Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1J9Q542

Protein Details
Accession A0A1J9Q542    Localization Confidence High Confidence Score 20
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
272-301SSSDPGRRAHRRRSSHRRRRSRSSSTGRDRBasic
481-508DCPRLVRLFDKEQRRRRRQNGQISSVRAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
277-313GRRAHRRRSSHRRRRSRSSSTGRDRHFRHRHRDDADR
Subcellular Location(s) nucl 26
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016197  Chromo-like_dom_sf  
IPR000953  Chromo/chromo_shadow_dom  
IPR023780  Chromo_domain  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR006600  HTH_CenpB_DNA-bd_dom  
IPR007889  HTH_Psq  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006338  P:chromatin remodeling  
Pfam View protein in Pfam  
PF00385  Chromo  
PF05225  HTH_psq  
PF03221  HTH_Tnp_Tc5  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50013  CHROMO_2  
PS51253  HTH_CENPB  
CDD cd00024  CD_CSD  
Amino Acid Sequences METAQAQQDPTDPERYTKAQFKNDCALLLLYKDDFAAGRSLHLLGLTSQRDFGRAEGIILSLSENSRNEAFTKAHATQGRSTGSTSTIPRFRQWLDRFRKGPQQQDGSYMFFPPLHPSFAAAASPQSDRNPDFPMQSPRPRSNSQDRQVIHDRVDRFHGSNNLRPLFVGDTRNDVSDLPTRNLPPSAPTQPTPPDSQNLPASRTLQDNLHCTTQQSFGSLPRRPHPNNNSRNNSAASDPSPVTMPAETEQPSTRSQRSTRHPSNPASDPSDSSSDPGRRAHRRRSSHRRRRSRSSSTGRDRHFRHRHRDDADRRHRPLDTLPLKSYMAKVPPANLSSVTHTTQPNNFFTLANLSALRLVRKGKYGYSLPSMSALSPILAGPFDIIERVGPLAYRLSLPPELDSIHPVVSVLHLEKFEKDPFGRPHPIPPTEIINGIPRNEIEQIIAERKDAEDGTPLLLARWAGYPDAPDSWEPRSHLMEDCPRLVRLFDKEQRRRRRQNGQISSVRAASKLYSVPRTTLGYRIQGRTTRVDTPSKHRKLSPTEEESLVQWILVMDERGQPPRVGTVREMANILLANRDPSAEARPPTVGKSW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.4
3 0.42
4 0.46
5 0.51
6 0.54
7 0.58
8 0.62
9 0.64
10 0.62
11 0.55
12 0.48
13 0.42
14 0.33
15 0.29
16 0.25
17 0.17
18 0.16
19 0.15
20 0.13
21 0.12
22 0.11
23 0.14
24 0.12
25 0.13
26 0.14
27 0.15
28 0.14
29 0.14
30 0.14
31 0.11
32 0.19
33 0.2
34 0.19
35 0.22
36 0.22
37 0.24
38 0.24
39 0.22
40 0.2
41 0.18
42 0.18
43 0.15
44 0.15
45 0.14
46 0.13
47 0.13
48 0.1
49 0.1
50 0.13
51 0.13
52 0.16
53 0.17
54 0.18
55 0.18
56 0.2
57 0.21
58 0.21
59 0.27
60 0.25
61 0.31
62 0.35
63 0.37
64 0.37
65 0.42
66 0.41
67 0.35
68 0.35
69 0.3
70 0.28
71 0.29
72 0.28
73 0.3
74 0.33
75 0.34
76 0.35
77 0.39
78 0.39
79 0.45
80 0.49
81 0.52
82 0.55
83 0.63
84 0.63
85 0.64
86 0.71
87 0.67
88 0.69
89 0.67
90 0.66
91 0.57
92 0.61
93 0.58
94 0.52
95 0.46
96 0.38
97 0.3
98 0.23
99 0.22
100 0.22
101 0.21
102 0.19
103 0.18
104 0.2
105 0.21
106 0.21
107 0.21
108 0.15
109 0.14
110 0.14
111 0.15
112 0.15
113 0.15
114 0.19
115 0.2
116 0.23
117 0.26
118 0.26
119 0.27
120 0.31
121 0.38
122 0.41
123 0.48
124 0.53
125 0.55
126 0.6
127 0.6
128 0.63
129 0.64
130 0.67
131 0.65
132 0.66
133 0.6
134 0.61
135 0.65
136 0.6
137 0.53
138 0.48
139 0.44
140 0.37
141 0.42
142 0.36
143 0.3
144 0.31
145 0.36
146 0.35
147 0.38
148 0.44
149 0.41
150 0.38
151 0.36
152 0.34
153 0.3
154 0.29
155 0.27
156 0.2
157 0.24
158 0.25
159 0.26
160 0.24
161 0.2
162 0.2
163 0.22
164 0.24
165 0.2
166 0.23
167 0.23
168 0.24
169 0.25
170 0.22
171 0.19
172 0.22
173 0.26
174 0.26
175 0.26
176 0.29
177 0.32
178 0.35
179 0.36
180 0.32
181 0.29
182 0.27
183 0.31
184 0.33
185 0.31
186 0.31
187 0.28
188 0.29
189 0.27
190 0.28
191 0.25
192 0.22
193 0.23
194 0.24
195 0.24
196 0.24
197 0.23
198 0.21
199 0.22
200 0.22
201 0.19
202 0.17
203 0.16
204 0.2
205 0.26
206 0.29
207 0.31
208 0.33
209 0.42
210 0.43
211 0.52
212 0.56
213 0.6
214 0.65
215 0.72
216 0.74
217 0.67
218 0.67
219 0.59
220 0.5
221 0.41
222 0.33
223 0.24
224 0.21
225 0.18
226 0.16
227 0.15
228 0.13
229 0.13
230 0.11
231 0.1
232 0.08
233 0.11
234 0.11
235 0.12
236 0.13
237 0.15
238 0.18
239 0.21
240 0.22
241 0.24
242 0.27
243 0.33
244 0.41
245 0.49
246 0.53
247 0.58
248 0.61
249 0.6
250 0.62
251 0.58
252 0.53
253 0.47
254 0.4
255 0.33
256 0.29
257 0.28
258 0.23
259 0.2
260 0.21
261 0.19
262 0.2
263 0.24
264 0.28
265 0.35
266 0.42
267 0.51
268 0.55
269 0.62
270 0.71
271 0.78
272 0.83
273 0.84
274 0.88
275 0.89
276 0.88
277 0.89
278 0.88
279 0.85
280 0.84
281 0.82
282 0.82
283 0.8
284 0.8
285 0.72
286 0.7
287 0.65
288 0.66
289 0.67
290 0.64
291 0.65
292 0.65
293 0.69
294 0.66
295 0.73
296 0.71
297 0.72
298 0.75
299 0.73
300 0.68
301 0.64
302 0.59
303 0.51
304 0.44
305 0.43
306 0.38
307 0.34
308 0.32
309 0.32
310 0.32
311 0.31
312 0.31
313 0.23
314 0.2
315 0.19
316 0.18
317 0.18
318 0.21
319 0.21
320 0.2
321 0.18
322 0.17
323 0.17
324 0.2
325 0.19
326 0.19
327 0.2
328 0.21
329 0.24
330 0.26
331 0.24
332 0.23
333 0.23
334 0.2
335 0.19
336 0.2
337 0.16
338 0.14
339 0.13
340 0.11
341 0.13
342 0.13
343 0.13
344 0.12
345 0.14
346 0.14
347 0.19
348 0.2
349 0.19
350 0.23
351 0.24
352 0.25
353 0.27
354 0.27
355 0.23
356 0.23
357 0.22
358 0.18
359 0.16
360 0.13
361 0.08
362 0.08
363 0.07
364 0.06
365 0.05
366 0.05
367 0.04
368 0.04
369 0.04
370 0.04
371 0.04
372 0.04
373 0.04
374 0.05
375 0.05
376 0.04
377 0.05
378 0.06
379 0.07
380 0.08
381 0.08
382 0.11
383 0.13
384 0.14
385 0.14
386 0.14
387 0.15
388 0.14
389 0.16
390 0.13
391 0.12
392 0.11
393 0.1
394 0.09
395 0.08
396 0.1
397 0.09
398 0.1
399 0.1
400 0.11
401 0.13
402 0.16
403 0.17
404 0.19
405 0.2
406 0.26
407 0.3
408 0.37
409 0.42
410 0.39
411 0.46
412 0.49
413 0.5
414 0.44
415 0.41
416 0.39
417 0.34
418 0.34
419 0.27
420 0.26
421 0.26
422 0.25
423 0.24
424 0.18
425 0.19
426 0.2
427 0.19
428 0.13
429 0.13
430 0.16
431 0.19
432 0.19
433 0.17
434 0.17
435 0.16
436 0.18
437 0.16
438 0.13
439 0.12
440 0.12
441 0.13
442 0.14
443 0.14
444 0.12
445 0.12
446 0.12
447 0.09
448 0.1
449 0.1
450 0.09
451 0.1
452 0.11
453 0.12
454 0.13
455 0.14
456 0.14
457 0.16
458 0.19
459 0.22
460 0.22
461 0.24
462 0.26
463 0.27
464 0.28
465 0.31
466 0.36
467 0.36
468 0.38
469 0.37
470 0.35
471 0.33
472 0.32
473 0.29
474 0.27
475 0.34
476 0.38
477 0.47
478 0.56
479 0.66
480 0.76
481 0.83
482 0.87
483 0.87
484 0.9
485 0.89
486 0.9
487 0.9
488 0.88
489 0.84
490 0.79
491 0.72
492 0.64
493 0.54
494 0.43
495 0.35
496 0.26
497 0.23
498 0.22
499 0.25
500 0.27
501 0.28
502 0.3
503 0.32
504 0.36
505 0.34
506 0.36
507 0.35
508 0.37
509 0.41
510 0.43
511 0.46
512 0.46
513 0.49
514 0.49
515 0.49
516 0.47
517 0.46
518 0.51
519 0.49
520 0.55
521 0.62
522 0.63
523 0.63
524 0.61
525 0.65
526 0.66
527 0.71
528 0.71
529 0.67
530 0.64
531 0.61
532 0.57
533 0.5
534 0.44
535 0.34
536 0.24
537 0.17
538 0.12
539 0.11
540 0.12
541 0.12
542 0.1
543 0.16
544 0.2
545 0.24
546 0.26
547 0.25
548 0.25
549 0.33
550 0.34
551 0.32
552 0.31
553 0.33
554 0.35
555 0.36
556 0.36
557 0.27
558 0.26
559 0.24
560 0.22
561 0.19
562 0.16
563 0.16
564 0.16
565 0.16
566 0.15
567 0.16
568 0.23
569 0.25
570 0.27
571 0.28
572 0.32
573 0.33