Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1J9RHF5

Protein Details
Accession A0A1J9RHF5    Localization Confidence High Confidence Score 20.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
635-656ENAQVVKRRHEKEEKSRNHDDEBasic
719-740DNQMAKRNRIIAKKRMLRKNRKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
560-566RRAKGKG
643-649RHEKEEK
659-691RQQARPQKNALPNRRDSSKPGFPAKQGMKRKRS
715-740KPEKDNQMAKRNRIIAKKRMLRKNRK
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034809  Nop4_RRM4  
IPR034808  Nop4p_RRM3  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12676  RRM3_Nop4p  
cd12677  RRM4_Nop4p  
Amino Acid Sequences MAETRKRRRLSDSGSFQEDGGIPVTDQKTETAETVADGDVAASHQKTKSRRTLFVRSLPTSATTESLTEYFSQSYPLKHATVVLDPQTKQSKGYGFVTFADHEDATKALEEFNGAVFDGKKLKIEVAEPRHREIDEKRGKSVSTSNLKQERENQRAQAQPPKLIIRNLPWSIAEPDQLATLFRSFGKVKHAVIPKRGTQHSGFGFVVLRGRKNAEKALEAVNGKKIDGRTLAVDWAVEKSIWDELQNNQDEAVDGKVKKKEQGDNDHEGIGKDEDESALDDESNGGLEDEDEDKDDISMADVDEGQEMDEEVEDERNASTVFMRNLPFSATDETLYEHFVQFGPLRYARVVVDPETDRPRGTAFVCFWKTQDAISCLRDAPKRTDLPRAEESKARMSTIKHSVLEDENKDPSGKYTMDGRVLQLSLAVSKSQAAKLEAEGSSRREARDKDKRRLFLLSEGTIPSNSPLYKQLSPTEIAMREASAKQRQKLIKSNPMLHISLTRLSVRNIPRNIDSKALKALAREAVVGFAKDVKGGLREPLSKEELHRSTDDMKEEDKLRRAKGKGIIKQAKVVFEGKEGSKVDEKSGAGRSRGYGFIEYYSHRSALMGLRWLNGHAVAGPDKKKKRLIVEFAIENAQVVKRRHEKEEKSRNHDDEGGRQQARPQKNALPNRRDSSKPGFPAKQGMKRKRSESVAGQGNPNPTAATKADNAKDAKPEKDNQMAKRNRIIAKKRMLRKNRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.66
3 0.57
4 0.5
5 0.42
6 0.32
7 0.24
8 0.19
9 0.13
10 0.19
11 0.21
12 0.18
13 0.19
14 0.18
15 0.2
16 0.21
17 0.22
18 0.16
19 0.15
20 0.15
21 0.16
22 0.15
23 0.12
24 0.1
25 0.09
26 0.07
27 0.08
28 0.1
29 0.09
30 0.13
31 0.16
32 0.23
33 0.29
34 0.38
35 0.48
36 0.52
37 0.6
38 0.65
39 0.72
40 0.75
41 0.78
42 0.77
43 0.7
44 0.65
45 0.57
46 0.52
47 0.44
48 0.36
49 0.29
50 0.21
51 0.18
52 0.19
53 0.18
54 0.16
55 0.15
56 0.16
57 0.16
58 0.15
59 0.19
60 0.19
61 0.2
62 0.24
63 0.26
64 0.25
65 0.23
66 0.27
67 0.24
68 0.27
69 0.29
70 0.31
71 0.34
72 0.33
73 0.4
74 0.44
75 0.41
76 0.38
77 0.38
78 0.36
79 0.34
80 0.38
81 0.35
82 0.29
83 0.3
84 0.33
85 0.29
86 0.26
87 0.25
88 0.2
89 0.17
90 0.17
91 0.15
92 0.12
93 0.13
94 0.12
95 0.09
96 0.09
97 0.09
98 0.09
99 0.1
100 0.09
101 0.08
102 0.1
103 0.1
104 0.12
105 0.16
106 0.16
107 0.17
108 0.17
109 0.18
110 0.19
111 0.23
112 0.3
113 0.35
114 0.44
115 0.46
116 0.48
117 0.5
118 0.48
119 0.49
120 0.43
121 0.45
122 0.45
123 0.45
124 0.45
125 0.45
126 0.45
127 0.43
128 0.45
129 0.43
130 0.42
131 0.43
132 0.48
133 0.54
134 0.55
135 0.55
136 0.59
137 0.6
138 0.58
139 0.59
140 0.54
141 0.54
142 0.58
143 0.59
144 0.59
145 0.52
146 0.48
147 0.48
148 0.49
149 0.45
150 0.42
151 0.41
152 0.38
153 0.43
154 0.4
155 0.37
156 0.32
157 0.32
158 0.32
159 0.3
160 0.25
161 0.17
162 0.16
163 0.16
164 0.15
165 0.13
166 0.11
167 0.1
168 0.1
169 0.09
170 0.13
171 0.13
172 0.15
173 0.22
174 0.24
175 0.25
176 0.32
177 0.41
178 0.42
179 0.48
180 0.52
181 0.49
182 0.53
183 0.53
184 0.49
185 0.42
186 0.44
187 0.38
188 0.38
189 0.33
190 0.26
191 0.26
192 0.22
193 0.25
194 0.2
195 0.2
196 0.17
197 0.21
198 0.22
199 0.25
200 0.29
201 0.26
202 0.26
203 0.27
204 0.29
205 0.3
206 0.29
207 0.27
208 0.28
209 0.25
210 0.24
211 0.25
212 0.21
213 0.19
214 0.2
215 0.19
216 0.16
217 0.17
218 0.17
219 0.15
220 0.14
221 0.12
222 0.11
223 0.1
224 0.08
225 0.07
226 0.07
227 0.09
228 0.09
229 0.1
230 0.1
231 0.12
232 0.2
233 0.22
234 0.21
235 0.19
236 0.19
237 0.18
238 0.17
239 0.17
240 0.14
241 0.13
242 0.18
243 0.22
244 0.24
245 0.28
246 0.33
247 0.38
248 0.41
249 0.51
250 0.53
251 0.55
252 0.55
253 0.51
254 0.46
255 0.39
256 0.33
257 0.23
258 0.16
259 0.1
260 0.09
261 0.07
262 0.07
263 0.08
264 0.07
265 0.07
266 0.06
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.05
272 0.04
273 0.03
274 0.04
275 0.05
276 0.06
277 0.06
278 0.07
279 0.07
280 0.07
281 0.07
282 0.08
283 0.06
284 0.05
285 0.06
286 0.05
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.05
291 0.05
292 0.05
293 0.04
294 0.04
295 0.04
296 0.04
297 0.04
298 0.04
299 0.05
300 0.05
301 0.05
302 0.05
303 0.05
304 0.05
305 0.05
306 0.06
307 0.09
308 0.1
309 0.13
310 0.14
311 0.14
312 0.14
313 0.14
314 0.14
315 0.13
316 0.14
317 0.12
318 0.12
319 0.12
320 0.12
321 0.12
322 0.13
323 0.12
324 0.09
325 0.09
326 0.08
327 0.1
328 0.09
329 0.11
330 0.12
331 0.12
332 0.13
333 0.13
334 0.14
335 0.13
336 0.14
337 0.13
338 0.11
339 0.14
340 0.14
341 0.17
342 0.2
343 0.2
344 0.18
345 0.17
346 0.17
347 0.16
348 0.16
349 0.16
350 0.13
351 0.2
352 0.23
353 0.23
354 0.22
355 0.22
356 0.22
357 0.19
358 0.2
359 0.16
360 0.17
361 0.17
362 0.18
363 0.16
364 0.2
365 0.22
366 0.21
367 0.23
368 0.27
369 0.3
370 0.31
371 0.4
372 0.37
373 0.41
374 0.45
375 0.44
376 0.4
377 0.38
378 0.39
379 0.37
380 0.36
381 0.3
382 0.26
383 0.23
384 0.27
385 0.31
386 0.32
387 0.26
388 0.25
389 0.26
390 0.27
391 0.3
392 0.27
393 0.22
394 0.19
395 0.19
396 0.19
397 0.17
398 0.15
399 0.15
400 0.13
401 0.11
402 0.16
403 0.18
404 0.21
405 0.22
406 0.21
407 0.19
408 0.19
409 0.18
410 0.13
411 0.11
412 0.08
413 0.08
414 0.07
415 0.06
416 0.07
417 0.09
418 0.09
419 0.11
420 0.12
421 0.12
422 0.12
423 0.16
424 0.14
425 0.15
426 0.16
427 0.17
428 0.19
429 0.2
430 0.2
431 0.21
432 0.24
433 0.32
434 0.41
435 0.48
436 0.54
437 0.6
438 0.62
439 0.6
440 0.61
441 0.53
442 0.49
443 0.45
444 0.36
445 0.3
446 0.28
447 0.26
448 0.22
449 0.2
450 0.14
451 0.12
452 0.11
453 0.1
454 0.14
455 0.18
456 0.2
457 0.22
458 0.24
459 0.24
460 0.25
461 0.25
462 0.26
463 0.21
464 0.21
465 0.19
466 0.17
467 0.17
468 0.17
469 0.21
470 0.25
471 0.29
472 0.29
473 0.37
474 0.41
475 0.44
476 0.52
477 0.55
478 0.56
479 0.58
480 0.62
481 0.59
482 0.59
483 0.53
484 0.44
485 0.38
486 0.31
487 0.27
488 0.23
489 0.2
490 0.18
491 0.19
492 0.25
493 0.29
494 0.35
495 0.35
496 0.36
497 0.38
498 0.41
499 0.42
500 0.42
501 0.37
502 0.3
503 0.32
504 0.32
505 0.28
506 0.24
507 0.26
508 0.22
509 0.21
510 0.19
511 0.15
512 0.15
513 0.15
514 0.15
515 0.12
516 0.11
517 0.1
518 0.1
519 0.1
520 0.08
521 0.1
522 0.11
523 0.14
524 0.16
525 0.2
526 0.23
527 0.27
528 0.29
529 0.28
530 0.3
531 0.35
532 0.34
533 0.33
534 0.32
535 0.3
536 0.32
537 0.35
538 0.35
539 0.28
540 0.26
541 0.27
542 0.3
543 0.33
544 0.35
545 0.37
546 0.38
547 0.44
548 0.45
549 0.48
550 0.52
551 0.57
552 0.56
553 0.63
554 0.67
555 0.6
556 0.65
557 0.61
558 0.54
559 0.47
560 0.43
561 0.32
562 0.26
563 0.29
564 0.22
565 0.26
566 0.24
567 0.25
568 0.28
569 0.28
570 0.28
571 0.28
572 0.28
573 0.26
574 0.33
575 0.34
576 0.29
577 0.3
578 0.3
579 0.28
580 0.3
581 0.28
582 0.22
583 0.2
584 0.2
585 0.22
586 0.22
587 0.24
588 0.24
589 0.22
590 0.2
591 0.19
592 0.19
593 0.22
594 0.22
595 0.23
596 0.22
597 0.23
598 0.23
599 0.24
600 0.22
601 0.17
602 0.15
603 0.1
604 0.12
605 0.15
606 0.21
607 0.27
608 0.35
609 0.41
610 0.47
611 0.53
612 0.56
613 0.62
614 0.65
615 0.67
616 0.66
617 0.67
618 0.63
619 0.58
620 0.54
621 0.43
622 0.34
623 0.27
624 0.21
625 0.21
626 0.21
627 0.28
628 0.35
629 0.4
630 0.49
631 0.58
632 0.65
633 0.69
634 0.79
635 0.8
636 0.8
637 0.85
638 0.79
639 0.73
640 0.7
641 0.62
642 0.6
643 0.58
644 0.59
645 0.51
646 0.48
647 0.5
648 0.52
649 0.55
650 0.5
651 0.47
652 0.47
653 0.56
654 0.66
655 0.7
656 0.7
657 0.72
658 0.74
659 0.74
660 0.68
661 0.66
662 0.64
663 0.63
664 0.61
665 0.62
666 0.6
667 0.57
668 0.64
669 0.66
670 0.67
671 0.69
672 0.72
673 0.72
674 0.76
675 0.79
676 0.77
677 0.74
678 0.71
679 0.68
680 0.67
681 0.67
682 0.62
683 0.61
684 0.57
685 0.54
686 0.47
687 0.4
688 0.31
689 0.22
690 0.24
691 0.2
692 0.2
693 0.21
694 0.29
695 0.31
696 0.37
697 0.39
698 0.38
699 0.46
700 0.47
701 0.49
702 0.47
703 0.51
704 0.52
705 0.59
706 0.63
707 0.62
708 0.68
709 0.7
710 0.7
711 0.73
712 0.74
713 0.71
714 0.74
715 0.74
716 0.73
717 0.76
718 0.79
719 0.81
720 0.83