Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1J9RKM6

Protein Details
Accession A0A1J9RKM6    Localization Confidence High Confidence Score 17.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
61-80SWLQRKARLKEEKKAKLEKHBasic
374-402GDRDRDRDYRDRDRDRDRDRDRYGRRDDEAcidic
NLS Segment(s)
PositionSequence
67-76ARLKEEKKAK
190-204KGWKPRRFGGGLGGR
352-378RDRDRDRDRDRDRDRGGDRGRGGDRDR
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto_nucl 10, mito 8, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR034143  snRNP70_RRM  
IPR022023  U1snRNP70_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0030619  F:U1 snRNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PF12220  U1snRNP70_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12236  RRM_snRNP70  
Amino Acid Sequences MTDKLPPNLLALFAPRPPLRYIPPADRAPDDIEASKIGGVAQFVDELQKYGEEVPYNATESWLQRKARLKEEKKAKLEKHLTEGLKEYNPNNDPQVRGDAFKTLFVSRLSYDATEADLEREFGRFGPIERIRIVVDTHNPKRNSKKPHRGYAFIVYEREQDMKAAYKETDGIRIKDRRVLVDVERGRTVKGWKPRRFGGGLGGRGYTKSMPARPMGPGGFAPSGPGGFRGGGFGGRGGFRGGFRGDRGFGGRGGIGYQGGPGGRSAFGPSNGVGGQPPPNAPSGPGGGRSGGYGGGANGYDGGMGGYGDSRRGGAYDDRAGHRGGSRHEREARGITGSNREPVRPRDGFGDRDRDRDRDRDRDRDRGGDRGRGGDRDRDRDYRDRDRDRDRDRDRYGRRDDEYSRKRYHEGDDYDDPRSKRRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.26
3 0.29
4 0.31
5 0.35
6 0.36
7 0.41
8 0.46
9 0.47
10 0.54
11 0.55
12 0.55
13 0.52
14 0.5
15 0.46
16 0.42
17 0.37
18 0.3
19 0.27
20 0.24
21 0.23
22 0.19
23 0.15
24 0.13
25 0.11
26 0.1
27 0.09
28 0.09
29 0.09
30 0.09
31 0.12
32 0.11
33 0.11
34 0.12
35 0.11
36 0.11
37 0.13
38 0.16
39 0.14
40 0.14
41 0.18
42 0.19
43 0.21
44 0.2
45 0.2
46 0.2
47 0.22
48 0.3
49 0.33
50 0.32
51 0.36
52 0.46
53 0.5
54 0.57
55 0.64
56 0.63
57 0.66
58 0.76
59 0.79
60 0.78
61 0.83
62 0.76
63 0.76
64 0.78
65 0.71
66 0.67
67 0.66
68 0.58
69 0.5
70 0.5
71 0.43
72 0.38
73 0.37
74 0.32
75 0.32
76 0.32
77 0.32
78 0.35
79 0.34
80 0.32
81 0.31
82 0.37
83 0.3
84 0.3
85 0.29
86 0.29
87 0.26
88 0.27
89 0.27
90 0.2
91 0.21
92 0.2
93 0.21
94 0.16
95 0.17
96 0.17
97 0.15
98 0.15
99 0.13
100 0.13
101 0.12
102 0.12
103 0.11
104 0.1
105 0.11
106 0.1
107 0.1
108 0.1
109 0.09
110 0.11
111 0.1
112 0.11
113 0.2
114 0.22
115 0.24
116 0.24
117 0.26
118 0.23
119 0.24
120 0.24
121 0.18
122 0.23
123 0.3
124 0.36
125 0.42
126 0.44
127 0.48
128 0.57
129 0.61
130 0.64
131 0.66
132 0.71
133 0.71
134 0.8
135 0.79
136 0.74
137 0.7
138 0.68
139 0.63
140 0.53
141 0.47
142 0.37
143 0.34
144 0.31
145 0.28
146 0.19
147 0.13
148 0.13
149 0.15
150 0.15
151 0.15
152 0.14
153 0.13
154 0.16
155 0.16
156 0.24
157 0.22
158 0.23
159 0.29
160 0.33
161 0.33
162 0.35
163 0.35
164 0.28
165 0.28
166 0.29
167 0.24
168 0.29
169 0.31
170 0.28
171 0.29
172 0.28
173 0.26
174 0.25
175 0.27
176 0.23
177 0.3
178 0.39
179 0.43
180 0.48
181 0.5
182 0.53
183 0.5
184 0.45
185 0.44
186 0.4
187 0.35
188 0.32
189 0.29
190 0.25
191 0.23
192 0.23
193 0.15
194 0.12
195 0.12
196 0.14
197 0.15
198 0.16
199 0.18
200 0.18
201 0.2
202 0.17
203 0.15
204 0.13
205 0.14
206 0.14
207 0.12
208 0.12
209 0.09
210 0.09
211 0.08
212 0.08
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.06
223 0.07
224 0.07
225 0.07
226 0.07
227 0.09
228 0.1
229 0.1
230 0.11
231 0.12
232 0.12
233 0.13
234 0.15
235 0.14
236 0.13
237 0.13
238 0.12
239 0.1
240 0.1
241 0.09
242 0.07
243 0.06
244 0.06
245 0.06
246 0.06
247 0.06
248 0.05
249 0.06
250 0.06
251 0.07
252 0.09
253 0.1
254 0.11
255 0.12
256 0.12
257 0.12
258 0.12
259 0.12
260 0.1
261 0.1
262 0.13
263 0.13
264 0.13
265 0.12
266 0.14
267 0.14
268 0.14
269 0.14
270 0.14
271 0.14
272 0.15
273 0.15
274 0.14
275 0.14
276 0.13
277 0.12
278 0.09
279 0.08
280 0.07
281 0.06
282 0.06
283 0.06
284 0.06
285 0.05
286 0.05
287 0.04
288 0.04
289 0.04
290 0.03
291 0.03
292 0.03
293 0.05
294 0.05
295 0.06
296 0.06
297 0.07
298 0.07
299 0.07
300 0.1
301 0.11
302 0.16
303 0.21
304 0.25
305 0.27
306 0.29
307 0.29
308 0.27
309 0.27
310 0.27
311 0.27
312 0.33
313 0.35
314 0.42
315 0.48
316 0.48
317 0.49
318 0.49
319 0.45
320 0.38
321 0.37
322 0.31
323 0.33
324 0.32
325 0.34
326 0.32
327 0.33
328 0.35
329 0.37
330 0.44
331 0.37
332 0.37
333 0.39
334 0.42
335 0.46
336 0.46
337 0.52
338 0.44
339 0.52
340 0.53
341 0.52
342 0.52
343 0.55
344 0.57
345 0.57
346 0.62
347 0.65
348 0.67
349 0.71
350 0.71
351 0.71
352 0.66
353 0.65
354 0.62
355 0.59
356 0.55
357 0.53
358 0.51
359 0.48
360 0.48
361 0.48
362 0.5
363 0.5
364 0.55
365 0.53
366 0.57
367 0.61
368 0.66
369 0.68
370 0.71
371 0.73
372 0.75
373 0.79
374 0.82
375 0.81
376 0.83
377 0.8
378 0.8
379 0.78
380 0.81
381 0.79
382 0.79
383 0.8
384 0.78
385 0.74
386 0.72
387 0.71
388 0.72
389 0.73
390 0.72
391 0.7
392 0.65
393 0.65
394 0.61
395 0.61
396 0.6
397 0.56
398 0.55
399 0.58
400 0.57
401 0.59
402 0.61
403 0.55