0.6
823 0.53