Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1J9Q116

Protein Details
Accession A0A1J9Q116    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MGKNRRRAKKWAQAHLPILQHydrophilic
353-372LEKERERETKRGMKKATRKGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
311-372RKLRRAHEVEKSEERKLQAEKVKKEERDRLLRGMSAEEQRKFLEKERERETKRGMKKATRKG
Subcellular Location(s) mito 19.5, cyto_mito 12.833, mito_nucl 11.666, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012879  CCDC47  
Gene Ontology GO:0005783  C:endoplasmic reticulum  
GO:0016020  C:membrane  
GO:0005509  F:calcium ion binding  
GO:0032469  P:endoplasmic reticulum calcium ion homeostasis  
Pfam View protein in Pfam  
PF07946  CCDC47  
Amino Acid Sequences MGKNRRRAKKWAQAHLPILQSEFAVVGYGGVGGARRALSVDNVQAEGLAKASATASASASSGDELEVPASMLKEMSGTEFVTYATGRQNVAFMDVSIKLFRWYNPLYMLGDFAVSMFFDSWPVPVERVECTAYSFDGKEKDLVPAPSAVEKELIEQRTKGAANSSSYDGFVFAVVHKNCMRKLREDRYDISLTFTRDNPKLPQWATVMSESAEITDTMLTADLIKAVEDAGEDFEYLIITDQPLDKPTKLDETTPGKRINLSLRLPKSGSYTTTMPIFTYFLRLTDRVVSAAHFRAEVVRKLRNTRDEETRKLRRAHEVEKSEERKLQAEKVKKEERDRLLRGMSAEEQRKFLEKERERETKRGMKKATRKG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.81
2 0.77
3 0.69
4 0.59
5 0.51
6 0.41
7 0.31
8 0.23
9 0.18
10 0.11
11 0.09
12 0.08
13 0.06
14 0.05
15 0.05
16 0.05
17 0.05
18 0.05
19 0.04
20 0.06
21 0.07
22 0.06
23 0.07
24 0.09
25 0.12
26 0.15
27 0.19
28 0.19
29 0.19
30 0.19
31 0.19
32 0.19
33 0.15
34 0.13
35 0.08
36 0.06
37 0.06
38 0.07
39 0.07
40 0.07
41 0.08
42 0.08
43 0.09
44 0.09
45 0.09
46 0.09
47 0.09
48 0.08
49 0.07
50 0.07
51 0.06
52 0.06
53 0.06
54 0.06
55 0.07
56 0.07
57 0.07
58 0.06
59 0.06
60 0.06
61 0.06
62 0.08
63 0.09
64 0.09
65 0.09
66 0.1
67 0.1
68 0.11
69 0.1
70 0.1
71 0.12
72 0.14
73 0.14
74 0.14
75 0.15
76 0.13
77 0.16
78 0.15
79 0.11
80 0.12
81 0.13
82 0.14
83 0.13
84 0.13
85 0.12
86 0.13
87 0.14
88 0.18
89 0.19
90 0.2
91 0.21
92 0.23
93 0.23
94 0.22
95 0.22
96 0.15
97 0.13
98 0.11
99 0.09
100 0.07
101 0.05
102 0.05
103 0.05
104 0.05
105 0.06
106 0.06
107 0.06
108 0.08
109 0.09
110 0.09
111 0.1
112 0.11
113 0.11
114 0.14
115 0.15
116 0.13
117 0.14
118 0.14
119 0.14
120 0.14
121 0.13
122 0.13
123 0.14
124 0.14
125 0.15
126 0.14
127 0.16
128 0.18
129 0.18
130 0.17
131 0.16
132 0.16
133 0.17
134 0.16
135 0.14
136 0.12
137 0.11
138 0.13
139 0.17
140 0.18
141 0.16
142 0.16
143 0.17
144 0.2
145 0.2
146 0.17
147 0.15
148 0.16
149 0.17
150 0.18
151 0.19
152 0.16
153 0.16
154 0.16
155 0.13
156 0.11
157 0.09
158 0.07
159 0.06
160 0.13
161 0.12
162 0.16
163 0.18
164 0.2
165 0.22
166 0.29
167 0.3
168 0.31
169 0.4
170 0.46
171 0.5
172 0.52
173 0.52
174 0.51
175 0.51
176 0.43
177 0.38
178 0.32
179 0.27
180 0.24
181 0.23
182 0.22
183 0.21
184 0.23
185 0.22
186 0.22
187 0.26
188 0.25
189 0.27
190 0.24
191 0.25
192 0.25
193 0.22
194 0.2
195 0.14
196 0.15
197 0.11
198 0.1
199 0.08
200 0.06
201 0.06
202 0.05
203 0.05
204 0.04
205 0.05
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.04
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.05
225 0.04
226 0.04
227 0.05
228 0.06
229 0.07
230 0.1
231 0.12
232 0.12
233 0.13
234 0.15
235 0.21
236 0.21
237 0.22
238 0.27
239 0.33
240 0.38
241 0.42
242 0.43
243 0.36
244 0.36
245 0.38
246 0.37
247 0.36
248 0.36
249 0.4
250 0.4
251 0.43
252 0.43
253 0.41
254 0.39
255 0.34
256 0.31
257 0.26
258 0.25
259 0.23
260 0.25
261 0.24
262 0.19
263 0.18
264 0.17
265 0.13
266 0.16
267 0.15
268 0.14
269 0.18
270 0.18
271 0.19
272 0.21
273 0.22
274 0.18
275 0.18
276 0.18
277 0.18
278 0.2
279 0.19
280 0.15
281 0.14
282 0.2
283 0.24
284 0.28
285 0.29
286 0.34
287 0.38
288 0.44
289 0.52
290 0.54
291 0.56
292 0.55
293 0.62
294 0.62
295 0.67
296 0.7
297 0.72
298 0.71
299 0.7
300 0.69
301 0.68
302 0.68
303 0.68
304 0.68
305 0.64
306 0.63
307 0.68
308 0.69
309 0.62
310 0.59
311 0.53
312 0.48
313 0.46
314 0.48
315 0.46
316 0.51
317 0.54
318 0.6
319 0.67
320 0.69
321 0.74
322 0.75
323 0.75
324 0.76
325 0.74
326 0.71
327 0.65
328 0.6
329 0.53
330 0.48
331 0.44
332 0.43
333 0.45
334 0.4
335 0.4
336 0.39
337 0.43
338 0.41
339 0.44
340 0.46
341 0.47
342 0.53
343 0.6
344 0.69
345 0.69
346 0.74
347 0.75
348 0.74
349 0.75
350 0.77
351 0.77
352 0.77